AMBER

Amber 中Lipid11 PDB文件的格式

     LIPID11中每个磷脂分子由3个残基组成。当在LEAP程序中加在磷脂的PDB文件时，LEAP程序就可以将分子的头部和尾部连接在一起。为了使LEAP能够正确的识别磷脂分子，PDB中残基的定义方式应当按照下面的定义方法：                                  PDB中的每一个磷脂分子的定义：                                    
rogerzhanglijie·2013-01-08 10:00

Redhat 5.6中 Amber12的安装

               今天下午弄了将近5个小时，终于把AMBER12给装上了.一开始用GNU编译了好几次，总是出现错误，原因可能是ifortran的错误，但始终没有解决，最终不得不选择用intel
rogerzhanglijie·2013-01-06 19:00

Amber12发布了

著名的分子动力学模拟软件Amber最近发布了新版本Amber12。同时，AmberTools也发布了新版AmberTools12。
rogerzhanglijie·2012-12-26 09:00

Iphone中的UIView开发 (转)

http://blog.csdn.net/amber_tear/article/details/7764195 
zj510·2012-12-24 21:00

Amber中利用nmode模块进行熵计算

最近在对一个系统进行MD计算模拟，在对生成的轨道做能量分析时，突然遇到点问题，也就是对系统熵的计算。主要原因也就是自己系统太大，没法进行熵计算。因此，就需要将系统中关键部位的残基拿出来构建一个小系统。我看目前许多发表的文章也是按照这个思路在做。如何定义关键部位呢，通常选取小分子周围8-12A范围的残基作为关键残基，并与小分子一起拿出来共同构建一个小系统。    我具体的做法如下：    1.确定关
rogerzhanglijie·2012-11-06 10:00

AMBER分子动力学简例

                   AMBER分子动力学简例（一）概述以下是使用AMBER包的简单教程，希望对开始学习分子动力学的同学有用处。
rogerzhanglijie·2012-10-18 09:00

amber中生成小分子模板（转）

amber中生成小分子模板（转）第一步：生成小分子模板蛋白质中各氨基酸残基的力参数是预先存在的，但是很多模拟过程会涉及配体分子，这些有机小分子有很高的多样性，他们的力参数和静电信息不可能预存在库文件中，
rogerzhanglijie·2012-10-16 10:00

poj 2396（有源汇的上下界可行流。。。。。dinic）

上下流相关的网络流的各种问题在Amber大牛的《图论原理》里讲的特备清楚。。。。。资料需要网上下载。。我就把原文摘抄下来吧。。。。。。
luyuncheng·2012-09-04 20:00

工作流流程条件配置

在wf_amber.indysp_cond_type中插入一条记录，cond_type为上面查出的NAME   3.添加一个流程条件：    
荒村听雨31·2012-08-17 15:00

poj 2396(有上下界的 可行流)

Amber大牛的《图论原理》：问题模型：给定一个加权的有向图，满足：(1)容量限制条件：(2)流量平衡条件：(2)中的即除了源汇外，所有点都满足流量平衡条件，则称G为有源汇网络；否则，即不存在源汇，所有点都满足流量平衡条件
Weiguang_123·2012-08-05 15:00

SPOJ 839 Optimal Marks 最小割模型的转化（按位求最大流）

此题Amber的论文上还是有讲，建图的方法就不再赘述题意描述：一个无向图，一些顶点权值已知而一些顶点权值未知，其中图中边的权值为其关联的两个顶点的异或值，现在让你在未知权值的顶点上填上权值后使得要求所有的边权之和最小
sdj222555·2012-08-04 20:00

ZOJ 2676 01分数规划 最小割

一个典型的01分数规划， 建图详见amber的论文很详细了这种题最有可能出问题的是二分精度。尤其是之前做过的一个密度子图的题。
sdj222555·2012-08-04 17:00

POJ 3155 最大密度子图 二分+最小割

还是参考amber的论文最小割那篇这道题建图的话按照论文上建就可以。但是对于本题来讲，最最蛋疼的地方绝对不是建图，而是精度。
sdj222555·2012-07-29 04:00

更换pdb文件中的特定的字符使之转换为能够在AMBER中运行的pdb文件

""""author:lijiezhangdata:2012-05-24func:thisscriptisusedtoremovetheatomorlinewhichisnotneededinthefileform"""importglobL=["HB","O5T","H2A*","O3T","HN6A","HN6B","HE","HN2A","HN2B","H2B*","HN4A","HN4B"
rogerzhanglijie·2012-06-06 13:00

