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R语言聚类
kmeans实例及代码
聚类
和决策树一样,属于无监督学习。也就是说数据样本只有特征x,没有给定y。
聚类
的目的是找到样本特征潜在的类别,将同类别的样本放在一起。
morie_li
·
2024-02-07 06:57
机器学习
聚类
算法
聚类
算法是一种无监督学习方法,用于将数据集中的样本划分为多个簇,使得同一簇内的样本相似度较高,而不同簇之间的样本相似度较低。
小森( ﹡ˆoˆ﹡ )
·
2024-02-07 04:26
机器学习算法
算法
聚类
机器学习
scanpy 教程 1:预处理和
聚类
3k PBMCs
推荐先按顺序阅读往期内容:文献篇:1.文献阅读:SCANPY:大规模单细胞基因表达数据分析2.文献阅读:scverse项目为单细胞组学数据分析提供了计算生态系统目录1预处理2主成分分析3计算邻域图4嵌入邻域图5对邻域图进行
聚类
Tiger Z
·
2024-02-07 03:02
程序人生
python小白入门单细胞分析scanpy
这里要注意一下,它和
R语言
的不同,Scanpy中的行为样本,列为基因
生信小博士
·
2024-02-07 03:01
scanpy
python
开发语言
双序列比对的多路径回溯,
R语言
双序列比对的多路径回溯**这是双序列比对的多路径回溯的
R语言
实现,用类似linux系统中给用户赋权限的方法记录来源方向,感觉比列表储存来源方向好。
琅琊笑笑风
·
2024-02-07 03:19
数据无量纲化 学习(1):三种常用数据缩放方法的对比:StandardScaler、MinMaxScaler、RobustScaler
在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;在距离类模型,譬如K近邻,KMeans
聚类
中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响
Tony Einstein
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2024-02-06 22:03
特征工程
机器学习
python
算法
特征工程
数据标准化
R语言
--12
数组(array)数组是k维的数据表。向量(n=1),矩阵(n=2),高维数组(n>=3)矩阵的生成及基本操作matrix(data=NA,nrow=1,ncol=1,byrow=FALSE,dimnames=NULL):data可以为一个向量,nrow/ncol为指定生成的行数和列数,byrow:设定向量排布成指定的行数和列数时,按照行排列,默认是按列排布。dimnames:设定行名和列名。co
白猫警长ic
·
2024-02-06 19:02
R语言
绘图教程 | 双侧条形图绘制教程
写在前面双侧条形图在我们的文章中也是比较常见的,那么这样的图形是如何绘制的呢?以及它使用的数据类型是什么呢?这些都是我们在绘制图形前需要掌握的,至少我们知道绘图的数据集如何准备,这样才踏出第一步。今天的教程,我们会从数据的准备,以及数据如何整理,以及结合自己的绘图过程中遇到问题是如何解决来进行讲解。PS:仅代表个人的观点,以及自己遇到此问题时自己的方法来进行说明。也许,这个并不会死唯一且最好的方法
小杜的生信筆記
·
2024-02-06 18:56
R语言精美图形绘制教程
r语言
双侧条形图
条形图
R语言绘图
R语言
学习case12:ggplot 置信区间(多线型)
接上文:多条曲线
R语言
学习case11:ggplot置信区间(包含多子图)在ggplot2中,每个geom函数都接受一个映射参数。然而,并非每个美学属性都适用于每个geom。
早起CaiCai
·
2024-02-06 14:12
R语言
r语言
学习
开发语言
数据可视化
数据分析
caTools一个奇特的工具集
R语言
作为统计学一门语言,一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发,
R语言
变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入,
R语言
的社区在迅速扩大成长。
Fens
·
2024-02-06 13:11
r语言
人工智能
java
FigDraw 5. SCI 文章绘图之柱状图 (Barplot)
前两期简单介绍了
R语言
基础,比较简单粗略,然后介绍了
R语言
中表格的转换,因为现在绘图基本以及舍弃了基本绘图的方式,都会选择ggplot2来作图,这期SCI绘图介绍一下柱状图!
