k-mers和序列比对The learning notes of the biostar handbook(6)
k-mersk-mers是指将序列分为k个碱基的字符串,一般长短为m的序列可以分成m-k+1个k-mers。ATGCA的所有k-mer如下:2-mers:AT,TG,GCandCA3-mers:ATG,TGCandGCA4-mers:ATGC,TGCA5-mers:ATGCA我们将这些k-mers放入计算机进行组装,则可能的组装为ATGkgTGCkgkGCAATGCA连续的空格不知道怎么打出来,用