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R语言-常见问题解决
R语言
画相关性热图
R语言
进行聚类热图install.packages("corrplot2")install.packages("Hmisc")install.packages("pheatmap")library(Hmisc
还没秃头的程序猿-D
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2024-02-19 14:02
研究牲
r语言
开发语言
R语言
如何绘制相关性热图(14)
1.什么是相关性热图?相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。当两个变量之间存在非常强烈的相互依赖关系的时候,我们就可以说两个变量之间存在高度相关性。若两组的值一起增大,我们称之为正相关,若一组的值增大时,另一组的值减小,我们称之为负相关。默认一般使用皮尔逊算法算相关性。皮尔逊相关系
心有灵犀啦
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2024-02-19 14:31
R语言绘图
r语言
R语言
corrplot相关性热图制作
R语言
corrplot相关性热图制作使用
R语言
制作相关性热图,使用corrplot这个包,本文进行简略的介绍,函数的具体内容见文档:https://cran.r-project.org/web/packages
梦剧场zjugis
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2024-02-19 14:01
可视化
R语言
数据分析
r语言
数据可视化
数据分析
R语言
绘制相关性热图
1.ggplot2包ggplot函数绘制相关性热图###1.ggplot2包ggplot函数绘制相关性热图rm(list=ls())head(mtcars[,1:6])#查看前六行六列cormtcars%#将矩阵转换成数据框 mutate(x=rownames(cormtcars))%>% #新建一列x,是11种属性变量 melt(id='x')%>% #将宽数据转换成长数据,更适
qq_27390023
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2024-02-19 14:01
r语言
R语言
linkET包绘制相关性组合网络热图
能绘制热图的R包很多,既往我们已经介绍了《
R语言
pheatmap包绘制热图》,今天咱们来介绍一下
R语言
linkET包绘制相关性组合网络热图。
天桥下的卖艺者
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2024-02-19 14:29
R语言
科研绘图
r语言
开发语言
利用
R语言
绘制相关性热图
数据示例(归一化处理后):install.packages("corrplot")install.packages("ggplot2")install.packages("ggpubr")library(corrplot)install.packages("GGally")library(GGally)library(ggplot2)library(ggpubr)library(readxl)#读
陆小吉1212
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2024-02-19 14:53
r语言
python
开发语言
R语言
基本数据管理学习
“数据是一件麻烦事——一件非常非常麻烦的事。《星际迷航》本章内容1.操纵日期和缺失值2.熟悉数据类型的转换3.变量的创建和重编码4.数据集的排序,合并与取子集5.选入和丢弃变量1.创建新变量x%%y为求余;x%/%y整数除法。5%/%2的结果为2。利用$符号,也可以为为数据框添加新的一列,eg:mydata$sumx2.变量的重编码将一个连续型变量修改为一组类别值将误编码的值替换为正确值基于一组分
超人快飞
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2024-02-19 13:05
R语言
|绘制曼哈顿图
曼哈顿图(manhattanPlot)是一种散点图,因形似曼哈顿摩天大楼而命名,常用于全基因组关联研究(GWAS)以显示重要的SNP。曼哈顿图作为经典的可视化方式,通常用于显示具有大量数据点,许多非零振幅和更高振幅值分布的数据,不仅可以展示数据全貌,又能快速找到目标基因或OTU,同时可知目标的具体位置和分类、显著程度等信息。小编今天给大家分享一下manhattanPlot的绘制方法,使用R的qqm
维凡生物
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2024-02-19 13:06
RapidMiner缺失数据处理——去掉数据大量缺失的变量
和
R语言
相比,RapidMiner在数据处理方面要简单直观得多。虽然RapidMiner的功能可能不如R强大。
carlwu
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2024-02-19 11:59
数据挖掘
RapidMiner
数据挖掘
RapidMiner
Java
R语言
RapidMiner数据挖掘
根据KDnuggets在2011年的一次投票显示,从使用率来看该软件比之
R语言
还要略胜一筹。因为其具备GUI特性,所以很适合于数据挖掘的初学者入门。
arrow8071
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2024-02-19 11:28
data
mining
数据挖掘
R语言
课程论文-飞机失事数据可视化分析
数据来源:AirplaneCrashesSince1908(kaggle.com)代码参考:ExploringhistoricAirPlanecrashdata|Kaggle数据指标及其含义指标名含义Date事故发生日期(年-月-日)Time当地时间,24小时制,格式为hh:mmLocation事故发生的地点Operator航空公司或飞机的运营商Flight由飞机操作员指定的航班号Route事故前
