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torch_geometric
PyTorch Geometric(
torch_geometric
)简介
在深入探讨PyTorchGeometric(通常简称为PyG)之前,我们先了解一下它的背景和应用。PyG是基于PyTorch的一个扩展库,专为图数据和图网络模型设计。图网络是深度学习领域的一种强大工具,它能够处理结构化数据,如社交网络、分子结构、交通网络等。PyTorchGeometric的主要功能数据处理与加载:图数据的简化表示:PyG提供了一种高效的方式来表示和存储图数据。主要是通过Data对
小桥流水---人工智能
·
2024-08-30 06:32
机器学习算法
深度学习
人工智能
pytorch
人工智能
python
torch_geometric
和torch的版本匹配问题
安装
torch_geometric
建议直接在网站下载安装。
Sinsinw
·
2024-02-20 06:31
屡试不爽的
torch_geometric
安装方法
个人因为换电脑安装了2次,都成功了,记录一下,方便大家交流学习和自己下次安装。一、torch安装torch是个开源的机器学习库,用于构建神经网络和各种机器学习或深度学习模型。安装torch本身很简单,但是需要考虑是否和自己的python版本兼容。例如:python-3.7.x与torch-1.12.0可以兼容,但python-3.8.x就不行了。我比较习惯用python-3.7版本了,所以两次都是
快乐旺仔小馒头
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2024-01-27 23:03
python
pytorch
深度学习
成功解决ImportError: Failed to load PyTorch C extensions:
个人觉得这个方法有点玄乎……我做的是一个调用
torch_geometric
跑gcn的分类预测项目,之前都好好的,能直接跑,今天下午打开电脑突然不行了,(jupyternotebook)提示的问题是:就很莫名其妙啊
快乐旺仔小馒头
·
2024-01-27 23:02
调bug
python
python版本3.7情况下安装rdkit,
torch_geometric
,numpy的过程
前言在上一篇中,我是在anaconda自带的python3.9的环境下安装的
torch_geometric
,相对来说步骤比较少,一个下午就安装好了,但是在最近接触的一篇论文中需要用到rdkit这个包,我尝试在这个虚拟环境下安装
CWQF-T
·
2024-01-26 19:54
python
numpy
深度学习
torch_geometric
,scatter,sparse, cluster的安装
本人菜鸟一枚,搞了两天才把
torch_geometric
,scatter,sparse,cluster的安装搞定,中间几度抓狂,现记录下来过程以防后面需要帮别人安装。
菜丢
·
2024-01-01 10:31
macos M系列 安装
torch_geometric
torch-sparse torch-cluster torch-scatter 等库
背景默认电脑已经安装好Anaconda环境笔者配置为MacBookPro14寸CPU为M1Pro方法一针对你的torch版本去官网下载对应的whl文件然后pip安装地址为:https://pytorch-geometric.com/whl/下载好后运行指令pipinstall下载路径/torch_sparse.......whl方法二直接终端输入指令先安装指定版本的torch以2.0.1为例pip
zoe_ya
·
2023-12-27 08:13
macos
torch_geometric
笔记:global_mean_pool
对全图的点嵌入(nodeembedding)进行池化操作,返回一个图嵌入(graphembedding)global_mean_pool(x,batch,size=None)[x(torch.tensor)输入的点嵌入batch(torch.tensor)指示点属于哪个图size(optional)图的数量,可以自动推断得到
UQI-LIUWJ
·
2023-10-29 05:03
pytorch学习
深度学习
torch_geometric
笔记:TORCH_GEOMETRIC.UTILS(更新中)
1torch_geometric.utils.add_self_loopsadd_self_loops(edge_index,edge_weight:Optional[torch.Tensor]=None,fill_value:float=1.0,num_nodes:Optional[int]=None)在edge_index中,对图上每个节点i,添加一条边(i,i)参数介绍edge_index(
UQI-LIUWJ
·
2023-10-29 05:33
pytorch学习
pytorch
深度学习
神经网络
torch版本对应的
torch_geometric
与torch-sprse/cluster/scatter库的正确安装
torch_geometric
官网:Installation—pytorch_geometricdocumentation使用上述标红命令即可快速安装需要的包(确定自己环境中安装的pytorch版本以及
ASS-ASH
·
2023-10-19 18:13
Python与相关环境
算法
python
人工智能
java
程序员
torch_geometric
获取datasets(解决连不了外网的问题)
Cora数据集的代码3.解决程序运行的机器无法联网的问题3.1尝试运行,查看数据集下载链接3.2放置到对应文件夹下3.3重新运行之前写的程序4.一点感慨1.torch_geometric.data介绍
torch_geometric
薛钦亮
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2023-10-02 21:41
