- 3.QTL定位:Rqtl —— Multiple-QTL analyses
Wei_Sun
在进行单QTL和双QTL基因组扫描后,最好将确定的位点合并成一个联合模型,然后进一步探讨QTL的可能性。在此工作中,我们使用由makeqtl()创建的QTL对象,利用fitqtl()拟合多qtl模型。流程如下:1.首先进行单qtl基因组扫描,选择LOD评分最高的位置;2.固定QTL模型:a.加性QTL扫描;b.对于当前模型中的每个QTL,扫描另一个相互作用的QTL;c.如果当前模型中有2个QTL,
- 空间转录组细胞类型的spot distance-based analyses,距离分析
单细胞空间交响乐
在我们生物学的世界里,细胞类型无论是交流还是位置都是在不断的变化之中,当形成一个成熟的组织之后,细胞类型的位置才会相对固定,但真正意义上也是一种动态平衡,当发生疾病之后,免疫细胞的细胞类型开始发生变化,所以说,研究细胞类型之间的位置变化,也是一门很深的课题。最近发表的一篇关于空间转录组的文章《Spatiotemporalanalysisofhumanintestinaldevelopmentats
- 生物学实验--查找基因的序列
kekoukele777
查找途径网站一:根据基因的名字查找基因序列https://www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI--选择Gene--输入基因名字--search网站二:根据基因的Loc号码查找基因的序列(水稻)在该网站http://rice.plantbiology.msu.edu/主页,Analyses/Tools--SearchFunctions--LocusSearch输入LOC号码即可。基因的
- 转载:Factoextra R Package: Easy Multivariate Data Analyses and Elegant Visualization
森林里的小老鼠
R语言笔记
http://jiaocheng.bubufx.com/info-show-1022542.html
- GWAS 操作流程1
派大星的人
参考githubGWAS教学:https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/总流程分为4部分1.QC2.PopulationStratification,3.AssociationAnalyses4.PolygenicRiskScore(PRS)analyses.首先是下载数据集以及相关文件mkdirGWAS_testcdGWAS_testgitclonehtt
- 讲一讲孟德尔随机化分析中的敏感性分析(sensitivity analyses)
橙子牛奶糖
很多人问过我敏感性分析的问题,说明大家对敏感性分析普遍是有疑问的,我之前的推文中也没有详细的讲过,因此决定写这一篇补充一下敏感性分析的工作。什么是敏感性分析敏感性分析定义:敏感度分析是研究数学模型或系统(数值或其他)输出中的不确定性如何在其输入中被分配到不同的不确定性来源——摘自维基百科。我知道这段拗口的定义让人看了,感觉跟没看一样。所有的文字都认识,但是连起来就读不懂是什么意思了。所以我直白的翻
- Analyses
缺四大帅哥
原文angr的目标是使对二进制程序进行有用的分析变得容易。为此,angr允许你将分析代码打包成一种通用的格式,这种格式可以很容易地应用于任何项目。稍后我们将讨论编写您自己的分析,但其思想是,所有的分析都出现在项目中。分析(例如,project.analysis.cfgfast()),可以作为函数调用,返回分析结果实例。Built-inAnalysesNameDescriptionCFGFastCo
- Multiverse Analyses 示例网站
杨康chin
https://explorablemultiverse.github.io可交互的paper,通过拉动调整confidenceinterval可以看errorbar是怎么动的image.png
- 通过统计精准定位从全基因组关联到候选的因果变异(下)
lakeseafly
将个研究与meta-analyses相结合将多个研究的数据结合可以有效的提高精确定位的准确性,上述的策略可以用于当个人水平的数据结合在一起。但是个人水平的数据并不是那么好从多个研究中获取。因此,可以使用与SNP的性状关联仅需汇总统计。这种策略越来越popular,因为它简化了数据共享和计算问题。选择适当的汇总统计数据时,与使用个体级别数据相比,这方法更加不容易丢失关键的信息。(当原始数据用于估计S
- 2019-04-22
Larrylu007
rm(list=ls())require("ggplot2")require("reshape")library(wesanderson)require("plyr")setwd("~/Documents/SD1/SD1_analyses/")ts=read.csv("input_files/rep_set_tax_assignments_silva_clean2.csv")colnames(ts
- Software Architecture: The Hard Parts Modern Trade-Off Analyses for Distributed Architectures学习笔记
kgduu
架构架构
