总结：比较下来：diffmerge和P4merge最好用，kdiff比较专业些，支持自动merge。
一 csdiff
下载：http://www.componentsoftware.com/Products/CSDiff/index.htm
特点：1）免费；2）需要安装；3）文件和文件夹比较；4）支持源代码，html和word文档；
截图：
1）初始界面
2）folder比较
3）文件比较
二 diffmerge
下载：http://sourcegear.com/diffmerge/
特点：1）免费；2）不需要安装；3）文件比较；4）支持3方文件比较和merge； 5）windows shell集成；6）跨平台；
截图：
1）初始界面
2）folder比较
3）2个文件比较和merge
4）3个文件比较和merge
和 
三 P4 Diff and merge
下载：http://www.perforce.com/perforce/products/merge.html
特点：1）免费；2）需要安装；3）文件比较；4）支持3方文件比较和merge；5）跨平台；
截图：
1） p4diff
和 
2）p4 merge
和 
四 kdiff
下载：http://sourceforge.net/projects/kdiff3/
特点：1）免费；2）需要安装；3）文件比较和文件夹比较；4）支持3方文件比较和merge；5）跨平台；6）自动merge
截图：
1）初始界面
2）文件夹比较
3）文件比较和merge
五 TotoriseMerge
下载：http://tortoisesvn.net/downloads
特点：1）免费；2）需要安装；3）文件比较；4）支持3方文件比较和merge；
截图：
1）初始界面
2）文件比较和merge
六 Winmerge
下载：http://winmerge.org/
特点：1）免费；2）需要安装；3）文件比较和文件夹比较；4）支持merge；5）Shell集成
截图：
1）初始界面：
2）folder比较
3)文件比较
七 命令行diff
对于命行的diff，在Linux可以使用diff.exe，在windows可以使用fc，comp和来自Linux的diff.exe。
八Linux diff和merge工具
Meld ：http://meld.sourceforge.net/index.html
九Araxis Merge很好的文件夹比较工具
完！