R语言入门系列

使用R语言进行数据处理，数据分析，特征工程的基础以及代码实现（以房价预测数据集为例）

主要内容：一、对数据缺失值进行处理在R语言中，处理数据缺失值是数据预处理的一个重要步骤，通常采用以下方法：识别缺失值：在R中，缺失值通常用NA表示。
筱筱西雨·2023-12-24 07:37

R语言ggplot2可视化：分组堆叠条形图，展示不同分组的多个处理数据特征，动态交互式条形图

今天分享的内容是在R语言中绘制该图的方法，包括数据的整理准备过程，以及绘图所用的代码，所有数据均随机生成，无实际意义。使用R语言中plotl
生信分析笔记·2023-12-24 06:54

生物系统学中的进化树构建和分析R工具包V.PhyloMaker2的介绍和详细使用

V.PhyloMaker2是一个R语言的工具包，专门用于构建和分析生物系统学中的进化树（也称为系统发育树或phylogenetictree）。
小果运维·2023-12-24 02:31

R语言专题班（直播：2023.8.4~8.6）

茗创科技专注于脑科学，涵盖（EEG/ERP，fMRI，结构像，DTI，ASL，FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑科学课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技·2023-12-24 00:24

R语言广义线性模型：Logistic回归模型的亚组分析及森林图绘制

R语言广义线性模型：Logistic回归模型的亚组分析及森林图绘制Logistic回归模型是一种常用的广义线性模型，广泛应用于分类问题。
大笑编程·2023-12-23 21:06

决策曲线分析DCA用于lasso回归/随机森林

本文首发于公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。
医学和生信笔记·2023-12-23 21:29

GDAS003-Bioconductor与基因组级数据分析简介

R语言，R包与仓库(repositories)学习这一系列课程的前提是你已经有
backup备份·2023-12-23 14:37

R语言【rWCVP】——解决！wcvp_checklist在使用物种的完整科学名，并指定物种的分类等级为“species”时，找不到任何记录，并输出：No occurrences.

PackagerWCVPversion1.2.4解决方法直接看Solution。Parameterswcvp_checklist(taxon=NULL,taxon_rank=c("species","genus","family","order","higher"),area_codes=NULL,synonyms=TRUE,render_report=FALSE,native=TRUE,intr
ALittleHigh·2023-12-23 12:09

R语言【dplyr】——right_join(x, y)将y在x中找到的匹配项传回y

Packagedplyrversion1.1.4right_join(x,y,by=NULL,copy=FALSE,suffix=c(".x",".y"),...,keep=NULL)##S3methodforclass'data.frame'right_join(x,y,by=NULL,copy=FALSE,suffix=c(".x",".y"),...,keep=NULL,na_matches
ALittleHigh·2023-12-23 12:36

R与RStudio的安装教程

    随着大数据和机器学习的快速发展，数据分析已成为物联网、云计算等领域最核心的处理方法，而R语言作为一种为统计计算和图形显示而设计的免费开源的语言环境，无疑是数据分析行业最炙手可热的一把“利器”！
YERA·2023-12-23 11:56

ETL入门系列 之 数据整合面临的挑战

这些挑战可能包括：政治的、组织性的、功能性的或者技术性的。方法论：敏捷BI软件开发者们发现这些结构化的瀑布模型方法并不能适用于所有场景，尤其是在需求经常变化的情况下。为了解决这种需求经常变化的问题，出现了各种不同的“敏捷”开发方法。在这些方法中，也许Scrum方法是最著名的一个。Pentaho公司把开发PentahoBI套件过程中使用的敏捷开发经验提升为敏捷BI方法。这样做不公可以给BI开发者提供
小纠结在简书·2023-12-23 09:23

R语言贝叶斯网络模型、INLA下的贝叶斯回归、R语言现代贝叶斯统计学方法、R语言混合效应（多水平/层次/嵌套）模型

目录㈠基于R语言的贝叶斯网络模型的实践技术应用㈡R语言贝叶斯方法在生态环境领域中的高阶技术应用㈢基于R语言贝叶斯进阶:INLA下的贝叶斯回归、生存分析、随机游走、广义可加模型、极端数据的贝叶斯分析㈣基于
WangYan2022·2023-12-23 07:07

R语言中使用ggplot2绘制散点图箱线图，附加显著性检验

本篇笔记主要内容：介绍R语言中绘制箱线图和散点图的方法，以及二者结合展示教程，添加差异比较显著性分析，绘制如上结果图。
生信分析笔记·2023-12-23 07:07

