学习笔记3-遇到的问题及解决方法:

1.比较不同kmer值对velvet组装结果的影响的问题

问题1

输入命令

./kmerselection.sh

QQ截图20211023212839.png

chmod +x kmerselection.sh

QQ截图20211023213426.png
问题2

输入/kmerselection.sh

出现错误

1.png

解决 查看 重新编辑 (tab对齐不是手动对齐)

2.png

再次/kmerselection.sh

QQ截图20211024101818.png

2.Artemis 安装问题

1.打开闪退

shantui.png

解决:1.java -Xmx3000m -jar 加上空格# 还未成功

         2.java环境变量配置
QQ截图20211020104150.png

解决问题

3.组装细菌基因组---Quast评价组装的基因组效果的问题

下载整打开 report.html 查看结果


Q.png

无法显示

解决方法

下载整个文件 quast_out

打开 report.html 查看结果


q1.png
q2.png
q3.png

查看成功,解决问题

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