- 2021-10-06
多去看看
下载完数据后,一用do.call(dplyr::bind_rows,diagnose)然后去clinical$demographic两者用patient_id合并,可以得到数据现在做单因素分析,然后lasso回归分析已经得到数据表,单因素分析需要什么?似乎需要的数据不多,看看怎么弄做单因素分析:基因表达值,生存状态:死亡或者存活,生存时间那剩下的那些是个什么鬼生存分析,生存时间,生存状态生存分析模
- R语言dplyr过滤指定字符的行
不懂python不懂R
R语言r语言
过滤df数据框中,Class列中,含有字符"a",“b”,"c"的行df1%filter(Class%in%c("a","b","c"))
- [R] First Section Revision
EricWang1358
Rr语言开发语言
Testwhetheryouhaveunderstoodallthecodesbelow:setwd()getwd()diabetes=c("Type1","Type2","Type1","Type2","Type2","Type2","Type1","Type1","Type2","Type1")install.packages(tydiverse)library(dplyr)detach("p
- 04.寻找所有亚群的差异基因并输出
科研小徐
为方便注释时查看,及文章发表时上传补充材料。对所有亚群的marker基因进行文件输出rm(list=ls())library(Seurat)library(dplyr)load(file='pbmc-noann.rdata')pbmc=scepbmc.markers%group_by(cluster)%>%slice_max(n=2,order_by=avg_log2FC)write.table(
- R如何将表格作为注释添加到图形中
R语言与SPSS学习笔记
如果您想将表格放在图形的内部,可以使用annotation_custom()函数将表格作为图形的注释添加到ggplot图形中。以下是示例代码:library(ggplot2)library(gridExtra)library(kableExtra)library(dplyr)#创建一个示例的ggplot图形plot1%kable()%>%kable_styling(bootstrap_option
- R语言-dplyr包进行条件均值
PriscillaBai
实际处理数据中,我们往往需要将某变量分组进行运算,dplyr包中的group_by和summarise函数联合使用,会让code变得更简洁。library(dplyr)##读取tsv格式文件data%group_by(age)%>%summarise(friend_count_mean=mean(friend_count),friend_count_median=median(friend_cou
- Error in `arrange()`: ! Can‘t transform a data frame with `NA` or `““` names.
Rosebud的记录本
Rr语言
问题:给Taxonomy排序,并筛选OTU表中存在的根据提示运行:rlang::last_error(),显示:Backtrace:▆1.├─dplyr::arrange(taxonomy,phylum,class,order,family,full)2.├─dplyr:::arrange.data.frame(taxonomy,phylum,class,order,family,full)3.│
- 2.R运行前准备——代码
denghb001
代码在刚开始时,你可能一直在使用控制台来运行代码。这是一个很好的起点,但是当您创建更复杂的ggplot2图形和dplyr管道时,您会发现它很快就会变得狭窄。为了给自己更多的工作空间,最好使用Rstudio脚本编辑器。通过单击“文件”菜单,然后选择“新建文件”,然后选择“R脚本”或使用键盘快捷键Cmd/Ctrl+Shift+N来打开它。现在您将看到四个窗口:image脚本编辑器是放置您运行代码的好地
- dplyr1.0.0 重点内容 across()、slice_*()、nest_by()、mutate(.keep, .names, .before, .after)、rowwise()、rel...
