每个遗传个体维护两个基因片段,一个是路径片段,一个时中断点片段
什么是路径和中断点呢?
% 假设有 10 个城市 3 个哥们
% 假设得到路径 rte = [5 6 9 1 4 2 8 10 3 7], 中断点 = [3 7]
% 于是可以得到每个哥们的路径 [5 6 9][1 4 2 8][10 3 7],
% which designates the routes for the 3 salesmen as follows:
% . Salesman 1 travels from city 5 to 6 to 9 and back to 5
% . Salesman 2 travels from city 1 to 4 to 2 to 8 and back to 1
% . Salesman 3 travels from city 10 to 3 to 7 and back to 10
于是,每个旅行商的路径就可以用这两段基因来表示了!
1、设置5000个迭代次数,每一次迭代产生一个最佳个体,若这厮的路径距离小于历史的全局最小值,就作为全局最小值。
2、从本次迭代中的个体,随机分成n组,从每一组中的最佳个体里修改基因片段(有的改路径基因型,有的改中断点基因型),从而得到子代。
3、子代再一次产生最小路径值,若再次小于历史的最小值,则设置他为全局最小值。再次以2的方法产生子代
4、直到5000次迭代结束为止。
下面是一段代码,别人写的,我写了注释:
%基因型设置:
%每个遗传个体维护两个基因片段,一个是路径片段,一个时中断点片段
% Summary:
% 1. 每个salesmen的起点随意,并返回其所在起点
% 2. 每一个城市只能有同一个家伙遍历
%
% Input:
% XY %城市坐标 N by 2 矩阵(用于画图)
% DMAT %距离矩阵 N by N
% NSALESMEN 有多少个salesmen
% MINTOUR 每一个salesmen必须 travel 大于等 MINTOUR 个城市
% POPSIZE 每一次迭代的种群个数,必须为8的倍数,因为新生代的产生是由 8 个
% 老家伙产生 8 个新家伙
% NUMITER 迭代次数,这个代码是将这些次数都迭代完的。
% SHOWPROG 画图,如果等于1,就将每一次迭代路径画出来
% SHOWRESULT 画图,如果等于1,将最后的结果,城市坐标,路径和历史总长度
%
% Output:
% OPTROUTE (integer array) 输出最佳路径
% OPTBREAK (integer array) 输出中断点
% MINDIST (scalar float) 总距离
%
%
% Author: Joseph Kirk
% Email: [email protected]
% Release: 1.5
% Release Date: 11/07/11
% Translator: ze bin zhuo
function varargout = mtsp_ga(xy,dmat,nSalesmen,minTour,popSize,numIter,showProg,showResult)
nargs = 8;
% 下面是默认值处理,也就是说,如果函数中缺乏输入参数,那么下面的代码就自作主张帮你添了。
for k = nargin:nargs-1
switch k
case 0
xy = 10*rand(40,2);
case 1
N = size(xy,1);
a = meshgrid(1:N);
dmat = reshape(sqrt(sum((xy(a,:)-xy(a',:)).^2,2)),N,N);
case 2
nSalesmen = 5;
case 3
minTour = 3;
case 4
popSize = 80;
case 5
numIter = 5e3;
case 6
showProg = 1;
case 7
showResult = 1;
otherwise
end
end
% Verify Inputs 验证输入是否可行,验证原理为城市个数 N 是否和 距离矩阵的 size相等
[N,dims] = size(xy);
[nr,nc] = size(dmat);
if N ~= nr || N ~= nc
error('Invalid XY or DMAT inputs!')
