CHIP 第19页

GTRD:最全面的人和小鼠转录因子chip_seq数据库

GTRD从SRA,GEO,ENCODE等公共数据库中收集转录因子相关的chip_seq数据，采用标准流程进行peakcalling分析，并基于已有的转录因子motif数据，预测了转录因子结合位点TFBS

生信修炼手册·2020-03-25 14:45

ATAC-seq 分析（上）

之前写过ChIP-seq的基础分析：ChIP-seq数据分析（一）：从rawreads到peaks，和此文有很多相似之处。

presentlife·2020-03-25 02:23

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月26日

用心陪伴每一天1音频1a2动画无3儿歌与游戏Londonbridgeisfallingdown大堤边上有很多墩子，看上去就像桥墩子，放学路上必玩的游戏就是在墩子之间走过来走过去。Londonbridgeisfallingdown,fallingdown,fallingdown.Londonbridgeisfallingdown,Myfairlady!Roleplay黑灯瞎火玩买卖游戏B:Mummy

水中的珊瑚雨·2020-03-24 23:53

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月10日

用心陪伴每一天（day17）1、音频：0aunit1-12轮播；幼儿汉语第一册下2、动画：0bwitchinajar,thefiremen3、儿歌与游戏：a、WitchinajarChip:Mum,I'mawitch.Thisismyjar.(大纸箱)Hushbaby,hushbaby.Don'tgofar.I'llcatchyou.I'llputyouinmyjar.Mum:Oh,yougotm

水中的珊瑚雨·2020-03-24 10:50

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月21-22日

用心陪伴每一天1音频1a、peppapig第一季1-10集、牙牙学语12动画thefiremen3儿歌与游戏A、Walking,walking去妈妈以前读书的校园玩耍，在小树林间撒欢。Look,baby,somanyleavesontheground.Let’splaywalking,walking,squatdown.Whenwesquatdown,wecanpickuponeleaf.Walk

水中的珊瑚雨·2020-03-23 04:32

找个motif嘛，简单

我在生信菜鸟团发布的自学CHIP-seq分析第八讲就提到过如何寻找motif，motif是比较有特征的短序列，会多次出现的，一般认为它的生物学意义重大，做完CHIP-seq分析之后，一般都会寻找motif

生信技能树·2020-03-22 10:06

智能扫码套件

项目描述微处理器IOTC0370CHIP识读方式640×480CMOS接口RS-232/USB1.1识读模式感应识读、连续识读识读精度10mil读码窗口52x69mm视角68°/42°/54°最大功耗1W

数拓·2020-03-19 07:24

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月18日

用心陪伴每一天1音频peppapig第1季1-10集、牙牙学语12动画/电影peppapig第1季第10、11集3儿歌与游戏A、LittlemouseLook,baby,what’sthisonmyfinger?Isitalittlemouse?Yes.Ok,Ipaintedamouse.NowI’malittlemouse.You’reabigcat.Let’splayafingergame“l

水中的珊瑚雨·2020-03-18 11:10

用BWA-MEM比对ChIP-seq数据到基因组

20200315诺禾致源给出的测序结果有两个，一个是测序结果原始文件.raw.fq.gz文件，一个是质控过滤rawreads得到的cleanreads的.clean.fq.gz文件。如果质疑公司的质控，可以自己尝试质控。下载安装bwa，注意配置.conda文件$condacreate-nbwapython=3.7$condaactivatebwa$condainstallbwa建立基因组索引→比对

嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2020-03-18 09:51

2018-03-02

提到染色质生物学，我就会想到Chip-Seq。但我今天无意间google到一个剑桥大学2017年生信暑期学校的pdf，上面有一张图让我非常震惊，原来相关实验技术这么多！！

生信family·2020-03-17 22:30

【万科'V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月10日

用心陪伴每一天1音频0a0b轮播2动画1a1-4,汉语第一册第七至十二单元3儿歌与游戏a、lollipop今天又要求做棒棒糖，于是我们又做了两根棒棒糖.Imadeabiglollipop.Imadeasmalllollipop.Imadearoundlollipop,andyourlollipoplookslikeaheart.Ilikeyourlolipop.图片发自Appb、wearesteg

水中的珊瑚雨·2020-03-17 08:39

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月10日

用心陪伴每一天1音频peppapig第1季1-5集、牙牙学语12动画peppapig-theplayground；牙牙学语1-跳花墙3儿歌与游戏A、bigbadbug（拖鞋版）Baby,I’mabigbadbug.Youcanchaseme,andmakemegoawaybytheshoe.Ok?Youcanpatmybottomwhenyoucatchme.Ok.Chasethatbigbadb