热衷组培的二货潜
title:"dplyr1.0.0重点内容"author:"qliu"date:"2020/6/5"output:html_document翻译链接为:MyFavoritedplyr1.0.0Features加载包和数据#install.packages("AmesHousing")library(AmesHousing)library(tidyverse)ames_data%janitor::c
- Seurat4.0 系列教程1 分析流程
zhengxj_
Seurat4.0几何学
library(dplyr)library(Seurat)library(patchwork)#LoadthePBMCdatasetpbmc.data<-Read10X(data.dir="G:/practice/singlecell/pbmc3k/filtered_gene_bc_matrices/hg19/")#InitializetheSeuratobjectwiththeraw(non-n
- 生信星球学习小组第129期Day6-爆爆
爆不了米花
今天以dplyr为例学习R包,可怜我的小破电脑安装不了包,只能先将文字版本整理下来dplyr包是用于数据清理的高效R包,是tidyverse的核心包之一安装和加载R包设置镜像https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWwoptions("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRA
- in r, 找出所有重复的元素,包括第一个 R语言|如何筛选所有的重复行(包括第一行重复在内)
生信小博士
r语言开发语言
library(dplyr)data%group_by(type)%>%#根据你要筛选的列进行分组filter(duplicated(type)|n()!=1)%>%#将该列中有重复的行挑选出来ungroup()方法二#示例向量x<-c(1,2,3,2,4,5,5,6)#找出所有重复的元素(包括第一次出现的)duplicates<-duplicated(x)|duplicated(x,fromLa
- r语言svr模型_R建立SVR模型,并用遗传算法优化
weixin_39760433
r语言svr模型
刚刚尝试在建立了SVR模型之后,再用遗传算法优化SVR的cost和gamma参数,给大家分享下,有错误的欢迎指正~rm(list=ls())#loadpackagelibrary(stringr)library(dplyr)library(openxlsx)#readdatagaseread.xlsx("D:/3_analytic_case/1_gase_data_pred/原始数据.xlsx",
- R语言提高效率的技巧方法(1)
weixin_49320263
常用方法r语言开发语言
1、批量导入包library(pacman)p_load("dplyr","survival")2、查看R包使用方法help(package="survival")3、查看R包内所有函数library("survival")all_functions<-ls("package:survival",pos=1)4、查看具体函数注释和用法db<-tools::Rd_db("dplyr")#获取R包内所
- 学习小组Day6笔记--Drku
DrKu
今天主要学习一个dplyr包老规矩,走流程step1安装包options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")if(!require(dplyr))install.packages("dplyr")li
- 利用R语言把某网站的所有那啥妹子都爬了下来!
jackGan
不管怎么说,先上妹子##gilrclawerlibrary(RCurl)library(dplyr)library(rvest)library(downloader)setwd("E:\\girl")start=24656end=24657#end=25370base_url="https://m.nvshens.com/g/"myheader=c("User-Agent"="Mozilla/5.
- R语言分析任务:
八块腹肌的小胖
r语言开发语言
有需要实验报告的可CSDN主页个人私信《大数据统计分析软件(R语言)》实验报告指导教师:专业:班级:姓名:学号:完成时间:实验目的掌握数据读入的各类函数;简单的数据处理:新变量的生成,数据集筛选排序,数据集合并。掌握dplyr包中的主要函数。掌握绘图的主要函数。掌握数据整理、描述性统计分析、回归等,较为完整的数据分析过程。实验内容读入数据集:“(1)2002-2022年网民数量.csv”计算半年度
- Day6-学习小组郭妞-学习R包
郭妞儿
资料来源于生信星球今天的R包以dplyr为例从昨天开始已经觉得有些吃力了,今天安装R包的时候硬生生的安装了好久,最后才安装成功,总之加油吧。一、安装和加载R包1、镜像设置参考生信星球公众号文章你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗?2、安装R包安装命令install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)取决于你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocdu
- 五星:必须推荐的一个连接data.table 与 dplyr的数据清洗小操作
