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热图
R语言: 从pheatmap无缝迁移至ComplexHeatmap
pheatmap是一个非常受欢迎的绘制
热图
的R包。ComplexHeatmap包即是受之启发而来。你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同。
wanghaihua888
·
2023-08-06 08:07
【R语言】
热图
绘制-heatmap+RColorBrewer配色方案
前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制
热图
☞【R语言】
热图
绘制-heatmap函数+默认配色方案☞R语言中的颜色(一)-自带的调色板也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap
生信交流平台
·
2023-08-05 07:59
Python matplotlib 二维图与三维曲面图
1.matplotlibMatplotlib是python的绘图库,可以绘制各种各样的图形,如散点图,线图,直方图,
热图
等等,是数据可视化的得力助手。
backward
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2023-08-02 09:14
DC.js教程_编程入门自学教程_菜鸟教程-免费教程分享
它允许呈现复杂的数据可视化,并具有一个包含条形图、散点图、
热图
等的设计仪表板。DC.js构建为与Crossfilter一起用于数据操作。DC.js使单个(大型)数据集能够通过许多具
IT民工爱搬砖
·
2023-07-31 21:03
笔记
CrossInfoNet: Multi-Task Information Sharing Based Hand Pose Estimation总结
文章链接摘要单深度图2D卷积预测手势将手势估计任务拆分为手掌关节点预测子任务和手指关节点预测子任务,两个子任务之间共享互补有益信息提出基于2D
热图
监督训练手部特征提取网络介绍当前主流方法直接把深度图当作
中了胖毒
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2023-07-29 19:55
R语言绘制环状
热图
实操1
#rm(list=ls())#clearGlobalEnvironment#setwd('F:\\RStudio\\RStudio_workPath\\heatmap')#设置工作路径###安装包#if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=T))#install.packages("BiocManager")#BiocManager::install("
龙star180
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2023-07-29 16:17
[日更千字之08]黄花菜的前世今生
娇艳欲滴图片发自App水深火
热图
片发自App图片发自App凤凰涅槃图片发自App价值翻倍曾经走回路别人价值翻倍是有故事的,你!可曾经历!人间炼狱那几载?涅槃是需要人间炼狱的加持。
释冰心
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2023-07-27 15:26
deeptools
写在前面:参考1参考2BAM和bigWig文件处理质量控制
热图
和其他描述性作图其他deeptools
shine_9457
·
2023-07-26 02:46
【
热图
】
参考:《R数据可视化手册》、学术数据分析及可视化1.pheatmap绘制
热图
热图
常用于展示某种特定的基因表达分布模式,在这里仅提供部分目前用到的绘制
热图
的方法,根据后续的需要进行更新。
lkj666
·
2023-07-25 03:06
Coding and Paper Letter(六十九)
1Coding:1.基于Python和Matplotlib的日历
热图
。
chengman0008
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2023-07-25 01:26
界面控件Telerik UI for WinForms R2 2023——发布全新的
热图
控件
TelerikUIforWinForms拥有适用WindowsForms的110多个令人惊叹的UI控件。所有的UIforWinForms控件都具有完整的主题支持,可以轻松地帮助开发人员在桌面和平板电脑应用程序提供一致美观的下一代用户体验。在本文中,我们将揭秘一下TelerikUIforWinFormsR22023新版本新的改变吧~获取TelerikUIforWinFormsR22023正式版下载(
界面开发小八哥
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2023-07-24 08:24
ui
界面控件
UI开发
telerik
【pheatmap
热图
scale报错】Error in hclust(d, method = method):NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 11)
初始数据类似如下:image.png填充下缺失值data[data==0]<-NAdata[is.na(data)]<-min(data,na.rm=T)*0.01pheatmap(log10(data))pheatmap(data,scale="row")直接取log绘制不报错,但做scale时报错:Errorinhclust(d,method=method):NA/NaN/Infinforei
米源MY
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2023-07-23 19:53
grafana安装及监控Prometheus
它主要有以下六大特点:1、展示方式:快速灵活的客户端图表,面板插件有许多不同方式的可视化指标和日志,官方库中具有丰富的仪表盘插件,比如
热图
、折线图、图表等多种展示方式;2、数据源:Graphite,InfluxDB
在路上的阿帅
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2023-07-22 00:19
监控模块
linux
centos
运维
四月|戳到你心坎了吗?
