Nature

单样本基因集富集分析 --- ssGSEA

文章2009年发表于nature，题目为SystematicRNAinterferencerevealsthatoncogenicKRAS-drivencancersrequireTBK1。
林枫bioinfo·2023-04-11 00:43

新刊Nature Cancer: 单细胞分析揭示GBM肿瘤干细胞异质性

2021年2月份发表在NatureCancer（Nature旗下新期刊，无影响因子）上的关于GBM异质性的单细胞研究，GradientofDevelopmentalandInjuryResponsetranscriptionalstatesdefinesfunctionalvulnerabilitiesunderpinningglioblastomaheterogeneity
概普生信·2023-04-10 10:58

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画世界地图的简单小例子

论文是Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png这篇论文的数据是公开的，我们可以试着用公开的数据复现一下论文中用来展示数据的图。第一个图是使用地图来展示实验样本的地理分布。论文中写道画图是使用ggplot2，作图数据来自theNatu
小明的数据分析笔记本·2023-04-10 03:22

英语流利说 Level 5 Unit 1-4 Mysteries of Nature 1

音频Therearemanymysteriesinnature.Mysteriesarethingswedon'tunderstand,suchashowtheEgyptianpyramidswerebuilt.Infact,wearesurroundedbymysteries.Whatweknowabouttheworldseemslikeverylittle.Scientiststellust
missnini·2023-04-10 02:20

Nature Comm：金粟兰基因组解析核心被子植物五大类群系统发育关系

11月26日，深圳华大生命科学研究院主导在NatureCommunications期刊发表题为“Chloranthusgenomeprovidesinsightsintotheearlydiversificationofangiosperms”的研究论文。该研究从金粟兰目基因组水平，确定金粟兰目一直存在争议的系统发育位置，为核心被子植物五大类群系统发育关系进一步研究奠定基础，揭示金粟兰目植物药用和
尐尐呅·2023-04-09 17:34

Saving Nature, Not Only for Man.

Withourenvironmentdeteriorating,moreandmorepeoplehavecometorealizethatimmediatemeasuresshouldbetakentoprotectourenvironmentfromgettingworse.However,inthearticleSavingNature,ButOnlyforManbyCharlesKraut
Ainevsia·2023-04-09 13:44

本周最新文献速递20211219

精细解读文献一文献题目：Thepowerofgeneticdiversityingenome-wideassociationstudiesoflipids不想看英文题目：脂质全基因组关联的遗传多样性研究杂志和影响因子：Nature
橙子牛奶糖·2023-04-09 03:15

21-Nature-A Geometric Deep Learning Approach to Predict Binding Conformations of Bioactive Molecules

2021-Nature-AGeometricDeepLearningApproachtoPredictBindingConformationsofBioactiveMoleculesPaper:https
发呆的比目鱼·2023-04-09 02:50

靶点c语言,Nature关注的经典靶点，看完这篇就懂了

原标题：Nature关注的经典靶点，看完这篇就懂了解螺旋公众号·陪伴你科研的第2096天靶点虽老，关注不减！在很多肿瘤中，都存在KRAS的突变。KRAS-G12C是一种常见的KRAS突变形式。
沛青·2023-04-09 01:07

Nature Neuroscience：网络神经科学

尽管最近取得了实质性的进展，但我们对复杂大脑功能和认知的原理和机制的理解仍然不完全。网络神经科学的提出解决了这些持久的挑战。网络神经科学从一个明确的综合视角来研究大脑的结构和功能，寻求新的方法来绘制、记录、分析和建模神经生物学系统的元素和相互作用。两个平行的趋势推动了这种方法:新的经验工具的可用性，以创建全面的地图和记录分子、神经元、大脑区域和社会系统之间的动态模式；以及现代网络科学的理论框架和计
思影科技·2023-04-08 22:26

斯坦福高效睡眠

作者是西野精治，是斯坦福大学睡眠研究所所长，从事睡眠研究超过40年，有大量成果发表在Nature、Science等顶级学术期刊上。
whatever_bullet·2023-04-08 18:13

跟着Nature学作图：R语言corrplot包画热图展示相关系数

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的
小明的数据分析笔记本·2023-04-08 14:44

