r语言glmnet 第32页

R语言零基础基因/数据差异分析（二）

文章目录结果展示安装ggplot2包制作方法注意，本系列有连贯性，每一步都很详细，每一步都很重要，请耐心读完！！结果展示安装ggplot2包如图操作找到并勾上即可。制作方法关于基因的选定标准，即logFC和FDR，请仔细阅读代码修改即可，这里给出的标准是：|log2(FC)|>1且FDR1),'Title']<-'up'#上调趋势筛选#FDR边界限定和logFC上边界限定df[which(df$F

Frms·2023-10-17 14:54

《R实现贝叶斯统计》chapter 1

前言最近在阅读《贝叶斯统计及其R实现》，这是一本用R语言实现贝叶斯统计的一本书本书分为七章1.介绍基本的贝叶斯概念2.介绍共轭先验分布的基本概念3.介绍先验分布的基本求法4.贝叶斯统计推断5.贝叶斯决策

小潤澤·2023-10-17 11:41

百日筑基篇——差异基因分析Limma包（R语言初识七）

百日筑基篇——差异基因分析Limma包（R语言初识七）文章目录前言一、Limma包介绍二、使用步骤1.数据预处理2.进行voom转换3.得到差异表达数据4.样本间距离的可视化三、DESeq2包于limma

星石传说·2023-10-17 11:01

python 梯度提升树_机器学习：梯度提升算法｜python与r语言代码实现

梯度提升算法10.1GBMGBM(梯度提升机)是一种在处理大量数据以进行高预测的预测时使用的Boosting算法。Boosting实际上是一个学习算法的集合，它结合了几个基本估计量的预测，以便比单个估计量提高坚固性。它将多个弱或平均预测因子组合成一个强预测因子。这些提升算法在Kaggle、AVHackthon、CrowdAnalytix等数据科学竞赛中总能表现得很好。Python代码#Import

weixin_39521520·2023-10-17 10:50

如何对多变量数据批量进行t test和anova test并标注P值

前言用R语言对单独的变量数据进行ttest或者anovatest大家肯定耳熟能详。

Jason数据分析生信教室·2023-10-17 10:00

R语言处理基因芯片测序得到的SNP数据的一个简单小例子~进化树和PCA

最终拿到的数据格式如下image.png第一列是探针id第二列是染色体编号第三类是染色体位置第四列是第一个样本的基因型接下来依次是每个样本的基因型相当于是每行是一个位点，每列是一个样本这个数据集下载自链接https://popgen.nescent.org/StartSNP.htmlimage.png今天推文的主要内筒也是参考自这个链接，这个链接的数据集是500多个样本，3000多个位点，我只选取

小明的数据分析笔记本·2023-10-17 06:50

R语言ggplot2画漂亮的环形柱形图的一个实例

配色很漂亮，代码和数据也是公开的，今天的推文来学习一下他的代码代码来源的链接是https://github.com/NearAndDistant/data_science_with_r这个链接还有很多其他的R语言

小明的数据分析笔记本·2023-10-17 01:13

7.R语言logistic回归临床预测模型-Calibration校准曲线

以下内容来自B站up主：大鹏统计工作室的系列教学视频《R语言Logistic回归临床预测模型》第七节calibration校准曲线(4种款式）假定已经拟合好了下面的模型：image.pngdd=datadist

北欧森林·2023-10-17 01:25

scitb5函数1.7版本（交互效应函数P for interaction）发布----用于一键生成交互效应表、森林图

交互效应表我在既往文章《R语言手把手教你制作一个交互效应表》已经介绍怎么制作了，详细的可以去看一下。

天桥下的卖艺者·2023-10-16 13:53

生物信息学基础知识Day1

文章目录前言一、生物大分子1.DNA2.RNA3.蛋白质二、基因组、转录组和蛋白质组1.基因2.基因组3.转录组4.蛋白质组总结前言个人学习《R语言与Bioconductor生物信息学应用》的一些笔记。

抱紧我自己·2023-10-16 10:09

R语言——caret包机器学习的应用

参考文章：https://blog.csdn.net/jiabiao1602/article/details/44975741此代码主要用于我分析光谱数据，结果为二分类，此光谱数据共有128个波长，既128个特征。######数据的读入######setwd("C:/Users/chengdehe/Desktop/近红外")cheng<-read.csv("605_h4-1.csv",header

chengdehe·2023-10-16 10:48

SCI论文高效写作：Citespace、vosviewer和R语言在文献调研与论文撰写中的应用

文献计量学是指用数学和统计学的方法，定量地分析一切知识载体的交叉科学。它是集数学、统计学、文献学为一体，注重量化的综合性知识体系。特别是，信息可视化技术手段和方法的运用，可直观的展示主题的研究发展历程、研究现状、研究热点和发展态势。Citespace和vosviewer是使用最广泛的文献信息可视化软件工具，在理工、经管、法学、教育、农学、文史、医学、艺术等学科中普遍应用，发文量逐年显著上升。了解全

