read.csv

R语言作图——Line plot with colored background

数据的格式如下图：Step2.绘图数据的读取data<-read.csv(“yourfilepath”,header=T)Step3.绘
生信了·2023-09-30 08:04

生信学习小组-Day5 - 三三

关键词R语言，数据类型，向量，数据框今日笔记向量来自生信星球1.赋值命令x数据框1.读取本地数据read.csv()read.csv()read.table()read.table()2.设置行名和列名
三三鹅_·2023-09-29 16:21

实验设计——R语言（DAY02：R语言基础操作）

R语言基础操作1.基础操作#文件读取geted()seted()file.choose()read.csv(file.choose())#保存文件save()#加载R文件load()#加载某个包的数据集
cyt—srhloveyou·2023-09-20 06:16

R语言读取csv文件

read.csvR语言用read.csv读取csv文件，读取返回一个data.frame的内存对象。
santiagoru·2023-09-19 18:46

R语言画多变量间的两两相关性图

语言代码：setwd("D:/Desktop/0000/R")#更改路径df<-read.csv("kaggle/Seed_Data.csv")head(df)df$target<-factor(df$
清纯世纪·2023-09-18 01:56

R语言用列数据画PCA带椭圆图

先放个原数据格式：datagrouplibrary("FactoMineR")library("factoextra")library("dplyr")data=read.csv("G:/TPTN
清珺·2023-09-15 23:17

rnaseq-R

library(ballgown)library(RSkittleBrewer)library(genefilter)library(dplyr)library(devtools)patient_data=read.csv
MissL_78e0·2023-09-15 05:28

Fig3-d 箱图的绘制 2020-12-17

数据准备与格式：读取数据d<-read.csv(file.choose())d导入需要的包：library(ggplot2)library(ggthemr)library(ggpubr)ggthemr(
RashidinAbdu·2023-09-09 08:57

不好好做图的NSC系列(九):ggplot2重现Nature文章折线图+多图叠加

setwd("F:/生物信息学/NATURE折线图")A<-read.csv("折线图.csv",header=T)ggplot(A,aes(x=Day,y=val
KS科研分享与服务·2023-08-24 09:37

R语言：联合多指标的ROC曲线

#加载数据和包rm(list=ls())library(pROC)library(ggplot2)setwd("C:/Users/syy/Desktop/MRI_lab/")data<-read.csv
MRI_lab·2023-08-24 07:27

2020-02-08 根据DAVID结果做图GOterm分析

##根据DAVID结果做图GOterm分析，数据格式从DAVID中下载，先保存至txt,后用excel打开，再保存为CSV格式x<-read.csv(file="C:\\Users\\zhouwenqing789
海阔天空周·2023-08-24 03:19

R语言13-R语言中的数据导入导出和批量导入

数据导入CSV文件：使用read.csv()函数导入逗号分隔的文本文件。
丰。。·2023-08-23 14:13

R分析实例1

汽车燃料效率#汽车燃料效率数据来源#'http://www.fueleconomy.gov/feg/epadata/vehicles.csv.zip'vehicles<-read.csv('C:\\Users
qclonle·2023-08-18 02:06

R语言实现线性回归

下面是一个使用R语言实现线性回归的示例程序：#Loadthedatadata<-read.csv("data.csv")#Splitthedataintotrainingandtestsetstrain_index
LiuTselin·2023-08-10 20:29

KEGG Pathway通路结果绘制气泡图

pathway富集分析气泡图（Bubble图）:数据结构及代码getwd()setwd("D:/Desktop/")#查看和修改工作目录library(ggplot2)#加载ggplot2包pathway=read.csv
小灰灰want_to_fly·2023-08-02 23:42

R语言绘图基础

2）颜色集合（3）调色板三、页面布局与图形组合1、用par函数布局页面2、用layout函数布局页面3、同时打开多个绘图窗口一、R语言的基本绘图函数1、高级绘图函数（1）plot函数data2_1<-read.csv
可乐　　·2023-08-02 14:51

解决R语言读取数据自动置换符号问题，例如把TCGA样本中的-读取为·

解决方案在使用R语言read.csv()函数读取csv文件时，会自动把TCGA样本中的-替换为.，为后续数据处理带来不便。
is_colorful·2023-07-24 20:02

