h5py

h5文件的读取（h5py、scanpy）

datasets--group包含了其它groups和datasets，像字典一样工作（类似目录）--dataset即numpy.ndarray，像numpy数组一样工作（类似文件）2.使用python处理h5（h5py

拜托啦！狮子·2024-02-13 18:01

TensorFlow学习遇到到问题

报错：anaconda3/lib/python3.6/site-packages/h5py/__init__.py:34:FutureWarning:Conversionofthesecondargumentofissubdtypefrom

妙步少一秒·2023-12-26 20:32

Tensorflow/Keras/h5py报错处理

目录Python/Tensorflow/Keras版本对应AttributeError:module'h5py'hasnoattribute'File'AttributeError:'str'objecthasnoattribute'decode'Python

AsmallFROG·2023-12-23 14:11

h5py的具体用法总结

1.创建文件我们可以通过在初始化File对象时设置“w"来创建文件。其他一些模式a（用于读/写/创建访问）和r+（用于读/写访问）。importh5pyimportnumpyasnpf=h5py.File("mytestfile.hdf5","w")print(f)结果为在此Python文件的同目录下产生了mytestfile.hdf5此文件。（创建文件，相当于打开，需要关闭文件f.close()

要奋斗呀·2023-12-22 06:58

[1233]Python数据存储之h5py详解

文章目录简介安装使用h5py创造一个HDF5文件读取一个HDF5文件示例1：利用h5py储存Numpy数组示例2：存储List和Dict分块存储策略HDF5的分层结构属性高级特征简介h5py官方文档：https

周小董·2023-12-22 06:25

HDF5 文件及 h5py

h5py操作HDF5文件的Python工具查看数据的操作打开文件>>>f=h5py.File(h5_filename)查看groups名字>>>print('h5groups=',list(f.keys

猴子喜·2023-12-17 03:04

利用h5py加速数据集读取

直接使用：defstore_in_h5(images,output_filename):withh5py.File(output_filename,'w')ashf:data_group=hf.create_group('data')label_group=hf.create_group('label')fori,(data_patches,label_patches)inenumerate(im

prinTao·2023-11-11 01:38

Jupyter Notebook 导入tensorflow内核挂掉重启的解决办法

在AnacondaPrompt终端是这样的显示解决方法在当前虚拟环境下卸载h5py并重装pipuninstallh5pypipinstallh5py重启jupyternotebook就可正常使用了！

InveR1el·2023-11-09 04:55

Python h5py包详解

一、概念h5py文件是存放两类对象的容器，数据集(dataset)和组(group)，dataset类似数组类的数据集合，和numpy的数组差不多。

zhen24·2023-11-07 10:05

python h5py库安装

不过今天一直安装出错，换其他源也一样，于是下周wheel文件安装下载wheel文件安装直接下载安装的库，下载地址https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#h5py

MySunshine456·2023-11-07 10:05

【python基础】h5py库的基本使用

而h5py则是python提供的HDF文件处理库。

guofei_fly·2023-11-07 10:33

Py的h5py库：详细介绍、安装和使用方法

Py的h5py库：详细介绍、安装和使用方法h5py是一种Python库，用于在Python中访问HDF5文件的数据。HDF5是一个灵活的数据格式，可用于存储和处理大量数据。

代码编织匠人·2023-11-07 10:01

python 笔记：h5py 读取HDF5文件

1HDF5文件HDF5是HierarchicalDataFormatversion5的缩写，是一种用于存储和管理大量数据的文件格式一个h5py文件可以看作是“dataset”和“group”二合一的容器

UQI-LIUWJ·2023-10-28 21:38

h5py(python)读取matlab的结构体文件

存在一个结构体文件这个结构体内部的数据是这样的：采用了网上各种方法读取都不管用，最后去overstackflow上破解了这个问题，代码如下：withh5py.File('./Lake/Y.mat')asf:data=[f[element[0]][:]forelementinf['Y']]简单高效，牛逼PLUS！