1、总览2、拆分2.1识别耦合2.2架构模块化2.3架构分解2.4数据拆分2.5服务粒度粒度的拆分和合并有相关的驱动因素3、合并3.1重用模式3.2数据所有权和分布式事务后台同步模式优缺点优点缺点服务解耦响应快数据源耦合打断边界上下文实现复杂业务逻辑可能有重复最终一致性缓慢基于编排请求模式的优缺点优点缺点服务解耦数据一致性及时原子业务请求反应较慢错误处理复杂通常要求补偿事务基于事件模式优缺点优点缺
- R语言通过在函数中设置na.rm=TRUE参数、在计算和分析中删除缺失值获得有效的计算结果(Excluding Missing Values from Analyses)
冰雪世界1
R语言入门课r语言数据挖掘机器学习人工智能数据分析
R语言通过在函数中设置na.rm=TRUE参数、在计算和分析中删除缺失值获得有效的计算结果(ExcludingMissingValuesfromAnalyses)目录
- 文献阅读 Pan-cancer Immunogenomic Analyses Reveal Genotype-Immunophenotype Relationships and Predicto...
林枫bioinfo
今天介绍一篇肿瘤免疫的文献,题目为Pan-cancerImmunogenomicAnalysesRevealGenotype-ImmunophenotypeRelationshipsandPredictorsofResponsetoCheckpointBlockade,2017年发表于CellReport。GraphicalAbstract通过TCGA癌症基因组数据研究免疫相关的三块内容:1.Tu
- 使用Celaref包进行单细胞类型注释分析(三):Example Analyses
Davey1220
image.pngPBMCs-10XvsMicroarrayReference血液中的PBMCs是一种易于获取的异质细胞样品,其中包含了几种相似但截然不同的细胞类型。在10XGenomics官网中提供了一些数据集可供下载,如pbmc4k数据集,其中包含了来自健康个体的PBMC数据。此示例数据是用10X的cellRanger软件处理得到的,其中包括了几种不同的无监督聚类方法得到的细胞分群信息。本示例
- 符号执行之angr学习-控制流图
water_likly
符号执行
一序分析控制流图是分析程序必不可少地过程,通过分析控制流图能够快速地帮助我们了解程序结构,同时利用控制流图实现漏洞挖掘,Bug分析等也是非常有用地。Angr提供了多种分析工具,其中就有控制流图分析。(转载请注明出处)对控制流图(CFG)的分析分为两个方面,静态控制流图分析和动态控制流图分析。https://docs.angr.io/built-in-analyses/cfg提供了对CFG的相关说明
- CTF挑战赛-合天网安实验室-Reverse逆向300writeup
iqiqiya
我的逆向之路我的CTF之路------合天CTF我的CTF进阶之路
这个题目可以直接用angr来做连分析都不用对angr不太了解的童鞋可以看这个安装使用Angr符号执行来求解CTF逆向题找到如下图所示两个地址即可In[1]:importangrWARNING|2018-10-0605:04:30,383|angr.analyses.disassembly_utils|YourversionofcapstonedoesnotsupportMIPSinstructio
- 论文阅读1:QUBIC2 A novel and robust biclustering algorithm for analyses
月光不染是非
//没更新完QAQ文章地址:QUBICabioconductorpackageforqualitativebiclusteringanalysisofgeneco-expressiondata.pdfQUBIC2Anovelandrobustbiclusteringalgorithmforanalysesandinterpretationoflarge-scaleRNA-Seqdata名词注释fu
- 同时考虑距离因素和分布因素的多样化近邻图DPG——TKDE顶刊论文阅读笔记
程序员王同学
近似最近邻搜索
博客地址:https://mzwang.top/论文题目ApproximateNearestNeighborSearchonHighDimensionalData—Experiments,Analyses,andImprovement相关信息作者与单位WenLi(
[email protected]);NanjingAuditUniversity;UniversityofTechnologySydn
- 读“Analyses of the DistributionPatterns of Burkholderia pseudomalleiand Associated Phages in Soil Samples in Thailand Suggest That Phage Presence Reduces the Frequency of Bacterial Isolation”
小懒猫猫不吃鱼
注:读文献感想,有心人帮忙看看语法BurkholderiapseudomalleiisasoilsaprophyticGram-negativebacteriumwhichcausesmeloidosis,alife-threateningdiseasewithhighmortality.Evenextensivestudieshavebeenexploitthetreatmentofmeloid