python从入门到入土
深度学习
pytorch
神经网络
图神经网络
pyg
GNN PyG~
torch_geometric
学习理解
目录1.PyGIntroduction2.PyGInstallation2.1PyG安装常见错误及原因2.2PyG具体安装步骤3.torch_geometricpackagestorch_geometric.data.DataDataset与DataLoaderDropout、BatchNorm3.torch_geometric:理解edge_index3.1理解mini-batchedgeind
天狼啸月1990
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2023-10-02 21:10
学习
PyG/
torch_geometric
的一些坑
安装PyGimportosimporttorchos.environ['TORCH']=torch.__version__print(torch.__version__)!pipinstall-qtorch-scatter-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-${TORCH}+${CUDA}.html!pipinstall-qtorch-sparse-fhttps://
FantasyJXF
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2023-10-02 21:10
GNN
torch_geometric
PyG
图神经网格
GNN
将数据包装成一个图数据结构(
torch_geometric
)
importtorchfromtorch_geometric.dataimportDatax=torch.tensor([[0,1],[2,3],[4,5]],dtype=torch.float)#节点特征矩阵(三个节点,每个节点两个特征)edge_index=torch.tensor([[0,1,1,2],[1,0,2,1]],dtype=torch.long)#边索引矩阵(四条边,每条边包含两
清纯世纪
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2023-10-01 02:53
记录小知识
pytorch
深度学习
人工智能
正确安装
torch_geometric
库
step1:查看pytorch+cuda版本torch-scattertorch-sparsetorch-clustertorch-spline-conv这些关联包要与torch版本匹配。importtorchprint(torch.__version__)print(torch.cuda.is_available())torch.version.cuda或者piplist查看版本step2:下载
夏日轻风有你
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2023-09-08 02:31
pytorch
安装
torch_geometric
安装
torch_geometric
需要相应的依赖torch_scattertorch_sparse这两个依赖和pytorch版本强绑定,所以需要访问https://pytorch-geometric.com
Mr.RottenPeach
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2023-09-08 02:01
笔记
graph
【操作记录】pytorch_geometric安装方法
pytorch版本,我的是Win10Python3.8.3+Pytorch1.8.1+CUDA10.2手动下载四个依赖包本地安装:主要不要直接:pipinstalltorch_geometric这样会安装最新的
torch_geometric
cskywit
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2023-08-30 07:07
pytorch
人工智能
python
torch_geometric
实现GCN和LightGCN
torch_geometric
实现GCN和LightGCN题记demo示意图GCN代码LightGCN代码参考博文及感谢题记使用
torch_geometric
实现GCN和LightGCN,以后可能要用,
只是一个代号不必认真
·
2023-08-28 18:33
推荐系统
Pytorch
图神经网络
pytorch
人工智能
python
深度学习(37)—— 图神经网络GNN(2)
深度学习(37)——图神经网络GNN(2)这一期主要是一些简单示例,针对不同的情况,使用的数据都是
torch_geometric
的内置数据集文章目录深度学习(37)——图神经网络GNN(2)1.一个graph
柚子味的羊
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2023-08-13 07:50
图神经网络
深度学习
神经网络
人工智能
图神经网络
torch、torchvision、
torch_geometric
、torch-scatter、torch-sparse的安装版本对应问题
首先查看自己的GPU的cuda,然后安装对应的CUDA和CUdnn,然后下载对应版本的torch和torchvision,下载网站https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html,这里注意有一个折磨我半天的大坑,pip安装torchvision的时候会自动下载它对应版本的CPU版的torch,所以应该先安装torchvision,然后卸载CPU版
celine_lee
·
2023-08-01 08:20
python
pytorch
深度学习
GNN环境安装
参考:
torch_geometric
踩坑实战–安装与运行亲测有效!!