R语言的极值统计学及其在相关领域中的实践技术应用

受到气候变化、温室效应以及人类活动等因素的影响，自然界中极端高温、极端环境污染、大洪水和大暴雨等现象的发生日益频繁；在人类社会中，股市崩溃、金融危机等极端情况也时有发生；今年的新冠疫情就是非常典型的极端现象。研究此类极端现象需要新的统计学方法，该类统计学的理论和方法都与传统的基于高斯分布的统计学模型有极大的不同。极值统计学就是专门研究自然界和人类社会中很少发生，然而发生之后有着巨大影响的极端现象的
梦想的初衷~·2023-12-23 07:35

求解中位数的R语言实现

求解中位数的R语言实现中位数是统计学中常用的一个概念，它代表一组数据中的中间值。在R语言中，我们可以使用不同的方法来计算中位数。
RTX99090·2023-12-23 05:36

跟着Science学作图：R语言ggplot2画箭头展示变量对主成分的贡献

论文https://www.science.org/doi/10.1126/science.abk0989image.png最近朋友圈好多人都在转这个论文，我也找来看了看，论文研究的内容看的还是一知半解。论文用到的数据代码都是公开的，我们可以学习一下其中的代码代码链接https://github.com/James-S-Santangelo/glue_pc今天的图文重复论文中的Figure2Bim
小明的数据分析笔记本·2023-12-23 04:02

R语言【cli】——简短的提示性信息输出cli_alert，cli_alert_success，cli_alert_danger，cli_alert_warning，cli_alert_info

Packagecliversion3.6.2cli_alert_success(text,id=NULL,class=NULL,wrap=FALSE,.envir=parent.frame())cli_alert_danger(text,id=NULL,class=NULL,wrap=FALSE,.envir=parent.frame())cli_alert_warning(text,id=NUL
ALittleHigh·2023-12-23 02:45

R语言【tidyselect】——all_of，专门在select函数中传递字符型向量，比如select(all_of(vars))，必须保证所有传入值都有用，否则报错

Packagetidyselectversion1.2.0Parameterall_of(x)参数【x】：表示名称的字符型或表示索引位置的数值型向量。Tipall_of()用于严格选择。如果字符向量中缺少任何一个变量，就会出错。all_of()用于配合类似dplyr::select()的函数使用，以便达到在数据集中按照列名获取子集的效果。Examplelibrary(tidyverse)#Forb
ALittleHigh·2023-12-23 02:15

R语言【dplyr】——filter保留符合筛选条件的行，以数据的行为单位，创建子集

Packagedplyrversion1.1.4Parametersfilter(.data,...,.by=NULL,.preverse=FALSE)参数【.data】：一个数据集（dataframe），数据集扩展（比如：tibble），或者lazydataframes（比如：来自dbplyr或dtplyr）。参数【...】：数据过滤表达式（data-maskingexpression），返回的
ALittleHigh·2023-12-23 02:14

R语言【stringr】——str_detect 检测是否存在字符串的匹配项

Packagestringrversion1.5.1str_detect(string,pattern,negate=FALSE)参数【string】：输入向量。既可以是字符向量，也可以是强制作为一个字符向量。参数【pattern】：要寻找的模式。默认解释为正则表达式，如vignette("regular-expressions")所述。参数【negate】：如果为TRUE，则将得到的布尔向量反转
ALittleHigh·2023-12-23 01:11

R语言编程-Tidyverse 书籍-第一章（1）

0.1认识编程元素和语法规则R中编程元素：元素，向量，数据框，列表，HadleyWickham定义的数据科学的工作流程：数据读入-清理数据-数据转换-数据可视化-数据建模-文档沟通image.png0.2R语言编程思想面向对象
Hello育种·2023-12-22 23:08

R语言里做基因组共线性可视化R包~GENESPACE

论文GENESPACE:syntenicpan-genomeannotationsforeukaryoteshttps://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.03.09.483468v1还没有发表github主页https://github.com/jtlovell/GENESPACE详细介绍https://htmlpreview.github.io/?ht
小明的数据分析笔记本·2023-12-22 21:51

跟着JoVE学作图：R语言ggplot2做簇状柱形图并添加显著性标记的完整示例

昨天的推文发出后，好多人留言问如何添加显著性标记，今天的推文介绍下如何在簇状柱形图的基础上添加显著性标记添加显著性标记用到的是ggsignif包中的geom_signif()函数在昨天推文的基础上，如果是利用带重复的原始数据作图，然后利用geom_signif()函数作图的时候我遇到了报错，暂时还不知道如何解决。等找到原因了再来介绍。查找资料的过程中找到了一篇论文image.pnghttps://
小明的数据分析笔记本·2023-12-22 16:07

46期生信第四天-一加一等于几

生信学习第四天---R语言基础1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）用搜狗微信搜索：“果子学生信给自己一个全新的R语言环境官网网址R:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn
茶黄素·2023-12-22 14:49