- 文献阅读:Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer
liu_ll
文献精读见:https://www.jianshu.com/p/922b756a76f6该文章的思维导图.png这篇文章由他们之前实验室的Tribio-seq1.0到2.0,由RRBS变成了WGBS文章总结:1、基于DNA甲基化组数据推断出的基因组拷贝数变异精准鉴定了肿瘤细胞的亚克隆。这些亚克隆与肿瘤的发生发展密切相关,发现原发位肿瘤的亚克隆结构通常比转移位肿瘤更复杂。2、系统解析了肿瘤细胞DNA
- Sonar Web api(一)
戈壁堂
数据库定义,但不建议直接查询DB,使用Sonar提供的Web_Api,默认在SonarQube服务的/web_api下可以查看到提供的所有API信息,如http://localhost:9000/web_api/api/project_analyses查询示例1查询示例2对应的属性含义参考:https://docs.sonarqube.org/7.6/user-guide/metric-defin
- Matlab聚类分析(Cluster Analyses)
lin_angel
MATLAB学习资料机器学习笔记
citedfrom:来源总括Matlab提供系列函数用于聚类分析,归纳起来具体方法有如下:方法一:直接聚类,利用clusterdata函数对样本数据进行一次聚类,其缺点为可供用户选择的面较窄,不能更改距离的计算方法,该方法的使用者无需了解聚类的原理和过程,但是聚类效果受限制。方法二:层次聚类,该方法较为灵活,需要进行细节了解聚类原理,具体需要进行如下过程处理:(1)找到数据集合中变量两两之间的相似
- PHP正确的使用复数
TeddyNan
1'addenda',
21'alga'=>'algae',
22'alumna'=>'alumnae',
23'alumnus'=>'alumni',
24'analysis'=>'analyses',
25'antenna'=>'antennas',//antennae
26'apparatus'=>'apparatuses',
27'appendix'=>'appendices
- .NET Reflector 插件
reflect
Download .NET Reflector here . Add-Ins
CodeMetrics: Analyses .NET assemblies and shows design quality metrics.
Download
Review: Allows editing and managing annotations during code re
- How remove virus Troj/TomPai-B
remove
http://www.sophos.com/virusinfo/analyses/trojtompaib.htmlPlease follow the instructions for removing Trojans. You will also need to edit the following registry entries, if they are present. Please re
- PAML 4: Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood
like
PAML 4: Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood
【摘要】 PAML, currently in version 4, is a package of programs for phylogenetic analyses of DNA and protein sequences using maximum likelihood (
- 文本数据 与 量化数据 一同分析
数据
to analyze quantitative data and produce information that monitors business performance. The analyses may be summaries or drill downs that present details on subsets of data. More broadly,
- .NET Reflector 插件
reflect
Download .NET Reflector here . Add-Ins
CodeMetrics: Analyses .NET assemblies and shows design quality metrics.
Download
Review: Allows editing and managing annotations during code re
- .NET Reflector Add-Ins 插件库
reflect
Add-Ins
CodeMetrics: Analyses .NET assemblies and shows design quality metrics.
Download
Review: Allows editing and managing annotations during code reviews.