樱木之
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2023-07-20 10:15
人工智能
3步安装
torch_geometric
想使用PytorchGeometric实现GCN、GraphSAGE和GAT,首先模块直接报错。安装步骤:1打开当前环境所在的命令行,输入python查看python版本;输入importtorch和torch__version__#双下斜杠查看torch版本;输入torch.version.cuda查看cuda版本。2下载安装所需组件链接:https://pytorch-geometric.co
sweettea~
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2023-07-18 07:40
Python
Python环境配置
Python常见报错
python
深度学习
pytorch
【python+pycharm+pip安装
torch_geometric
】
安装
torch_geometric
:python+pycharm+pip本文针对python(无anaconda)+pip方式安装cpu环境下的
torch_geometric
第一步:查看自己的torch
qq_44533176
·
2023-06-24 10:04
python
pycharm
pip
安装
torch_geometric
torch_geometric
是用pycharm学习图神经网络时候会用到的一个包,安装方法如下:1.先找到对应的包先在https://pytorch-geometric.com/whl/里面找到对应自己电脑上
CWQF-T
·
2023-06-23 05:18
python
pytorch
开发语言
torch_geometric
踩坑实战--安装与运行 亲测有效!!
torch_geometric
是PyG中必不可少的一个包,也是进行图神经网络学习的必备,然而安装这个包并运行一段简单的代码踩了不少坑,记录一下。
小汤爱学习
·
2023-06-23 05:47
深度学习
pytorch
python
No module named ‘
torch_geometric
‘解决办法——PyG(PyTorch Geometric)安装教程
1、查询已安装的torch版本一定要先查询自己的torch版本,也不同版本的依赖跟库都是不一样的。importtorchprint("torch版本:",torch.__version__)输出结果:2、安装依赖2.1进入官网下载依赖。官网下载链接:官网下载链接,进入官网找到自己对应的版本;这里要仔细看清楚,一共需要下载四个依赖包,根据自己的Python版本(cp39表示的就是Python3.9)
蜡笔大新home
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2023-06-19 19:11
笔记
pytorch
深度学习
GCN
No module named ‘
torch_geometric
‘解决办法
参考链接:https://blog.csdn.net/weixin_47779152/article/details/120570367https://data.pyg.org/whl/torch-1.12.0%2Bcu113.htmlhttps://blog.csdn.net/qq_44832009/article/details/129351554https://blog.csdn.net/q
碧寒
·
2023-06-19 19:08
pytorch
深度学习
python
pycharm使用之
torch_geometric
安装
正式安装之前要先查看一下torch的版本一、查看torch版本1、win+R,输入cmd2、输入python3、输入importtorch,然后输入torch.__version__,最后回车可以看到我的torch版本是1.10.0二、下载合适的版本1、打开链接https://pytorch-geometric.com/whl/2、选择对应的torch版本有cude的就选择对应的cuxxx,没有的
奶茶可可
·
2023-06-17 18:17
python与R的bug记录
pycharm
python
深度学习
pytorch低版本找到并安装
torch_geometric
对应版本
一、找到官网的安装命令不同版本的
torch_geometric
对应的安装命令不完全一致,因此我们需要首先找到所需
torch_geometric
版本的正确安装命令。然后再去找对应的版本。
me_yundou
·
2023-06-13 20:05
环境配置
pytorch
【图神经网络之神器】
torch_geometric
GCN/GraphSAGE/GAT代码导包importtorchimporttorch.nn.functionalasFfromtorch_geometric.nnimportGCNConv,SAGEConv,GATConvfromtorch_geometric.datasetsimportPlanetoid导入数据集dataset=Planetoid(root='./tmp/Cora',name
三石大数据
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2023-04-21 20:13
知识图谱
神经网络
深度学习
机器学习
pytorch
图计算
图神经网络 pytorch GCN
torch_geometric
KarateClub 数据集
图神经网络安装Pyg首先安装
torch_geometric
需要安装pytorch然后查看一下自己电脑Pytorch的版本importtorchprint(torch.
