Plants

2022《Nature Plants》通过基因组组装揭示模式蕨类植物的动态基因组进化

Introduction大多数蕨类植物的大基因组和复杂度，阻碍了其通过基因组组装来阐明蕨类生物学和陆地植物的进化。本研究对水蕨（Ceratopterisrichardii）进行了染色体水平的基因组组装，以及相关的甲基组、转录组和代谢组分析。该组装揭示了一段非常动态的基因组进化历史，包括大约6000万年前最近一次全基因组复制后基因组内容和结构的快速变化。包括大量基因丢失、串联复制和来自细菌的多个水平
iBioinformatics·2024-09-02 07:21

Dynamics and function of DNA methylation in plants（二）

MolecularfunctionsofDNAmethylationDNA甲基化与组蛋白修饰及非组蛋白共同决定了染色质结构和开放程度。因此，DNA甲基化有助于调控基因表达、转座子沉默、染色质互作（图4）以及性状遗传（Box1）。Generegulation植物中基因相关的DNA甲基化发生在启动子区或者转录基因区。尽管某些情况下DNA甲基化会促进基因的表达，比如说拟南芥中ROS1基因以及番茄中数百个
黄粱一梦贰十年·2024-01-31 10:07

Leetcode刷题笔记题解（C++）：LCR 121. 寻找目标值 - 二维数组

如果当前值大于目标值则列-1；如果当前值小于目标值则行+1，以此遍历来查找目标值；注意col和row的选取classSolution{public:boolfindTargetIn2DPlants(vector>&plants
Demo.demo·2024-01-24 00:53

【文献解读】Nature Plants|An apoplastic peptide activates salicylic acid signalling in maize

背景：Z.maysimmunesignallingpeptide1(Zip1):17aminoacidpeptide[+EGESELKLATQGASVRR–]cornsmut[植保]玉米黑粉病玉米黑粉病由玉米黑粉菌（Ustilagomaydis）（活体寄生biotrophicfungus）所引起的一种局部侵染性病害。孢子堆的小大、形状不定，多呈瘤状，长或直径3-15cm，初期外面有一层白色膜，往往
ss的专属赫兹·2024-01-03 11:52

数据结构学习 jz04二维矩阵找数字

空间复杂度O(1)#include#include//解法一找到角落的一个点，然后渐进目标classSolution{public:boolfindTargetIn2DPlants(std::vector>&plants
_Rindo·2023-12-21 14:44

day01

示例1：输入：[2,3,1,0,2,5,3]输出：2或3123限制：2set=newHashSet=0while(row>=0&&coltarget){row--;}elseif(plants[row
Bugman.·2023-12-20 23:13

Nature Plants | 全球首个高粱泛基因组研究成果发表！

2021年5月20日晚间，中科院植物所景海春课题组、澳大利亚昆士兰大学与华大基因等机构的研究者在NaturePlants上在线发表了题为“Extensivevariationwithinthepan-genomeofcultivatedandwildsorghum”的文章。该研究构建了世界上首个高粱泛基因组，揭示了高粱一级基因库资源广泛的遗传多样性，为高粱驯化研究和育种应用打下了坚实的基础。此项研
尐尐呅·2023-12-19 18:11

Frontier ，MDPI T3系列，植物科学领域高质量期刊分级目录发布！

https://mp.weixin.qq.com/s/ukbjIgdyaza7LmKmZmy5bw2023年3月31日，中国科学技术大学科研部发布2023年学术期刊负面清单，MDPI多本杂志上榜包括plants
生信漫谈·2023-12-17 22:55

Nature Plants:植物线粒体基因编辑，产生不育株系

提示：欢迎点击上方「PaperRss」↑关注我们！基因编辑技术革新了遗传学领域，使研究人员能够对各种动植物核、动物线粒体、植物叶绿体等的DNA进行有针对性的改变。然而，直到最近，这份清单上还缺少植物线粒体DNA。为植物线粒体提供必要的编辑酶的工具还没有建立起来。东京大学的植物分子生物学家Shin-ichiArimura和同事们已经填补了这一空白，创造了植物友好的mitoTALENs--线粒体靶基因
PaperRSS·2023-12-14 19:30