zmjia111·2023-10-16 04:01

利用R语言进行生态环境数据的可视化分析：方法和实践

R语言是一种用于统计分析、绘图的语言和操作环境，属于GNU系统的一个自由、免费、开源的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具1。

zmjia111·2023-10-16 04:01

Anaconda 下配置 R 环境并配置 Jupyter Notebook 的 R Kernel

本文将介绍如何在Anaconda中配置R环境，并配置JupyterNotebook的RKernel，以便于使用R语言进行数据分析和可视化。一、安装Anaconda首先，我们需要安装Anaconda。

ByteWhiz·2023-10-16 01:17

在C++中使用Protocol Buffers

更多详细的信息，请参考ProtocolBuffer语言指南，C++A

hanpfei·2023-10-15 22:53

在Java中使用Protocol Buffers

小毕先生·2023-10-15 22:16

filt3d通过卷积过滤带遮罩的图像（矩阵），R语言imagefx包，时序图像特征识别

filt3d通过卷积过滤带遮罩的图像（矩阵），R语言imagefx包，时序图像特征识别#TueOct1214:25:052021edit#字符编码：UTF-8#R版本：R4.1.1x64forwindow11

youmigo·2023-10-15 17:22

R语言导入TXT数据，最简单明了！！！

R语言导入TXT数据，最简单明了！！！

Guanghui Yu·2023-10-15 17:08

R语言中ggplot2绘制——随心所欲修改横纵坐标！！！

1、首先绘制一个自带的数据散点图：install.packages("ggplot2")#安装ggplot2包library("ggplot2")#加载该包ggplot(iris,aes(Sepal.Length,Sepal.Width))+geom_point()#绘制一个散点图2、修改横坐标（对原图进行修改）ggplot(iris,aes(Sepal.Length,Sepal.Width))+

Guanghui Yu·2023-10-15 17:37

R语言学习笔记——for循环

基本语法：for(iin()){}或for(iin1:n){}例一、为向量赋值x=0){y[i]<-8}else{y[i]<-7}}print(y)[1]77787x<-0y<-0#seq(1:n):生成一个连续序列for(iinseq(1:5)){x<-2*x+3y<-y+x}y[1]171例二、构造矩阵并赋值a<-matrix(0,5,5)#构造一个全为0的5×5矩阵for(iin1:5){f

去看海呀~·2023-10-15 15:32

r语言基础学习——数据对象

常用数据对象：1、向量2、矩阵3、列表4、数据框6、因子和表一、向量R语言最基本的数据类型是向量（vector）x<-c(1,5,2,4,5,7)#创建一个向量添加或删除向量元素：x<-c(x[1:3]

P-ShineBeam·2023-10-15 15:02

r连接db2 no license is present_R语言基础期中考试

一、单选题(题数：20，共40.0分)1下列用来转换数据框的函数是()(2.0分)2.0分A、as.listB、as.matrixC、as.data.frameD、as.vector我的答案：C2以下函数不能直接查看plot函数的帮助文档的是:(2.0分)2.0分A、?plotB、??plotC、help(plot)D、help(“plot”)我的答案：B3下列选项不是逻辑型数据的是()(2.0分

weixin_39775577·2023-10-15 15:31

R语言数据结构——变量、标量、因子

变量的赋值:使用"<-","<<-","=",常用"<-"1.2标量(scalar)R语言的基本数据类型是向量(vector)，标量是长度为1的向量，即长度为1的数据

Bio大恐龙·2023-10-15 15:55

R语言——基础（赋值、输入、截取数据中的一段数据、缺失值处理）

1将时间序列数据赋值a、调用c函数并将6个时序数据赋值给price；b、调用ts函数，指定price为时序变量，并设置起始时间为2015年1月，频率为12；c、输出结果为JanFebMarAprMayJun20151018266353172列输入a、调用scan函数，以列的方式读入6个数据。b、输出结果JanFebMarAprMayJun20151018266353173序列变换成loga、对前面

维生素软糖·2023-10-15 15:24

R语言——（一）、数据结构与基本运算

目录学习之前小技巧：1、数据类型2、数据对象2.1.1向量（vector）结构2.1.2矩阵结构2.1.3数组结构2.1.4因子结构2.1.5列表2.1.6数据框提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考学习之前小技巧：下载应用可进入微信搜索“软件管家”，任何大部分软件齐全。下载奥rstudio后，发现界面的字体非常小。我们可以进行调整字体以及界面样式：进行调整就好啦！快捷键：#清除所有历史变

小趴菜_·2023-10-15 15:54

R语言——赋值（= ，＜- ，＜＜-）

R语言R语言——赋值（=，也是被允许的，<-的方向也是意味着赋值的方向）功能重复了，一般在R中用<-进行赋值，=作为为子集赋“name”的存在。

福旺旺·2023-10-15 15:17

arcgis地理配准_【更新69篇】地理数据科学技术文章合集，欢迎大家点赞、在看、转发三连！...