R语言【base】——requireNamespace检查软件包是否安装

Packagebaseversion4.3.2requireNamespace(package,...,quietly=FALSE)参数【package】：字符串，表示要加载的软件包/名称空间（NAMESPACE）。参数【quietly】：逻辑值；是否应取消进度和错误信息？参数【quietly】的默认值FALSE表示在控制台输出检查过程和信息；将此参数的值设置为TRUE，可以隐藏检查过程的信息在控
ALittleHigh·2023-12-22 10:42

R语言可视化（十六）：PCA图绘制

16.PCA图绘制清除当前环境中的变量rm(list=ls())设置工作目录setwd("C:/Users/Dell/Desktop/R_Plots/16pca/")加载示例数据data<-read.table("demo_pca.txt",header=T,row.names=1,sep="\t",check.names=F)#查看数据head(data)##C1C2C3M1M2M3##AT1G
Davey1220·2023-12-22 08:39

R语言【base】——inherits判断R对象是否继承某类

Packagebaseversion4.3.2inherits(x,what,which=FALSE)参数【x】：一个R语言对象。参数【what】：命名类的字符向量。
ALittleHigh·2023-12-22 07:55

《物种起源》第一章：家养状况下的变异读后感

人们为了将数据可视化而发明的多种语言工具如R语言、python语言、C语言等；为了阐明恒定各种物理定律，科学家对各种抽象的事物进行命名如“速度、质量、引力、磁场、电场、神以及物种等”，其中物种一词至今都没有一个明确的界定
澡堂陈奕迅·2023-12-22 06:36

3.多元统计分析

学习多元统计分析与R语言截屏。但是我不会R,只会Python。所以只是用来学习一些方法。第一章概述1.1目录目录第二章多元数据的数学表达2.1R:用矩阵表示数据。行代表样本，列代表特征值。
Plenari·2023-12-22 05:50

R语言快速更新

打开R而不是Rstudio，输入：installr::updateR()没有installr包的需要安装一下，这种比上官网下载并且自己转移包要方便的多。
该叫个什么名字好呢·2023-12-22 02:02

R语言的ggplot2+ggforce包绘制散点图并添加分组边界

之前的推文介绍过ggplot2绘图添加椭圆分组边界和圆形分组边界，借助的函数分别是stat_ellipse()ggforce包里的geom_circle()函数今天查找桑基图的资料的时候发现了一份介绍ggforce这个包的使用方法的文章https://rviews.rstudio.com/2019/09/19/intro-to-ggforce/，发现发现添加分组边界还有其他的实现方法，今天的推文记
小明的数据分析笔记本·2023-12-22 00:52

R语言【base】——match.arg通过部分匹配校正参数输入，参数的输入值从首字母开始，保持连续，宁缺勿错

Packagebaseversion4.3.2match.arg通过部分匹配校正参数输入match.arg(arg,choices,several.ok=FALSE)match.arg的功能是：将参数【arg】的传入值与参数【choices】的传入值进行匹配，参数choices的传入值可以视为一个候选值列表。match.arg的参数参数【arg】：当参数【serveral.ok】为FALSE时，既
ALittleHigh·2023-12-21 19:47

R语言【invisible】——将控制台的输出模式调整为隐藏，只允许赋值后输出，返回对象的（临时）不可见副本

Packagebaseversion4.3.2invisible(x=NULL)参数【x】：一个任意的R对象，默认为NULL。如果希望函数返回的值可以赋值，但在未赋值时不打印，则可以使用该函数。f<-function(x){if(x){return(x)}else{return(invisible(x))}}f(1)f(0)只有f(1)显示结果：[1]1
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【cli】——cli_warn可以更便捷的在控制台输出警告信息

Packagecliversion3.6.2cli_warn(message,...,.envir=parent.frame())参数【message】：它是通过调用cli_bullets()进行格式化的。进一步地，还需要调用inline-makeup（内联标记）。参数【...】：传递给rlang::abort()，rlang::warn()或rlang::warn()的参数。参数【.envir】
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【assignOps】——通过超赋值符（＜＜-）向上层环境中的变量写入值，或者在上层环境中创建新变量并写入值

Packagebaseversion4.3.2在R语言中，处在某一个环境层的代码都拥有读入上一环境层的变量的权限，但相反地，若只通过标准的赋值运算符test_suprassign()[1]3>a错误
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【cli】——通过cli_abort用 cli 格式的内容显示错误、警告或信息，内部调用cli_bullets和inline-makeup

cli_abort(message,...,call=.envir,.envir=parent.frame(),.frame=.envir)先从那些不需要下大力气理解的参数入手：参数【.envir】：进行万能表达式编译的环境。参数【.frame】：抛出上下文。默认用于参数【.trace_bottom】，当参数【.internal】为TRUE时，用于确定在内部错误中提及的内部软件包。参数【call】
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言机器学习与临床预测模型74--模型建立和验证的统计基础

