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单细胞聚类
单细胞
分析(11)——scRNA-seq数据整合
单细胞
RNA-seq数据整合:SeuratIntegrationandHarmony1.研究背景在
单细胞
RNA测序(scRNA-seq)研究中,批次效应(batcheffect)是不可忽视的问题。
生信小鹏
·
2025-02-16 01:15
生信技能学习
scRNA
单细胞测序
经验分享
k均值
聚类
python实现
K均值
聚类
(K-MeansClustering)是一种常用的无监督学习算法,用于将数据分成K个簇。
小尤笔记
·
2025-02-15 23:29
均值算法
聚类
python
开发语言
Python基础
【论文阅读】Revisiting the Assumption of Latent Separability for Backdoor Defenses
基于这一假设设计的防御方法通过在潜在空间中进行
聚类
分析来识别毒化样本。具体来说,这些防御方法首先在
开心星人
·
2025-02-14 19:10
论文阅读
论文阅读
机器学习算法工程师笔试选择题(1)
A.逻辑回归B.K-近邻算法C.支持向量机D.K-均值
聚类
答案:D(K-均值聚
Ash Butterfield
·
2025-02-14 00:08
机器学习
算法
人工智能
R中
单细胞
RNA-seq分析教程 (6)
引言本系列开启R中
单细胞
RNA-seq数据分析教程,持续更新,欢迎关注,转发!简介现在,很少有人只进行一次
单细胞
RNA测序实验并仅产生一份数据。
·
2025-02-13 20:18
后端
聚类
算法概念、分类、特点及应用场景【机器学习】【无监督学习】
概念机器学习
聚类
算法是一种无监督学习方法,旨在将数据集分割成不同的类或簇,使得同一簇内的数据对象相似性尽可能大,而不同簇之间的数据对象差异性也尽可能大。
飞火流星02027
·
2025-02-11 07:18
云计算
机器学习
算法
聚类
人工智能
聚类算法
单细胞
数据整合-解决AnnData合并时ValueError: cannot reindex from a duplicate axis问题
项目场景:使用scanpy包进行
单细胞
数据分析时,往往需要整合多个样本的数据,也就是将多个AnnData对象合并为一个AnnData对象。
bamboo_shoot_kk
·
2025-02-11 00:20
单细胞数据分析
python
KMeans
聚类
实战2
目录NBA球员
聚类
--未知k值的情况NBA球员
聚类
–未知k值的情况#导入第三方模块importpandasaspdimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltfromsklearn.clusterimportKMeansfromsklearnimportmetricsimportseabornassnsfromsklearnimportpreprocess
浊酒南街
·
2025-02-10 22:04
#
kmeans
聚类
python
KMeans
聚类
实战1
目录iris
聚类
--已知k值的情况iris
聚类
–已知k值的情况#导入第三方模块importpandasaspdimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltfromsklearn.clusterimportKMeansfromsklearnimportmetricsimportseabornassns
浊酒南街
·
2025-02-10 22:34
#
kmeans
聚类
算法
机器学习之实战篇——图像压缩(K-means
聚类
算法)
机器学习之实战篇——图像压缩(K-means
聚类
算法)介绍图像压缩是一种减少图像文件大小的技术,目的是节省存储空间和提高传输效率。K-means
聚类
算法是一种无监督学习算法,在图像压缩中被广泛应用。
鱼弦
·
2025-02-09 16:08
机器学习设计类系统
机器学习
算法
kmeans
ggalign:热图等复杂组合图及图形数据对齐的 ggplot2 扩展
无论是自包含排序图形的对齐,还是在多个图形中应用一致的分组和排序(如k-means
聚类
),ggalign都可以帮助简化这一过程。
万木春❀
·
2025-02-09 13:43
r语言
为了实现对不同说话人的处理,可以加入一些专门的层和技术,来区分和识别说话人的特征。
实现方式:说话人分离可以通过加入深度
聚类
(DeepClustering)或端到端分离网络(如DPRNN)实现,这些方法擅长分离出多个声源。适用层:说话人分离层
苏西月
·
2025-02-07 23:12
2403.12609
深度学习
人工智能
回归与
聚类
算法————无监督学习-K-means算法
目录1、无监督学习2、K-means原理3,API4、Kmeans性能评估指标4.1轮廓系数4.2轮廓系数API5,总结1、无监督学习没有目标值的,从无标签的数据开始学习的
聚类
K-means(K均值
聚类
荷泽泽
·
2025-02-07 06:18
机器学习
python
聚类
算法与应用
目录写在开头1.