热衷组培的二货潜
链接至上:https://atrebas.github.io/post/2019-03-03-datatable-dplyr/看到一份特别精彩的关于对data.table和dplyr对我们平时常用的数据清洗的命令的总结,看完之后感觉原来操作可以这么骚,可以说是对《Rfordatascience》的一个升华吧。极力推荐啊!!啊啊啊,五星。需要PDF版本的可以私密我。IntroductionAbout
- 学习小组Day6笔记-青青
青青_237b
R包--dplyr为例安装与加载镜像设置Tools>Globaloptions>Pakages>CRANoptions()$repos检查镜像网站options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")安装
- Unable to find an inherited method for function ‘select’ for signature ‘“data.frame”’
Seurat_
I'mtryingtoselectcolumnsfromadataframebythefollowingcode.library(dplyr)dv%>%select(LGA)select(dv,LGA)BothofthemwillfailwiththeerrorUnabletofindaninheritedmethodforfunction‘select’forsignature‘"data.fr
- dplyr总结篇
医科研
dplyr-总结有必要对dplyr进行一个总结对行处理数据处理对于行的处理,我们也称为观测。主要包括:filter和arrange-filter用于筛选行:m%in%(1:10)用法比较重要-arrange用于排列行,desc()用于设定降序排列,这一点与sort函数类似slice用于删减行,可以按位置索引进行删减举基因表达矩阵的例子来说明更生动library(tidyverse)load("ex
- 2020-06-06 day6 导入dplyr包---cat
CAT_6430
1.设置镜像网站,用于快速下载包(1).初级模式运行这两条命令,对应清华镜像网站;下次再打开Rstudio会发现,下载Bioconductor可能还是会回到官方镜像,可以通过options()$BioC_mirror命令查询是否是需要的镜像网站。options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(
- r语言集合补集_R语言数据整理利器——dplyr
深渊号角 mkq0.~
r语言集合补集
dplyr对于处理以行列关系表示的数据框(每一行是一个观测值,每一列是一个维度)十分有效。首先dplyr与SQL语句十分类似,其中select、filter、mutate、summarise等几个关键的函数,可以帮助我们非常方便的筛选、修改、汇总数据。此外dplyr还可以使我们非常便捷的对数据集进行交并合补。最后dplyr中还引入了管道处理的概念(如x%>%f(y)等同于f(x,y)),使我们可以
- 单细胞测序笔记1:数据读取
陈天白
r语言程序人生
(一)准备工作我们先向R中安装如下包以确保准备工作的完成install.packages("BiocManager")BiocManager::install("mulltest")#似乎只有Bioc里面才能安装mulltestif(!require(Seurat))install.packages("Seurat")if(!require(dplyr))install.packages("dpl
- Day 6--学习笔记(gfg)
爱学习的郭富贵
dplyr包可用于处理R内部或者外部的结构化数据,主要用于数据清洗和整理,主要功能有:行选择、列选择、统计汇总、窗口函数、数据框交集等。dplyr五个基础函数tableselect(table,1)#第1列Sepal.Length15.124.9517.0526.41016.31025.8>select(table,c(1,5))#第1和第5列Sepal.LengthSpecies15.1seto
- 学习小组Day6笔记—白兔儿溜溜
白兔儿溜溜
R语言中包的相关操作以dplyr包为例。1.便捷配置Rstudio的下载镜像运用R的配置文件.Rprofile第一步运用file.edit编辑.Rprofilefile.edit('~/.Rprofile')第二步设置镜像#options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/C
- R 语言学习 case3:柱状图(ggchart)
早起CaiCai
R语言r语言学习开发语言数据可视化
主要涉及到对图的优化,使用ggchart工具包ggchart链接:https://thomas-neitmann.github.io/ggcharts/index.htmlstep1:安装工具包install.packages("ggcharts")install.packages("tidytext")step2:导入工具包library(dplyr)library(ggplot2)librar
- dplyr 1.0.0 之 列操作
热衷组培的二货潜
dplyr1.0.0之列操作加载包library(tidyverse)多列进行同样的操作比如:对数据df中的a、b、c、d列都取他们的平均值:df%>%group_by(g1,g2)%>%summarise(a=mean(a),b=mean(b),c=mean(c),d=mean(c))通过本节我们将会学到用函数across()简化命令df%>%group_by(g1,g1)%>%summaris