【阅读整理】An Accurate Skeleton ExtractionApproach From 3D Point Clouds of Maize Plants

原文：Frontiers|AnAccurateSkeletonExtractionApproachFrom3DPointCloudsofMaizePlants|PlantScience提出方法：提出了一种准确的骨架提取方法来弥补3D点云与玉米植物表型性状估计之间的差距：该算法首先使用点云聚类和色差去噪来降低输入点云的噪声。接下来，应用拉普拉斯收缩算法来收缩点。然后通过自适应采样选取代表植物骨架的关
Zlan_lvlv·2023-11-19 17:10

每日OJ题_剑指offer数组篇

Offer11旋转数组的最小数字代码解析剑指Offer21.调整数组顺序使奇数位于偶数前面代码解析剑指Offer04二维数组中的查找LCR121.寻找目标值-二维数组-力扣（LeetCode）m*n的二维数组plants
GR_C·2023-11-16 13:01

JavaScript 数组方法总结

constplants=['broccoli','cauliflower','cabbage','kale','tomato'];plants.pop()//"tomato"console.log(plants
lio_zero·2023-11-11 00:14

剑指offer-二维数组中的查找

剑指offer-二维数组中的查找题目原题如下：LCR121.寻找目标值-二维数组力扣题目链接m*n的二维数组plants记录了园林景观的植物排布情况，具有以下特性：每行中，每棵植物的右侧相邻植物不矮于该植物
Jasper_Fish·2023-11-07 18:15

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画分组折线图展示甲基化水平

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本·2023-11-06 07:42

Nat Plants |益生微生物群在控制拟南芥适当免疫能力中的关键作用

陆地植物的地上和地下寄生着各种各样的微生物，它们共同构成了植物微生物群。微生物群成员可以存在于植物表面或植物内部。植物微生物群的广泛保存表明，植物可能已经进化出选择和维持微生物群丰度、组成和功能的机制，以实现体内平衡。正确组合的微生物群(即益生菌群)可能对植物健康和生存至关重要。虽然微生物群的个体或群体成员已被证明可以改善营养吸收、生长和对非生物和生物胁迫的抗性，但植物的整个本土微生物群对植物功能
爱基百客·2023-10-30 11:53

三维基因组 | 棉花 《Nature Plants》 2018

转自：https://www.sohu.com/a/220053461_761120写在前面——什么是三维构象？大家比较熟悉蛋白质的一级结构决定高级结构，高级结构决定蛋白质的功能。对于染色体来说，也是同样的道理。目前基因组测序获取了大量物种的染色体的一级结构（通俗讲DNA序列），对于基因功能研究起到了重要的作用，但染色体的高级结构（3D结构）对于基因功能研究也是不可或缺的。下面小编介绍一讲3D结构
生信师姐·2023-10-30 07:53

基因组组装项目的十二步建议

数据库查询：fungi(http://www.zbi.ee/fungalgenomesize)animals(http://www.genomesize.com)plants(http://data.kew.org
生物信息与育种·2023-10-23 23:23

植物大战僵尸(Plants vs. Zombies)Mac版本

游戏介绍可怕的僵尸即将入侵你的家，唯一的防御方式就是你栽种的植物！武装你的植物，切换他们不同的功能，诸如强悍的豌豆射手或樱桃炸弹，更加快速有效的将僵尸阻挡在入侵的道路上。不同的敌人，不同的玩法构成五种不同的游戏模式，加之夕阳、浓雾以及泳池之类的障碍增加了其挑战性，奇特的游戏乐趣永无止境！独特的五种游戏模式：冒险，迷你，益智，生存，再加上毫无压力的禅境花园多达50个的冒险模式关卡设定，从白天到夜晚再
Such a life·2023-10-15 16:44

「JCVI教程」如何绘制CNS级别的共线性图（上）

本教程借鉴https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version).我们先从http://plants.ensembl.org/index.html
xuzhougeng·2023-10-01 21:56

第271场力扣周赛

classSolution{publicintcountPoints(Stringrings){int[]nums=newint[10];inti=0;while(iwaterA){if(waterB<plants
libChan·2023-09-29 02:24