水中的珊瑚雨·2020-03-17 07:30

ChIP-Seq数据挖掘系列-1: Motif 分析(1) - HOMER 安装

HOMERHOMER是一套用于Motif查找和二代数据分析的工具。HOMER中的工具是使用Perl和C++编写的，适用于unix操作系统。基于motif寻找的算法，HOMER适用于在大规模基因组数据中发现8-20bpmotifs。#1.使用基本要求Homer是一个计算密集型的工具，因此对计算机硬件有所要求。Unix-styleoperatingsystem(UNIX/LINUX/Mac/Cygwi

_eason_·2020-03-17 02:09

ChIP-Seq数据挖掘系列-2: Motif 分析(2) - HOMER Motif 分析基本步骤

HOMER主要被用于ChIP-Seq和promoter分析，但是核酸序列motif寻找问题都可以尝试使用HOMER。HOMER预测Motif需要的两个序列集感兴趣的目标序列。例如

_eason_·2020-03-15 20:39

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月8日

用心陪伴每一天1音频0b2动画:两只羊，1aunit1-43儿歌与游戏a、walking,hop,running上学路上，一路欢快地跑跳walking,walking,walking,walking,hop,hop,hop,running,running,running,running,now,let'sstop.now,let'sstop.Now,It'syourturn.b、HandyDand

水中的珊瑚雨·2020-03-12 16:58

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月7日

用心陪伴每一天1音频汉语第一册儿歌轮播，幼儿英语0b轮播2动画汉语第一册-两只羊，幼儿英语1aunit1-43儿歌与游戏a、dinosaur道具:两双长袜子，两双大鞋子Hello,baby,look,twopairofshoesandsocks.Wecanputhandsinthesocks.Andthenputonthebigshoes.Justlikeme.Yeah,nowwearedinos

水中的珊瑚雨·2020-03-10 05:29

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月11日

comeherequickly.Mum:Ok,Let'ssingthesongtogether.Mum&Chip:Drivethefiretruck.Hurryhurr

水中的珊瑚雨·2020-03-09 08:31

表观调控-果蝇探索PRC复合物之文章复现（一）

这篇文章据说是RNA-seq和ChIP-seq数据

小梦游仙境·2020-03-07 12:58

FPGA SOC chip architect

郝宇峰·2020-03-05 19:27

TFTG:human转录因子靶基因数据库

研究转录因子调控的靶基因有两种常用的手段，第一种就是利用chip-seq等方式，研究特定转录因子在基因组的结合位置，从而判断其调控的基因，因为有实验证据的支持，所以这种方式得到的调控基因会更加可信，存在的问题就是

生信修炼手册·2020-03-04 05:40

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月4日

1音频0b轮播2动画0bthefiremen,eggfun,johnny,johnny,seesaw3儿歌与游戏seesaw宝宝拿着两个小玩偶，开心地玩着seesawupanddown,upanddown,upanddown,seesaw,Teetertottertilt,somegoesup,somegoesdown.图片发自App后来又爬到妈妈腿上玩了一轮seesawhop,hop,hop放学

水中的珊瑚雨·2020-03-04 01:57

Flutter移动应用：MDC

原文地址：https://siques.cn/p/38这个章节我们继续介绍一些重要的Material风格的小部件Chip是小碎片，我们会学习创建各种不同类型的Chip比如带删除功能的Chip，像按钮的Chip

秋刀不是鱼·2020-03-03 13:01

deeptools使用过程中出现问题集

1.想要画一个chip-seq的热图，首先要通过bamcompare获得针对IP和input样品的处理后的bigwig文件，通过运行命令bamcompare-b1IP.bam-b2input.bam-olog2ratio_IP1

不吃菜的花花·2020-03-01 09:52

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月27日

用心陪伴每一天1音频0a、1a轮播2动画1aunit1-33儿歌与游戏AlollipoptreeBaby,Look,Ihavepainteddifferentkindsoflollipops,heartlollipop,balllollipop,circlelollipop,bunnylollipop.Let’smakealollipoptree.Firstly,Iwilldrawatree,ab

水中的珊瑚雨·2020-02-28 02:29

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月12日

用心陪伴每一天1音频peppapig第1季1-5集、牙牙学语12动画汉语第一册下3儿歌与游戏ThelittlegreenfrogLondonbridgeisfallingdown4分级与绘本海尼曼12本（day5）5FieldtripA、品尝蜂蜜、醋、盐水Baby,let’splayagame.Weneedthreepapercups,honey,vinegar,salt,andsomewater

水中的珊瑚雨·2020-02-27 14:02

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月29日

用心陪伴每一天1音频0b、1a2动画Peppapig:mudpuddle;牙牙学语：小豆芽3儿歌与游戏a、学习身体各个部位的名称1）bodysongHead,shoulders,kneesandtoes.Kneesandtoes.Head,shoulders,kneesandtoes.Andeyesandearsandmouthandnose.2）Baby,where’syourmouth?Ope