talle2021
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2024-02-19 11:45
数据分析
r语言
数据分析
数据可视化
代码+视频基于
R语言
进行K折交叉验证
我们在建立数据模型后通常希望在外部数据验证模型的检验能力。然而当没有外部数据可以验证的时候,交叉验证也不失为一种方法。交叉验验证(交叉验证,CV)则是一种评估模型泛化能力的方法,广泛应用中于数证据采挖掘和机器学习领域,在交叉验证通常将数据集分为两部分,一部分为训练集,用于建立预测模型;另一部分为测试集,用于测试该模型的泛化能力。在如何划分2个集合的问题上,统计学界提出了多种方法:简单交叉验证、留一
天桥下的卖艺者
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2024-02-15 09:11
代码+视频系列
R语言
r语言
开发语言
跟着Nature学作图:
R语言
ggplot2频率分布直方图
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的Figure2c频率分布直
小明的数据分析笔记本
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2024-02-15 04:29
ggplot2不能截断纵坐标肿么办
R语言
实现数据和原图dfWarning:Removed1rowscontainingmissingvalues(position_stack).library(ggplot2)ggplot()+aes(
小洁忘了怎么分身
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2024-02-15 01:02
R语言
ggplot2绘图拟合曲线的置信区间边框变成虚线
https://stackoverflow.com/questions/57988682/how-to-remove-filled-area-on-se-when-plot-geom-smooth-in-ggplot2library(ggplot2)ggplot(data=mtcars,mapping=aes(x=wt,y=mpg))+geom_point(size=2)+geom_smooth(
小明的数据分析笔记本
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2024-02-14 20:28
R语言
学习之基本文字处理代码
...getwd()setwd("")is()rm()q()字符串的处理常用代码切割strsplit()子集substr()大小写toupper()tolower()文字连接paste()paste0()替代文字gsub()去除前后空格strtrim()举例strsplit("hello,world",",")substr("hello,world",start=2,stop=4)toupper(
佐博伊森
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2024-02-14 17:26
R语言
从拍摄照片生成色卡用于统计图
ok.pngex_2021-04-29_02-10-25.pngex_2021-04-29_02-13-55.png图片1.jpg微信图片_20210429013555.jpg#ThuApr2901:37:232021-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.5forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任,拎了个梨.rs.restartR()requir
youmigo
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2024-02-14 16:14
R语言
入门学习笔记(2)
课程源代码:https://github.com/miwu8512/IntroToR视频地址:https://www.youtube.com/watch?v=rPj5FsTRboE&list=PLBTcf4SwWEI9_kCOJ-1o-Jwr-_Qb6bkegLecture2数据集的结构和作图的主要变量1understandingthedataset1.1Vector向量Define:Vector
DC小白
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2024-02-14 12:45
ubuntu eclipse mysql_Ubuntu设置、应用及
常见问题解决
(十)- 安装jdk+tomcat+eclipse+mysql...
Ubuntu设置、应用及
常见问题解决
(十)-安装jdk+tomcat+eclipse+mysql,ortypeselectionnumber:输入包含有"sun"字样的行的前面的数字。
weixin_39662142
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2024-02-14 12:14
ubuntu
eclipse
mysql
R语言
作业-20题
1.安装包代码在https://github.com/jmzeng1314/5years/blob/master/learn-R/tasks/3-r-20-codes.R二.2、了解ExpressionSet对象,比如CLL包里面就有data(sCLLex),找到它包含的元素,提取其表达矩阵(使用exprs函数),查看其大小3、了解str,head,help函数,作用于第二步提取到的表达矩阵sup
鱼啸九天
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2024-02-14 11:17
【量化干货合集】你想要的,都在这里!