神经网络算法

以下是一些有关神经网络研究背景的论文引用：Rumelhart,D.E.,Hinton,G.E.,&Williams,R.J.(1986).Learningrepresentationsbyback-propagatingerrors.Nature
丰。。·2023-04-08 06:19

Nature专栏：博士生合理管理时间，走出泥潭

她在美国加州大学圣地亚哥分校攻读生物医学科学博士，目前是第4个年头，她已经共同发表了一篇Nature论文和一篇Nature子刊论文。Maya对科研很是着迷。
Datawhale·2023-04-08 06:34

跟着Nature学作图：R语言ggplot2分组折线图添加误差线

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的
小明的数据分析笔记本·2023-04-08 02:56

Anger, one of the human nature.

Getanger,loosethetemperareallhumannature.Manypeoplehaveatantrumexperience.Howeverthereisagroupofpeoplewhoalmostdon’tgetangryintheirlife.Whereisthesourceofangerforthem?Whatcanirritatethem?Isangrygoodor
呜拉卡·2023-04-07 17:43

互联网摸鱼日报（2023-04-07）

互联网摸鱼日报（2023-04-07）InfoQ热门话题腾讯提出蛋白质研究AI模型，预测准确率刷新纪录，入选Nature子刊生成式AI助力游戏开发：腾讯推出3D虚拟场景自动生成解决方案三星被曝芯片机密代码遭
每日摸鱼大王·2023-04-07 12:58

Linux上基于R安装Peer包

最近很多高水平的文章如nature上的，nat
Bio_zouxudong·2023-04-07 00:41

眼见为实：HiFi测序挑战不同类型基因组组装

近日，美国加州大学和国家人类基因组研究所等单位组装出人完整X染色体的研究成果在《Nature》发表，其中HiFiReads在重复序列的准确组装中功不可没。
贝瑞科服·2023-04-06 23:44

Nature新规：用ChatGPT写论文可以，列为作者不行

詹士发自凹非寺量子位|公众号QbitAI面对ChatGPT，Nature终于坐不住了。本周，这家权威学术出版机构下场，针对ChatGPT代写学研文章、被列为作者等一系列问题，给了定性。
QbitAl·2023-04-06 14:21

互联网摸鱼日报（2023-04-03）

四院院士，再发Nature！收益减少，B站UP主发起停更潮赛力斯许林：赛力斯
每日摸鱼大王·2023-04-06 12:38

2022-10-31

Nature|540万人遗传数据揭示身高差异相关基因原创图灵基因图灵基因2022-10-3113:54发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析在迄今为止最大规模的基因组研究中，由昆士兰大学（UQ）的科学家领导的一个团队分析了
图灵基因·2023-04-05 18:22

AI守望者(2021-03-11)

AI守望者为您推送今日科技资讯简报：1.复旦Nature论文实现《三体》科幻场景：把显示屏穿身上，还能导航、聊天那种每个人都是一个行走的显示屏，这并不是科幻小说里才有的场景。
烛之文·2023-04-05 18:20

本周最新文献速递20210528

Interpretingtype1diabetesriskwithgeneticsandsingle-cellepigenomics不想看英文题目：利用遗传学和单细胞表观基因组学解析1型糖尿病的风险杂志和影响因子：Nature
橙子牛奶糖·2023-04-05 11:06

失眠君，我要和你说分手！(双语)

Osleep,Ogentlesleep,nature'ssoftnurse,howhaveIfrightedthee?"下面我们一起来了解睡眠，早日和失眠君说分手！曾经，人们把睡眠视
penguin热带企鹅·2023-04-04 19:31

集成光子芯片Micro-comb原理

2021年1月6号，一篇名为《11TOPSphotonicconvolutionalacceleratorforopticalneuralnetworks》的论文发表在nature上。
考琪·2023-04-04 16:11

文献阅读 The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer analysis project

今天阅读了一篇较早的TCGA项目组在2013年发表于Nature的评论文章，题目为TheCancerGenomeAtlasPan-Canceranalysisproject。
林枫bioinfo·2023-04-04 14:31

