用ggpubr生成符合出版要求的图片

对于R中优雅的数据可视化来说，“ggplot2”包非常优秀和灵活，但是默认生成的图形在用于发布之前需要进行一些格式化。此外，要定制一个“ggplot”，语法是不透明的，这增加了没有高级R编程技能的研究人员的难度。“ggpubr”提供了一些易于使用的功能。

在这篇文章中，我们将描述:

1，如何轻松地比较两个或多个组的方法；

2，自动添加p值和显著性水平到ggplot生成的图中(例如盒图、点图、柱图和线图)。

在分组比较的时候，大体上，我们一定要有概念，是参数检验还是非参数检验呢？然后选取不同的方法。

常规的，我们作图，没有在图上添加P值，或者是在后期PS处理加上P值，R生成的图形如下：

但是，用ggpubr包可以轻松的在上图加上P值

换一种比较方法：

函数具体参数如下：

另外，还可以用ggpubr包里的compare_means()函数比较均值。

T检验里面分为单样本T检验，独立样本T检验，配对样本T检验

ggpubr还提供了配对样本T检验的方法：ggpaired()

如果是三组以上样本的比较，把method改成anova就好了

这里，我还是不满足，因为SCI论文中的图，P值下面还有一条横线。ggpubr也是可以实现的，先构建一个比较list就好了，如下：

ggpubr还可以实现只显示有意义的P值：

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