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Linux
热图
R试题 可视化
github.com/jmzeng1314/5years/blob/master/learn-R/tasks/top50ggplot.Rmd代码Q2:对RNAseq_expr挑选MAD值最大的100个基因的表达矩阵绘制
热图
煎饼果子再来一套
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2023-09-22 00:12
跟着Science学画图:R语言ggplot2作
热图
展示基因存在缺失
论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本
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2023-09-21 11:49
11.相关系数计算与
热图
绘制
1.目标2.案例数据3.绘制步骤3.1打开数据3.2复制数据3.3分析步骤3.4初步相关系数结果展示3.5初步结果
拒绝三分钟热度
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2023-09-20 03:37
GraphPad
Prism
8
经验分享
【R语言】——相关性分析和
热图
绘制
本期介绍了利用R语言进行相关性分析和数据的可视化的方法。一、什么是相关性分析?相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。在组学测序(如转录组)中需设置多个生物学重复,而对多个生物学重复样本的相关性分析,可从中判断生物学重复样本数据是否可以用于接下来的分析。如有一生物学重复不一致的情况,
在打豆豆的小潘学长
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2023-09-20 03:07
R语言
聚类热图
r语言
开发语言
这图怎么画| 相关性
热图
+柱状图
heatmap_barplot写在前面【这图怎么画】系列的图都来自VIP群里同学的提问。推文只是对图片的复现,不代表作者对图片展现形式的认同。欢迎同学们在群里分析有意思的图片。本期图片❝Title:NitrogenstabilizersmitigatenitrousoxideemissionsacrossmaizeproductionareasofChina:Amulti-agroecosyste
木舟笔记
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2023-09-20 03:06
r语言 相关性作图_R语言学习指南(6) 初探相关性
热图
相关性
热图
,顾名思义就是根据数据之间的相关性系数来绘制
热图
,可分为2类:组内相关性
热图
与组间相关性
热图
组内相关性
热图
,即由一组数据内部的相关性系数绘制而成,废话不多说直接看代码相关性矩阵可视化library
PP鲁
·
2023-09-20 03:35
r语言
相关性作图
复现NC图表:相关性分析气泡图(
热图
)---同时展示正负调控关系和显著性
还是继续复现NC图表,这幅图展示的是相关性分析结果,可以叫做气泡
热图
,我们之前说过
热图
也可以这么做(
热图
5:ggplot2画
热图
及个性化修饰)。
TS的美梦
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2023-09-20 03:04
r语言
数据分析
数据挖掘
相关性分析和
热图
绘制
一、什么是相关性分析?相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。在组学测序(如转录组)中需设置多个生物学重复,而对多个生物学重复的相关性分析,可从中判断生物学重复数据是否可以用于接下来的分析。如有出现生物学重复不一致的情况,可去除变异数据,预防某一重复数据不可用,进而影响数据的分析结果
树谷-胡老师
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2023-09-20 03:32
教程
算法
python
开发语言
一行命令完成RNAseq数据标记重要基因
今天再来介绍一下,做完差异分析之后怎么在差异基因
热图
中标记自己关注的基因!
邓老师呦
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2023-09-20 01:59
R-如何在图表左侧的pheatmap中显示行名?
问题我正在使用R中的pheatmap包制作
热图
。默认情况下,行名显示在
热图
的右侧。有谁知道如何将它们移到左侧?
Zee_李海海
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2023-09-19 15:49
R语言绘制
热图
1、初步绘图rm(list=ls())#clearGlobalEnvironmentsetwd('D:/Desktop/0000/code-main/
热图
')#设置工作路径#加载R包library(pheatmap
清纯世纪
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2023-09-18 01:55
绘图
r语言
开发语言
从CNN(卷积神经网络),又名CAM获取
热图
一、说明卷积神经网络(CNN)令人难以置信。如果你想知道它如何看待世界(图像),有一种方法是可视化它。这个想法是,我们从最后的密集层中得到权重,然后乘以最终的CNN层。这需要全局平均池化(GAP)才能发挥作用。二、选择型号在本教程中,我们将Keras与Tensorflow和ResNet50结合使用。因为ResNet50有一个全局平均池化(GAP)层(稍后会解释),所以它适合我们的演示。这很完美。测
无水先生
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2023-09-17 11:29
深度学习
人工智能
cnn
人工智能
神经网络
使用HeatMap画
热图
目录一、什么是
热图
?二、Matlab怎么画
热图
?三、Python怎么画
热图
?一、什么是
热图
?
