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生信R语言
EasyExcel实现复杂Excel的导入
1.Excel样板如上图,需要导入学校学
生信
息。前面三列,固定为学校班级信息,可以理解为主表。从第四列开始,为学
生信
息,其中一列为一条子表信息。
小卡车555
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2024-09-14 23:05
java处理excel
excel
R语言
标准普尔500指数Garch(1,1)模型
一、例3.3标准普尔500指数的月超额收益率,从1926年开始,共792个观察值,如图所示。记rt为超额收益率,rt的样本ACF和rt2的样本PACF。在间隔为1,3时有少许序列相关性,但主要特征是平方序列显示的强烈线性相关性。例题建立garch(1,1)模型的过程:(1)应用arma(p,q)模型消除数据的线性依赖(2)在arma(p,q)模型基础上,建立garch(1,1)模型(3)改进g
ronghuilin
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2024-09-14 22:51
R 地图绘制-比例尺与指北针
ggplot绘制map
R语言
可以进行数据分析,也可以进行地图绘制,而且非常简洁,快速。
jamesjin63
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2024-09-14 21:30
读书笔记
雅斯贝尔斯再进一步来看,他说:“真正使人产
生信
仰的,既不是宇宙万物,也不是人生的特别遭遇,而是人的自由。一个人意识到自己是自由的,就等于确信了上帝的存在。”
归根曰静
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2024-09-14 11:26
高情商沟通(9)迅速破冰建立信任,持续获得好感
高情商,两人相遇无话可说,实质是彼此没有安全感,而让对方有安全感的基本是信任感,破冰就是要让对方产
生信
任感,建立信任的目的:在沟通中,建立彼此之间的信任感,其最重要的目的,是建立起良好的人脉关系,建立信任的需求
叁叁二二叁磊设计
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2024-09-14 07:19
javaweb基于ssm框架学
生信
息管理(成绩)系统设计与实现
开发平台、开发工具、应用服务器的介绍开发平台:Windows开发工具:idea+mySql应用服务器:ApacheTomcat8.0学生成绩管理系统主要用于学校学生成绩信息管理,能实现学生、老师、院系、班级、课程的增删改查操作,同时学生能进行选课和退课操作,老师能对学生的成绩录入和修改操作。系统流程图功能结构图部分截图免费源码获得:扫码关注微信公众号:ancenok,然后回复:013
ancen_73bd
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2024-09-14 06:08
纯
生信
很难发表?只是你没有及时抓住研究热点
当你还做meta分析的时候,你会发现meta分析很难发或者单位已经不承认了,而聪明的人已经开始做常规的
生信
GEO、TCGA数据挖掘这些(这个时候
生信
比较好发)。
SCI狂人团队
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2024-09-13 20:01
学习小组Day4笔记--王英芳
R语言
基础准备工作电脑用户名需要是英文R基础,Rstudio人性化界面资源Rfordatasciencechapter1下载RandRstudio给自己一个全新的
R语言
环境R是什么一种变成语言,统计计算和绘图的环境
一万万万万
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2024-09-13 19:51
R语言
基础笔记
起因:今天不知道要写什么。把之前的笔记复制一下。代码开头,导入:#清除系统变量rm(list=ls())#隐藏警告信息:options(warn=-1)#把当前目录,设置为工作目录。library(rstudioapi)current_folder_path0.0&ideology<10.0)分组聚合,类似groupby()df2<-aggregate(df1KaTeXparseerror:Exp
waterHBO
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2024-09-13 15:38
r语言
笔记
开发语言
本周回顾2021-02-28
目标
生信
、交易系统、健身、写作、音乐本周完成节食坚持了11天,周末最终还是中断了,明天继续。工作较忙,加上沟通问题,对于
生信
有些动摇。音乐上还是要加强练习。反思管住嘴,坚持住。
曾有卓
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2024-09-13 14:26
R语言
包AMORE安装报错问题以及RStudio与Rtools环境配置
在使用
R语言
进行AMORE安装时会遇到报错,这时候需要采用解决办法:'''AMORE包安装,需要离线官网下载安装包:Indexof/src/contrib/Archive/AMORE(r-project.org
卡卡_R-Python
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2024-09-13 14:29
R语言数据分析与可视化
r语言
开发语言
本周回顾2021-10-31
目标
生信
、交易系统、子女教育、健身、写作、音乐本周完成健身一次,节食3天,效果不好,下周继续健身其实孩子的老师原来愿意SL,有喜有忧吧孩子玩乐高非常投入,可以说忘我,这还真是天生的。
曾有卓
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2024-09-13 13:25
Java 知识框架主要包括面向对象、集合框架、异常处理、泛型和多线程等知识
案例:创建一个学生类,包含学生的姓名和年龄属性,以及获取学
生信
息和修改学
生信
息的方法。publicclas
爱摄影的程序猿
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2024-09-13 03:44
JAVA面试
java
开发工具
windows
java
spring
boot
2019-06-19暑期补习,你怎么看?