LINQ Group by 多列值在C#与VB.Net上写法的区别

,FName="John",Age=23,Sex='M'},newEmployee{ID=2,FName="Mary",Age=25,Sex='F'},newEmployee{ID=3,FName="Amber
兔子党-督察·2012-06-04 14:20

LINQ Group by 多列值在C#与VB.Net上写法的区别

FName="John",Age=23,Sex='M'}, newEmployee{ID=2,FName="Mary",Age=25,Sex='F'}, newEmployee{ID=3,FName="Amber
q107770540·2012-06-04 14:00

公司工作流问题查询

    1.查代办工单   用户:amber  数据库：XMSGPM   1.select * from wf_amber.indywf_worklist_cur
荒村听雨31·2012-05-17 17:00

Amber is an implementation of the Smalltalk language that runs on top of the JavaScript runtime.

AmberisanimplementationoftheSmalltalk-80language.Itisdesignedtomakeclient-sidedevelopmentfasterandeasier.Itallowsdeveloperstowriteclient-sideheavywebapplicationsinSmalltalk.Amberincludesanintegratedde
·2012-04-23 00:00

POJ 2987 最大流最小割最大权闭合图

在Amber的论文里有这个解法，大家去看看吧。其他的不说了。这题把数据类型全都改成longlong才过，瞪大眼睛找了一晚上，没找出trick....悲催.... 
sevenster·2012-04-19 22:00

POJ 2125 最小割最小点权覆盖

做这题还是看了Amber大神的论文...还是在这里冗余一下吧：点覆盖集：无向图G的一个点集，使得该图中所以边都至少有一个端点在该集合内。
sevenster·2012-04-18 23:00

[NOI2009]植物大战僵尸

这道题跟NOI2006最大获利其实是很像的一样都是要搞定一些点才能搞定另一些点，然后有些点正权有些点负权这种问题，其实是最大权闭合子图amber的最小割论文有详细的讲解法和证明闭合子图的定义是，图中每个点所连接的的任何一条边不指向图外
OrpineX·2012-01-05 15:00

《幸福额度》.Love.on.Credit/Xing.Fu.E.Du. DVD BD 蓝光高清720P 1080P下载

年代2011 ◎国家中国 ◎类别喜剧/爱情 ◎片长95分钟 ◎导演陈正道ZhengdaoChen ◎主演林志玲ChilingLin 廖凡FanLiao 陈坤KunChen 杨佑宁TonyYang 吴翩翩Amber
yangji008·2011-11-28 19:07

poj 2396（有源汇的上下界可行流。。。。。dinic）

上下流相关的网络流的各种问题在Amber大牛的《图论原理》里讲的特备清楚。。。。。资料需要网上下载。。我就把原文摘抄下来吧。。。。。。
water_glass·2011-09-26 21:00

alpha平台工作流数据无法查出

浙江库)      而同义词：create or replace synonym SY_WF_V_INDYSP_WORKLIST_CUR for WF_AMBER.V_INDYSP_WORKLIST_CUR
荒村听雨31·2011-09-19 15:00

简单比较 JDO、EJB-CMP、Hibernate、Amber

网页Amber生命周期中有些图示。●PersistentManagerAPI对如何管理JDO对象的状态有一定的优势和价值。JDO的缺点
lm2302293·2011-09-19 14:00

ORACLE同义词

; for SGPM.P_SYS_USER;   create or replace synonym SY_WF_INDYWF_WORKLIST_COM  for WF_AMBER.INDYWF_WORKLIST_C
荒村听雨31·2011-09-16 19:00

Spoj 1479 最小直径生成树

Amber>  半径只需计算这些相邻点Li，即为最优值了在这之前，需要去除掉一些点，只保留最外层的那些，才能有上面那样子交点/**//*    n#include#include#include#include
Yuan·2011-07-21 01:00

Facebook Effect

之前看过，没有什么太多的感触，之前草草看过LXH写的《SNS浪潮》，看过Amber关于SNS的评论。总之这本书没有给我一些更新的东西。
O(1) 的小乐·2011-06-25 11:00

htc android测试模式验机

共3个测试项:前两个是听筒上的灯，green是绿灯；Amber桔黄灯；Button是键盘灯。2、Buttontest：测试手机上所有的按钮。比如声音键，按下后，界
haohetao·2011-06-15 22:00

htc android测试模式验机

共3个测试项:前两个是听筒上的灯，green是绿灯；Amber桔黄灯；Button是键盘灯。2、Buttontest：测试手机上所有的按钮。比如声音键，按下后，界
haohetao·2011-06-15 22:00

htc android测试模式验机

共3个测试项:前两个是听筒上的灯，green是绿灯；Amber桔黄灯；Button是键盘灯。 2、Button test：测试手机 上所有的按钮。
haohetao·2011-06-15 22:00

htc android测试模式验机

共3个测试项:前两个是听筒上的灯，green是绿灯；Amber桔黄灯；Button是键盘灯。 2、Button test：测试手机 上所有的按钮。
haohetao·2011-06-15 22:00