重构人胚胎着床的单细胞转录组与DNA甲基化组图谱

文章链接：https://www.nature.com/articles/s41586-019-1500-0概述胚胎植入是哺乳动物胚胎发生过程的里程碑事件，植入失败是流产相当重要的因素之一。
Dengfeng_Gao·2023-04-04 11:46

腾讯提出蛋白质研究AI模型，预测准确率刷新纪录，入选Nature子刊

蛋白质相互作用（PPI）可以说是人体最重要的分子事件之一，事关人体生长发育、新陈代谢，是疾病治疗干预的重要来源，PPI失调会导致癌症等疾病发生，因而该领域也是医药行业关注的研究热点。为了更好地预测和解读PPI，并深入挖掘相关分子信息，2023年3月，腾讯AILab联合香港科技大学、中国科学院大学相关团队，将深度学习领域的层次图学习技术引入PPI研究，提出了一种双视图层次图学习模型（HIGH-PPI
AI科技大本营·2023-04-04 11:17

跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并在坐标轴添加分组标记

论文EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和数据下载链接https://github.com/plemey/SARSCoV2origins今天的推文我们来重复一下论文中的Figure2中的簇状柱
小明的数据分析笔记本·2023-04-03 23:10

2022-06-28

Nature|合成IL-9受体加强过继细胞治疗原创风不止步图灵基因2022-06-2810:04发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制撰文：风不止步IF=49.962推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：文章通过使用嵌合正交细胞因子受体重新利用
图灵基因·2023-04-03 21:45

跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2画世界地图展示采样地点

论文StructureandfunctionofthesoilmicrobiomeunderlyingN2Oemissionsfromglobalwetlandshttps://www.nature.com
小明的数据分析笔记本·2023-04-03 16:07

Single cell ATAC-seq

https://www.nature.com/articles/nature14590http://cole-trapnell-lab.github.io/projects/sc-atac/https:
zhoujj2013·2023-04-03 11:45

基因编辑系统Prime Editing的工作原理

2019年10月21日，哈佛大学Broad研究所刘如谦（DavidR.Liu）教授团队在Nature上发表“Search-and-replacegenomeeditingwithoutdouble-strandbreaksordonorDNA
去学习一下啊·2023-04-03 09:10

阿里云E-HPC+i4p大内存实例，加速寻因生物单细胞数据分析效率

单细胞测序技术呼唤更高计算性能自单细胞测序技术问世以来，先后被NatureMethods评为年度技术，被Nature评为最值得期待的生物技术之一。相比于传统的检测技术，单细胞技术以细胞为研究单位，用更
弹性计算百晓生·2023-04-03 03:21

Nature Biotechnology| 胰腺癌空间转录组+单细胞测序分析

整合空间转录组和单细胞测序揭示PDAC组织结构单细胞RNA测序（scRNA-seq）能够系统地识别组织中的细胞群，但描述其空间组织仍然具有挑战性。2020年发表在NatureBiotechnology（IF=54.901）上的文章Integratingmicroarray-basedspatialtranscriptomicsandsingle-cellRNA-seqrevealstissuear
概普生信·2023-04-03 02:03

【文献速递】nature及子刊文献单细胞空间组学双周更2022-08-09

nature/natureneuroscience/natureecology&evolutionbioRxiv
基因侦探·2023-04-02 23:55

2022-04-23

Nature|实体瘤中CART细胞杀伤的特有机制原创骄阳似我图灵基因2022-04-2307:03收录于合集#前沿分子生物学机制撰文：骄阳似我IF：49.962推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：嵌合抗原受体（CAR
图灵基因·2023-04-02 17:57

2021-11-17

Nature|IL-10+巨噬细胞限制抗肿瘤免疫由B细胞引发原创榴莲不酥图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：榴莲不酥IF=49.962推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文确定了B细胞衍生的GABA可促进单核细胞分化为分泌
图灵基因·2023-04-02 01:31

文献阅读-FER调控单花粉管受精的机制

今天阅读的文献是一片今年发表较早的《Nature》，《FERONIAcontrolspectin-andnitricoxidemediatedmale–femaleinteraction》，通讯作者是美国马萨诸塞州立大学阿默斯特分校教授
每天都想睡觉的阿源·2023-04-01 22:28