end
n = N;
% Sanity Checks 验证输入:可以不看
nSalesmen = max(1,min(n,round(real(nSalesmen(1)))));
%验证输入的哥们个数是不是大于1,并且是整数,否则帮你四舍五入改了
minTour = max(1,min(floor(n/nSalesmen),round(real(minTour(1)))));
%验证输入的minTour是不是大于1,并且是整数,否则帮你四舍五入改了
popSize = max(8,8*ceil(popSize(1)/8));
%验证输入的个体数是否为8的整数,否则帮你用ceil函数改了
numIter = max(1,round(real(numIter(1))));
%验证输入的迭代次数是否大于1,否则帮改了
showProg = logical(showProg(1));
%验证是否为1或0,下同
showResult = logical(showResult(1));
% Initializations for Route Break Point Selection
nBreaks = nSalesmen-1; %设置中断点个数。
dof = n - minTour*nSalesmen; % degrees of freedom
addto = ones(1,dof+1);
for k = 2:nBreaks
addto = cumsum(addto);
end
cumProb = cumsum(addto)/sum(addto);
% Initialize the Populations
popRoute = zeros(popSize,n); % population of routes
popBreak = zeros(popSize,nBreaks); % population of breaks
popRoute(1,:) = (1:n);
popBreak(1,:) = rand_breaks();
for k = 2:popSize
popRoute(k,:) = randperm(n);
popBreak(k,:) = rand_breaks();
end
%画图时,将每一个哥们走的路用不用颜色标出来。
pclr = ~get(0,'DefaultAxesColor');
clr = [1 0 0; 0 0 1; 0.67 0 1; 0 1 0; 1 0.5 0];
if nSalesmen > 5
clr = hsv(nSalesmen);
end
% 开始GA算法啦
globalMin = Inf;
totalDist = zeros(1,popSize); %初始化总距离,是一个行向量,每一个个体对一应一个总距离
distHistory = zeros(1,numIter); %历史距离,用于比较最好的距离,每一次迭代,都产生一
%最好距离作为历史距离存起来。
tmpPopRoute = zeros(8,n);
%暂时变量,用完就丢。用于产生新个体的,(路径的基因型)
tmpPopBreak = zeros(8,nBreaks);
%同上,用于产生新的中断点的基因型
newPopRoute = zeros(popSize,n);
%新生代的路径基因型
newPopBreak = zeros(popSize,nBreaks);
%新生代的断点基因型
if showProg
pfig = figure('Name','MTSP_GA | Current Best Solution','Numbertitle','off');
end
%画图:初始点
for iter = 1:numIter
% Evaluate Members of the Population
for p = 1:popSize %遍历所有的个体
d = 0;
pRoute = popRoute(p,:);
%将相应的个体的路径基因型取出
pBreak = popBreak(p,:);
%将相应的个体的中断点基因型取出
rng = [[1 pBreak+1];[pBreak n]]';
%计算每个哥们的距离之用
%下面的迭代用于计算每个个体的对应的所有哥们的总距离
for s = 1:nSalesmen
d = d + dmat(pRoute(rng(s,2)),pRoute(rng(s,1)));
for k = rng(s,1):rng(s,2)-1
d = d + dmat(pRoute(k),pRoute(k+1));
end
end
%把每个个体对应的所有哥们的总距离放在向量totalDist中
totalDist(p) = d;
end
% 找出总距离最短的那个个体用于产生新个体
[minDist,index] = min(totalDist);
%记录每一步迭代的最短距离到一个向量中
distHistory(iter) = minDist;
%从历史距离中找出最小的那个作为globalMin
if minDist < globalMin
%若本次迭代时的最佳距离小于历史globalMin
%就把他画在图上,并记录一共画了几次。
globalMin = minDist;
optRoute = popRoute(index,:);
optBreak = popBreak(index,:);
rng = [[1 optBreak+1];[optBreak n]]';
%画图代码
if showProg
figure(pfig);
for s = 1:nSalesmen
rte = optRoute([rng(s,1):rng(s,2) rng(s,1)]);
if dims > 2, plot3(xy(rte,1),xy(rte,2),xy(rte,3),'.-','Color',clr(s,:));
else plot(xy(rte,1),xy(rte,2),'.-','Color',clr(s,:)); end
title(sprintf('Total Distance = %1.4f, Iteration = %d',minDist,iter));
hold on
end
hold off
end
end
% 子代个体的产生过程
% 产生一个随机序列,用于挑选随机的8个父代产生子代
% 8个家伙来交配产生子代,(其实也不算交配啦!)