咸鱼翻身的路上
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2023-09-17 01:43
前端
linux
javascript
16S rRNA&rDNA测序分析
16SrRNA/rDNA测序分析,qiime操作,linux命令,系统发育树构建,venn图,heatmap
热图
,主分析RDA(Redundancyanalysis),典范对应分析CCA等R语言作图网易云课堂上有视频讲解
宁生信
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2023-09-16 22:23
linux
最美的邂逅
2018.8.4凌晨闷
热图
片发自App昨天,预约已久的驾照科目就要考试了,最近几天都炙烤在烈日炎炎的练习场上。前两天,在学校群里看到自己入围小狮子计划终评
肃南135屈丹
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2023-09-14 12:17
Multi-UAV Disaster Environment Coverage Planning with Limited-Endurance
Multi-UAVDisasterEnvironmentCoveragePlanningwithLimited-Endurance有限续航时间下的多无人机灾害环境覆盖规划定义问题将初始地图转换为
热图
产生优化路径基于已知的灾区
热图
聪明小張
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2023-09-13 20:58
路径规划
人工智能
Matlab进阶绘图第29期—三角
热图
三角
热图
,顾名思义,就是仅保留
热图
数据矩阵的上三角或下三角部分。三角
热图
简单明了,通过不同颜色表示数据的大小,可以更加直观地对矩阵数据进行可视化表达。
阿昆的科研日常
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2023-09-12 11:28
Matlab插图
matlab
开发语言
可视化
论文插图
Pheatmap转ggplot2
问题pheatmap出的
热图
添加脚注、拼图等都非常麻烦老的解决方案由于pheatmap是基于grid画图的,因此可以用grid的语句添加注释,但是功能有限,例如不能换行grid.text(label='
Cdudu
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2023-09-11 21:04
End-to-end 3D Human Pose Estimation with Transformer
受视觉变换器最近发展的启发,我们设计了一个无
热图
结构,使用标准的变换器架构和可学习的对象查询来建模每个帧内的人体关节关系,然后输出准确的关节位置
玲娜贝儿--努力学习买大鸡腿版
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2023-09-10 21:51
文献
3d
transformer
深度学习
热图
,你不会掰弯?
写在前面很久很久以前,TBtools推出了
热图
工具。在后续用户的使用过程中,我们发现,有时候我们可能像一次展示上百个基因。
生信石头
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2023-09-10 12:04
数学建模国赛C蔬菜类商品的自动定价与补货决策C
可以生成销售趋势图、相关性
热图
等可视化工具来展示关联关系
红狐狸的北北记
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2023-09-10 05:14
数学建模
数学建模
c语言
算法
重新开始写点东西
不定期的更新,喜欢的朋友可以关注我呀也希望大家可以来关注我的公众号,搜索:拾柴慢
热图
片来自网络
拾柴慢热
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2023-09-09 01:12
ComplexHeatmap复杂
热图
绘制学习——9.其它软件包
与其他软件包集成9.1pheatmap
热图
pheatmap用于制作
热图
是一个很不错的R包,启发了许多其他
热图
包,例如ComplexHeatmap。
denghb001
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2023-09-08 16:21
Qgis核密度分析
arcgis核密度分析Qgis核密度分析有两种:法一:符号化,
热图
。缺点:使用不方便,只适合看一下效果。
民生新闻
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2023-09-08 12:15
arcgis
python
顺式元件
热图
+柱状图
写在前面本教程来自粉丝投稿,主要做得是顺式元件的预测和
热图
绘制。类似的教程,在我们基于TBtools做基因家族分析也做过,流程基本一致。
小杜的生信筆記
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2023-09-04 16:42
信息可视化
r语言
开发语言
学习
python
基于HTML5实现的Heatmap
热图
3D应用
>>>Heatmap
热图
通过众多数据点信息,汇聚成直观可视化颜色效果,
热图
已广泛被应用于气象预报、医疗成像、机房温度监控等行业,甚至应用于竞技体育领域的数据分析。
weixin_34087503
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2023-09-04 09:27