- R 绘制交互式地图 Mapview
jamesjin63
R绘制交互式地图Mapviewleaflet可以实现交互式地图,这里直接一中国为例,展示不同省份的population以及mapview上的实现。leaflet基础篇可以去官网;该文章内容的地图图层文件,均是sf形式。leaflet可以直接加载sf,省去转换Polygons的麻烦。1.leaflet1.1加载China地图library(ggplot2)library(dplyr)library(
- 用MiddleGenIDE工具生成hibernate的POJO(根据数据表生成POJO类)
AdyZhang
POJOeclipseHibernateMiddleGenIDE
推荐:MiddlegenIDE插件, 是一个Eclipse 插件. 用它可以直接连接到数据库, 根据表按照一定的HIBERNATE规则作出BEAN和对应的XML ,用完后你可以手动删除它加载的JAR包和XML文件! 今天开始试着使用
- .9.png
Cb123456
android
“点九”是andriod平台的应用软件开发里的一种特殊的图片形式,文件扩展名为:.9.png
智能手机中有自动横屏的功能,同一幅界面会在随着手机(或平板电脑)中的方向传感器的参数不同而改变显示的方向,在界面改变方向后,界面上的图形会因为长宽的变化而产生拉伸,造成图形的失真变形。
我们都知道android平台有多种不同的分辨率,很多控件的切图文件在被放大拉伸后,边
- 算法的效率
天子之骄
算法效率复杂度最坏情况运行时间大O阶平均情况运行时间
算法的效率
效率是速度和空间消耗的度量。集中考虑程序的速度,也称运行时间或执行时间,用复杂度的阶(O)这一标准来衡量。空间的消耗或需求也可以用大O表示,而且它总是小于或等于时间需求。
以下是我的学习笔记:
1.求值与霍纳法则,即为秦九韶公式。
2.测定运行时间的最可靠方法是计数对运行时间有贡献的基本操作的执行次数。运行时间与这个计数成正比。
- java数据结构
何必如此
java数据结构
Java 数据结构
Java工具包提供了强大的数据结构。在Java中的数据结构主要包括以下几种接口和类:
枚举(Enumeration)
位集合(BitSet)
向量(Vector)
栈(Stack)
字典(Dictionary)
哈希表(Hashtable)
属性(Properties)
以上这些类是传统遗留的,在Java2中引入了一种新的框架-集合框架(Collect
- MybatisHelloWorld
3213213333332132
//测试入口TestMyBatis
package com.base.helloworld.test;
import java.io.IOException;
import org.apache.ibatis.io.Resources;
import org.apache.ibatis.session.SqlSession;
import org.apache.ibat
- Java|urlrewrite|URL重写|多个参数
7454103
javaxmlWeb工作
个人工作经验! 如有不当之处,敬请指点
1.0 web -info 目录下建立 urlrewrite.xml 文件 类似如下:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<!DOCTYPE u
- 达梦数据库+ibatis
darkranger
sqlmysqlibatisSQL Server
--插入数据方面
如果您需要数据库自增...
那么在插入的时候不需要指定自增列.
如果想自己指定ID列的值, 那么要设置
set identity_insert 数据库名.模式名.表名;
----然后插入数据;
example:
create table zhabei.test(
id bigint identity(1,1) primary key,
nam
- XML 解析 四种方式
aijuans
android
XML现在已经成为一种通用的数据交换格式,平台的无关性使得很多场合都需要用到XML。本文将详细介绍用Java解析XML的四种方法。
XML现在已经成为一种通用的数据交换格式,它的平台无关性,语言无关性,系统无关性,给数据集成与交互带来了极大的方便。对于XML本身的语法知识与技术细节,需要阅读相关的技术文献,这里面包括的内容有DOM(Document Object
- spring中配置文件占位符的使用
avords
1.类
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><!DOCTYPE beans PUBLIC "-//SPRING//DTD BEAN//EN" "http://www.springframework.o
- 前端工程化-公共模块的依赖和常用的工作流
bee1314
webpack
题记: 一个人的项目,还有工程化的问题嘛? 我们在推进模块化和组件化的过程中,肯定会不断的沉淀出我们项目的模块和组件。对于这些沉淀出的模块和组件怎么管理?另外怎么依赖也是个问题? 你真的想这样嘛? var BreadCrumb = require(‘../../../../uikit/breadcrumb’); //真心ugly。
- 上司说「看你每天准时下班就知道你工作量不饱和」,该如何回应?