90066456ace6
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2024-02-06 13:07
r语言
中大小写c的区别吗,
R语言
大小写字母转换
JavaforLeetCode231PowerofTwopublicbooleanisPowerOfTwo(intn){if(n运行,打开运行窗口.2,输入cmd,打开命令行窗口.3,进入cmd,找到orpxllite.ocx和orTrueReuse.ocx的所在的目录4,输入以下命令:regsvr32&...Swift表视图动画教程:Drop-InCardshttp://www.ra
神秘巨星z
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2024-02-06 12:16
r语言中大小写c的区别吗
代码+视频一步到位:手把手教你
R语言
竞争风险模型建模-列线图-校准曲线-K折验证-外部验证- 决策曲线
我们在既往文章《手把手教你使用
R语言
做竞争
天桥下的卖艺者
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2024-02-06 12:45
R语言
代码+视频系列
r语言
R语言
阈值效应函数cut.tab2.0版发布(支持线性回归、逻辑回归、cox回归,自定义拐点)
阈值效应和饱和效应是剂量-反应关系中常见的两种现象。阈值效应是指当某种物质的剂量达到一定高度时,才会对生物体产生影响,而低于这个剂量则不会产生影响。饱和效应是指当某种物质的剂量达到一定高度后,其影响不再随剂量的增加而增加,即产生饱和现象。这两种效应在药物、毒物、营养物质等剂量-反应关系中都有应用。接下来聊聊RCS阈值函数是干什么用的,随便抓一篇论文给大家看看,粉丝发给我的。L-shapedasso
天桥下的卖艺者
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2024-02-06 12:44
R语言
我写的R包
回归
r语言
线性回归
基于python的k_means算法实现
K-Mean算法,即K均值算法,是一种常见的
聚类
算法。算法会将数据集分为K个簇,每个簇使用簇内所有样本均值来表示,将该
小菜鸡@
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2024-02-06 11:25
python
算法
聚类
sklearn之模型评估指标总结归纳
文章目录机器学习模型评估分类模型回归模型
聚类
模型交叉验证中指定scoring参数网格搜索中应用机器学习模型评估以下方法,sklearn中都在sklearn.metrics类下,务必记住哪些指标适合分类,
lzw2016
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2024-02-06 10:57
机器学习
Python学习
sklearn
模型评估指标
归纳总结
R语言
:箱线图绘制(添加平均值趋势线)
之前我是比较喜欢使用origin进行绘图,但是绘制的图不太好看,并且需要进行不断调整,不太方便,所以开始使用
R语言
进行绘制。2.箱线图绘制2.1相关R包导入library(openxlsx)libr
Amyniez
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2024-02-06 09:42
R语言
r语言
python
开发语言
经验分享
GIS
ggplot2
R语言
学习case11:ggplot 置信区间(包含多子图)
ggplotGeometricobjectsHowarethesetwoplotssimilar?两个图都包含相同的x变量、相同的y变量,并且描述相同的数据。但是这两个图并不相同。每个图使用不同的可视化对象来表示数据。在ggplot2语法中,我们说它们使用不同的geoms。geom是绘图使用的几何对象,用于表示数据。人们通常通过绘图使用的geom类型来描述图表。例如,柱状图使用bargeoms,折
早起CaiCai
·
2024-02-06 09:10
R语言
r语言
学习
开发语言
数据分析
数据可视化
2022-08-14
我想完善一下,会使用Linux,会使用
R语言
,学了转录组分析的流程和
佳奥
·
2024-02-06 09:00
R语言
方差分析
医学和生信笔记,专注
R语言
在临床医学中的使用,
R语言
数据分析和可视化。这是
R语言
和医学统计学的第2篇内容。主要是用
R语言
复现课本中的例子。
医学和生信笔记
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2024-02-06 09:26
R语言
专题班(直播:2023.8.4~8.6)
茗创科技专注于脑科学,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加我们的工程师(微信号MCKJ-zhouyi或17373158786)咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技