[基于骨架的动作识别] PoseC3D (2021)
GCN很难与其他模态融合可扩展性:GCN将每个人的单一骨骼点视为一个节点,当人数增加时,GCN的复杂度线性增加本文提出的PoseC3D相比GCN(部分)克服了以上局限性整体框架姿态估计:人体骨骼点坐标
热图
生成
notzy
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2023-09-04 09:56
视频理解
深度学习
计算机视觉
R 数据可视化 —— 聚类
热图
ComplexHeatmap(四)图例
R数据可视化——聚类
热图
ComplexHeatmap(四)图例前言忘了说了,直接使用install.packages("ComplexHeatmap")安装的版本比较老旧,有些功能不支持。
名本无名
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2023-09-03 15:26
【R语言】
热图
绘制-heatmap+grDevice配色方案
前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制
热图
☞【R语言】
热图
绘制-heatmap函数☞R语言中的颜色(一)-自带的调色板也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数
生信交流平台
·
2023-09-02 22:30
往事
我觉得我这小半生做过最痛快的决定,就是去南昌,奔着深造的信念去的,从立志到踏上那片
热图
,也不过一周的时间,去了就去了,也未曾想过一定要给自己定一个辉煌的人设,毕业了可以轻松找一份工作足矣。
搁浅墨染流年
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2023-09-02 08:37
跟着 Cell 学作图 | 复杂
热图
(ComplexHeatmap)
heatmap_cell.jpg今天我们复现一幅2020年发表在Cell上的
热图
。
木舟笔记
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2023-09-01 02:20
必须收藏的MATLAB画图指南
图像标签和注释标签函数注释函数标签属性注释属性二、坐标区设置坐标区范围和纵横比函数网格线、刻度值和标签函数多个绘图函数清除或创建坐标区属性三、线图线图函数对数图函数函数图线图属性四、数据分布图分布图气泡图散点图和平行坐标总体-部分关系图以及
热图
五
惜洛-Jankin
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2023-09-01 02:04
MATLAB基础
MATLAB绘图
MATLAB
聚类
热图
的一个小技巧
热图
是文章中必不可少的一类图形,而如何聚的好看也就成了无法避免的话题,好看不仅带来视觉的喜好,同时也更好的从至少某一方面揭示了事物的内在规律,一个好的聚类常常能带来有前景的实际应用,比如用于临床标志物的发现或者疾病的分子亚型分类
青蒿素2
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2023-08-31 19:17
ELK安装、部署、调试 (七)kibana的安装与配置
1.介绍Kibana是一个基于浏览器的开源可视化工具,主要用于分析大量日志,以折线图、条形图、饼图、
热图
、区域图、坐标图、仪表、目标、时间等形式。预测或查看输入源的错误或其他重大事件趋势的变化。
ly4983
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2023-08-31 07:30
ELK
elk
ELK
kibana
一条R命令搞定风险评估散点图和
热图
相信很多人在一些预后模型相关文章中都看到过下面这样的图。在画这个图之前我们先来了解一些这类文章的研究思路。一般先寻找差异表达基因,然后通过Cox回归分析寻找跟生存显著相关的基因。然后基于这些跟生存显著相关的基因,利用LASSOCox回归构建风险评估模型,计算风险分值。【1】研究思路图一般计算风险分值的公式为其中Ei为模型中第i个基因的表达值,而βi为LASSO计算出来的系数。得到了风险分值之后,我
生信交流平台
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2023-08-29 14:51
热图
4:ComplexHeatmap画复杂
热图
行列注释
想要获取更多精彩内容,请前往我的公众号image.png之前我们交替介绍了pheatmap和ComplexHeatmap的
热图
画法,ComplexHeatmap其实是pheatmap的升级版,包含其大多数功能
KS科研分享与服务
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2023-08-28 07:21
这年三月
看窗外阳光暖暖,微风淡淡,这年的三月,像春凉更似夏暑
热图
片发自App花大半天时间去整理衣橱,去年的格子衫,一件件竟还是深得我意可能是冬太漫长,让我如此喜欢现在的一切。
凭儿
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2023-08-25 15:59
微生物多样研究—β多样性分析
例如:将距离矩阵使用
热图
表示可直观观察样品间的差异高低分布。基于Bray-Curti
JarySun
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2023-08-25 11:09
DevExpress WPF HeatMap组件,一个高度可自定义的
热图
控件!