跟着Nature学作图：R语言ggplot2箱线图和堆积柱形图完整示例

论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586
小明的数据分析笔记本·2023-04-01 18:38

Nature解读——基于单细胞测序和空间转录组发现流感病毒感染肺组织新治疗靶点——ADAMTS4

单细胞测序&空间转录组，双剑合璧，谁与争锋编辑：ANIMUS校对：ANIMUS编者按：2020年初一场猝不及防的新冠肺炎疫情彻底改变了这个世界，也改变了我们每个人的工作和生活。传染性呼吸系统病毒和疾病从未真正停止过，比如2003年的SARS，2015年的MERS和2020年的SARS-CoV-2。对于呼吸道感染相关病原菌及其宿主免疫机制的研究对于基础科研和公共卫生具有重大战略意义。爱丽慕斯学术团队
ANIMUS爱丽慕斯·2023-04-01 16:50

Nature子刊|“二代+三代”宏基因组学揭示肠道微生物群的个性化结构变异

2022年，《Naturecommunications》期刊发表的“Short-andlong-readmetagenomicsexpandindividualizedstructuralvariationsingutmicrobiomes”研究论文中，通过建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装的新方法，表征了来自健康人类的数百个肠道微生物组中结构变异（SV）的精细遗传变异。研
凌恩生物·2023-04-01 12:30

跟着Nature Medicine学画图：R语言散点图组合频率分布图的简单小例子

今天的推文内容来自论文ClusteringandsuperspreadingpotentialofSARS-CoV-2infectionsinHongKong，期刊是NatureMedicineimage.png论文的数据代码公开，非常好的学习R语言的素材数据代码地址https://github.com/dcadam/covid-19-sse今天的推文内容我们来学习一下论文中的figure4b，散
小明的数据分析笔记本·2023-04-01 10:15

几种查找文献的方式

几种常用查找文献的方式1、Nature杂志官网*****百度进入Nature杂志的官网（https://www.nature.com/），如下图所示，点击右上角的Search，即可利用文献关键词进行搜索
璐小宝·2023-04-01 09:09

生信分析 Nature|染色体外环状DNA与癌症的相关性分析

要说2020年遗传与生物信息领域最热门的话题之一那必定是染色体外环状DNA了。不仅是BioRxiv上不断增多的相关内容，更有从年初几篇发在高分期刊的环状DNA文章，到年末频频发表的生信流程和软件。染色体外环状DNA的研究正在吸引越来越多的科学家和生信工作者。那么今天我们一起来分享其中一项具有代表性的研究：染色体外环状DNA与癌症的相关性分析。该研究于2020年8月发表于NatureGenetics
概普生信·2023-04-01 08:00

| Nature子刊综述

2020年10月7日，瑞典皇家科学院已决定将2020年诺贝尔化学奖授予德国马克斯·普朗克病原学研究所的EmmanuelleCharpentier博士以及美国加州大学伯克利分校的JenniferA.Doudna博士，以表彰她们在基因组编辑领域的贡献。两位科学家于2012年在《科学》杂志发表论文并首次指出，CRISPR-Cas9系统在体外实验中能“定点”对DNA进行切割，显著提升了基因编辑的效率。那么
尐尐呅·2023-04-01 03:01

2022-04-27

Nature|神经网络模拟寻找蛋白质变构与弱结合位点原创旧岛望月亮图灵基因2022-04-2707:03收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：旧岛望月亮IF=49.962推荐度：⭐⭐⭐⭐亮点：作者设计了一种名为
图灵基因·2023-04-01 01:59

R语言作图——Beeswarm plot(蜜蜂图)

Nature系列的文章就不用多说了，无数科研人心中的神刊，一篇Nature文章需要耗费大量的心血和经费。不过小仙想提醒大家一下，当你中了Nature，除了高兴之外还要留意一下，文章发表还要再
生信了（公众号同名）·2023-03-31 15:16

一文看全！史上以来的59家测序仪公司

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2023-03-31 09:31
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