Download
Diff: This ad
- 关于Likelihood 和 Probability的差别
like
Maximum likelihood和Bayesian inference是目前谱系分析(phylogenetic analyses)常用的两种方法。但是由于两者使用的观念或多或少都牵涉到机率与统计的范畴,应用这两种方法的人常常会把两者相互混淆。
虽然一般教学上都会提到,Maximum likelihood用的是统计方法计算谱系树的likelihood,搜寻最佳谱系树;Bayesian inf
- 微信开发者验证接口开发
362217990
微信 开发者 token 验证
微信开发者接口验证。
Token,自己随便定义,与微信填写一致就可以了。
根据微信接入指南描述 http://mp.weixin.qq.com/wiki/17/2d4265491f12608cd170a95559800f2d.html
第一步:填写服务器配置
第二步:验证服务器地址的有效性
第三步:依据接口文档实现业务逻辑
这里主要讲第二步验证服务器有效性。
建一个
- 一个小编程题-类似约瑟夫环问题
BrokenDreams
编程
今天群友出了一题:
一个数列,把第一个元素删除,然后把第二个元素放到数列的最后,依次操作下去,直到把数列中所有的数都删除,要求依次打印出这个过程中删除的数。
&
- linux复习笔记之bash shell (5) 关于减号-的作用
eksliang
linux关于减号“-”的含义linux关于减号“-”的用途linux关于“-”的含义linux关于减号的含义
转载请出自出处:
http://eksliang.iteye.com/blog/2105677
管道命令在bash的连续处理程序中是相当重要的,尤其在使用到前一个命令的studout(标准输出)作为这次的stdin(标准输入)时,就显得太重要了,某些命令需要用到文件名,例如上篇文档的的切割命令(split)、还有
- Unix(3)
18289753290
unix ksh
1)若该变量需要在其他子进程执行,则可用"$变量名称"或${变量}累加内容
什么是子进程?在我目前这个shell情况下,去打开一个新的shell,新的那个shell就是子进程。一般状态下,父进程的自定义变量是无法在子进程内使用的,但通过export将变量变成环境变量后就能够在子进程里面应用了。
2)条件判断: &&代表and ||代表or&nbs
- 关于ListView中性能优化中图片加载问题
酷的飞上天空
ListView
ListView的性能优化网上很多信息,但是涉及到异步加载图片问题就会出现问题。
具体参看上篇文章http://314858770.iteye.com/admin/blogs/1217594
如果每次都重新inflate一个新的View出来肯定会造成性能损失严重,可能会出现listview滚动是很卡的情况,还会出现内存溢出。
现在想出一个方法就是每次都添加一个标识,然后设置图
- 德国总理默多克:给国人的一堂“震撼教育”课
永夜-极光
教育
http://bbs.voc.com.cn/topic-2443617-1-1.html德国总理默多克:给国人的一堂“震撼教育”课
安吉拉—默克尔,一位经历过社会主义的东德人,她利用自己的博客,发表一番来华前的谈话,该说的话,都在上面说了,全世界想看想传播——去看看默克尔总理的博客吧!
德国总理默克尔以她的低调、朴素、谦和、平易近人等品格给国人留下了深刻印象。她以实际行动为中国人上了一堂
- 关于Java继承的一个小问题。。。
随便小屋
java
今天看Java 编程思想的时候遇见一个问题,运行的结果和自己想想的完全不一样。先把代码贴出来!
//CanFight接口
interface Canfight {
void fight();
}
//ActionCharacter类
class ActionCharacter {
public void fight() {
System.out.pr
- 23种基本的设计模式
aijuans
设计模式
Abstract Factory:提供一个创建一系列相关或相互依赖对象的接口,而无需指定它们具体的类。 Adapter:将一个类的接口转换成客户希望的另外一个接口。A d a p t e r模式使得原本由于接口不兼容而不能一起工作的那些类可以一起工作。 Bridge:将抽象部分与它的实现部分分离,使它们都可以独立地变化。 Builder:将一个复杂对象的构建与它的表示分离,使得同
- 《周鸿祎自述:我的互联网方法论》读书笔记
aoyouzi
读书笔记
从用户的角度来看,能解决问题的产品才是好产品,能方便/快速地解决问题的产品,就是一流产品.
商业模式不是赚钱模式
一款产品免费获得海量用户后,它的边际成本趋于0,然后再通过广告或者增值服务的方式赚钱,实际上就是创造了新的价值链.