2019/6/195/17周三多云眼下,已经开始有一些教育培训机构在已经在争先恐后的开始发放起来了,琳琅满目的招
生信
息一下子席卷而来。话说,这离放假还早着呢,你们就这么着急开始收学生了吗?
M曼君
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2024-09-13 01:29
sql 外键约束
创建有外键约束的数据库表首先创建父表这里用的学
生信
心录入为例子--创建父表:班级表createtablet_class(cnoint(4)primarykeyauto_increment,cnamevarchar
Tanjarh
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2024-09-12 22:45
MySQL笔记
sql
生态位宽度计算&可视化展示(
R语言
)
生态位宽度是指物种(或其它生物单位)在群落中所利用的各种不同资源的总和。物种的生态位越宽,该物种的特化程度就越小,倾向于泛化种(generalistspecies);物种的生态位越窄,倾向于是一个特化种(specialistsspecies)。本篇所使用为生态位宽度指数即**Levins的生态位宽度指数。**(除此之外也有用shannon指数)#安装并加载必要的包if(!requireNamesp
光疏介质
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2024-09-12 17:12
r语言
生信
人应该这样来装软件(未完待续)
P1优先选择二进制可执行软件来安装不同组学任务模块比对重要全基因组测序/外显子测序找差异和变异转录组相关计数软件安装规律:二进制,下载解压,全路径调用#C语言查看在还是不在whichmakewhichcmakewhichjavawhichperlwhichpython#查看版本python--versionperl--version查看版本,版本问题导致错误如何判断所有软件是否是二进制,进入软件官
dandanwu90
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2024-09-12 15:50
R语言
多项逻辑回归-因变量是无序多分类
因变量是无序多分类资料(>2)时,可使用多分类逻辑回归(multinomiallogisticregression)。使用课本例16-5的数据,课本电子版及数据已上传到QQ群,自行下载即可。某研究人员欲了解不同社区和性别之间居民获取健康知识的途径是否相同,对2个社区的314名成人进行了调查,其中X1是社区,社区1用0表示,社区2用1表示;X2是性别,0是男,1是女,Y是获取健康知识途径,1是传统大
医学和生信笔记
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2024-09-12 09:22
医学统计学
r语言
医学统计学
生信
学习Day-1
1.如何学习2.怎样解决学习中遇到的问题?a.第一步:搜索:首选-谷歌,其次-必应,大神级的搜索引擎:虫部落快搜。专业教程-搜狗微信、搜狗知乎、、githubb.第二步:如果你的问题不知该如何搜索,可在微信群中与小组成员讨论c.第三步:正确的提问3.如何搭建高效的学习平台a.效率软件:(1)浏览器-chrome浏览器简洁高效无广告,可以添加插件,比如”沙拉查词”(自行搜索),可以即时翻译。(2)电
GJJDr
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2024-09-12 04:28
Protocol Buffer编译器安装
该站点上的大多数示例代码都使用protocolbuffe
r语言
(proto3)的版本3。protocolbuff
雪域迷影
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2024-09-12 03:22
R语言
自学笔记-2内置数据集
#b站视频——
R语言
入门与数据分析#内置数据集#固定格式的数据(矩阵、数据框或一个时间序列等)#统计建模、回归分析等试验需要找合适的数据集#R内置数据集,存储在,通过help(package="datasets
实验室长工
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2024-09-12 00:36
7+纯
生信
,单细胞识别细胞marker+100种机器学习组合建模,机器学习组合建模取代单独lasso回归势在必行!