四月图片发自App没有冬季的寒冷图片发自App没有夏季的炎
热图
片发自App这么美的四月戳到你心坎了吗?图片发自App
诗和远方的假象
·
2023-07-21 20:00
使用Origin绘制相关性热力图:Correlation Plot (附工具下载及安装步骤)
相关性
热图
在很多文章中都有出现,一般都是使用R或者matlab语言进行绘制。
BetterQ.
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2023-07-20 21:09
绘图
Origin
相关性热力图
跟着Nature学作图:R语言pheatmap包做
热图
论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接,可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的
小明的数据分析笔记本
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2023-07-19 22:30
《炎热的夏季,一定是属椒盐的》
炎热的夏季一定是属椒盐的连烧烤都能省一半的燃气慵懒的想泡在水里连欲望也泄了一半的气图片发自App蝉终于脱了壳在这个寂静的中午奋力的叫着夹杂几处鸟儿的鸣叫夏日的炙烤使万物枯萎而树林却给了它们新生欢脱的想对抗那灼人的
热图
片发自
雪间四月
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2023-07-19 21:34
注释气泡图函数(更新)
之前我们写过一个原创可视化函数Dotplot_anno.R,nature级别图表:一个注释气泡
热图
函数(适用于单细胞及普通数据)。主要解决的问题是1)单细胞基因可视化分组注释。
TS的美梦
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2023-07-19 16:18
ggplot2
单细胞
气泡图
注释
R语言学习——绘制
热图
deg=read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/32R
热图
/32_eatmap/MIR_DEG_fc_2.5_pval_0.01.txt',header=T
帅锅不识字
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2023-07-19 14:07
r语言
学习
开发语言
ComplexHeatmap复杂
热图
绘制学习——7.OncoPrint
OncoPrintOncoPrint是一种通过
热图
可视化多个基因组变化的方法。这里的ComplexHeatmap包提供了一个制作oncoPrints的函数oncoPrint()。
denghb001
·
2023-07-19 01:47
复现NC图表:相关性分析气泡图(
热图
)---同时展示正负调控关系和显著性
还是继续复现NC图表,这幅图展示的是相关性分析结果,可以叫做气泡
热图
,我们之前说过
热图
也可以这么做(
热图
5:ggplot2画
热图
及个性化修饰)。
KS科研分享与服务
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2023-07-18 22:35
R数据分析:冲击流图与
热图
的做法以及多图布局
今天看了一篇新冠肺炎相关后遗症的文章,主要探讨新冠住院病人一年后的后遗症情况,文章的统计分析很简单,不过结果展示中的两个图我觉的大家可以学一学,原文如下Rivera-Izquierdo,M.,Láinez-Ramos-Bossini,A.J.,deAlba,I.GF.etal.LongCOVID12monthsafterdischarge:persistentsymptomsinpatientsh
Codewar
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2023-07-18 19:47
使用Requests爬取网页图片并保存
目标爬取糗事百科上的“
热图
”的图片并保存在一个新建文件夹当中过程一、获得当前网页使用的是requests爬虫,在使用requests库爬取网页中有介绍。
露葵025
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2023-07-18 14:27
爬虫
python
掌握 Seaborn:Python 数据可视化高级篇
在这篇高级篇中,我们将更进一步,介绍如何使用Seaborn创建复合图形,如网格图、因子图和聚类
热图
等。一、网格图网格图(Grids)是一种用于显示高维数据关系的强大工具。
青春不朽512
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2023-07-18 05:18
python知识整理
python
信息可视化
开发语言
corplot绘制SCI级相关性
热图
(基础知识)
最近年中总结,我们学习一些基础知识利用corrplot包中的corrplot()函数corrplot介绍:使用:corrplot(corr,method=c(“circle”,“square”,“ellipse”,“number”,“shade”,“color”,“pie”),type=c(“full”,“lower”,“upper”),add=FALSE,col=NULL,bg=“white”,
单细胞空间交响乐
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2023-07-18 00:44
电气器件系列四十:红外热成像仪
通俗地讲热像仪就是将物体发出的不可见红外能量转变为可见的
热图
像。
热图
像的上面的不同颜色代表被测物体的不同温度。原理:热红外成像原理-知乎科普|红外热成像技术是什么?