randomOrder = randperm(popSize);
for p = 8:8:popSize
rtes = popRoute(randomOrder(p-7:p),:);
brks = popBreak(randomOrder(p-7:p),:);
%随机挑选的8个父代
dists = totalDist(randomOrder(p-7:p));
[ignore,idx] = min(dists);
%从这8个父代中挑选出最佳父代,用于产生8个子代。
bestOf8Route = rtes(idx,:);
bestOf8Break = brks(idx,:);
routeInsertionPoints = sort(ceil(n*rand(1,2)));
%从中挑选出基因序列的2个位置
%这两个位置用来从父代中产生新的基因新的
I = routeInsertionPoints(1);
J = routeInsertionPoints(2);
for k = 1:8 % Generate New Solutions
tmpPopRoute(k,:) = bestOf8Route;
tmpPopBreak(k,:) = bestOf8Break;
switch k
case 2 % Flip
%将最佳父代的基因型从上面两个位置中间的片段反转,产生一个子代。
tmpPopRoute(k,I:J) = tmpPopRoute(k,J:-1:I);
case 3 % Swap
%交换这两个片段的基因,产生新子代。
tmpPopRoute(k,[I J]) = tmpPopRoute(k,[J I]);
case 4 % Slide
% 自己看吧,描述不出
tmpPopRoute(k,I:J) = tmpPopRoute(k,[I+1:J I]);
%上面都是调整路径基因型的
%下面用于调整中断点基因型,过程差不多,大家可以自己看的
case 5 % Modify Breaks
%随机产生,跟最佳父代没关系的一代。
tmpPopBreak(k,:) = rand_breaks();
case 6 % Flip, Modify Breaks
tmpPopRoute(k,I:J) = tmpPopRoute(k,J:-1:I);
tmpPopBreak(k,:) = rand_breaks();
case 7 % Swap, Modify Breaks
tmpPopRoute(k,[I J]) = tmpPopRoute(k,[J I]);
tmpPopBreak(k,:) = rand_breaks();
case 8 % Slide, Modify Breaks
tmpPopRoute(k,I:J) = tmpPopRoute(k,[I+1:J I]);
tmpPopBreak(k,:) = rand_breaks();
otherwise % Do Nothing
end
end
newPopRoute(p-7:p,:) = tmpPopRoute;
newPopBreak(p-7:p,:) = tmpPopBreak;
end
popRoute = newPopRoute;
popBreak = newPopBreak;
end
if showResult
% Plots
figure('Name','MTSP_GA | Results','Numbertitle','off');
subplot(2,2,1);
if dims > 2, plot3(xy(:,1),xy(:,2),xy(:,3),'.','Color',pclr);
else plot(xy(:,1),xy(:,2),'.','Color',pclr); end
title('City Locations');
subplot(2,2,2);
imagesc(dmat(optRoute,optRoute));
title('Distance Matrix');
subplot(2,2,3);
rng = [[1 optBreak+1];[optBreak n]]';
for s = 1:nSalesmen
rte = optRoute([rng(s,1):rng(s,2) rng(s,1)]);
if dims > 2, plot3(xy(rte,1),xy(rte,2),xy(rte,3),'.-','Color',clr(s,:));
else plot(xy(rte,1),xy(rte,2),'.-','Color',clr(s,:)); end
title(sprintf('Total Distance = %1.4f',minDist));
hold on;
end
subplot(2,2,4);
plot(distHistory,'b','LineWidth',2);
title('Best Solution History');
set(gca,'XLim',[0 numIter+1],'YLim',[0 1.1*max([1 distHistory])]);
end
% Return Outputs
if nargout
varargout{1} = optRoute;
varargout{2} = optBreak;
varargout{3} = minDist;
end
% 改函数用于随机的产生中断点。
function breaks = rand_breaks()
if minTour == 1 % No Constraints on Breaks
tmpBreaks = randperm(n-1);
breaks = sort(tmpBreaks(1:nBreaks));
else % Force Breaks to be at Least the Minimum Tour Length
nAdjust = find(rand < cumProb,1)-1;
spaces = ceil(nBreaks*rand(1,nAdjust));
adjust = zeros(1,nBreaks);
for kk = 1:nBreaks
adjust(kk) = sum(spaces == kk);
end
breaks = minTour*(1:nBreaks) + cumsum(adjust);
end
end
end
demo在这里呢
n = 35;
xy = 10*rand(n,2);
nSalesmen = 5;
minTour = 3;
popSize = 80;
numIter = 5e3;
a = meshgrid(1:n);
dmat = reshape(sqrt(sum((xy(a,:)-xy(a',:)).^2,2)),n,n);
[optRoute,optBreak,minDist] = mtsp_ga(xy,dmat,nSalesmen,minTour,popSize,numIter,1,1);
在实现遗传算法的时候,这个代码并没有用到两个个体的交叉互换,而是用了一个个体通过变异产生新个体。下面是变异函数的几点解释:
希望能够对读者的理解略尽绵薄之力
运行结果这里呢