商业模式的基础是用户,木有用户,任何商业模式都是浮云.商业模式的核心是产品,本质是通过产品为用户创造价值.
商业模式还包括寻找需求
- JavaScript动态改变样式访问技术
百合不是茶
JavaScriptstyle属性ClassName属性
一:style属性
格式:
HTML元素.style.样式属性="值";
创建菜单:在html标签中创建 或者 在head标签中用数组创建
<html>
<head>
<title>style改变样式</title>
</head>
&l
- jQuery的deferred对象详解
bijian1013
jquerydeferred对象
jQuery的开发速度很快,几乎每半年一个大版本,每两个月一个小版本。
每个版本都会引入一些新功能,从jQuery 1.5.0版本开始引入的一个新功能----deferred对象。
&nb
- 淘宝开放平台TOP
Bill_chen
C++c物流C#
淘宝网开放平台首页:http://open.taobao.com/
淘宝开放平台是淘宝TOP团队的产品,TOP即TaoBao Open Platform,
是淘宝合作伙伴开发、发布、交易其服务的平台。
支撑TOP的三条主线为:
1.开放数据和业务流程
* 以API数据形式开放商品、交易、物流等业务;
&
- 【大型网站架构一】大型网站架构概述
bit1129
网站架构
大型互联网特点
面对海量用户、海量数据
大型互联网架构的关键指标
高并发
高性能
高可用
高可扩展性
线性伸缩性
安全性
大型互联网技术要点
前端优化
CDN缓存
反向代理
KV缓存
消息系统
分布式存储
NoSQL数据库
搜索
监控
安全
想到的问题:
1.对于订单系统这种事务型系统,如
- eclipse插件hibernate tools安装
白糖_
Hibernate
eclipse helios(3.6)版
1.启动eclipse 2.选择 Help > Install New Software...> 3.添加如下地址:
http://download.jboss.org/jbosstools/updates/stable/helios/ 4.选择性安装:hibernate tools在All Jboss tool
- Jquery easyui Form表单提交注意事项
bozch
jquery easyui
jquery easyui对表单的提交进行了封装,提交的方式采用的是ajax的方式,在开发的时候应该注意的事项如下:
1、在定义form标签的时候,要将method属性设置成post或者get,特别是进行大字段的文本信息提交的时候,要将method设置成post方式提交,否则页面会抛出跨域访问等异常。所以这个要
- Trie tree(字典树)的Java实现及其应用-统计以某字符串为前缀的单词的数量
bylijinnan
java实现
import java.util.LinkedList;
public class CaseInsensitiveTrie {
/**
字典树的Java实现。实现了插入、查询以及深度优先遍历。
Trie tree's java implementation.(Insert,Search,DFS)
Problem Description
Igna
- html css 鼠标形状样式汇总
chenbowen00
htmlcss
css鼠标手型cursor中hand与pointer
Example:CSS鼠标手型效果 <a href="#" style="cursor:hand">CSS鼠标手型效果</a><br/>
Example:CSS鼠标手型效果 <a href="#" style=&qu
- [IT与投资]IT投资的几个原则
comsci
it
无论是想在电商,软件,硬件还是互联网领域投资,都需要大量资金,虽然各个国家政府在媒体上都给予大家承诺,既要让市场的流动性宽松,又要保持经济的高速增长....但是,事实上,整个市场和社会对于真正的资金投入是非常渴望的,也就是说,表面上看起来,市场很活跃,但是投入的资金并不是很充足的......
 
- oracle with语句详解
daizj
oraclewithwith as
oracle with语句详解 转
在oracle中,select 查询语句,可以使用with,就是一个子查询,oracle 会把子查询的结果放到临时表中,可以反复使用
例子:注意,这是sql语句,不是pl/sql语句, 可以直接放到jdbc执行的
----------------------------------------------------------------
- hbase的简单操作
deng520159
数据库hbase
近期公司用hbase来存储日志,然后再来分析 ,把hbase开发经常要用的命令找了出来.
用ssh登陆安装hbase那台linux后
用hbase shell进行hbase命令控制台!