影响因子:7.3研究概述:皮肤黑色素瘤(SKCM)是所有皮肤恶性肿瘤中最具侵袭性的类型。本研究从GEO数据库下载单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集,根据原始研究中定义的细胞标记重新注释各种免疫细胞,以确定其特异性标志。接着通过计算免疫细胞通信网络,结合对通信网络的大量分析和通信模式的识别,对所有网络进行了定量表征和比较。最后基于bulkRNA测序数据,使用机器学习训练了枢纽通讯细胞的特定
生信小课堂
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2024-09-11 14:08
在TCGA上下载数据并且进行处理
使用
R语言
脚本对数据进行处理,将其提取为genesymbol和样本的数据,推荐看一下该博主处理数据!!真的非常详细!他
R语言
脚本在这个链接里
Red Red
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2024-09-11 09:00
生信小技巧
r语言
数据库
R语言
-非结构化数据-文本数据读入
#2.2.2非结构化数据-文本数据读入rm(list=ls())#清空工作空间##1.读入简单文本数据###假如数据包含大量经过结构化的文本数据#只需按照读入csv等标准式数据的方法读入#例:novel=read.csv("novel.csv",fileEncoding="UTF-8")head(novel)##2.用readtable读入文本###文本数据普通读法test=read.table(
pdc31czy
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2024-09-10 22:44
R
r语言
数据分析
学习小组Day3笔记--安之若素
Conda的安装与初步使用Conda是Linux环境下的软件安装与管理工具相当于应用商店,日常
生信
使用miniconda即可miniconda的下载与安装从清华镜像下载miniconda3安装包wgethttps
安之若素_9e53
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2024-09-10 20:09
Coding and Paper Letter(十四)
1Coding:1.
R语言
包ungeviz,ggplot2的拓展包,专门用来作不确定性的可视化。ungeviz2.计算机图形学相关开源项目。计算机图形学光线追踪开源项目C++源码。
G小调的Qing歌
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2024-09-10 13:10
r语言
做绘制精美pcoa图_
R语言
高级绘图 — ggplot2
2)PCA的作图PCA主成分分析,可以将高维数据进行降维处理。我们的OTU表格就是典型的高维数据,可以对其进行降维处理得到主成分PC1和PC2,然后将所有样品都分解到这两个成分方向,进行散点绘图,可以直观的看出样品间的差异。首先需要一系列的统计处理,然后用ggplot2进行绘图,过程如下:#加载需要的三个包(需要先下载,再加载)>library(ade4)>library(ggplot2)>lib
weixin_39560002
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2024-09-10 06:59
r语言做绘制精美pcoa图
科研绘图系列:
R语言
扩展物种堆积图(Extended Stacked Barplot)
介绍
R语言
的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具,它不仅展示了物种的堆积结果,还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。
生信学习者1
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2024-09-09 16:10
SCI科研绘图系列
r语言
数据可视化
数据分析
科研绘图系列:
R语言
柱状图分布(histogram plot)
文章目录介绍加载R包读取数据画图介绍柱状图(BarChart)是一种常用的数据可视化图表,用于展示和比较不同类别或组的数据。它通过在二维平面上绘制一系列垂直或水平的柱子来表示数据的大小,每个柱子的长度或高度代表一个数据点的数值。柱状图非常适合于展示分类数据的分布和比较。柱状图的特点:直观比较:柱状图可以直观地展示不同类别之间的数值比较,易于理解。分类展示:数据按照类别或组别进行分组展示,每个类别用
生信学习者1
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2024-09-09 15:06
SCI科研绘图系列
r语言
数据可视化
科研绘图系列:
R语言
富集散点图(enrichment scatter plot)