水中的珊瑚雨·2020-02-27 11:42

2019-12-26 复习表观调控相关内容（图1-3）

此次表观调控课程是整合RNA-seq数据和表观数据，比如Chip-seq和ATAC-seq，主要是依托于文章GlobalchangesofH3K27me3doma

程良平·2020-02-26 23:49

去东方，最好用的在线GO富集分析工具

微信公众号：http://blog.genesino.comGeneOntology富集分析是是高通量数据分析的标配，不管是转录组、甲基化、ChIP-seq还是重测序，都会用到对一个或多个集合的基因进行功能富集分析

生信宝典·2020-02-25 09:58

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年12月第一周

用心陪伴每一天1音频1b、peppapig第一季1-10集、牙牙学语1、不一样的卡梅拉、婷婷唱古文2动画1b、消防员山姆（中文）3儿歌与游戏A、ThechimneyBaby,comehere.Let’smakeachimney.Hereisabox.Let’scutthetwosidesoftheboxwithscissors.Nowwegotachimney.Thisisthetop.Herei

水中的珊瑚雨·2020-02-23 13:05

分类（控制台打印转码，unicode转中文）

夜雨聲煩_·2020-02-20 17:48

FactorBook:人和小鼠转录因子chip_seq数据库

FactorBook整合了ENCODE数据库中人和小鼠的chip_seq数据，以转录因子为中心，进行了转录因子motif分析,与其他转录因子或者组蛋白修饰的关联分析，数据库网址如下http://www.factorbook.org

生信修炼手册·2020-02-20 15:32

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月11日

用心陪伴每一天1音频peppapig第1季1-5集、牙牙学语12动画无3儿歌与游戏找出弟弟的小鼓和气球，我们煞有介事地玩起了《敲大鼓》的游戏敲大鼓，吹长号，我要当兵学放炮。一二三，快卧倒，（赶紧卧倒）大炮炸不着，呲~砰（将吹得鼓鼓的气球一松开，气球嗖地窜出去）！4分级与绘本海尼曼12本（day4）5FieldtripRain一大早雨就下个不停，正好这几天我们在读《rain》的分级绘本。上学路上：L

水中的珊瑚雨·2020-02-20 00:47

如何寻找并设计ChIP-qPCR引物

如何寻找并设计ChIP-qPCR引物引物设计的流程：用到的工具：NCBI,UCSC网站（直接百度就可以找到官网了）首先，确定目标区域的DNA（我是以做ChIP为例，寻找的是DNA引物模板）原理：IP拉下来的是

liu_ll·2020-02-19 15:25

Week 5 L9-10 真核复制、复制起始、ChIP、端粒、核小体压缩DNA、核小体装配、染色质包装

有多个复制起点复制叉移动很慢9.2复制起始InitiationinEukaryoticReplication9.3解旋酶HelicaseLoadingandChromatinImmunoprecipitation(ChIP

英天·2020-02-19 13:27

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年10月17日

用心陪伴每一天1音频peppapig第1季1-10集、牙牙学语12动画/电影peppapig第1季第8、9集；牙牙学语1《拍饼子》3儿歌与游戏A、LittlemouseBaby,look,there’saholeformouse.Let’splaythegameofmouseandcat.OK?OK.I’mamouse.You’reacat.Hereisalittlemouse.Peekingth

水中的珊瑚雨·2020-02-18 10:49

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月25日

1音频1a2儿歌与游戏a、AflyingrocketWeneedtoprepareaballoon,alongstringandatube.Firstly,putthestringthroughthetube.Secondly,Blowtheballoon,andholdittight.Thirdly,Pastetheballoononthetube.Atlast,Let’ssingthesong

水中的珊瑚雨·2020-02-17 20:08

biostar handbook(八)|高通量数据分析初步：序列比对

高通量短读比对工具在过去的十几年里，随着高通量测序(HTS)成本降低，出现了各种测序概念,DNA-Seq,ChIP-Seq,RNA-Seq,BS-Seq覆盖了研究领域的方方面面。

徐洲更hoptop·2020-02-17 12:40

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年9月6日

用心陪伴每一天1音频汉语第一册儿歌轮播，0b轮播2动画0beggfun,thefiremen,johnny,johnny,seesaw3儿歌与游戏dinosaur准备道具:箱子、蛋、恐龙卡片1)Honey,You'reababydinosaur.I'mmommydinosaur.Now,pleasegointothebox.Readyset,go.Dinosaur,dinosaur,waveyou

水中的珊瑚雨·2020-02-16 05:51

英语启蒙分级读物牛津树为何必不可少？

主要围绕三个孩子Biff,Chip,Kipper还有他们的爸爸妈妈一家人展开故事。每一本书都是他们生活中的一个故事，就像看电视连续剧一样，熟悉了这几个人物之后，就会看上瘾，非常适合亲子阅读和幼儿启蒙。

