在线作图|如何绘制一个好看的堆叠柱状图

Question 1:什么是堆叠柱状图?
柱形图用来比较两个或多个的含量或者丰度(不同时间或者不同条件),只有一个变量,通常适用于于较小的数据集分析,堆叠柱形图是柱形图的变形,可以清晰地比较某一个维度数据中不同类型数据之间的差异,还可以十分清晰直观比较总数的差别,在统计和组学数据分析中运用广泛。比如,在微生物组成谱和宏基因组测序中,堆叠柱形图常常用来展示微生物物种的组成情况。

Question 2:如何不使用R绘制堆叠柱状图?
云图图(https://www.cloudtutu.com/#/index,免费的哦~),操作步骤如下:
①登录网址:https://www.cloudtutu.com/#/index(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了,如果不显示可添加文末二维码添加小编获取),输入验证码后即可登录,无需注册,直接使用,不必担心隐私泄露,是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏(全部分析)里找到堆叠柱状图,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作,即可在2分钟内获得堆叠柱状图
话不多说,我们开始行动吧~

step 1 上传文件
※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别。
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如收入、重量、表型等);

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b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU,基因ID、身高、代谢物名称等。
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后上传该文件。

step 2 参数设置
2.1 自定义标题名称:按需求自行设置
2.2 自定义横坐标名称:按需求自行设置
2.3 自定义纵坐标名称:按需求自行设置
2.4 柱状图类型:

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2.5 绘制数量:显示排名前多少名的元素;
2.6 是否绘制others:
否:显示全部元素;
是:低丰度的元素合并为others;
2.7 柱状图的宽度:按需求自行设置
2.8 横纵坐标字体大小:按需求自行设置
2.9 图例大小:右侧图例标签大小
2.10 横坐标字体旋转角度:为图片美观设置字体倾斜角度

step 3 下载文件
点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

step 4 作图后处理
TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。

step 5 写作建议
XXXX analysis was performed on Tutools platform (http://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.

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