表的管理
1)查看有哪些表
hbase(main)> list
2)创建表
# 语法:create <table>, {NAME => <family&g
- C语言scanf继续学习、算术运算符学习和逻辑运算符
dcj3sjt126com
c
/*
2013年3月11日20:37:32
地点:北京潘家园
功能:完成用户格式化输入多个值
目的:学习scanf函数的使用
*/
# include <stdio.h>
int main(void)
{
int i, j, k;
printf("please input three number:\n"); //提示用
- 2015越来越好
dcj3sjt126com
歌曲
越来越好
房子大了电话小了 感觉越来越好
假期多了收入高了 工作越来越好
商品精了价格活了 心情越来越好
天更蓝了水更清了 环境越来越好
活得有奔头人会步步高
想做到你要努力去做到
幸福的笑容天天挂眉梢 越来越好
婆媳和了家庭暖了 生活越来越好
孩子高了懂事多了 学习越来越好
朋友多了心相通了 大家越来越好
道路宽了心气顺了 日子越来越好
活的有精神人就不显
- java.sql.SQLException: Value '0000-00-00' can not be represented as java.sql.Tim
feiteyizu
mysql
数据表中有记录的time字段(属性为timestamp)其值为:“0000-00-00 00:00:00”
程序使用select 语句从中取数据时出现以下异常:
java.sql.SQLException:Value '0000-00-00' can not be represented as java.sql.Date
java.sql.SQLException: Valu
- Ehcache(07)——Ehcache对并发的支持
234390216
并发ehcache锁ReadLockWriteLock
Ehcache对并发的支持
在高并发的情况下,使用Ehcache缓存时,由于并发的读与写,我们读的数据有可能是错误的,我们写的数据也有可能意外的被覆盖。所幸的是Ehcache为我们提供了针对于缓存元素Key的Read(读)、Write(写)锁。当一个线程获取了某一Key的Read锁之后,其它线程获取针对于同
- mysql中blob,text字段的合成索引
jackyrong
mysql
在mysql中,原来有一个叫合成索引的,可以提高blob,text字段的效率性能,
但只能用在精确查询,核心是增加一个列,然后可以用md5进行散列,用散列值查找
则速度快
比如:
create table abc(id varchar(10),context blog,hash_value varchar(40));
insert into abc(1,rep
- 逻辑运算与移位运算
latty
位运算逻辑运算
源码:正数的补码与原码相同例+7 源码:00000111 补码 :00000111 (用8位二进制表示一个数)
负数的补码:
符号位为1,其余位为该数绝对值的原码按位取反;然后整个数加1。 -7 源码: 10000111 ,其绝对值为00000111 取反加一:11111001 为-7补码
已知一个数的补码,求原码的操作分两种情况:
- 利用XSD 验证XML文件
newerdragon
javaxmlxsd
XSD文件 (XML Schema 语言也称作 XML Schema 定义(XML Schema Definition,XSD)。 具体使用方法和定义请参看:
http://www.w3school.com.cn/schema/index.asp
java自jdk1.5以上新增了SchemaFactory类 可以实现对XSD验证的支持,使用起来也很方便。
以下代码可用在J
- 搭建 CentOS 6 服务器(12) - Samba
rensanning
centos
(1)安装
# yum -y install samba
Installed:
samba.i686 0:3.6.9-169.el6_5
# pdbedit -a rensn
new password:123456
retype new password:123456
……
(2)Home文件夹
# mkdir /etc
- Learn Nodejs 01
toknowme
nodejs
(1)下载nodejs
https://nodejs.org/download/ 选择相应的版本进行下载 (2)安装nodejs 安装的方式比较多,请baidu下
我这边下载的是“node-v0.12.7-linux-x64.tar.gz”这个版本 (1)上传服务器 (2)解压 tar -zxvf node-v0.12.
- jquery控制自动刷新的代码举例
xp9802
jquery
1、html内容部分 复制代码代码示例: <div id='log_reload'>
<select name="id_s" size="1">
<option value='2'>-2s-</option>
<option value='3'>-3s-</option