彩虹绘本屋·2020-02-16 01:11

Chip-seq的22个疑问——【Jimmy】

1、所有的蛋白都能被修饰吗？都能被甲基化，乙基化，磷酸化等等？http://www.biotrainee.com/thread-450-1-1.html2、所有的蛋白都能找到抗体吗？http://www.biotrainee.com/thread-451-1-1.html抗体有效性如何评价？蛋白质有抗体，蛋白质被修饰后修饰位点又有特异性抗体？抗体获取实验环节耗时如何？3、蛋白质的修饰，主要就是甲基

超级无敌大蜗牛·2020-02-15 23:53

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月16日

用心陪伴每一天1音频0a轮播，0bunit7,10,112动画0bunit1-23儿歌与游戏a、johnny,johnny妈妈和宝宝轮流扮演爸爸和johnny进行儿歌对话，从刚开始只做johnny到后来可以顺利扮演爸爸b、lollipop妈妈和宝宝轮流扮演bunny和horseHello,bunny.Hello,horse.Areyoueatingalollipop?Yes,alollipop.I

水中的珊瑚雨·2020-02-15 22:47

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月21日

用心陪伴每一天1音频0a0b轮播2动画witchinajar,johnny,johnny,thefiremen3儿歌与游戏zoom,zoom,zoom宝宝，我们来玩磁力片吧！好啊！爽快答应，有妈妈的陪伴总是很开心的！M:Ok,let'smakearocket,andthenzoom,zoom,zoom,gotothemoon.C:Yeah~bigrocket.M:First,wemaketheto

水中的珊瑚雨·2020-02-15 20:29

“have a chip on one's shoulder”是什么意思呢？

“haveachiponone'sshoulder”是“（因觉得受委屈或不如别人优秀而）好生气”的意思。这一说法起源于1800年代的美国，当时有个约定俗成的习惯，要是你想找人打架、单挑啥的，就在肩膀上放片儿木屑，然后挑衅别人把它弄掉。比如，“He'sgotachiponhisshoulderaboutnothavingbeeninvitedtotheparty.”就是“他因没被邀请参加派对而耿耿于

玲玲A·2020-02-14 14:03

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月27日

用心陪伴每一天1音频0a0b轮播，汉语第一册上2动画0bwitchinajar,thefiremen3儿歌与游戏threelittlemonkeysthreelittlemonkeysjumpingonthebed,onefelloffandbumpedhishead.Mumcalledthedoctor.Thedoctorssaid,nomorelittlemonkeysjumpingonthe

水中的珊瑚雨·2020-02-14 08:34

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2017年8月26日

用心陪伴每一天1音频0a0b轮播2动画无3儿歌与游戏walking每天晚餐后例行散步Let'splaywalking,walking,squatdown,comeon.walking,walking,squatdown.walking,walking,squatdown.kangarooMommy,Icanhop.hop,hop,hop.从高处跳下来，大喊，妈妈，你看！Wow,youcanhopv

水中的珊瑚雨·2020-02-14 01:41

Chip Factory（0/1字典树）

ChipFactoryAC_Code:1#include2#include3#include4#include5#include6usingnamespacestd;7typedeflonglongll;8constintmaxn=1010;910inttrie[maxn*35][2],val[maxn*35],num[maxn*35],tot;11lls[maxn];12llans;1314vo

Angle_yin·2020-02-13 22:00

ATAC-seq分析练习

ATAC-seq和CHIP-seq的分析非常相似，CHIP-seq检测的是抗体结合的DNA序列；而ATAC-seq检测的是“易接近”的DNA序列。ATAC-seq原理：ATAC-seq的原理及应用。

生信start_site·2020-02-13 15:12

GSEA富集分析 - 界面操作

欢迎关注天下博客：http://blog.genesino.com/2018/03/chip-pipeline/Jumpto...GSEA定义GSEA原理GSEA分析Leading-edge分析MSigDB

生信宝典·2020-02-13 07:42

ReMap:人类Chip-seq数据大全

ReMap收集来自GEO和Encode项目中人的chip_seq数据，对来自不同细胞系，不同类别转录因子的数据进行归类整理，网址如下http://tagc.univ-mrs.fr/remap/index.php

生信修炼手册·2020-02-13 07:43

2019-09-02R包第二天：差异分析包（二）DEseq2

本文转载自:presentlife的、括囊无誉的建议直接跳转：康君爱上了蕊酱的摘要测序产生的数据内容为，每个样本中，每个基因分配到多少个测序片段，各种类型的测序（RNA-seq，CHIP-Seq，HiC

一只烟酒僧·2020-02-11 10:37

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