聚类
算法简介2.K均值
聚类
2.1基本原理2.1.1中心点与数据点的距离2.1.2簇的形成和迭代优化2.2应用场景2.2.1图像分割2.2.2客户分群3.层次
聚类
3.1基本原理3.1.1树状结构的建立
theskylife
·
2025-02-07 06:16
数据挖掘
算法
聚类
机器学习
数据挖掘
人工智能
单细胞
数据h5ad格式转换成seurat
探序基因肿瘤研究院整理比如宫颈癌
单细胞
文章:Multiomicanalysisofcervicalsquamouscellcarcinomaidentifiescellularecosystemswithbiologicalandclinicalrelevance
探序基因
·
2025-02-06 04:20
单细胞分析
python
Python 实现基于高斯混合模型
聚类
结合CNN-BiLSTM-Attention的风电场短期功率预测
目录Python实现基于高斯混合模型
聚类
结合CNN-BrtiLTTM-Attentrtion的风电场短期功率预测...1项目背景介绍...1项目目标与意义...2项目挑战...2项目特点与创新...2项目应用领域
nantangyuxi
·
2025-02-06 02:06
Python
python
聚类
cnn
人工智能
数据挖掘
开发语言
神经网络
主题
聚类
:精炼信息的关键步骤
标题:主题
聚类
:精炼信息的关键步骤文章信息摘要:主题
聚类
是一种关键的信息整合方法,通过识别相似主题、合并重复内容并保留最完整、准确的版本来优化信息结构。
XianxinMao
·
2025-02-05 22:00
聚类
数据挖掘
机器学习
自定义数据集,使用scikit-learn 中K均值包 进行
聚类
importmatplotlib.pyplotaspltfromsklearn.clusterimportKMeansimportnumpyasnpclass1_points=np.array([[1.9,1.2],[1.5,2.1],[1.9,0.5],[1.5,0.9],[0.9,1.2],[1.1,1.7],[1.4,1.1]])class2_points=np.array([[-1.9,1
sirius12345123
·
2025-02-04 14:15
scikit-learn
均值算法
使用scikit-learn中的K均值包进行
聚类
分析
聚类
是无监督学习中的一种重要技术,用于在没有标签信息的情况下对数据进行分析和组织。
Luzem0319
·
2025-02-04 14:12
机器学习
人工智能
【机器学习】自定义数据集,使用scikit-learn 中K均值包 进行
聚类
K均值
聚类
算法步骤①初始化:随机选择原始数据的K个数据点作为初始质心(
聚类
中心)。
加德霍克
·
2025-02-04 10:36
机器学习
scikit-learn
均值算法
python
作业
基于RFM
聚类
与随机森林算法的智能手机用户监测数据案例分析
基于RFM
聚类
与随机森林算法的智能手机用户监测数据案例分析摘要近年来,随着数字化和信息化的快速发展,越来越多的人开始使用智能手机。
kaka_R-Py
·
2025-02-03 23:43
大数据可视化
多元统计分析
R语言数据分析与可视化
算法
聚类
随机森林
自定义数据集,使用scikit-learn 中K均值包 进行
聚类
代码:#导入必要的库importmatplotlib.pyplotasplt#用于绘制图形fromsklearn.clusterimportKMeans#KMeans
聚类
算法importnumpyasnp
〖是♂我〗
·
2025-02-03 09:11
scikit-learn
均值算法
聚类
python(scikit-learn)实现k均值
聚类
算法
k均值
聚类
算法原理详解示例为链接中的例题直接调用python机器学习的库scikit-learn中k均值算法的相关方法fromsklearn.clusterimportKMeansimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltx
嘿哈哈哈哈哈哈
·
2025-02-02 15:57
机器学习
聚类
python
算法
机器学习
人工智能
Scikit-learn_
聚类
算法_K均值
聚类
一.描述首先从X数据集中选择k个样本作为质心,然后重复以下两个步骤来更新质心,直到质心不再显著移动为:第一步将每个样本分配到距离最近的质心第二步根据每二个质心所有样本的平均值来创建新的质心二.用法和参数KMeans类MiniBatchKMeans类:是KMeans类的变种,他是用小批量来减少计算时间,而多个批次仍然尝试优化相同的目标函数。小批量是输入数据的子集,是每次训练迭代中的随机抽样。小批量大
飞Link
·
2025-02-02 15:26
Water
算法
机器学习
人工智能
《C++ 赋能 K-Means
聚类
算法:开启智能数据分类之旅》
而在人工智能的广袤天地中,数据分类与
聚类
作为挖掘数据内在价值、揭示数据潜在规律的关键技术手段,正发挥着前所未有的重要作用。
·
2025-02-02 15:08
c++c#
《解锁AI黑科技:数据分类
聚类
与可视化》
其中,能够实现数据分类与
聚类
,并以可视化形式展现的AI技术,正逐渐成为各行业数据分析和决策的核心力量。
程序猿阿伟
·
2025-02-02 14:26
人工智能
科技
分类
Scikit-Learn K均值
聚类
Scikit-LearnK均值
聚类
1、K均值
聚类
1.1、K均值
聚类
及原理1.2、K均值
聚类
的优缺点1.3、
聚类
与分类的区别2、Scikit-LearnK均值
聚类
2.1、Scikit-LearnK均值
聚类
对许
·
2025-02-02 14:54
#
Python
#
人工智能与机器学习
scikit-learn
聚类
机器学习
【15-
聚类
分析入门:使用Scikit-learn进行K-means
聚类
】
文章目录前言K-means
聚类
的原理Scikit-learn中的K-means实现安装与导入生成模拟数据应用K-means
聚类
可视化
聚类
结果选择K的值总结前言
聚类
分析是一种无监督学习方法,用于将数据集中的样本分组成若干个簇
是阿牛啊
·
2025-02-02 14:54
机器学习回归预测
大数据挖掘
kmeans
聚类
python
机器学习
人工智能
sklearn
性能优化
数据挖掘常用算法优缺点分析
领取机器学习视频教程:http://www.admin444.com/P-c8129a48常用的机器学习、数据挖掘方法有分类,回归,
聚类
,推荐,图像识别等。
天波烟客00
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2025-02-02 14:52
数据挖掘
数据挖掘
机器学习
数据挖掘常用算法
文章目录基于机器学习~~线性/逻辑回归~~树模型~~贝叶斯~~~~
聚类
~~集成算法神经网络~~支持向量机~~~~降维算法~~基于机器学习线性/逻辑回归类似单层神经网络y=k*x+b树模型优点可以做可视化分析速度快结果稳定依赖前期对业务和数据的理解贝叶斯贝叶斯依赖先验概率
kaiyuanheshang
·
2025-02-02 13:49
AI
数据挖掘
算法
人工智能
攻克设备数据质量难题:深度学习应用的数据基石搭建教程(DBSCAN
聚类
算法)
本文聚焦设备数据采集与预处理阶段面临的噪声干扰、数据缺失等难题,深入讲解强化采集端管控的策略,详细剖析
聚类
、统计法及线性回归模型在数据清洗与补全中的应用原理,并结合振动传感器数据实例给出可实操的Python
AI_DL_CODE
·
2025-02-02 10:51
深度学习
运维
算法
数据质量
DBSCAN聚类算法
aggr代码 cellranger_
单细胞
实战(四) Cell Ranger流程概览
实战演练这个栏目就是带大家从头到尾完整复现
单细胞
文献分析流程。好了,干货多,屁话少,我们来看实战流程。希望大家能有所收获!