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画分组折线图和置信区间

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 22:17

2018-7-23 雅思基础口语

昨天和今天的作业:三个topic:①dictionaries②spacetravel③plants链接中的小问题都要说到三遍录音第一遍为原始表达，注重meaning第二遍和第一遍观点要一样，回听第一遍录音
L7_526d·2023-09-21 11:22

Nature Plants：一种新型植物基因工程CRISPR-Cas12b编辑工具问世

图片下载：右键此处另存为可保存此图片提示：欢迎点击上方「PaperRss」↑关注我们！马里兰大学研究人员建立了一种用于植物基因工程新的CRISPR-Cas12b系统。图片下载：右键此处另存为可保存此图片CRISPR基因编辑。图片来源：国立卫生研究院在新出版的《NaturePlants》的中马里兰大学植物科学系助理教授YipingQi首次建立了一种在植物中可行的新CRISPR基因组工程系统：CRIS
PaperRSS·2023-09-16 06:28

Nature Plants：将节节麦基因组导入小麦作为谷物改良的基础

2021年5月，河南大学作物逆境适应与改良国家重点实验室等多家机构的科研团队开发了一个快速渐渗技术平台，利用该技术体系可将A.tauschii（节节麦）丰富的遗传变异转入小麦基因组。相关研究结果已发表在《NaturePlants》上。此项研究中4个新参考基因组的组装数据和注释文件已存储于国家基因库生命大数据平台（CNGBdb），项目编号为：CNP0001325。研究背景增加作物产量对于养活世界上不
尐尐呅·2023-09-10 04:01

63、十三个JavaScript数组的方法

Saturn','Earth','Uranus','Mercury','Venus','Earth','Mars','Jupiter'];varuniquePlants=Array.from(newSet(plants
郑先森·2023-08-29 18:33

E - Plants vs. Zombies

[2018青岛ICPC（ZOJ）Cloned]-VirtualJudge(vjudge.net)问题描述：一个机器人可以走m步，每走一步可以给走到的那一个位置的花浇水，（如果要给一个位置的花浇多次，那么需要再回到这个位置才可以）。现在给了数组a，表示第i个花浇一次水会增加价值ai。求经过最多m步浇水，这一行花最小价值的最大值是多少。思路：二分答案，经典的最小值最大。那么如何考虑对一个花进行多次浇水
golitter.·2023-08-28 07:00

2018-09-01 雅思基础口语

HOMEWORK:plants/spacetravel两个话题AccommodationHouse（可分为六类）flat（可分为四类）Directanswer:eg:Well,Iliveina2-bedroomand2
L7_526d·2023-08-12 04:28

小麦参考基因组下载及相关文件说明

小麦基因组下载地址ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/fasta/triticum_aestivum/dna/其他植物基因组下载地址http
张志勇_zzy·2023-07-29 06:55

Dynamics and function of DNA methylation in plants

AbstractDNA甲基化是非常保守的表观修饰，对于基因调控及基因组稳定性十分重要异常的DNA甲基化模式会导致植物的发育缺陷。一个特定的DNA甲基化状态是由从头甲基化、甲基化维持以及主动去甲基化的动态调控所实现的，这些过程受到多个酶的催化，并且受到不同调控通路的调控。本综述主要讨论了植物中的DNA甲基化，包括甲基化和去甲基化酶以及调控因子，还有一个甲基化和去甲基化共同协作的机制（甲基化稳态调控）
黄粱一梦贰十年·2023-07-22 15:31

Plant Simulation与python之Socket通信的数据交互问题

所以，在PlantS
竹森科技-杨波·2023-04-13 23:30

12个有用的JavaScript数组方法技巧

Saturn','Earth','Uranus','Mercury','Venus','Earth','Mars','Jupiter'];varuniquePlants=Array.from(newSet(plants
Wjy_·2023-04-12 16:05

[基因组学]使用biomaRt做水稻ID转换及相关信息的填充

在水稻中有一些网页工具能完成ID的转换，如EnsemblePlants(http://plants.ensembl.org/index.html)，RAP-Db(h
巩翔宇Ibrahimovic·2023-04-06 03:43

js 数组操作技巧

Saturn','Earth','Uranus','Mercury','Venus','Earth','Mars','Jupiter'];varuniquePlants=Array.from(newSet(plants
GFI_ZT·2023-04-02 02:49