R语言ROC曲线包

###pROC#####################install.packages("pROC")library(pROC)setwd()ROCR1<-read.csv("ROC1.csv")##
装在瓶子里的阳光_2a70·2023-07-23 20:43

学习小组day5笔记-曾俊辉

向量与数据框向量向量：多个元素组成的变量元素：数字或者字符串标量：单个元素组成的变量赋值:给变量一个数值，用<-赋值（以最后一次赋值为准）提取向量中的元素：x[]数据框获得数据框:X<-read.csv
aa麦·2023-07-22 14:09

2019-04-22

ggplot2")require("reshape")library(wesanderson)require("plyr")setwd("~/Documents/SD1/SD1_analyses/")ts=read.csv
Larrylu007·2023-07-22 05:51

R语言read.csv函数读取数据，报出错误：二进列运算符中有非数值参数

R语言read.csv函数读取数据，报出错误：二进列运算符中有非数值参数项目算法程序开发（win764bit）完后，把代码放在需要去现场部署的centos系统服务器上测试，R版本是3.5.2，除了一些编码方式需要修改外
巴顿庄园·2023-07-17 03:34

R和python中dataframe读取方式总结

./6group_count.csv",index_col=0)df而在R中读取的方式如下df=read.csv("./6group_count.csv",row.names=1)
我的心永远是冰冰哒·2023-07-15 02:55

R语言用逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测|附代码数据

在本文中，我们使用了逻辑回归、决策树和随机森林模型来对信用数据集进行分类预测并比较了它们的性能数据集是credit=read.csv("gecredit.csv", header = TRUE, sep
·2023-06-20 00:40

R语言改进的DCC-MGARCH：动态条件相关系数模型、BP检验分析股市数据

原始数据读取数据#data=read.csv("数据
·2023-06-20 00:59

r语言使用rjags R2jags建立贝叶斯模型|附代码数据

area,perimeter,campactness几个变量的贝叶斯建模,来查看他们对groovelength这个变量的影响，并且对比rjagsR2jags和内置贝叶斯预测函数的结果读取数据seed=read.csv
·2023-06-16 00:54

R语言学习系列之“多变的热图”

公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程：生物信息学教学前段时间我们更新过一篇推文热图系列1，隶属R语言学习系列，今天我们继续热图系列2导入数据library(pheatmap)TEST=read.csv
生信小课堂·2023-06-12 20:13

r股票数据接口读取CSV文件

r股票数据接口C++代码二、读取CSV文件1、读取csv文件应使用read.csv()函数read.csv("path")；2、csv文件被默认加载为数据帧，即data.frame格式
l2接口·2023-06-07 01:51

Fig2-c 纵轴log化的带标签散点图Scatter Plot的绘制 2020-12-14

image.png重点：1）散点图上带标签2）纵轴log化（即：ggplot2::scale_y_log10()的应用）具体实现如下：3.7.1数据格式image.png读取数据：l1<-read.csv
RashidinAbdu·2023-04-18 16:00

R语言做单因素方差分析

R语言做单因素方差分析检验三组与三组以上数据（需满足正态，方差，独立）整理数据保存CSV格式打开Rstudiogetwd()#查看工作目录read.csv("filename")df<-read.csv
μμ豆奶·2023-04-17 07:26

R语言作图——Density plot

数据的格式如下图：一列表示一种变量，第一行是列名imageimageStep2.绘图数据的读取data<-read.csv(“yourfile
生信了·2023-04-13 06:38

R语言初学笔记：差异表达基因

"E:/GSE25066")#环境设置library(limma)#加载差异分析包limma#将分组文件加载到环境中，分组信息第一列为样本名，第二列为分组信息如“high”“low”targets<-read.csv
麦子菇娘·2023-04-11 18:26

学习小组Day5笔记--Xiaofan1991

read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)a<-read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)三、设置行名和列名X<-read.csv
xiaofan1991·2023-04-08 12:19

R合并表格

>library(dplyr)>info=read.csv("test.csv",header=T)>head(info)celltype1w11_1:CELL2755_N1EX_migrating_newborn2w11
SnorkelingFan·2023-04-07 04:38