SPOJ 1476 profit 最大权闭合图 ★★★

 /**//*    Amber《最小割》    题意：n个中转站，每个站建立花费Xi  m个客户，每个客户需要中转站Ai,Bi，获得收益为Ci           问最大收益    要满足客户i，必须有中转站
Yuan·2010-08-08 22:00

Mini MVC

、XML部署文件、JSP视图第一步：构建用户最初请求的HTML表单BeerSelectionPage  Selectbeercharacteristics  Color:      light    amber
bitzyun·2010-07-08 22:21

Linux发行版大全

Amber Linux：基于Debian，针对拉脱维亚用户作了一些定制。
yangzb·2010-03-06 03:00

Linux发行版大全

Amber Linux：基于Debian，针对拉脱维亚用户作了一些定制。
yangzb·2010-03-06 03:00

Linux发行版大全

Amber Linux：基于Debian，针对拉脱维亚用户作了一些定制。
yangzb·2010-03-06 03:00

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yangzb·2010-03-06 03:00

amber9单机版安装

amber9单机版安装1．安装(1)把AMBER9.TGZ文件拷贝到/usr/local/#cp–rf/media/AMBER9/AMBER.TGZ/usr/local/(2)把AMBER9解压到/usr
大漠驼铃·2010-01-06 16:00

喜欢java更喜欢旅游.....

HI,您在Q群的朋友amber邀请你加入"hiCAFE自助旅行交友网"HiCafe自助旅行交友网是由资深驴友创建。创始人YOUNG是一个狂热背包客，拥有10多年的自助旅行经验。
z75148885·2009-08-31 11:00

牙好是多么幸福的一件事

昨天，陪朋友amber去医院修复牙，我们在一楼挂完号，跑到三楼去排队。喔，那么多人在等待，年龄大概在二十多占多数，女的也很多哦。
quan_xiao·2009-04-12 14:10

牙好是多么幸福的一件事

昨天，陪朋友amber去医院修复牙，我们在一楼挂完号，跑到三楼去排队。喔，那么多人在等待，年龄大概在二十多占多数，女的也很多哦。
quan_xiao·2009-04-12 14:10

动态规划总结(by Amber)

动态规划总结(byAmber) 动态规划总结byAmber1.  按状态类型分写在前面：从状态类型分，并不表示一题只从属于一类。其实一类只是一种状态的表示方法。可以好几种方法组合成一个状态，来解决问题。1.1.编号（长度）动态规划共性总结本类的状态是基础的基础，大部分的动态规划都要用到它，成为一个维。一般来说，有两种编号的状态：状态(i)表示前i个元素决策组成的一个状态。状态(i)表示用到了第i个
蔡东赟·2009-03-17 18:00

JDO、EJB/CMP、Hibernate和Amber比较

【转】JDO、EJB/CMP、Hibernate和Amber比较JDO的优点：●JDO的生命周期状态机(lifecyclestatemachine)是正确的用法。
JAVA—咖啡馆·2008-05-27 10:00

JAVA设计模式之Singleton

java代码public class Tenn&Amber{                      private static Tenn&Amber tennamber;                          
tenn·2007-11-26 11:00

Cisco R&S Product Operation Fundamental

CaseStudy:LEDsLED主要有三种状态：green,amber(aligntorangecolor),offCisco设备的LED主要有四类LED：SYSTEM，RPS（RedundantPowerSupply
sense5·2007-04-28 08:00

世界是平的------说说SOA，jini,jxta,jbi,OSGi

这个月内我学习了很多技术知识和一些经济基础知识还有理财基础知识，另外在amber的催促下，我翻看了托马斯·弗里德曼写的热门书籍<<世界是平的>>。
yanghuidang·2006-10-31 21:00

轻量级的关系/对象映射--Amber进阶

摘要:本文推荐的一个叫Amber的框架提供了一种相反的轻量级实现。
沉思的狗の博客·2006-04-25 09:00

JDO、EJB/CMP、Hibernate和Amber的比较

JDO、EJB/CMP、Hibernate和Amber的比较来自：http://www.matrix.org.cn/blog/liu2liu2JDO的优点：●JDO的生命周期状态机(lifecyclestatemachine
无花无酒锄作田·2006-02-21 16:00
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