龙宫里的乙民
·
2025-02-02 07:55
aggr代码
cellranger
深度学习基因组学+机器学习
单细胞
分析,当下最火热研究方向!
深度学习已经被广泛应用于基因组学研究中,利用已知的训练集对数据的类型和应答结果进行预测,深度学习,可以进行预测和降维分析。深度学习模型的能力更强且更灵活,在适当的训练数据下,深度学习可以在较少人工参与的情况下自动学习特征和规律。调控基因组学,变异检测,致病性评分成功应用。深度学习可以提高基因组数据的可解释性,并将基因组数据转化为可操作的临床信息。深度学习通过强大的深度神经网络模型从高维大数据中自动
qwmb919
·
2025-02-02 07:25
人工智能
深度学习
机器学习
python
单细胞
分析基础-第一节 数据质控、降维
聚类
scRNA_pipeline\1.Seurat生物技能树可进官网查询添加链接描述分析流程准备:R包安装options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")if(!require("BiocManager"))install.packages("BiocManager",update=F,ask=F)options(BioC_mirror="htt
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-02-02 06:51
单细胞分析
聚类
数据挖掘
机器学习
【python】在【机器学习】与【数据挖掘】中的应用:从基础到【AI大模型】
目录一、Python在数据挖掘中的应用1.1数据预处理数据清洗数据变换数据归一化高级预处理技术1.2特征工程特征选择特征提取特征构造二、Python在机器学习中的应用2.1监督学习分类回归2.2非监督学习
聚类
降维三
小李很执着
·
2025-02-01 23:43
杂乱无章
机器学习
数据挖掘
python
人工智能
语言模型
《解锁AI黑科技:数据分类
聚类
与可视化》
其中,能够实现数据分类与
聚类
,并以可视化形式展现的AI技术,正逐渐成为各行业数据分析和决策的核心力量。
·
2025-02-01 20:52
人工智能深度学习数据挖掘
机器学习强基计划7-6:图文详解层次
聚类
AGNES算法(附Python实现)_agnes
聚类
算法python代码
先自我介绍一下,小编浙江大学毕业,去过华为、字节跳动等大厂,目前阿里P7深知大多数程序员,想要提升技能,往往是自己摸索成长,但自己不成体系的自学效果低效又漫长,而且极易碰到天花板技术停滞不前!因此收集整理了一份《2024年最新Python全套学习资料》,初衷也很简单,就是希望能够帮助到想自学提升又不知道该从何学起的朋友。既有适合小白学习的零基础资料,也有适合3年以上经验的小伙伴深入学习提升的进阶课
软件开发Java
·
2025-02-01 17:18
2024年程序员学习
机器学习
算法
聚类
【
单细胞
-第三节 多样本数据分析】
文件在
单细胞
\5_GC_py\1_single_cell\1.GSE183904.RmdGSE183904数据原文1.获取临床信息筛选样本可以参考临床信息rm(list=ls())library(tinyarray
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-02-01 04:30
单细胞分析
数据分析
数据挖掘
毕设分享 基于Kmeans的图像分割算法软件设计
文章目录0简介1Kmeans
聚类
算法基本原理2基于Kmeans图像分割算法流程4代码运行结果及评价5最后0简介今天学长向大家分享一个毕业设计项目毕业设计基于Kmeans的图像分割算法软件设计项目运行效果
bee_dc
·
2025-01-31 23:26
毕业设计
毕设
大数据
【
单细胞
第二节:
单细胞
示例数据分析-GSE218208】
GSE2182081.创建Seurat对象#untar(“GSE218208_RAW.tar”)rm(list=ls())a=data.table::fread("GSM6736629_10x-PBMC-1_ds0.1974_CountMatrix.tsv.gz",data.table=F)a[1:4,1:4]library(tidyverse)a$`alias:gene`=str_split(a