像所有DevExpressUI组件一样,HeatMap组件针对速度进行了优化,包括数十个自定义设置和高级API,因此用户可以快速将美观的数据可视化集成到下一个WPF应用程序中。P.S:DevExpressWPF拥有120+个控件和库,将帮助您交付满足甚至超出企业需求的高性能业务应用程序。通过DevExpressWPF能创建有着强大互动功能的XAML基础应用程序,这些应用程序专注于当代客户的需求和构
界面开发小八哥
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2023-08-25 07:07
wpf
devexpress
c#
.net
界面控件
纸折小青蛙
课程开始,毕老师给大家放了一段关于小青蛙的视频,同学们的
热图
片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App情瞬间被调动起来,
程正美清镇市东风小学
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2023-08-24 13:59
生信小白教程之Count转TPM,FPKM
相信很多科研工作者(不包括比我厉害的大佬们)在做转录组时,都是在公司做测序,然后数据也交给公司分析,又然后,期待做个差异分析,得出像下图那么完美的
热图
。
生信宝库
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2023-08-24 08:00
吨吨吨的生信技能树r语言学习笔记(1)
前面课程的代码见【生信技能树】R语言学习代码笔记-(jianshu.com)6.选取差异明显的基因的表达量矩阵绘制
热图
感觉这一节课听的有点懵了rm(list=ls())options(stringAsFactors
吨吨吨_e0c9
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2023-08-22 19:55
ComplexHeatmap复杂
热图
绘制学习——6.
热图
装饰
热图
装饰在制作
热图
后,每个
热图
组件的绘图区域仍然保留,因此如何回到原始位置进而添加更多图形呢?看如下示例。首先生成一个几乎包含所有类型的
热图
组件的图。
denghb001
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2023-08-21 22:53
ComplexHeatmap复杂
热图
绘制学习——11.例子
更多示例参考链接1.为基因表达矩阵添加更多信息
热图
非常流行用于可视化基因表达矩阵。矩阵中的行对应于基因,在表达
热图
之后可以添加关于这些基因的更多信息。
denghb001
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2023-08-21 06:13
2022-06-03如何快速分析植物激素通路相关基因
最经典的两种形式,一是用不同颜色直观展示pathway中的上下调基因;****二是把通路简化成模式图,再用
热图
展示关键基因在各组织中的表达趋势。
麦冬花儿
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2023-08-20 09:55
【MATLAB基础绘图第16棒】绘制
热图
(Heatmap)
热图
(Heatmap)
热图
的主要作用是直观展示重点研究对象的差异情况,多用于经济学与工学差异性分析之中。
WW、forever
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2023-08-20 04:15
#
MATLAB图形绘制技巧
MATLAB
热图(Heatmap)
R 数据可视化 —— 聚类
热图
ComplexHeatmap(二)注释
热图
注释前面我们介绍了如何绘制聚类
热图
,在这一节我们将介绍如何添加注释
热图
的注释是聚类
热图
的重要组成部分,能够将
热图
的行、列附加信息添加到
热图
中。
名本无名
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2023-08-19 14:17
相关性
热图
下面我们就来看下如何用R语言实现相关性计算并绘制带有显著性星标的相关性
热图
。1.相关系数计算以R自带的数据集mtcar
wanghaihua888
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2023-08-18 04:17
热图
展示单细胞转录组基因在不同组中表达阳性细胞差异
近日,看到-生信作曲家-发的帖子,展示的内容是单细胞差异基因的图,是利用
热图
的形式展现的,在一个
热图
上可以展示不同cluster中不同组的基因表达阳性细胞比例,差别一目了然,可以同时展示很多的基因。
KS科研分享与服务
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2023-08-15 19:31
拟时序分析的
热图
提取基因问题
当然具体参数理解需要自行发力哦,见:使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育)用法只是最基础的知识而已,更多的时候,我们需要活学活用,比如课程学员提到的问题,就是因为做不到活学活用,他想知道下面的拟时序分析的
热图
提取基因
Seurat_Satija
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2023-08-15 14:04
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