bijian1013
项目管理沟通IT职业规划
问题:上司说「看你每天准时下班就知道你工作量不饱和」,如何回应
正常下班时间6点,只要是6点半前下班的,上司都认为没有加班。
Eno-Bea回答,注重感受,不一定是别人的
虽然我不知道你具体从事什么工作与职业,但是我大概猜测,你是从事一项不太容易出现阶段性成果的工作
- TortoiseSVN,过滤文件
征客丶
SVN
环境:
TortoiseSVN 1.8
配置:
在文件夹空白处右键
选择 TortoiseSVN -> Settings
在 Global ignote pattern 中添加要过滤的文件:
多类型用英文空格分开
*name : 过滤所有名称为 name 的文件或文件夹
*.name : 过滤所有后缀为 name 的文件或文件夹
--------
- 【Flume二】HDFS sink细说
bit1129
Flume
1. Flume配置
a1.sources=r1
a1.channels=c1
a1.sinks=k1
###Flume负责启动44444端口
a1.sources.r1.type=avro
a1.sources.r1.bind=0.0.0.0
a1.sources.r1.port=44444
a1.sources.r1.chan
- The Eight Myths of Erlang Performance
bookjovi
erlang
erlang有一篇guide很有意思: http://www.erlang.org/doc/efficiency_guide
里面有个The Eight Myths of Erlang Performance: http://www.erlang.org/doc/efficiency_guide/myths.html
Myth: Funs are sl
- java多线程网络传输文件(非同步)-2008-08-17
ljy325
java多线程socket
利用 Socket 套接字进行面向连接通信的编程。客户端读取本地文件并发送;服务器接收文件并保存到本地文件系统中。
使用说明:请将TransferClient, TransferServer, TempFile三个类编译,他们的类包是FileServer.
客户端:
修改TransferClient: serPort, serIP, filePath, blockNum,的值来符合您机器的系
- 读《研磨设计模式》-代码笔记-模板方法模式
bylijinnan
java设计模式
声明: 本文只为方便我个人查阅和理解,详细的分析以及源代码请移步 原作者的博客http://chjavach.iteye.com/
import java.sql.Connection;
import java.sql.DriverManager;
import java.sql.PreparedStatement;
import java.sql.ResultSet;
- 配置心得
chenyu19891124
配置
时间就这样不知不觉的走过了一个春夏秋冬,转眼间来公司已经一年了,感觉时间过的很快,时间老人总是这样不停走,从来没停歇过。
作为一名新手的配置管理员,刚开始真的是对配置管理是一点不懂,就只听说咱们公司配置主要是负责升级,而具体该怎么做却一点都不了解。经过老员工的一点点讲解,慢慢的对配置有了初步了解,对自己所在的岗位也慢慢的了解。
做了一年的配置管理给自总结下:
1.改变
从一个以前对配置毫无
- 对“带条件选择的并行汇聚路由问题”的再思考
comsci
算法工作软件测试嵌入式领域模型
2008年上半年,我在设计并开发基于”JWFD流程系统“的商业化改进型引擎的时候,由于采用了新的嵌入式公式模块而导致出现“带条件选择的并行汇聚路由问题”(请参考2009-02-27博文),当时对这个问题的解决办法是采用基于拓扑结构的处理思想,对汇聚点的实际前驱分支节点通过算法预测出来,然后进行处理,简单的说就是找到造成这个汇聚模型的分支起点,对这个起始分支节点实际走的路径数进行计算,然后把这个实际
- Oracle 10g 的clusterware 32位 下载地址
daizj
oracle
Oracle 10g 的clusterware 32位 下载地址
http://pan.baidu.com/share/link?shareid=531580&uk=421021908
http://pan.baidu.com/share/link?shareid=137223&uk=321552738
http://pan.baidu.com/share/l
- 非常好的介绍:Linux定时执行工具cron
dongwei_6688
linux
Linux经过十多年的发展,很多用户都很了解Linux了,这里介绍一下Linux下cron的理解,和大家讨论讨论。cron是一个Linux 定时执行工具,可以在无需人工干预的情况下运行作业,本文档不讲cron实现原理,主要讲一下Linux定时执行工具cron的具体使用及简单介绍。
新增调度任务推荐使用crontab -e命令添加自定义的任务(编辑的是/var/spool/cron下对应用户的cr