Gutie_bartholomew
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2023-07-17 03:23
电气器件系列
红外成像
2023美国大学生数学建模竞赛E题光污染完整数据集和求解代码分享
目录数据集收集GeoNames地理数据集全球各国的经纬度数据集协调一致的全球夜间灯光(1992-2018)数据集NASA的EaNBlueMarble2016数据集全球夜间数据集读取数据集绘制
热图
光污染分析数据集和代码地址
Kerry_6
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2023-07-16 13:08
人工智能
算法
matlab
python
数据挖掘
superheat | 超级简单的
热图
绘制解决方案!~(手把手教学~)(一)
1写在前面画
热图
一直是一件既简单又复杂的事情,想画个普通的
热图
还是挺简单的,但是复杂
热图
就要费事的多了。
生信漫卷
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2023-07-16 08:25
后端
superheat | 超级简单的
热图
绘制解决方案!~(二)(聚类和注释图的添加~)
1写在前面前面写了superheat的教程,今天写一下第二波,如何进行聚类以及添加注释图吧。分分钟提升你的heatmap的颜值哦!~2用到的包#devtools::install_github("rlbarter/superheat")library(superheat)library(tidyverse)3示例数据data("mtcars")DT::datatable(mtcars)4行聚类4.
生信漫卷
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2023-07-16 08:53
后端
南瓜炖土豆(不放大虾了)
App葱姜切段图片发自App料酒酱油图片发自App豆油加荤油图片发自App葱姜爆出香味,烹入料酒酱油图片发自App加入南瓜土豆翻炒图片发自App图片发自App加入清水图片发自App加入肉片图片发自App加
热图
片发自
无奈永恒
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2023-07-16 02:36
R语言ggplot2绘制
热图
展示GO富集分析结果的简单小例子
昨天有读者在公众号留言问下面这个
热图
如何画image.png这个图的实现办法有很多,今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2实现上图的代码。
小明的数据分析笔记本
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2023-07-16 00:31
【R语言】heatmap绘制
热图
并显示样本类型
前面分了四期类型给大家讲了绘制
热图
时的配色方案☞【R语言】
热图
绘制-heatmap函数+默认配色方案☞【R语言】
热图
绘制-heatmap+gplots配色方案☞【R语言】
热图
绘制-heatmap+grDevice
生信交流平台
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2023-07-15 15:35
利用R语言中pheatmap绘制
热图
1.设置工作目录和安装和加载所需的R包需要安装vegan包,利用命令install.packages("vegan")如图显示,表明安装成功并加载2.导入数据利用read.table()函数来导入原始数据header=T表示将第一行设置为列名,row.names=1表示将第1列设置为行名下图,数据读取成功然后将读取的数据存储到一个新的变量data中,方便后期处理data1.5,"*",""),nr
生信学习小达人
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2023-07-15 04:11
R
r语言
什么是Heatmap(
热图
)图表?用DHTMLX可实现快速构建
DHTMLXChart是DHTMLX最新发布的JavaScriptUI小部件库的核心内容之一,这个图表小部件收到了几个重要的更新,但其中最引人注目的是一个新的数据可视化选项——日历
热图
。
界面开发小八哥
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2023-07-14 18:39
信息可视化
使用ComplexHeatmap绘制复杂
热图
|Note2:单个
热图
(万字超详细教程)
complexheat_2.jpg2.单个
热图
2.1颜色2.2标题2.3聚类2.3.1距离方法2.3.2聚类方法2.3.3渲染树状图2.3.4重排树状图2.4设置行列顺序2.5维度名称2.6
热图
分割2.6.1
木舟笔记
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2023-07-14 09:15
喜欢上黑夜
多少年我享受着阳光的照射数着啊日头东边升起西头落有一天恰巧碰到月光在为大地倾泻悸动的心顿时撒上一层银白色想着是要逃离我却表现的不知所措我承认是我对白昼犯了错既然喜欢上黑夜就别再不冷不
热图
片发自App图片发自
十六岁捉住的那只蝉
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2023-07-14 01:46
2023.06.27 更新:新增声望里程碑和声望
热图
新功能新增声望里程碑概念,展示你的社区身份上线声望主页,支持查看声望里程碑和所有社区权益说明优化更新用户主页更新,新增声望
热图
查看每日声望变化优化新用户引导,新增推荐理由和更多推荐信息展示优化权限弹窗文案修复缺陷修复部分场景
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2023-07-13 15:51
segmentfault
GEO:图表和基础概念介绍
图表介绍1.