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2024-02-06 05:57
学习:StatQuest-Heatmap
热图中的标准化和
聚类
Z-scoreimage.png如果有一列数据,我们要计算Z-score:计算这组数据的均值每个数据点减去均值计算标准差用第二步计算的值除以标准差image.png标准化有对某一基因标准化的
小潤澤
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2024-02-06 05:17
r语言
svr模型_R建立SVR模型,并用遗传算法优化
刚刚尝试在建立了SVR模型之后,再用遗传算法优化SVR的cost和gamma参数,给大家分享下,有错误的欢迎指正~rm(list=ls())#loadpackagelibrary(stringr)library(dplyr)library(openxlsx)#readdatagaseread.xlsx("D:/3_analytic_case/1_gase_data_pred/原始数据.xlsx",
weixin_39760433
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2024-02-05 23:30
r语言svr模型
R语言
量化投资(1)
R是一门非常适合做数据的工具。不用关注时间复杂度多少,怎么把程序写漂亮。而是关注如何收集数据,提高数据质量,来解决实际的业务问题。跨界是一个很难的问题,因为不同背景的人进行沟通是一个非常困难的问题,尤其是金融行业和IT行业:一个封闭不愿意分享,一个开放崇尚开源;一种所有人都要为我服务,一种只专注自己感兴趣的事情。做跨学科的事情,你要了解项目管理的方法,产品设计的逻辑,数知识,机器学习知识,结合业务
Liam_ml
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2024-02-05 20:41
人工智能福利站,初识人工智能,机器学习,第四课
收藏人工智能领域知识链接专栏人工智能专业知识学习一机器学习专栏人工智能专业知识学习二机器学习专栏人工智能专业知识学习三机器学习专栏人工智能专业知识学习四机器学习专栏文章目录初识人工智能(机器学习)一、机器学习(4)31.什么是
聚类
算法中的层次
聚类
普修罗双战士
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2024-02-05 19:14
人工智能专栏
人工智能
机器学习
RStudio环境熟悉与基本小技巧
如果你是一个新手,通过上一篇的内容我相信你已经把
R语言
环境安装好了。那么,你肯定迫切想写下自己的第一行R代码。那么,是在RGui、还是Rstudio环境呢?
大数据技术派
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2024-02-05 18:30
R语言
正则表达式(1)
基本规则如下:.任意字符[a-z]表示a-z任意一个小写字符[0-9]匹配所有数字字符[^0-9]匹配所有非数字字符^位于表达式开始表示匹配文本开始处,放在方括号内开始表示非方括号内的任一字符{3}表示前面的字符或表达式的重复3次|表示前后的表达式任选一个\\(\\)匹配括号()\d表示0-9\D表示非数字\s表示空白字符\S表示非空白字符\w表示字符(字母和数字)\W表示非字符\b以英文字母,数
weixin_49320263
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2024-02-05 18:23
常用方法
正则表达式
R语言
提高效率的技巧方法(1)
1、批量导入包library(pacman)p_load("dplyr","survival")2、查看R包使用方法help(package="survival")3、查看R包内所有函数library("survival")all_functions<-ls("package:survival",pos=1)4、查看具体函数注释和用法db<-tools::Rd_db("dplyr")#获取R包内所
weixin_49320263
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2024-02-05 18:21
常用方法
r语言
开发语言
第八章
聚类
一.概述
聚类
(cluster)与分类(class)问题不同,
聚类
是属于无监督学习模型,而分类属于有监督学习。
聚类
使用一些算法把样本分为N个群落,群落内部相似度较高,群落之间相似度较低。
颜大哦
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2024-02-05 14:32
人工智能学习笔记
聚类
机器学习
支持向量机
机器学习本科课程 实验6
聚类
实验
第一题:使用sklearn的DBSCAN和AgglomerativeClustering完成
