人类暴露组学Human Environmental Exposome

今天在Cell杂志上发现一篇文章 《Dynamic Human Environmental Exposome Revealed by Longitudinal Personal Monitoring》

第一次听说暴露组学，很好奇！先翻译一下摘要看看。
摘要：人类的健康是依赖于自身暴露的周围环境的，但周遭的环境的多样性和变化性还知之甚少。我们开发了一个灵敏的方法去连续890天监测15个人在66个不同地理位置的自身暴露的周围空气和化学物质，以及其他的暴露物质。我们发现个体潜在的暴露在成千上万种的物种和包括杀虫剂和致癌物在内的化学物质。个人的生物和化学暴露组是高度动态化和时空化的，甚至在相同地理位置的个人间也存在巨大差异。综合的分析生物和化学暴露组揭示了非常强的位置依赖关系。最后，一个暴露组相关网络的构建展示了以一种独特而连续的包括人，植物，宠物和节肢动物人和周遭环境相互关系。总的来说，人类暴露组是多样，动态，时空驱动的一个相互作用的网络，潜在地影响着人类健康。

翻译的实在太烂，感兴趣的还是去读原文吧！

这篇文章中的数据量非常大，文中的数据分析和可视化值得学习。更好的是，文章附件中给分析和可视化的代码，Rmarkdown形式的，接近8000行的代码！！！正文文件也有40M。

上文中的几张图感受一下。

文章的暴露组学的实验设计

该文章暴露组学的实验设计

暴露的微生物物种

暴露的微生物物种

暴露组与个体和地理位置的变化

暴露组与个体和地理位置的变化

季节对暴露组影响

季节对暴露组影响

非生物因素的暴露与生物因素暴露的相关性

非生物因素的暴露与生物因素暴露的相关性

Extensive Pan-Domain Intraspecies Variation in the Exposome

Extensive Pan-Domain Intraspecies Variation in the Exposome

暴露组互作网络图

暴露组互作网络图

正文总共7张图，主要的分析和可视化都在R中进行，还提供代码，实在是学习的好模板！