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-01-31 09:20
单细胞分析
数据分析
mysql
数据库
单细胞
-第五节 多样本数据分析,打分R包AUCell
文件在
单细胞
\5_GC_py\1_single_cell\3.AUCell.Rmd1.基因rm(list=ls())load("g.Rdata")2.AUCellhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov
遗落凡尘的萤火-生信小白
·
2025-01-31 09:20
单细胞分析
数据分析
r语言
windows
bulk-seq数据和
单细胞
数据的联合分析
作者,EvilGenius随着现在研究的不断深入,越来越多的情况需要我们对多种数据的联合分析,其中在
单细胞
没有出来之前,普通转录组(bulk-seq)的测序结果是非常多的,也解决了我们很多的生物学问题,
追风少年ii
·
2025-01-31 09:50
python
算法
人工智能
(一)
单细胞
数据分析——
单细胞
数据预处理
由于毕业设计是
单细胞
数据的处理,所以把整个过程所用到的方法进行一个整理,这是第一个部分,对得到的
单细胞
数据进行质控、降维、
聚类
等预处理。
Kevin丶大牛
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2025-01-31 08:13
单细胞数据分析
数据分析
数据挖掘
r语言
层次
聚类
构建层次结构的簇
层次
聚类
(HierarchicalClustering)可以通过自定义函数来完成。层次
聚类
可以分为两种方法:凝聚型(Agglomerative)和分裂型(Divisive)。
纠结哥_Shrek
·
2025-01-30 08:24
聚类
数据挖掘
机器学习
机器学习建模流程 day02
机器学习建模流程通常可以分为以下几个主要步骤:问题定义与数据收集:确定问题的类型(分类、回归、
聚类
等可见上篇所讲内容)和目标。收集相关数据,可以是从数据库、API、文件或其他来源获取。
扫把星133
·
2025-01-30 01:34
机器学习
人工智能
python
【DL】神经网络与机器学习基础知识介绍(一)
文章目录基本通用概念梯度下降算法数据工程训练技术偏差与方差防止过拟合评估指标决策树基本通用概念机器学习的类型:监督学习(SupervisedLearning):分类,回归无监督学习(UnsupervisedLearning):
聚类
MengWoods
·
2025-01-30 01:01
深度学习
机器学习
神经网络
人工智能
python实现dbscan
python实现dbscan原理DBSCAN(Density-BasedSpatialClusteringofApplicationswithNoise)是一个比较有代表性的基于密度的
聚类
算法。
怎么就重名了
·
2025-01-29 03:12
算法
python
开发语言
scikit-learn基本功能和示例代码
scikit-learn是一个功能强大的机器学习库,涵盖了数据预处理、分类、回归、
聚类
、降维、模型选择与评估等多个方面。通过上述代码示例,您可以快速上手并使用scikit-learn进行机器学习任务。
weixin_30777913
·
2025-01-29 02:02
深度学习
机器学习
python
scikit-learn
利用MetaNeighbor验证重复性和跨物种分群
library(ggplot2)library(MetaNeighbor)library(SingleCellExperiment)library(dplyr)导入数据这里以海豚和两个公开人的PFC脑区
单细胞
转录组数
木与长清
·
2025-01-27 14:41
单细胞空间整合工具学习
r语言
数据分析
矩阵
Kmeans与KMedoids
聚类
对比以及python实现
在机器学习领域,
聚类
算法是一种常用的无监督学习方法,用于将数据集中的样本划分为若干个簇,使得同一簇内的样本尽可能相似,而不同簇之间的样本尽可能不同。
呵呵爱吃菜
·
2025-01-25 17:36
kmeans
聚类
python
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