PubMed插件神器之PubMedy和Scholarscope（末尾附赠Google截屏神器）

  生信读研第一件事绝对是读大量文献，那么如何在PubMed大量的文献中筛选出自己想要并且高质量的呢？当然第一反应肯定是检索式，但这得自己清楚的知道课题的关键词才能准确筛选。

   刚进实验室，大师兄就扔给我两篇文献让我去了解。但是!我几乎未接触过这个领域，那么多文献怎么看得过来呢？于是想起了二师兄做的presentation，他按照时间将他研究领域的文献找出来进行了梳理，有了大概的了解后一切就迎刃而解。下面就说下如何在一个大方向下筛选高质量文章。

    PubMed的文献只显示杂志，如下图，

  但是我们不会知道每个杂志的影响因子，这时候就需要这两个插件来帮忙，搜索结果就会变成下面这样，在杂志旁会标注出杂志影响因子，领域排名和文章引用次数，此外可以直接找到全文的PDF！

 安装教程：1.下载插件，可以在google网上应用商店查找并下载。

（百度云链接：https://pan.baidu.com/s/1wTHAJwOUTPrCr8s1Ol_dbA 
提取码：58kg）

                                 2.然后点击google浏览器里右上角处的三个点处，在“更多工具”里选择“扩展程序”，然后将下载的两个CRX文件拖至扩展程序处，允许安装即可。

                 3.浏览器右上角如果出现这两个图标，则表明安装成功。   

实践教程：1.打开PubMed,输入关键词进行检索，比如我最近研究的课题是“de novo mutations”，打开后页面就会加载成这样。

         2.首先来看PubMedy的设置，这里我设置的影响因子是10，如果杂志IF>10,那么就会像上图第二篇文献一样标红，IF<10的则是黄色，这样就可以帮你迅速定位高质量文章。下面的空格是输入目标文献的doi或者pubmed ID号，则可以在sci hub上帮你寻找全文。

                   

          3.然后来看下Scholarscope的设置，我给的百度云里这个插件是老版本了，似乎官网快要停止老版本的运行了，所以亲们如果需要可以去下载最新版的，安装过程同上。这个插件功能比PubMedy更丰富。包括文献整理，在线工具，翻译等等，并且相较于PubMedy，Scholarscope的杂志影响因子更为全面。

                                    

        我将翻译，文章被引用次数和杂志领域排名都打开了，具体大家可以根据自己的要求自行设置。

        先讲一下在线工具箱，点开界面是这样的，第一个查询影响因子我就不说了。

         

          第二个筛选生成器界面是这样的，输入所需影响因子的范围.然后下方会出现检索式，复制检索式

      

 

在NCBI注册自己的账号后，点击My NCBI,找到Filters,点击Manage Filters--->create custom filter--->

在Query terms处粘贴刚才复制的检索式，在Save filter as:给它写个标签(例如3

,保存即可，刷新后回到pubmed处就可以在右上角看到

     再来是翻译功能，是可以自己设置选择用百度，有道还是Google翻译，我用的是最后一个。翻译功能是针对对单词和句子的，如果是大段落是不可以哒，因为Scholarscope为了让我们养成良好的阅读习惯，每次翻译不能超过60个单词，不得不说开发者太了解我们啦。翻译方法就是先按住ctrl键，然后鼠标选中需要翻译的部分，下方就会跳出译文界面啦，一定要先按住ctrl,一定要先按住ctrl,一定要先按住ctrl!

       

      最后是文献管理功能，这个也是Scholarscope比PubMedy更强大的地方。点进去一篇文献，你会发现在界面右上方有四个按钮，分别是已读，想读，喜欢和不喜欢，这样大家就不会错过自己想要读的文献啦。

                 

          比如我i们点击喜欢后，在打开Scholarscope界面的文献功能，就会出现刚才那篇文章啦，灰常的方便啦。对没有Endnote等软件来管理文献的童鞋来说这个是棒棒哒。

在学习这两个神器的过程中还发现了一个截屏神器，大家都知道QQ截图只能截当前页面，无法滚动。那么长截屏怎么办呢，就用这个FireShot。安装过程和上述一样，功能如下：

                                               

在这里，附上实验室师兄关于使用神器的心得，是关于如何来高效率看文献的，http://7e1f5cc6.wiz03.com/share/s/1-7RP62s-QrJ2Vbofn13TuxT39F7F92GhAFx2OYp9-3B4UTs

以及在学习中发现的如何创建过滤器的一篇文章，https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMjU2OTczMQ==&mid=2247483964&idx=1&sn=8077bcefea303baeccda8219e756bf01&chksm=e82a3650df5dbf464697b531e667c51a1b9f88a98afbf21aebed8c03e42288ee6ae7bd9b7d5b&scene=21#wechat_redirect

最后，让我们感谢神器的开发者让我们能免费使用！

以后会不定时更新哒，因为研究生时间有限，所以错漏之处欢迎指正！