聚类
实验内容:使用sklearn的DBSCAN和AgglomerativeClustering在两个数据集上完成
聚类
任务对
聚类
结果可视化对比外部指标
11egativ1ty
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2024-02-05 13:43
机器学习
本科课程
机器学习
聚类
人工智能
(5)【Python/机器学习/深度学习】Machine-Learning模型与算法应用—12种
聚类
算法说明与归纳
目录一、12种
聚类
(无监督学习)算法说明和区分比较
聚类
算法的类型(一)编辑导入函数库加载数据集编辑(1)K-Means--Centroidmodels(2)Mini-BatchK-Means--Centroidmodels
代码骑士
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2024-02-05 13:12
#
机器学习
人工智能
数据库笔记——分析总结聚集索引、非聚集索引和覆盖索引
一、首先深入浅出理解索引结构来自聚集索引和非聚集索引实际上我们可以将索引理解为一种目录,索引可分为
聚类
索引和非
聚类
索引。我们的汉语字典的正文本身就是一个聚集索引。
学习BigData
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2024-02-05 13:29
数据库
笔记
oracle
sql
数据结构
(4)【Python数据分析进阶】Machine-Learning模型与算法应用-回归、分类模型汇总
135693621https://codeknight.blog.csdn.net/article/details/135693621本篇主要介绍决策树、随机森林、KNN、SVM、Bayes等有监督算法以及无监督的
聚类
算法和应用
代码骑士
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2024-02-05 13:59
#
python
数据分析
回归
R语言
:pie3D绘制三维饼图
导读:前面画过二维饼图:
R语言
:pie绘制饼图,这次用plotrix包pie3D函数画三维的。
胡童远
·
2024-02-05 12:08
挖掘建模概述
1、概述1.1数据挖掘的基本任务基本任务包括分类与预测、
聚类
分析、关联规则、时序模式、偏差检测、智能推荐等方法,通过完成这些任务,发现数据的价值,指导商业抉择,带来商业新价值。
三块给你买麻糬_31c3
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2024-02-05 07:02
Flutte
r语言
开发的高仿抖音App源码
简介一款基于Flutte
r语言
开发的高仿抖音App。初衷是用来学习Flutter跨平台技术,积累实战经验。开放出去是让更多的老铁们在技术的路上越走越远…老铁们喜欢的话,帮忙给个star,多谢!
专注移动开发
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2024-02-05 07:15
Flutter
Flutter仿抖音App源码
flutter
The Linux Process Principle, PID、PGID、PPID、SID、TID、TTY
进程2.Linux进程的相关标识3.进程标识编程示例4.进程标志在Linux内核中的存储和表现形式5.后记0.引言在进行Linux主机的系统状态安全监控的过程中,我们常常会涉及到对系统进程信息的收集、
聚类
liujianfei526
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2024-02-05 00:42
c/c++知识
什么?70 位顶尖测试工程师被 AI 击败(上)
我花了非常多的时间和精力去研究如何让机器使用神经网络、
聚类
、或者强化学习技术去执行测试用例,这是一项非常繁重的工作。不过从某种程度上这也是相对重复的工作。
泰斯特_
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2024-02-05 00:24
机器学习数据预处理--连续变量分箱
文章目录原理概念等宽分箱等频分箱
聚类
分箱有监督分箱原理概念连续变量分箱即对连续型字段进行离散化处理,也就是将连续型字段转化为离散型字段。
恒c
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2024-02-04 23:02
机器学习
人工智能
详细流程安装Anaconda,开启AI第一步【Windows版】
AI时代来临,让我们开启Pytorch之旅第一步,安装AnacondaAnaconda:数据科学的利器Anaconda是一个开源的Python和
R语言
发行版,用于计算科学,特别是数据科学。
心安成长
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2024-02-04 22:37
