【GATK加速】替换BWA/GATK/Mutect2,Sentieon软件 肿瘤体细胞突变检测分析指南-系列1(WES or WGS)
前言本文介绍了两种体细胞变异检测pipeline:TNscope:使用Sentieon特有的算法,拥有更快的计算速度和更高的计算精度,对临床基因诊断样本尤其适用;TNhaplotyper2:匹配Mutect2(现在匹配到4.1.9)结果的同时,计算速度提升10倍以上。关于TNscope和TNhaplotyper2的完整脚本,可访问:https://github.com/Sentieon/senti