(以下很多策略均包含源码分享供参考,欢迎大家多多交流谈论)资料分享Python、研究报告、计量经济学、投资书籍、
R语言
等!
水哥哥123
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2024-02-14 09:01
量化分析
量化
python
talib
R语言
的ggplot2画图去掉图例的灰色背景
R语言
默认的图例如下library(ggplot2)ggplot(iris,aes(x=Sepal.Length,y=Sepal.Width))+geom_point(aes(color=Species
小明的数据分析笔记本
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2024-02-14 06:09
单细胞测序最好的教程(一):质量控制
但是,其在国内的推广有两个不足:(一)全英文教程;(二)
R语言
与Python混合。二者限制了其在国内的推广
Starlitnightly
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2024-02-14 06:18
python
Python版RNA-seq分析教程:DEseq2差异表达基因分析
在omicverse中,除了最简单的ttest外,在这里,我们介绍一种类似
R语言
中的Deseq2等包的模型来计算差异表达基因。
Starlitnightly
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2024-02-14 06:48
python
开发语言
PySCENIC(一):python版单细胞转录组转录因子分析
关于单细胞转录组转录因子的分析我们之前在单细胞系列讲过
R语言
版本的,参考:跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录组因子分析,但是
R语言
分析起来速度非常慢,如果你动辄上万的单细胞可能要运行好几周,这显然不现实
TS的美梦
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2024-02-14 06:47
python
r语言
开发语言
单细胞
转录因子
HMM 隐马尔可夫模型初学(一)
笔记首先总结概括HMM相关理论知识,再通过生信序列的
R语言
实操对HMM深入了解1、MM,Markovmodel马尔科夫模型(1)天气举例假设只有晴、阴、雨三种天气情况。
小贝学生信
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2024-02-14 03:48
横向柱状图
横向柱状图正负值分开,颜色区分标签:
R语言
f3cb8856-be9b-4e46-a8cc-97656aa14e56.png上面的示意图中我们要注意的问题:横向柱状图正负值区分颜色赋值画柱状图两侧柱子标签
假装自己90斤
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2024-02-14 02:34
跟着BMC genomics学作图:
R语言
ggplot2+ggtree进化树拼接三角热图
image.png有读者在公众号留言问这个图的实现办法,今天的推文介绍一下这个图的
R语言
实现代码这个图示物种的进化树,热图展示的是kaks的值首先是进化树的数据image.pngnwk格式的树文件还有一个物种的分组文件
小明的数据分析笔记本
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2024-02-13 22:30
R语言
-dplyr包进行条件均值
实际处理数据中,我们往往需要将某变量分组进行运算,dplyr包中的group_by和summarise函数联合使用,会让code变得更简洁。library(dplyr)##读取tsv格式文件data%group_by(age)%>%summarise(friend_count_mean=mean(friend_count),friend_count_median=median(friend_cou
PriscillaBai
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2024-02-13 13:27
R语言
群组变量选择、组惩罚group lasso套索模型预测分析新生儿出生体重风险因素数据和交叉验证、可视化
原文链接:http://tecdat.cn/?p=25158原文出处:拓端数据部落公众号本文拟合具有分组惩罚的线性回归、GLM和Cox回归模型的正则化路径。这包括组选择方法,如组lasso套索、组MCP和组SCAD,以及双级选择方法,如组指数lasso、组MCP。还提供了进行交叉验证以及拟合后可视化、总结和预测的实用程序。本文提供了一些数据集的例子;涉及识别与低出生体重有关的风险因素。结果是连续测
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2024-02-13 13:46
数据挖掘深度学习人工智能算法
ueditor 禁止编辑_UEditor 编辑器
常见问题解决
ueditor单图上传图片显示上传错误/多图上传显示服务器错误,实际上图片已经传到服务器或者本地1、这个问题是因为ueditor里面的Upload.class.php里面__construct()方法里面的iconv函数有问题/*$this->stateMap['ERROR_TYPE_NOT_ALLOWED']=iconv('unicode','utf-8',$this->stateMap['ER
仙女山的仙女鹿
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2024-02-13 06:08
ueditor
禁止编辑
2022-07-15
R语言
数据标准化笔记
需要对一个dataframe中的单独一列进行标准化,看看如何用
R语言
实现吧:#!