公众号技术文章合集目录,目前已整理以下8个部分，共计69篇文章GIS基础GIS制图与空间分析地理数据分享与处理方法景观生态R语言/Python地理数据综合处理遥感与影像信息提取河口海岸各种软件工具和技巧总结文章附带练习数据

weixin_39673947·2023-10-15 12:53

arcgis中 shift数据重新定义投影_【更新82篇】地理数据科学技术文章合集，欢迎大家点赞、在看、转发三连！...

公众号技术文章合集目录,目前已整理以下8个部分，共计82篇文章GIS基础GIS制图与空间分析地理数据分享与处理方法景观生态R语言/Python地理数据综合处理遥感与影像信息提取河口海岸各种软件工具和技巧总结文章附带练习数据

weixin_39861498·2023-10-15 12:53

arcgis中 shift数据重新定义投影_【更新85篇】地理数据科学技术文章合集，欢迎大家点赞、在看、转发三连！...

公众号技术文章合集目录,目前已整理以下8个部分，共计85篇文章GIS基础GIS制图与空间分析地理数据分享与处理方法景观生态R语言/Python地理数据综合处理遥感与影像信息提取河口海岸各种软件工具和技巧总结文章附带练习数据

weixin_39652810·2023-10-15 12:23

IF：5+ 7种癌症免疫治疗证明DNA损伤反应通路突变可作为免疫检查点阻断疗效的潜在生物标志物

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你105篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用

桓峰基因·2023-10-15 09:40

使用R语言导入Excel数据

使用R语言导入Excel数据R语言是一种功能强大的统计分析和数据处理工具，可以轻松地导入和处理各种数据格式，包括Excel文件。本文将介绍如何使用R语言导入Excel数据，并提供相应的源代码示例。

代码艺术巧匠·2023-10-15 09:36

IF：4+ 膀胱癌RNA结合蛋白相关预后模型

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你71篇原创内容-->公众号最近分享了很多转录组的高级别分析

90066456ace6·2023-10-15 04:17

非约束排序2 主成分分析（PCA）第五章

第五章非约束排序2主成分分析（PCA）今天我们来学习一下赖江山老师的《数量生态学：R语言的应用第二版》第五章的正式内容了，今天主要讲的是主成分分析，也叫主分量分析，内容不少哦，开始吧。

fafu生信小蘑菇·2023-10-15 03:58

精选| 2017年12月R新包推荐

本文选摘了40个R包进行简单介绍，其余包大家可登录CRAN自行查看，希望有助于大家的学习，感谢大家对R语言中文社区的支持！一.计算方法1.

黄小伟Yeah·2023-10-15 03:27

学习小组Day5笔记-向量和数据框（李其龙）

向量标量与向量的区别首先我先restart一下我的RR语言学习第一篇：变量和向量这里也很清楚的写了关于变量和向量的知识。

李其龙_ec81·2023-10-15 01:29

【农业生产系统模型】基于R语言APSIM模型进阶应用与参数优化、批量模拟实践技术

随着数字农业和智慧农业的发展，基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM(AgriculturalProductionSystemssIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和NextGeneration两个系列模型，能模拟几十种农作物、牧

_遇见jia·2023-10-14 23:40

【R语言】--- 包(packages)的介绍及其使用方法

包R提供了很多可以直接调用的功能，这些基础的功能是R自带的。R不仅仅只具备基本的某些功能，其还可以通过可选模块的下载和安装来进行实现更多的功能。据统计，目前已经有大约2500多个包（packages）可以直接从由用户贡献的http://cran.r-project.org/web/packages进行下载安装使用。这些包包含了各种领域，包括地理数据分析、蛋白质质谱分析、心理测验分析及生态学分析等。