介绍富集通路散点图(EnrichmentPathwayScatterPlot)是一种数据可视化工具,用于展示基因集富集分析(GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA)的结果。横坐标是对应基因名称,纵坐标是通路名称,图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue,可以简单理解为不同环境下的贡献大小。加载R包导入所需要的R包,在导入前需要用户自己安装。library(readxl)l
生信学习者1
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2024-09-09 14:57
SCI科研绘图系列
r语言
数据可视化
tkinter+sqlite3学
生信
息管理系统_python图形界面数据库tkinter+sqlite3
网上学习资料一大堆,但如果学到的知识不成体系,遇到问题时只是浅尝辄止,不再深入研究,那么很难做到真正的技术提升。需要这份系统化学习资料的朋友,可以戳这里获取一个人可以走的很快,但一群人才能走的更远!不论你是正从事IT行业的老鸟或是对IT行业感兴趣的新人,都欢迎加入我们的的圈子(技术交流、学习资源、职场吐槽、大厂内推、面试辅导),让我们一起学习成长!用到了sqlite数据库,std_data.py文
2301_82244392
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2024-09-09 14:26
程序员
python
学习
面试
Python-Matplotlib安装及简单使用
Matplotlib是一个Python的图形框架,类似于MATLAB和
R语言
。
riyuexingchen0909
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2024-09-09 11:06
python
python
图形
sublime安装python库_Mac OS 轻松用 Sublime Text 3 配置Python编译环境
最近在学习数据分析相关的知识,对比Python和
R语言
在数据分析领域的优劣,Python更胜一筹。要学习Python,首先需要搭建编译环境。
weixin_39603397
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2024-09-09 06:34
0基础跟德姆(dom)一起学AI Python进阶03-面向对象版: 学生管理系统
*面向对象版:学生管理系统*Student学生类*StudentCMS学生管理类*main.py程序的主入口*加入文件:student.txt存储学
生信
息*深拷贝和浅拷贝*可变类型*不可变类型---1.
跟德姆(dom)一起学AI
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2024-09-08 11:22
python
开发语言
人工智能
在linux(ubuntu)中使用网页版的rstudio
RStudio是
R语言
集成开发环境的应用软件,RStudioServer是一个基于web访问的RStudio云端开发环境,需要安装在服务器上,支持多用户远程访问使用。
Chao_Powell_Hou
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2024-09-08 11:46
推荐一份生物信息学入门很好的参考材料
/tutorials-2/这个是康涅狄格大学(UniversityofConnecticut)提供的一份教程,主要的内容包括1、生物信息学中经常用到的文件格式image.png2、linux操作系统和
R语言
的基础知识
小明的数据分析笔记本
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2024-09-08 09:58
第十四节:学习Springboot 的restful接口风格(自学Spring boot 3.x的第三天)
RequestBodyStudentstudent){studentService.save(student);returnstudent;}注意:传参使用RequestBody删(DeleteMapping)/***删除学
生信
息
Mero技术博客
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2024-09-08 05:11
从零开始学习Spring
Boot
3.x
学习
spring
boot
restful
seurat提取表达矩阵_10X scRNA免疫治疗学习笔记-3-走Seurat标准流程
刘小泽写于19.10.15笔记目的:根据
生信
技能树的单细胞转录组课程探索10XGenomics技术相关的分析课程链接在:http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html
幸福的小酒瓶
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2024-09-07 18:25
seurat提取表达矩阵
自己公司业务逻辑,仅做个记录备份方便查阅
余额表:ID、剩余课时、剩余金额、学生ID、date消耗明细表:ID、学生名字、家长名字、单次消耗课时、单次消耗金额、当前剩余课时、当前剩余金额、上课老师后台管理逻辑思维:超级管理员登录后台,首先输入学