顽强的火锅
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2024-02-13 05:34
#电子电气架构——Vector工具
常见问题解决
三板斧
我是穿拖鞋的汉子,魔都中一位坚持长期主义的工科男。今天在与母亲聊天时,得到老家隔壁邻居一位大姐年初去世的消息,挺让自己感到伤感!岁月如流水,想抓都抓不住。想起平时自己加班的那个程度,可能后续也要自己注意身体啦。老规矩,分享一段喜欢的文字,避免自己成为高知识低文化的工程师:不要期待命运在某个瞬间被突然扭转,那些改变我们人生的能量,就在普普通通的每一天!努力是一个缓慢积累的过程,先有量变才有质变。这个
车载诊断技术
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2024-02-13 02:06
车载电子电气架构
车载软件架构
汽车
网络
AUTOSAR
架构
R语言
拆分测试集和训练集(1)
方法1:sample#拆分数据集#生成模拟数据集set.seed(5)data_mo<-data.frame(a1=rnorm(20,30,5),a2=rgamma(20,50,10),a3=rnorm(20,13,4),row.names=1:20)#1使用sampleset.seed(1)index<-sample(nrow(data_mo),nrow(data_mo)*0.7)indextr
weixin_49320263
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2024-02-13 00:34
常用方法
r语言
R语言
分类回归决策树交互式修剪和更美观地可视化分析细胞图像分割数据集
视频:从决策树到随机森林:
R语言
信用卡违约分析信贷数据实例从决策树到随机森林:
R语言
信用卡违约分析信贷数据实例,时长10:11#绘
拓端研究室
·
2024-02-13 00:04
R语言
机器学习
r语言
分类
回归
R语言
逻辑回归logistic模型分析泰坦尼克titanic数据集预测生还情况
相关视频:
R语言
逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险逻辑回归Logistic模型原理和
R语言
分类预测冠心病风险实例,时长06:48逻辑回归是一种拟合回归曲线的方法,y=f(x),当
拓端研究室
·
2024-02-13 00:03
R语言
R语言
逻辑回归
logistic
泰坦尼克
titanic
使用
R语言
建立回归模型并分割训练集和测试集
通过简单的回归实例,可以说明数据分割为训练集和测试集的必要性。以下先建立示例数据:set.seed(123)#设置随机种子x|t|)##(Intercept)-13.63231.6335-8.3454.63e-13***##x11.98010.716716.715<2e-16***##---##Signif.codes:0'***'0.001'**'0.01'*'0.05'.'0.1''1####
环能jvav大师
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2024-02-13 00:33
r语言
回归
开发语言
R语言
4——字符串&列表&矩阵&数组
R语言
4——R的数据类型2目录
R语言
4——R的数据类型21、字符串1.1在字符串的语法中,单引号和双引号不能混用1.2字符串连接函数——paste()函数1.3字符串格式化函数——format()函数1.4
朝荣
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2024-02-12 10:35
R语言统计分析
R语言字符串
R的列表
R语言矩阵
R语言数组
R语言
【utlis】——adist():字符串近似距离(编辑距离)
Packageutilsversion4.2.0Description计算字符向量之间的近似字符串距离。这个距离是一个广义的Levenshtein(编辑)距离,给出了将一个字符串转换为另一个字符串所需的最小可能的插入、删除和替换加权数。Usageadist(x,y=NULL,costs=NULL,counts=FALSE,fixed=TRUE,partial=!fixed,ignore.case=
ALittleHigh
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2024-02-12 10:34
#
utils
r语言
开发语言
R语言
【utlis】——alarm():提示音或提示符
Packageutilsversion4.2.0Description给用户一个声音或视觉信号。Usagealarm()Detailsalarm()通过向控制台发送一个“\a”字符来工作。在大多数平台上,这将向用户发出铃声、嘟嘟声或其他信号(除非重定向了标准输出)。它尝试刷新控制台(请参阅flush.console)。Value没有返回有用的值。Examplealarm()
ALittleHigh
·
2024-02-12 06:36
#
utils
r语言
R语言
管道操作及绘制数据集对比图和回归线的基础并简单建模
使用了
R语言
自带的数据框mtcars,里面包含了各品牌型号的车辆参数信息。
环能jvav大师
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2024-02-12 06:33
r语言
开发语言
使用
R语言
fifer包进行分层采样
使用
R语言
fifer包中的stratified()函数用来进行分层采样非常方便,但fifer包已经从CRAN存储库中删除,需要从存档中下载可用的历史版本,下载链接:Indexof/src/contrib