R语言作图——Scatter plot with marginal density

作图数据格式如下：（今天偷懒啦，直接借用了iris数据集）数据格式Step2.绘图数据的读取data<-read.csv(“yourfilepath”,header=T,check.names=F)#注
生信了·2023-04-07 03:08

如何在散点图里添加特定标签

>dat=read.csv("xxxx.csv",header=TRUE,sep=",")>colnames(dat)[1]"gene_id""geneModuleMembership""geneTraitSignificanc
生信start_site·2023-04-06 08:48

R语言基于mediation包行中介效应分析

我们先导入数据和R包library(mediation)bc<-read.csv("E:/r/test/yimin.csv",sep=',',header=TRUE)我们先来
天桥下的卖艺者·2023-04-01 02:22

R语言beeswarm函数画图

library(readxl)sourceData<-read.csv("D:/sourceData-NEW1.csv",stringsAsFactors=FALSE)#加载csv文件View(sourceData
liqingtx·2023-03-31 15:53

ComplexHeatmap画基因突变热图(一)

若某个基因在某个样本中既有deletion又有mutation则以;分隔library(ComplexHeatmap)library(RColorBrewer)setwd("E:/project/r")data1<-read.csv
elaine0622·2023-03-30 03:39

R语言交补集数据处理

一、交集——Merge函数rm(list=ls())setwd('/lab412C/LSM/蛋白质谱/蛋白质谱-RNAseq/缺少的300个')data1<-read.csv(file="all.csv
ShanSly·2023-03-29 18:34

第六学习小组day5-gl

#从1-10之间所有的整数x<-seq(1,10,by=0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）x<-rep(1:3,times=2)#1-3重复2次数据框获得示例数据X<-read.csv
Aloptna·2023-03-29 16:05

用R语言对基因进行KEGG分析（附详细代码）

1、所需的数据类型（只需要一列geneid即可分析）2、分析代码：rm(list=ls())genelist<-read.csv("C:/Users/user/Desktop/结果文件/pathway/
佛系盼毕业·2023-03-29 05:21

clusterprofiler包进行GO与KEGG富集分析

RNA-seq寻找到差异基因后，对比GO与KEGG库进行差异分析rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)DEG<-read.csv('.
twistti·2023-03-29 04:28

clusterProfiler进行GSEA富集分析

1.载入包，读入数据rm(list=ls())setwd("your_dir")#readthefilemydata<-read.csv("your_diff_expr_file",row.names=
qq_27390023·2023-03-29 04:38

Fig2-d 泡泡图的绘制2020-12-14

气泡图Bubbleplot的绘制气泡图用于多维数据的展示，即：1）不同动物2）不同物种3）物种数量（泡泡大小）4）物种丰度（泡泡颜色的深浅）首先需要的数据与格式：image.png读取数据bubble<-read.csv
RashidinAbdu·2023-03-27 00:24

2022-09-19一张图画多个KEGG富集结果

输入文件示例；Species用于指定不同的分组脚本library(ggplot2)pathway=read.csv("kegg1.csv",header=TRUE,check.names=FALSE)head
AsuraPrince·2023-03-26 02:25

R语言dplyr

nycflights13")library(nycflights13)library(tidyverse)打开文件getwd()##查看默认存储路径，再将csv文档存入文件夹打开library(readxl)read.csv
小新122·2023-03-20 09:27

帮老婆写时序分析

Mfuzz"author:"tf"date:"2021/09/05"#-----rm(list=ls())setwd('/Users/zhangjuxiang/Desktop/Rtimeseq/')df<-read.csv
SolomonTeng·2023-03-15 02:15

R语言用逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测|附代码数据

在本文中，我们使用了逻辑回归、决策树和随机森林模型来对信用数据集进行分类预测并比较了它们的性能数据集是credit=read.csv("gecredit.csv", header = TRUE, sep
·2023-02-18 00:55

转录组不求人系列(十三): GO、KEGG富集个性化作图

setwd("F:/生物信息学")A<-read.csv("GO.csv"
KS科研分享与服务·2023-02-16 22:48

excel行列转置

library(tidyverse)X<-read.csv(file="data_RNA_Seq_v2_mRNA_median_Zscores.csv",sep="\t",header=T,row.names
梦幻天堂_ccd5·2023-02-06 11:00
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