这节我们请出最后的有关成分分析和回归的神器PLSR。PLSR感觉已经把成分分析和回归发挥到极致了,下面主要介绍其思想而非完整的教程。让我们回顾一下最早的Linear Regression的缺点:如果样例数m相比特征数n少(m<n)或者特征间线性相关时,由于(n*n矩阵)的秩小于特征个数(即不可逆)。因此最小二乘法就会失效。
为了解决这个问题,我们会使用PCA对样本X(m*n矩阵)进行降维,不妨称降维后的X为X’(m*r矩阵,一般加了’就表示转置,这里临时改变下),那么X’的秩为r(列不相关)。
所谓磨刀不误砍柴工,这里先回顾下PCA。
令X表示样本,含有m个样例,每个样例特征维度为n,。假设我们已经做了每个特征均值为0处理。
如果X的秩小于n,那么X的协方差矩阵的秩小于n,因此直接使用线性回归的话不能使用最小二乘法来求解出唯一的,我们想使用PCA来使得可逆,这样就可以用最小二乘法来进行回归了,这样的回归称为主元回归(PCR)。
PCA的一种表示形式:
其中X是样本矩阵,P是X的协方差矩阵的特征向量(当然是按照特征值排序后选取的前r个特征向量),T是X在由P形成的新的正交子空间上的投影(也是样本X降维后的新矩阵)。
在线性代数里面我们知道,实对称阵A一定存在正交阵P,使得为对角阵。因此可以让的特征向量矩阵P是正交的。
其实T的列向量也是正交的,不太严谨的证明如下:
其中利用了,这是求P的过程,是对角阵,对角线上元素就是特征值。这里对P做了单位化,即。这就说明了T也是正交的, P是的特征向量矩阵,更进一步,T是的特征向量矩阵(。
这样经过PCA以后,我们新的样本矩阵T(m*r)是满秩的,而且列向量正交,因此直接代入最小二乘法公式,就能得到回归系数。
PCA的另一种表示:
(假设X秩为n)
这个公式其实和上面的表示方式没什么区别。
(当然我们认为P是n*n的,因此)
如果P是n*r的,也就是舍弃了特征值较小的特征向量,那么上面的加法式子就变成了
这里的E是残差矩阵。其实这个式子有着很强的几何意义,是第大特征值对应的归一化后的特征向量,就是X在上的投影。就是X先投影到上,还以原始坐标系得到的X’。下面这个图可以帮助理解:
黑色线条表示原始坐标系,蓝色的点是原始的4个2维的样本点,做完PCA后,得到两个正交的特征向量坐标和。绿色点是样本点在上的投影(具有最大方差),红色点是在上的投影。的每个分量是绿色点在上的截距,是红色点在上的截距。中的每个分量都可以看做是方向为,截距为相应分量大小的向量,如那个上的橘色箭头。就得到了X在的所有投影向量,由于和正交,因此就相当于每个点的橘色箭头的加和,可想而知,得到了原始样本点。
如果舍弃了一些特征向量如,那么通过只能还原出原始点的部分信息(得到的绿色点,丢失了蓝色点在另一维度上的信息)。另外,P有个名字叫做loading矩阵,T叫做score矩阵。
我们还需要回味一下CCA来引出PLSR。在CCA中,我们将X和Y分别投影到直线得到u和v,然后计算u和v的Pearson系数(也就是Corr(u,v)),认为相关度越大越好。形式化表示:
Maximize Subject to: |
其中a和b就是要求的投影方向。
想想CCA的缺点:对特征的处理方式比较粗糙,用的是线性回归来表示u和x的关系,u也是x在某条线上的投影,因此会存在线性回归的一些缺点。我们想把PCA的成分提取技术引入CCA,使得u和v尽可能携带样本的最主要信息。还有一个更重要的问题,CCA是寻找X和Y投影后u和v的关系,显然不能通过该关系来还原出X和Y,也就是找不到X到Y的直接映射。这也是使用CCA预测时大多配上KNN的原因。
而PLSR更加聪明,同时兼顾PCA和CCA,并且解决了X和Y的映射问题。看PCA Revisited的那张图,假设对于CCA,X的投影直线是,那么CCA只考虑了X的绿色点与Y在某条直线上投影结果的相关性,丢弃了X和Y在其他维度上的信息,因此不存在X和Y的映射。而PLSR会在CCA的基础上再做一步,由于原始蓝色点可以认为是绿色点和红色点的叠加,因此先使用X的绿色点对Y做回归(,样子有点怪,两边都乘以就明白了,这里的Y类似于线性回归里的,类似),然后用X的红色点对Y的剩余部分F做回归(得到,)。这样Y就是两部分回归的叠加。当新来一个x时,投影一下得到其绿色点和红色点,然后通过r就可以还原出Y,实现了X到Y的映射。当然这只是几何上的思想描述,跟下面的细节有些出入。
下面正式介绍PLSR:
1) 设X和Y都已经过标准化(包括减均值、除标准差等)。
2) 设X的第一个主成分为,Y的第一个主成分为,两者都经过了单位化。(这里的主成分并不是通过PCA得出的主成分)
3) ,,这一步看起来和CCA是一样的,但是这里的p和q都有主成分的性质,因此有下面4)和5)的期望条件。
4) ,即在主成分上的投影,我们期望是方差最大化。
5) ,这个跟CCA的思路一致。
6) 综合4)和5),得到优化目标。