浩浩的科研笔记
·
2023-04-17 21:21
图信号
pytorch
神经网络
python
关于transformer 学习、
torch_geometric
1、nn.TransformerEncodernn.TransformerEncoder是PyTorch中的一个模块,用于构建Transformer模型中的编码器。Transformer是一种强大的序列到序列模型,广泛应用于自然语言处理的各个领域。在nn.TransformerEncoder中,我们可以定义多个nn.TransformerEncoderLayer,每个nn.TransformerE
一条咸鱼在网游
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2023-04-17 12:32
transformer
学习
深度学习
【Python】安装
torch_geometric
、以及torch_scatter系列安装
【Python】安装
torch_geometric
、以及torch_scatter系列安装文章目录【Python】安装
torch_geometric
、以及torch_scatter系列安装1.介绍2.方法
笃℃
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2023-04-15 17:31
#
Python
使用说明
python
使用 PyTorch Geometric 和 GCTConv实现异构图、二部图上的节点分类或者链路预测
解决问题描述使用PyTorchGeometric和HeterogeneousGraphTransformer实现异构图上的节点分类在二部图上应用GTN算法(使用
torch_geometric
的库HGTConv
_刘文凯_
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2023-04-15 16:10
深度学习
图神经网络
神经网络
GTN
图深度学习
[图神经网络]PyTorch简单实现一个GCN
一、环境构建①安装
torch_geometric
包。pipinstalltorch_geometric②导入相关库importtorchimporttorch.nn.function
ViperL1
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2023-04-13 06:59
神经网络
学习笔记
pytorch
神经网络
深度学习
图神经网络库
torch_geometric
下载
下载地址:官网下载地址直接运行官网给出的命令会出现错误:error:MicrosoftVisualC++14.0orgreaterisrequired.出现这个错误的原因下载这个安装包需要用到c++编译工具,一种解决方法是直接把需要的关键包下载到本地文件夹再pipinstalltorch-geometric进入以下网址,找到对应pytorch版本的链接,点进去,选择该版本下对应的torch-geo
Coder Bin
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2023-03-24 02:09
机器学习笔记
神经网络
pytorch
深度学习
图神经网络系列【PyTorch & geometric】
torch_geometric
基础全回顾
山再高,往上攀,总能登顶;路再长,走下去,定能到达。作者主页:追光者♂个人简介:计算机专业硕士研究生、2022年CSDN博客之星人工智能领域TOP4、阿里云社区特邀专家博主、CSDN-人工智能领域新星创作者、预期2023年10月份·准CSDN博客专家【无限进步,一起追光!】欢迎点赞收藏⭐留言回顾在“图神经网络”中常用到的经典框架——geometric&PyTorch。较为详细地介绍torchgeo
追光者♂
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2023-03-24 02:31
图神经网络
PyTorch
geometric
torchgeometric
人工智能
安装完torch geometric,import
torch_geometric
然后报错:OSError: [WinError 127] 找不到指定的模块
1、出错原因:对于importtorch_geometric,然后报错:OSError:[WinError127]找不到指定的模块。我出错的原因是:pytorch的版本我用的是1.4,但是我在安装scatter、sparse、cluster和spline这四个包的时候,我直接去官网复制了torch1.5对应的包,所以错了。总的来说,我的这个错误是版本问题。2、解决方法:查看你安装的pytorch版
Ma Sizhou
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2023-02-05 09:23
PyTorch
python
pytorch
报错:No module named ‘torch_scatter.scatter_cuda‘ 适用gpu版的pytorch环境的
torch_geometric
安装
2020/9/16安装安装目的:跑CGC-Net(FATURE_EXTRACT)报错:Nomodulenamed'torch_scatter.scatter_cuda'参考:https://www.cnblogs.com/yqpy/p/13498200.html参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/138826540参考:https://blog.csdn.net/m0_
谛听先生和橘子小姐
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2023-02-05 09:52
pytorch
深度学习
No module named ‘
torch_geometric
‘报错
目录一、打开当前环境所在的命令行二、查看torch版本和cuda版本三、下载安装所需要的组件四、安装pyg一、打开当前环境所在的命令行输入python查看python版本二、查看torch版本和cuda版本importtorchtorch__version__#双下斜杠torch.version.cuda可以看到我的Python版本是3.6torch版本是1.9.1cuda版本是11.1三、下载安
opɹɐɔıᴚ
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2023-02-05 09:17
GNN
pytorch
深度学习
python
graph
torch_geometric--Convolutional Layers
torch_geometric