环能jvav大师
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2024-02-12 06:32
r语言
R语言
杂谈(一)
首先,你需要一个Rstudio,其次每一个项目需要一个文件夹以方便自己且路径中不要出现中文和空格,如果需要请用下划线替代。1.安装R包if(!require("tidyr"))install.packages("tidyr",update=F,ask=F)#或者选择安装Bioconductor上的R包if(!require("limma"))BiocManager::install("limma"
爱思考的照
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2024-02-12 03:46
R语言
RImagePalette包,图像照片提取调色板
R语言
RImagePalette包,图像照片提取调色板迁移照片颜色板Snipaste_2020-12-06_01-28-19.png001.jpg002.jpg003.pngSnipaste_2020-
youmigo
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2024-02-12 03:40
利用ggplot2制作金字塔图,展示人口结构数据
人口金字塔图是描述一个地区或国家人口结构类型的常用图示方式,今天我们介绍一下如何利用
R语言
制作金字塔图,快来看看如何作金字塔图吧!什么是人口金字塔图?
普癌新声
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2024-02-12 02:24
R语言
,rayshader包,save_3dprint函数,保存3D打印
好像不支持中文。实操失败。#FriOct1601:08:342020-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.2forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任#——拎了个梨.rs.restartR()#save_3dprint函数,保存3D打印rm(list=ls());gc()require(rayshader)#编写可用于3D打印的立体光刻(STL)文
youmigo
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2024-02-12 01:30
聚类分析-
R语言
1,原始数据,是矩阵,有行头和列名:data2,amap包的聚类分析:library(amap)clu<-hclusterpar(matx)plot(clu,sub="",hang=-1,xlab=NA,ylab=NA,main=NA)cluster用法:hcluster(x,method="euclidean",diag=FALSE,upper=FALSE,link="complete",mem
育种数据分析之放飞自我
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2024-02-12 00:39
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggplot2散点图及添加文字标签
论文MiDAS4:Aglobalcatalogueoffull-length16SrRNAgenesequencesandtaxonomyforstudiesofbacterialcommunitiesinwastewatertreatmentplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29438-7数据链接https://figshare.c
小明的数据分析笔记本
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2024-02-11 22:15
R语言
用随机森林模型的酒店收入和产量预测误差分析
全文链接:https://tecdat.cn/?p=35162在这篇文章中,我们将探讨基于随机森林模型的酒店收入和产量预测分析。我们将使用4月9日至4月15日的数据作为测试集,评估预测的准确度。我们将分别对单个酒店在三个预订渠道的总收入和总产量进行分析,并使用随机森林模型进行预测。通过对比每家酒店的间夜预测值(或收入)与实际值的结果,以及产量排名前四分之一酒店的平均误差值,我们将得出对酒店收入和产
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2024-02-11 18:33
数据挖掘深度学习人工智能算法
R语言
逻辑回归、决策树、随机森林、神经网络预测患者心脏病数据混淆矩阵可视化
全文链接:https://tecdat.cn/?p=33760原文出处:拓端数据部落公众号概述:众所周知,心脏疾病是目前全球最主要的死因。开发一个能够预测患者心脏疾病存在的计算系统将显著降低死亡率并大幅降低医疗保健成本。机器学习在全球许多领域中被广泛应用,尤其在医疗行业中越来越受欢迎。机器学习可以在预测关键疾病(例如心脏病)的存在或不存在方面发挥重要作用。如果能提前准确预测这些信息,可以为医生提供
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2024-02-11 18:20
数据挖掘深度学习人工智能算法
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