生态数据·2023-10-14 23:06

常见的作物模型有哪些？DSSAT模型、APSIM模型、WOFOST模型与PCSE模型等应用

小艳加油·2023-10-14 21:23

南丁格尔玫瑰图 With ggplot2【R语言】

前言之前在饼图中提到过，要整理一下南丁格尔玫瑰图的画法南丁格尔玫瑰图又名鸡冠花图、极坐标区域图，是南丁格尔在克里米亚战争期间提交的一份关于士兵死伤的报告时发明的一种图表。南丁格尔玫瑰图是在极坐标下绘制的柱状图，使用圆弧的半径长短表示数据的大小（数量的多少）。由于半径和面积的关系是平方的关系，南丁格尔玫瑰图会将数据的比例大小夸大，尤其适合对比大小相近的数值。由于圆形有周期的特性，所以玫瑰图也适用于表

万木春❀·2023-10-14 16:58

R语言~图例中的合并同类项

有时绘图，存在很多分类层次，需要用颜色，大小，线条类型来逐级区分，但是造成图例太多的情况，需要合并同类项。在网上找到了答案https://stackoverflow.com/questions/37140266/how-to-merge-color-line-style-and-shape-legends-in-ggplot以下示例基于自己的数据先上图加载工具包library(reshape2)l

Oodelay·2023-10-14 12:35

R语言ggplot2作图的时候给坐标轴添加文本π

image.png今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式，查了一下如何实现记录一下代码首先是构造一份数据集df<-data.frame(x=1,y=1)R语言ggplot2散点图并添加文本

小明的数据分析笔记本·2023-10-14 10:39

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2散点图展示PCA结果

论文是Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png这篇论文的数据是公开的，代码也公开了一部分，那我们就可以按照他的代码来学二代测序的数据分析啦今天我们来学习一些论文中Fig1c的画图代码，如下image.png数据对应的是论文中的sou

小明的数据分析笔记本·2023-10-14 01:23

R语言向量与矩阵

目录1.向量1.1介绍1.2使用1.2.1创建1.2.2运算1.2.3索引1.3相关函数1.3.1求长度1.3.2插入数据1.3.3删除2.矩阵2.1介绍2.2使用1.向量1.1介绍R语言中的向量与数学中的向量不同

ZDDWLIG·2023-10-14 01:20

r语言echarts画箱线图_echarts中箱线图的分析与绘制实例分享

echarts学习笔记之箱线图的分析与绘制详解一、箱线图Box-plot箱线图(Boxplot)也称箱须图(Box-whiskerPlot)，它是用一组数据中的最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数和最大值来反映数据分布的中心位置和散布范围，可以粗略地看出数据是否具有对称性。通过将多组数据的箱线图画在同一坐标上，则可以清晰地显示各组数据的分布差异，为发现问题、改进流程提供线索。什么是四分位数箱

weixin_39863759·2023-10-14 00:13

r语言echarts画箱线图_echarts学习笔记之箱线图的分析与绘制详解

一、箱线图box-plot箱线图(boxplot)也称箱须图(box-whiskerplot)，它是用一组数据中的最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数和最大值来反映数据分布的中心位置和散布范围，可以粗略地看出数据是否具有对称性。通过将多组数据的箱线图画在同一坐标上，则可以清晰地显示各组数据的分布差异，为发现问题、改进流程提供线索。什么是四分位数箱线图需要用到统计学的四分位数(quartile

練心·2023-10-14 00:12

R语言-使用箱型图进行数据异常值分析

R语言-使用箱型图进行数据异常值分析首先介绍本文章的主要内容：1.检查批量数据的完整性（录入不全）2.异常值分析（录入错误以及数据不合理）箱形图（英文：Boxplot），是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图

qq_38988257·2023-10-14 00:05

R语言|两因素重复测量方差分析

转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记：R语言：两因素重复测量方差分析01研究问题有研究将14名肥胖者随机分成2组，1组用A种减肥药，另一组用B种减肥药，坚持服药6个月，期间禁止使用任何影响体重的药物

小易学统计·2023-10-13 22:20

R语言caretEnsemble包搭建Stacking集成模型

R语言caretEnsemble包搭建Stacking集成模型caretEnsemble包简介小的tipscaretEnsemble搭建Stacking集成模型caretListcaretEnsemblecaretStack

嘛里嘛里哄·2023-10-13 21:28

R语言机器学习之caret包详解（二：模型的训练以及调参）

R语言机器学习之caret包详解（二：模型的训练以及调参）前言caret包模型调优的策略、示例、以及一些小tips前言在之前的博客中我们详细介绍过了数据的拆分策略、各种数据处理的方法、各种交叉验证的方法

嘛里嘛里哄·2023-10-13 21:27

R语言caret包结合自己的实际关注点对metric进行设置，并详细介绍defaultSummary等函数

R语言caret包结合自己的实际关注点对metric进行设置，并详细介绍defaultSummary等函数问题描述常见的回归模型评价指标平均绝对误差平均绝对百分比误差MSE(均方误差)RMSE(均方根误差