–ConvolutionalLayers卷积层MessagePassing式中口口口表示可微的排列不变函数,例如:sum,mean,min,max或者mul和γΘ\gamma
发呆的比目鱼
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2023-02-03 17:53
图神经网络
python
深度学习
win10安装cuda10.1+cudnn7.6.4+pytorch1.4.0及
torch_geometric
cuda10.1安装相比linux安装要简单很多,打开https://developer.nvidia.com/cuda-downloads点击蓝框进行下载,这个下载很快。https://docs.nvidia.com/cuda/archive/10.1/cuda-installation-guide-microsoft-windows/index.html这是英伟达官网的下载文档说明,如果想万无
宅顶聪明
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2023-02-02 10:15
pytorch
windows
10
torch_geometric
笔记: 数据集Cora &简易 GNN
1获取数据集该数据集用于semi-supervised的节点分类任务fromtorch_geometric.datasetsimportPlanetoiddataset=Planetoid(root='/tmp/Cora',name='Cora')dataset.num_classes#7#节点一共七个类dataset.num_features#1433#每个点1433个特征len(dataset
UQI-LIUWJ
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2023-02-02 07:00
pytorch学习
pytorch
深度学习
windows安装CPU版本
torch_geometric
教程
由于最近需要搞图神经网络(GNN),因此需要安装torch_genmetric:GraphNeuralNetworkLibraryforPyTorch,torch_genmetric封装了图神经网络常用的算法,例如GCN(图卷积网络)、GAT(图注意力网络)等等,因此安装其是十分必要的。本人环境配置:系统:windows10,python版本:3.6.1,pytorch版本:1.5.0+cpu在尝
带鱼工作室
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2023-02-02 07:59
Pytorch
神经网络
windows
图神经网络
深度学习
node classification:基于
torch_geometric
(PyG)框架搭建简单GCN网络对Cora数据集进行训练测试
参考文章:GNN的第一个简单案例:Cora分类PyG文档之二:快速入门1、Cora数据集(1)GNN常用的数据集:https://linqs.soe.ucsc.edu/data(2)Cora数据集是GNN中的一个经典数据集,相当于mnist数据集在CNN中的地位。该数据集是机器学习论文之间的引用网络,共有2708篇论文(即:节点数量)、7类论文(即:节点类别数)、5429条边,每个节点有1433个
会飞的咩咩
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2023-02-02 07:59
GNN
GNN
PyG
torch_geometric
(pyg)的介绍和简单使用
前言最近做毕业设计,需要用到图神经网络(以下简称GNN)。由于刚入门GNN,不想看大段的公式和相关论文(然而事实证明该看的永远逃不了),所以怎么办?百度上找呗!因为自己平时用pytorch比较多,所以找到了基于pytorch的图神经网络库,pytorch_geometric(以下简称pyg)。在用这个库的过程中,由于这个库“约定大于配置”的一些特性,也遇到了许多坑,而中文资料中,大多都是直接翻译文
卡拉叽里呱啦
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2023-02-02 07:29
在深度学习的海洋里
pytorch
深度学习
图神经网络
win10下
torch_geometric
安装踩坑记
安装过程要特别注意安装包版本、vs版本这两个问题!初次尝试按照网上的说法,使用了以下命令行安装:pipinstall--no-cache-dirtorch-scatter==1.3.1pipinstall--no-cache-dirtorch_cluster==1.4.3pipinstall--no-cache-dirtorch_sparse==0.4.0出现了ERROR:Commanderror
zjf6738
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2023-01-31 12:34
python
机器学习
神经网络
深度学习
pytorch
torch_geometric
-- Pooling Layers
torch_geometric
–PoolingLayersglobal_add_pool通过在节点维度上添加节点特征来返回批量图级输出,因此对于单个图它的输出由下式计算fromtorch_geometric.nnimportglobal_mean_pool
发呆的比目鱼
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2023-01-31 12:32
图神经网络
深度学习
人工智能
python
Datawhale GNN组队学习-Task 07
此基类与Torchvision的Dataset类的概念密切相关,这与第6节中介绍的
torch_geometric
lingwenzhenjun
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2023-01-31 12:32
GNN理论与实践
神经网络
pytorch
pyg Symbol not found: __ZN2at8internal13_parallel_runExxxRKNSt3__18functionIFvxxmEE
/anaconda3/envs/yolo/lib/python3.8/site-packages/
torch_geometric
/data/__init__.py",line1,infrom.dataimportDataFile
农民小飞侠
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2023-01-31 11:39
pytorch
pytorch
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