生信
息
风中凌乱的男子
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2024-09-07 16:30
使用集合操作思路,查询选修了CS305,但没有选修CS315的所有学
生信
息
--23.2使用集合操作思路,查询选修了CS305,但没有选修CS315的所有学
生信
息。
naughty610
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2024-09-07 11:36
sql
R语言
基础学习
R与RStudio
R语言
是数据科学和统计分析的语言,适合数据分析和数据可视化。R是开源的,拥有丰富的包(packages),可以与优化软件进行交互。
weixin_55475210
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2024-09-06 19:54
r语言
学习
开发语言
Linux编程--信号基础
有时也称为软件中断2.引发内核为进程产
生信
号的各类事件如下:硬件发生异常,即硬件检测到一个错误条件并通知内核,随即再由内核发送相应信号给相关进程。
玮玮豆豆
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2024-09-06 12:01
linux
linux
mysql 复杂 语句_Mysql复杂查询语句汇总(仅供学习)
*FROMsJOINscONs.id=sc.sidWHEREs.sn='朱欣磊'5查询没有选择数学课的学
生信
息SELEC
铁扇公子
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2024-09-06 12:30
mysql
复杂
语句
零基础入门
生信
数据分析——导读
零基础入门
生信
数据分析——导读
生信
数据分析,即生物信息学数据分析,是一个涵盖了生物学、计算机科学、数学和统计学等多个领域的交叉学科。
呆猪儿
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2024-09-06 02:32
生信之转录组——上游分析
生信之转录组——下游分析
学习方法
r语言
数据分析
数据库
数据挖掘
需求分析
大数据
Python程序设计之 —— 简易学
生信
息管理系统_用python做信息管理系统
前言Python简介Python是一个高层次的结合了解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。Python的设计具有很强的可读性,相比其他语言经常使用英文关键字,其他语言的一些标点符号,它具有比其他语言更有特色语法结构。Python是一种解释型语言:这意味着开发过程中没有了编译这个环节。类似于PHP和Perl语言。Python是交互式语言:这意味着,您可以在一个Python提示符>>>后直接执行
2401_84556837
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2024-09-05 18:06
程序员
python
开发语言
铁死亡、细胞焦亡都发了一篇纯
生信
,就差这个热点还没有发
有粉丝说自己发了一篇铁死亡的纯
生信
,细胞焦亡的纯
生信
也发了一篇,现在还想发一篇纯
生信
。好想找一个少人做的热点来继续搞一篇纯
生信
,但是不知道有没有这样的热点?
SCI狂人团队
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2024-09-05 15:01
学习小组Day5笔记--森蝶
6.表格在
R语言
中改名叫数据框7.函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮
松风
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2024-09-04 23:42
c语言结构体存储图形示例,C语言 结构体(Struct)详解及示例代码
但在实际的编程过程中,我们往往还需要一组类型不同的数据,例如对于学
生信
息登记表,姓名为字符串,学号为整数,年龄为整数,所在的学习小组为字符,成绩为小数,因为数据类型不同,显然不能用一个数组来存放。
龙猫美术的世界
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2024-09-03 19:03
c语言结构体存储图形示例
lncRNA数据分析专题
欢迎关注”
生信
修炼手册”!
生信修炼手册
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2024-09-03 09:30
学习小组Day6笔记--魏麻将
注意:学
生信
,
R语言
必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种
生信
分析R包。安装和加载R
魏麻将
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2024-09-03 08:34
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