Python工具
人工智能
python
机器学习 | 解析
聚类
算法在数据检测中的应用
目录初识
聚类
算法
聚类
算法实现流程模型评估算法优化特征降维探究用户对物品类别的喜好细分(实操)初识
聚类
算法
聚类
算法是一种无监督学习方法,用于将数据集中的对象按照相似性分组。
亦世凡华、
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2024-02-04 22:59
#
机器学习
机器学习
算法
聚类
k-means
人工智能
全面解析 Kmeans
聚类
算法(Python)
作者|泳鱼来源|算法进阶一、
聚类
简介Clustering(
聚类
)是常见的unsupervisedlearning(无监督学习)方法,简单地说就是把相似的数据样本分到一组(簇),
聚类
的过程,我们并不清楚某一类是什么
AI科技大本营
·
2024-02-04 22:59
算法
聚类
python
机器学习
人工智能
解析机器学习中的几种常见
聚类
算法
关于
聚类
算法一直是近几年来机器学习的热门,下面谈谈自己对其中几种
聚类
算法的理解,首先在谈
聚类
算法之前我们引入相似度这么一个概念,什么是相似度呢,简单来说假设有M个样本,其中任意两个样本之间的相似的度量,
魔法_wanda
·
2024-02-04 22:59
first
机器学习
算法
人工智能算法
机器学习——分级
聚类
法介绍及其Python实现
目录
聚类
分析概念1.1为什么
聚类
1.2
聚类
到底是什么1.3
聚类
与分类区别1.4相似性与距离
聚类
1.5相似性的测度特征相似度测度与
聚类
准则2.1特征相似度测度2.2
聚类
准则分级
聚类
法
聚类
分析概念1.1为什么
聚类
之所以要
聚类
AI小小白
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2024-02-04 22:29
聚类算法
人工智能
机器学习
聚类
算法
数据分析必备:掌握这个
R语言
基础包1%的功能让你事半功倍!(附代码)
本文介绍了utils包在
R语言
基础的用途。[导读]无论数据分析的目的是什么,将数据导入R中的过程都是不可或缺的。毕竟巧妇难为无米之炊。utils包是
R语言
的基础包之一。
数据派THU
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2024-02-04 20:19
今天看到一个好玩的图之柱状图加自定义图
忘了今天在找什么答案时候,无意中看到下面这个图,而且用
R语言
还有好几种方法画法,于是我就搬过来了。
热衷组培的二货潜
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2024-02-04 19:59
R语言
学习case10:ggplot基础画图Parallel Coordinate Plot 平行坐标图
step1:导入ggplot2库文件library(ggplot2)step2:带入自带的iris数据集iris<-datasets::irisstep3:查看数据信息dim(iris)维度为[150,5]head(iris)查看数据前6行的信息step4:利用ggplot工具包绘图plot5<-ggparcoord(data=iris,columns=1:4,groupColumn="Speci
早起CaiCai
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2024-02-04 17:18
R语言
r语言
学习
开发语言
数据可视化
COX预测模型过程中,我踩过的那些雷
R语言
做!初学者先进来看看!!!
皮肤科大白
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2024-02-04 14:41
r语言
回归
Cox等级资料是个坑
R语言
做!初学者先进来看看!!!
皮肤科大白
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2024-02-04 14:07
R语言
r语言
回归
跟着Nature Ecology&Evolution学作图:
R语言
ggmsa包展示多序列比对结果
论文https://www.nature.com/articles/s41559-022-01771-6#code-availability论文没有权限下载但是查看数据代码链接的时候发现github主页上提供了论文的下载链接论文中的图做的都非常好看,而且提供数据和代码,我们可以找来学习数据代码链接https://github.com/sebepedroslab/chromatin-evolutio
小明的数据分析笔记本
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2024-02-04 12:23
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