对水稻（模式物种）进行kegg富集分析

在水稻中有一些网页工具能完成ID的转换，如EnsemblePlants(http://plants.ensembl.org/index.html)，RAP-Db(https
多啦A梦的时光机_648d·2023-03-21 07:55

js中处理数组小技巧

Saturn','Earth','Uranus','Mercury','Venus','Earth','Mars','Jupiter'];varuniquePlants=Array.from(newSet(plants
走停2015_iOS开发·2023-03-15 19:50

小清明假期爬山泡“汤”记——增城站

先是潮汕，后厦门鼓浪屿，也曾考虑跟1778户外团去露营……否决了一堆plants之后，我决定开展他一开始就明确拒绝的泡温活动^-^真是天意~爬山其实只是一项”凑单“行程:)2019-04-04Part1
我养了只蠢猫叫星星·2023-03-15 19:21

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画热图展示基因表达量

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本·2023-03-15 02:04

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画变种火山图

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本·2023-02-18 05:43

零基础多物种间共线性分析

话不多说先上效果图一、准备工作1.下载各个物种的.gff文件和基因组序列文件示例数据下载地址：[http://plants.ensembl.org/info/
花舞lala·2023-02-04 10:43

Plant Care-Plants management

Thisisanappdesignedtohelpusersmanagetheirowngreenplants.Doyouhavetoomanyplants?Alwaysforgettheirtimeforwatering,fertilizingortrimming?Withourappyoucanuploadaphotoofeachofyourplants,settingtimeforwater
Green_Mage·2023-02-01 03:43

Nature(二稿)

Natureiswherewefromandwerealllivingcreaturesbelongs.Itbreedsvitalityandcontinuemakemiracles.Plants,Animals
River本大魁·2023-01-30 02:52

Nature

Natureiswherewefromandwerealllivingcreaturesbelongs.Itbreedsinfinitevitalityandcontinuemakemiracles.Plants
River本大魁·2022-12-27 08:26

Nature Plants|植物基因组测序20年回顾与展望：三代HiFi基因组时代

2021年11月29日，美国密歇根州立大学在《NaturePlants》期刊在线发表题为“Representationandparticipationacross20yearsofplantgenomesequencing”综述，系统阐述了在过去的20年间，对陆地植物基因组学组装质量、已测序物种的分类和地理分布的评估。在过去的20年中，陆地植物（胚胎植物）基因组测序技术的提高，组装质量有了显著提高
SHANGHAILINGEN·2022-11-29 07:26

JavaScript 数组方法总结

constplants=['broccoli','cauliflower','cabbage','kale','tomato'];plants.pop()//"tomato"console.log(plants
lio_zero·2022-05-30 14:04

跟着Nature Plants学作图：R语言ggtree包展示进化树

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641看了论文，提供了
小明的数据分析笔记本·2022-05-12 19:44

BZOJ1565：[NOI2009]植物大战僵尸——题解

Plants（植物）和Zombies（僵尸）是游戏的主角，其中Plants防守，而Zombies进攻。该款游戏包含多种不同的挑战系列，比如P
weixin_34356555·2022-04-30 19:58

洛谷 P2805 BZOJ 1565 植物大战僵尸

Plants（植物）和Zombies（僵尸）是游戏的主角，其中Plants防守，而Zombies进攻。该款游戏包含多种不同的挑战系列，比如ProtectYourBrain、Bowling等等。
weixin_33725272·2022-04-30 19:27

BZOJ1565[NOI2009]植物大战僵尸——最大权闭合子图+拓扑排序

Plants（植物）和Zombies（僵尸）是游戏的主角，其中Plants防守，而Zombies进攻。该款游戏包含多种不同的挑战系列，比如ProtectYourBrain、Bowling等等。
weixin_33860722·2022-04-30 19:27

基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型＆同源blast)

方法一：基于hmm模型的鉴定方法1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release
pomela·2022-02-13 13:16

C1任务01 北院314-张本龙

---任务步骤：1、所需软件植物大战僵尸游戏软件、二进制编辑器2、创建存档点开游戏，创建一个账户，开始一把游戏，存档创建成功3、找到游戏存档地址（C:\ProgramData\PopCapGames\Plants
qq_52204449·2021-05-27 11:18
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