R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01统计模型统计模型是一类数学模型，通常由一个或多个变量与近似现实相关的数学方程指定。
科研私家菜·2023-12-21 16:47

用Python画一个中国地图

为什么是Python先来聊聊为什么做数据分析一定要用Python或R语言。编程语言这么多种，Java,PHP都很成熟，但是为什么在最近热火的数据分析领域，很多人选择用Python语言？
小凶许打小脑斧·2023-12-21 15:12

R语言——文件读写（三）

目录一、获取数据二、读取文件三、写入文件四、读写Excel文件五、读写R格式的文件参考一、获取数据获取数据的三种途径：1.利用键盘来输入数据2.通过读取存储在外部文件上的数据3.通过访问数据库系统来获取数据edit()：定义一个数据编辑器，可直接输入修改数据，关闭编辑器，数据自动保存到变量中，注意这里需要将修改后的数据重新指向一个变量名，才可以成功保存fix()：可以直接修改并保存，不需要重新定义
Billie使劲学·2023-12-21 09:13

R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习技术应用

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。本教程针对
梦想的初衷~·2023-12-21 09:42

R语言——基本操作（二）

目录一、矩阵与数组二、列表三、数据框四、因子五、缺失数据六、字符串七、日期和时间参考一、矩阵与数组matrix：创建矩阵，nrow和ncol可以省略，但其值必须满足分配条件，否则会报错只写一个值则自动分配，默认按列分配byrow属性可以控制矩阵按行排列dimnames(m)：定义矩阵行和列的名字dim(x)：输出x的维度dim(x)<-c(2,5)：为x添加维度（创建数组），三个数字则为三维数组a
Billie使劲学·2023-12-21 09:41

蛋白质组学基础入门系列 |（三）蛋白质组学常用技术盘点（上）

基于质谱的蛋白质组学技术是生命科学领域十分常用的发现和验证工具。在进行日常科研工作时，经常在文献中看到各种各样的蛋白质组学技术专业名词，让人眼花缭乱、似懂非懂...本讲内容就带大家梳理这些专业术语，盘点蛋白质组学的常用技术。（蛋白质组学技术的专业名词）我们在第一讲《蛋白质组学的基本概念》中提到过蛋白质组学研究的基本流程主要包含样品处理、质谱检测、数据分析三大阶段，以上这些词都可以对应到蛋白质组学研
小谱是大妞·2023-12-21 09:52

R语言机器学习一揽子解决方案-tidymodels（Build a model）

本文为笔者从官网学习的代码实录，不对的地方请多指教！官网地址：https://www.tidymodels.org/官网介绍：Thetidymodelsframeworkisacollectionofpackagesformodelingandmachinelearningusingtidyverseprinciples.本次内容为getstarted部分的pipeline内容目录如下图内容目录载
灵活胖子的进步之路·2023-12-21 08:28

【R语言】logistic回归（一）批量单因素logistic回归

后续会继续分享一些R语言分析代码，欢迎大家一起讨论学习。
Moon_5237·2023-12-21 08:59

[原创][R语言]股票分析实战[3]:周级别涨幅趋势的相关性

[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父·2023-12-21 07:52

R语言：独立性检验函数

在R语言中，我们可以使用独立性检验函数来评估两个变量之间是否存在独立性关系。独立性检验是统计学中一种常用的方法，用于确定两个变量是否在统计上相互独立。
代码创造·2023-12-21 04:29

R语言中逻辑回归的R方求解

在R语言中，我们可以使用不同的函数和库来进行逻辑回归分析，并计算模型的R方（R-squared）值，以评估模型的拟合程度。R方是一种常见的统计指标，用于衡量回归模型对观测数据的拟合程度。
代码创造·2023-12-21 04:29

跟着PNAS学画图：R语言ggplot2分面的堆积柱形图

论文https://www.pnas.org/content/118/20/e2010588118Deathratesatspecificlifestagesmoldthesexgapinlifeexpectancyimage.png论文本地存储e2010588118.full.pdf很有意思的一篇论文，研究的内容是为什么女生比男生活的时间长（Whydowomenlivelongerthanmen
小明的数据分析笔记本·2023-12-21 03:40

R语言ggplot2绘制中国区域地图并添加河流信息的小栗子

下面是正文前几天看了几篇闫大佬绘制的中国沿海地区的地图（公众号：R语言数据分析指南），然后试着自己画了一下。大佬的代码里面只有中国主要河流的信息，没有区域河流信息。
小明的数据分析笔记本·2023-12-21 02:43

R语言|绘制组间差异柱状图

柱状图也是差异可视化图形的一种，今天小编来分享一下组间差异柱状图在R语言中的绘制方法，主要用的是ggplot2包，这个包功能的确很强大。
维凡生物·2023-12-21 01:45
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