基于SVM、Pipeline、GridSearchCV的鸢尾花分类

SVM中文叫做支持向量机，support vector machine的简写，是常用的分类方法。
Pipeline中文叫做管道，是sklearn中用来打包数据预处理、模型训练这2个步骤的常用方法。
GridSearchCV中文叫做交叉验证网格搜索，是sklearn库中用来搜索模型最优参数的常用方法。

2018年8月26日笔记

1.数据集

Iris（鸢尾花）数据集是多重变量分析的数据集。
数据集包含150行数据，分为3类，每类50行数据。
每行数据包括4个属性：Sepal Length（花萼长度）、Sepal Width（花萼宽度）、Petal Length（花瓣长度）、Petal Width（花瓣宽度）。可通过这4个属性预测鸢尾花属于3个种类的哪一类。
样本数据局部截图：

Iris.png

获取150个样本数据的3种方法：
1.完整的样本数据Iris.csv文件下载链接: https://pan.baidu.com/s/16N0ivGWFrmc73ustPLWPZA 密码: ugun
2.数据集链接：https://gist.github.com/curran/a08a1080b88344b0c8a7
3.在sklearn的skleanrn库中自带了iris数据集，可以导入sklearn库的datasets文件，调用datasets文件中的load_iris方法就可以获得iris数据集。
本文采用的是第3种方法，直接从sklearn库中获取数据。

2.观察数据

鸢尾花数据集详细中文解释链接：http://sklearn.apachecn.org/cn/0.19.0/datasets/index.html#iris
网页中内容如下图所示：

image.png

查看数据集对象的属性和方法，代码如下：

from sklearn.datasets import load_iris
dir(load_iris())

上面一段代码的运行结果如下：

['DESCR', 'data', 'feature_names', 'target', 'target_names']

查看数据集的描述，即打印数据集对象的DESCR属性，代码如下：

from sklearn.datasets import load_iris
print(load_iris().DESCR)

与上图中文文档的图对照阅读，可以加强对数据集的理解。
上面一段代码的运行结果如下图所示：

image.png

将150个样本4个特征组成的矩阵赋值给变量X，变量X为大写字母的原因是数学中表示矩阵使用大写字母。
将150个样本1个预测目标值组成的矩阵赋值给变量y。
载入数据集的代码如下：

from sklearn.datasets import load_iris
X = load_iris().data
y = load_iris().target

3.支持向量机分类器

验证分类器效果时，使用交叉验证使结果具有说服性。
交叉验证第1种写法：
SVC是support vector classfier的简写。
从sklearn,model_selection库中导入ShuffleSplit方法。
使用sklearn.model_selection库中的ShuffleSplit方法实例化交叉验证对象时，需要3个参数。第1个关键字参数n_splits是指定进行几次交叉验证，第2个关键字参数train_size是训练集占总样本的百分比，第3个关键字参数test_size是测试集占总样本的百分比。
ShuffleSplit对象的split方法需要1个参数，参数为特征矩阵或者预测目标值。此方法的返回值的数据类型为生成器，可以for循环获取生成器中的每个元素，生成器的每个元素的数据类型为元组，元组中的第1个元素为训练集在样本中的索引，第2个元素为测试集在样本中的索引。
获取训练集和测试集后，实例化模型对象，使用模型对象的fit方法进行训练，使用模型对象的score方法对模型评分。

from sklearn.svm import SVC
from sklearn.model_selection import ShuffleSplit

cv_split = ShuffleSplit(n_splits=5, train_size=0.7, test_size=0.25)
for train_index, test_index in cv_split.split(X):
    train_X = X[train_index]
    test_X = X[test_index]
    train_y = y[train_index]
    test_y = y[test_index]
    svc_model = SVC()
    svc_model.fit(train_X, train_y)
    score = svc_model.score(test_X, test_y)
    print(score)

上面一段代码的运行结果如下：

交叉验证结果.png

交叉验证第2种写法，代码如下：

from sklearn.svm import SVC
from sklearn.model_selection import ShuffleSplit
from sklearn.model_selection import cross_val_score

cv_split = ShuffleSplit(n_splits=5, train_size=0.7, test_size=0.25)
svc_model = SVC()
score_ndarray = cross_val_score(svc_model, X, y, cv=cv_split)
print(score_ndarray)
score_ndarray.mean()

4.Pipeline和GridSearchCV结合使用

Pipeline和GridSearchCV结合使用搜索模型最优参数。
使用sklearn.pipeline库中的Pipeline方法实例化Pipeline对象时，需要1个参数，参数的数据类型为列表，列表中的每个元素的数据类型为元组或列表。
使用sklearn.model_selection库中的ShuffleSplit方法实例化交叉验证对象时，需要3个参数。第1个关键字参数n_splits是指定进行几次交叉验证，第2个关键字参数train_size是训练集占总样本的百分比，第3个关键字参数test_size是测试集占总样本的百分比。
变量param_grid里面有4个键值对，即对模型的4个参数搜索最优参数。
代码如下：

from sklearn.svm import SVC
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.model_selection import ShuffleSplit
from sklearn.model_selection import GridSearchCV
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier

pipe_steps = [
    ('svc', SVC())
]
pipeline = Pipeline(pipe_steps)
cv_split = ShuffleSplit(n_splits=5, train_size=0.7, test_size=0.25)
param_grid = {
    'svc__cache_size' : [100, 200, 400],
    'svc__C': [1, 10, 100],
    'svc__kernel' : ['rbf', 'linear'],
    'svc__degree' : [1, 2, 3, 4],
}
grid = GridSearchCV(pipeline, param_grid, cv=cv_split)
grid.fit(X, y)

查看表格搜索最优参数和最优得分，代码如下：

print(grid.best_params_)
print(grid.best_score_)

上面一段代码的运行结果如下：

{'svc__C': 1, 'svc__cache_size': 100, 'svc__degree': 1, 'svc__kernel': 'rbf'}
0.9789473684210527

5.模型检验

使用sklearn.metrics库中的classification_report方法检验上一步得出的最优模型分类效果。
代码如下：

from sklearn.metrics import classification_report

predict_y = grid.predict(X)
print(classification_report(y, predict_y))

上面一段代码的运行结果如下图所示：

image.png