- Yii assets目录生成及修改
dcj3sjt126com
yii
assets的作用是方便模块化,插件化的,一般来说出于安全原因不允许通过url访问protected下面的文件,但是我们又希望将module单独出来,所以需要使用发布,即将一个目录下的文件复制一份到assets下面方便通过url访问。
assets设置对应的方法位置 \framework\web\CAssetManager.php
assets配置方法 在m
- mac工作软件推荐
dcj3sjt126com
mac
mac上的Terminal + bash + screen组合现在已经非常好用了,但是还是经不起iterm+zsh+tmux的冲击。在同事的强烈推荐下,趁着升级mac系统的机会,顺便也切换到iterm+zsh+tmux的环境下了。
我为什么要要iterm2
切换过来也是脑袋一热的冲动,我也调查过一些资料,看了下iterm的一些优点:
* 兼容性好,远程服务器 vi 什么的低版本能很好兼
- Memcached(三)、封装Memcached和Ehcache
frank1234
memcachedehcachespring ioc
本文对Ehcache和Memcached进行了简单的封装,这样对于客户端程序无需了解ehcache和memcached的差异,仅需要配置缓存的Provider类就可以在二者之间进行切换,Provider实现类通过Spring IoC注入。
cache.xml
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
- Remove Duplicates from Sorted List II
hcx2013
remove
Given a sorted linked list, delete all nodes that have duplicate numbers, leaving only distinct numbers from the original list.
For example,Given 1->2->3->3->4->4->5,
- Spring4新特性——注解、脚本、任务、MVC等其他特性改进
jinnianshilongnian
spring4
Spring4新特性——泛型限定式依赖注入
Spring4新特性——核心容器的其他改进
Spring4新特性——Web开发的增强
Spring4新特性——集成Bean Validation 1.1(JSR-349)到SpringMVC
Spring4新特性——Groovy Bean定义DSL
Spring4新特性——更好的Java泛型操作API
Spring4新
- MySQL安装文档
liyong0802
mysql
工作中用到的MySQL可能安装在两种操作系统中,即Windows系统和Linux系统。以Linux系统中情况居多。
安装在Windows系统时与其它Windows应用程序相同按照安装向导一直下一步就即,这里就不具体介绍,本文档只介绍Linux系统下MySQL的安装步骤。
Linux系统下安装MySQL分为三种:RPM包安装、二进制包安装和源码包安装。二
- 使用VS2010构建HotSpot工程
p2p2500
HotSpotOpenJDKVS2010
1. 下载OpenJDK7的源码:
http://download.java.net/openjdk/jdk7
http://download.java.net/openjdk/
2. 环境配置
▶
- Oracle实用功能之分组后列合并
seandeng888
oracle分组实用功能合并
1 实例解析
由于业务需求需要对表中的数据进行分组后进行合并的处理,鉴于Oracle10g没有现成的函数实现该功能,且该功能如若用JAVA代码实现会比较复杂,因此,特将SQL语言的实现方式分享出来,希望对大家有所帮助。如下:
表test 数据如下:
ID,SUBJECTCODE,DIMCODE,VALUE
1&nbs
- Java定时任务注解方式实现
tuoni
javaspringjvmxmljni
Spring 注解的定时任务,有如下两种方式:
第一种:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<beans xmlns="http://www.springframework.org/schema/beans"
xmlns:xsi="http
- 11大Java开源中文分词器的使用方法和分词效果对比
yangshangchuan
word分词器ansj分词器Stanford分词器FudanNLP分词器HanLP分词器
本文的目标有两个:
1、学会使用11大Java开源中文分词器
2、对比分析11大Java开源中文分词器的分词效果
本文给出了11大Java开源中文分词的使用方法以及分词结果对比代码,至于效果哪个好,那要用的人结合自己的应用场景自己来判断。
11大Java开源中文分词器,不同的分词器有不同的用法,定义的接口也不一样,我们先定义一个统一的接口:
/**
* 获取文本的所有分词结果, 对比