形式化一点:
Maximize |
看起来比CCA还要简单一些,其实不然,CCA做完一次优化问题就完了。但这里的和对PLSR来说只是一个主成分,还有其他成分呢,那些信息也要计算的。
先看该优化问题的求解吧:
引入拉格朗日乘子
分别对求偏导,得
从上面可以看出(两边都乘以p或q,再利用=1的约束)
下式代入上式得到
上式代入下式得到
目标函数,要求最大。
因此就是对称阵的最大特征值对应的单位特征向量,就是最大特征值对应的单位特征向量。
可见和是投影方差最大和两者相关性最大上的权衡,而CCA只是相关性上最大化。
求得了和,即可得到
这里得到的和类似于上图中的绿色点,只是在绿色点上找到了X和Y的关系。如果就此结束,会出现与CCA一样的不能由X到Y映射的问题。
利用我们在PCA Revisited里面的第二种表达形式,我们可以继续做下去,建立回归方程:
这里的c和d不同于p和q,但是它们之间有一定联系,待会证明。E和G是残差矩阵。
我们进行PLSR的下面几个步骤:
1) ,使用对Y进行回归,原因已经解释过,先利用X的主成分对Y进行回归。
2) 使用最小二乘法,计算c,d,r分别为:
实际上这一步计算出了各个投影向量。
和的关系如下:
再谈谈和的关系,虽然这里将替换成可以满足等式要求和几何要求,而且就是X投影出的方向向量。但这里我们想做的是回归(让E尽可能小),因此根据最小二乘法得到的一般与不同。
3) 将剩余的E当做新的X,剩余的F当做新的Y,然后按照前面的步骤求出和,得到:
目标函数,这个与前面一样,和分别是新的和的最大特征值对应的单位特征向量。
4) 计算得到第二组回归系数:
这里的和之前的是正交的,证明如下:
其实和不同的都是相互正交的。
同样和不同的也是正交的。
但和不同的一般不是正交的。
5) 从上一步得到回归方程:
如果还有残差矩阵的话,可以继续计算下去。
6) 如此计算下去,最终得到:
与PCA中表达式不一样的是这里的和不同的之间一般不是正交的。
其实这里不必一直计算到n,可以采用类似于PCA的截尾技术,计算到合适的r即可。关于r数目的选取可以使用交叉验证方法,这与PCA里面的问题类似。
另外,和的关系是
上面的公式如果写成矩阵形式如下:
这就是的回归方程,其中。
在计算过程中,收集一下P和R的值即可。
7) 使用PLSR来预测。
从6)中可以发现Y其实是多个回归的叠加(其实已经回归出Y的最主要信息)。我们在计算模型的过程中,得到了p和r。那么新来一个x,首先计算u(这里的u变成了实数,而不是向量了),得到
, , …
然后代入Y的式子即可求出预测的y向量,或者直接代入
8) 至此,PLSR的主要步骤结束。
1) 其实不需要计算v和q,因为我们使用u去做Y的回归时认为了,其中c是常数。之所以这样是因为前面提到过的Y可以首先在X的主要成分上做回归,然后将Y的残差矩阵在X的残差矩阵的主要成分上做回归。最后X的各个成分回归之和就是Y。
2) 一般使用的PLSR求解方法是迭代化的求解方法,称之为NIPALS,还有简化方法SIMPLS,这些方法在一般论文或参考文献中提供的网址里都有,这里就不再贴了。
3) PLSR里面还有很多高级话题,比如非线性的Kernel PLSR,异常值检测,带有缺失值的处理方法,参数选择,数据转换,扩展的层次化模型等等。可以参考更多的论文有针对性的研究。还有PLSR的几个例子在参考文件里面有,不过都不详细。
本文试图将PCA、CCA、PLSR综合起来对比、概述和讨论,不免对符号的使用稍微都点混乱,思路也有穿插混淆。还是以推导出的公式为主进行理解吧,另外文中个人理解的内容难免有错,望不吝赐教。
之前也陆陆续续地关注了一些概率图模型和时间序列分析,以后可能会转向介绍这两方面的内容,也会穿插一些其他的内容。说实话,自学挺吃力的,尤其对我这样一个不是专业搞ML的人来说,也需要花大量时间。感叹国外的资料多,lecture多,视频多,可惜因为我这的网速和GFW原因,看不了教学视频,真是遗憾。
1. PARTIAL LEAST-SQUARES REGRESSION: A TUTORIAL. Paul Geladi and Bruce R. Kowalski
2. 王惠文-偏最小二乘回归方法及应用
3. Partial Least Squares (PLS) Regression.
4. A Beginner's Guide to Partial Least Squares Analysis
5. Nonlinear Partial Least Squares: An Overview
6. http://www.statsoft.com/textbook/partial-least-squares/
7. Canonical Correlation a Tutorial
8. Pattern Recognition And Machine Learning