热图
输入数据是数值型矩阵/数据框颜色变化表示数值大小差异基因
热图
与相关性
热图
image.pngimage.png2.散点图和箱线图2.1散点图强调个体概念image.png2.2箱线图强调分组概念
认真学习小饼叽
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2023-06-24 09:42
好看的
热图
绘制教程|重现
前言在2019年第一次分析了使用heatmap包绘制
热图
:数据可视化|聚类
热图
-(jianshu.com),在2021年11月29日我又水了前面的码再次分享了一次(PS:全部粘贴复制)。
小杜的生信筆記
·
2023-06-23 23:06
MATLAB | 绘图复刻(十) | 旋转45度的相关系数
热图
绘制
我们在论文里经常能见到这样三角形的相关性
热图
,这样的
热图
绘制出来会更节省空间:这期就教大家如何绘制三角形的
热图
,绘制效果如下:以下是教程部分:0数据准备这里随便生成了一组数据,计算了相关系数,同时给出了各个变量名
slandarer
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2023-06-21 09:18
matlab
数学建模
开发语言
科研作图-heatmap(一)
1.简介在科研中有很多地方为了可解释给审稿人提供了
热图
,便于知道深度学习中到底是哪部分在起作用,或者是在机器学习中分析不同的特征之间是否存在相关性?
CV交流会
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2023-06-20 11:42
科研作图
几个实用数据可视化图表Python代码!
我们经常使用柱状图、直方图、饼图、箱图、
热图
、散点图、线状图等。这些典型的图对于数据可视化是必不可少的。
Python妙妙屋
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2023-06-18 22:12
信息可视化
python
开发语言
大山的心事
乌鸦偷走了酒壶那流水的速度正好拉响了风的提琴苔藓的哲学又一次征服了悬崖飞鸟和蚂蚁讨论着爱情的快乐图片发自App整个世界都在流水声中符合着叶子不断变幻着浪花的颜色山把所有的绿整理一次再整理一次她让所有的落花都可以和流水亲
热图
片发自
安凌_8551
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2023-06-18 19:34
热图
3:
热图
行列分组信息注释
这次我们要让
热图
更加复杂化。实际上,有些情况下做
热图
可能只需要标注对照组、实验组即可。
TS的美梦
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2023-06-15 20:43
热图
r语言
聚类
热图
5:ggplot2画
热图
及个性化修饰
这节我们讲下ggplot做的
热图
。实际上,之前heatmap已经足够了,但是ggplot2画图可以进行一些特殊的个性化修饰,一些比较特殊的
热图
也是通过ggplot做的。
TS的美梦
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2023-06-15 20:43
热图
r语言
数据挖掘
开发语言
openpose保姆级教程代码详细解析——预测部分
目录一:前言二:预测加载训练好的模型三:加载预测模型的各个层四:计算了关键点
热图
、人体姿态辅助图,图像的尺度变换因子五:对图片进行缩放,计算缩放的比例因子六:对图像进行预处理的函数六:将处理后的图片输入加载好的训练好的模
QTreeY123
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2023-06-15 05:15
人工智能
计算机视觉
神经网络
深度学习
R语言- ComplexHeatmap 绘制复杂
热图
示例
热图
(Heatmap)作为展示基因表达模式最直观的工具。
倪桦
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2023-06-14 14:17
Detr空间注意力
热图
及语义注意力
热图
可视化
文章目录前言完整代码GitHub链接附录:可视化resnet50最后一层特征图前言 之前一直比较好奇ConditionalDetr中如何可视化各个头部的空间注意力
热图
的,于是,本人尝试在Detr基础上实现了一个
武乐乐~
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2023-06-13 07:46
mmcv和mmdet源码注释版
pytorch
卷积神经网络中和自注意力机制中的注意力
热图
如何绘制?
1、自注意力机制中的
热图
绘制方法自注意力机制是深度学习中常用的一种机制,它可以使模型能够自动地学习输入中不同位置的关联性。
83斤玉树临风
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2023-06-13 07:41
cnn
python
深度学习
ComplexHeatmap复杂
热图
绘制学习——10.其它高级图
其它高级图参考链接1.密度
热图
我们通常使用箱线图或小提琴图可视化矩阵或列表中的数据,。我们还可以使用颜色来映射密度值并通过
热图
可视化分布。如果您有大量数据要可视化,这将非常有用。
denghb001
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2023-06-12 22:03
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