Leon嘞·2023-10-18 08:21

python读取mat（v7.3）文件中的cell以及struct

主要分为3个部分：1常规mat中的变量2mat文件中的cell内部数据读取3mat文件中的struct数据读取@author:ZXY""""""1常规mat中的变量"""importh5pyb=[]#首先用h5py

bot张翔宇·2023-10-13 12:07

python使用h5py读取mat文件数据

目录一.matlab生成.mat文件二.读取mat文件数据一.matlab生成.mat文件a=[];List=dir('C:\Users\Administrator\Desktop\code\lstmdata\pri*.mat');k=length(List);fori=1:kfile_name{i}=List(i).name;temp=importdata(file_name{i});%temp

moonbaby1·2023-10-01 10:07

python绘制北极风场与位势高度场/python cartopy极地投影重叠问题解决

作为胶水语言，近年来在气象数据处理与可视化中有着极为广泛地应用，诸多第三方库极为便利地满足了气象研究者处理数据与绘图的要求，处理数据的包：xarray、pandas，读取不同气象格式的包：netcdf4、h5py

什么都不会的张同学·2023-10-01 09:43

TypeError: h5py objects cannot be pickled

TypeError:h5pyobjectscannotbepickled确认不是文件出问题之后，将Dataloader加载时的num_workers,改为0即可。

坐在墙上的猫·2023-09-30 12:14

python运行报错收集

3pip安装很慢1没有相应的包运行python项目的时候出现ModuleNotFoundError:Nomodulenamed'h5py'这种错误是环境没有相应的包解决方法只需要找到terminal点开输入

zhanjuex·2023-09-23 13:24

tensorflow遇到的一些问题和解决方案的整理【tensorflow1.14.0gpu+h5py2.8.0+numpy1.16.6】+软件和包的重装

其中h5py和numpy的版本最容易出问题。除此以外，在重新安装包的时候，尽量在自己创建的环境里安装，否则一切都会出各种奇怪的问题。1.0问题描述Traceback(mostrecent

ACMSunny·2023-09-18 22:15

查看HDF5文件的内容

Python提供了多个库来读取和处理HDF5文件，其中最常用的是h5py和PyTables。你可以使用这些库来打开.h5文件，并使用相应的API读取和操作数据集、数据组和属性。

辉小歌·2023-09-18 00:34

anaconda配置h5py===2.10.0

一般在anaconda下直接在prompt窗口输入下面中一个就行condainstallh5pypipinstallh5py但是，如果想配置h5py==2.10.0，可以直接输入rcdcondainstallh5py

-MAX-MAX-·2023-09-12 06:14

python中读取带有cell元胞的.mat文件遇到：＜HDF5 object reference＞

问题：在python中读取带有cell元胞的.mat文件，特别是对7.3版及可能更高版本的mat文件，使用h5py读取遇到的问题。

weixin_41639378·2023-09-08 05:34

如何 python import h5py 报错：/defs.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so: undefined symbol: H5Pset_fapl_ros3

最近，需要对于.HDF文件进行读取，上网搜索发现可以通过:h5py，这个库进行读取。

简朴-ocean·2023-09-05 03:18

fatal error: Python.h: No such file or directory #include “Python.h“

在TX2上安装h5py时，pypi.org没有对应的轮子，需要自己用源码安装，源码中涉及到C语言，所以需要编译，然而在编译的过程中报错fatalerror:Python.h:Nosuchfileordirectory

lzfshub·2023-08-06 19:41

python h5py库安装（记录使用wheel安装的方法）

pythonh5py安装安装时一直报错，因此参考了关于python中h5py库安装不上的解决办法的文章，记录解决过程文章目录pythonh5py安装前言1.安装wheel库二、下载对应的h5py的版本，

beixidong·2023-08-03 22:19

AI - Mac M1 机器学习环境 (TensorFlow, JupyterLab, VSCode)

tensorflowXcodeCommandLineToolsHomebrewMiniforge下载AppleTensorFlow创建虚拟环境安装必须的包安装特殊版本的pip和其他包安装Apple提供的包(numpy,grpcio,h5py

CatchZeng·2023-08-02 22:58

python 读取H5PY文件并保存为图像

importh5pyimportnumpyasnphr_dataset=h5py.File('fuzzy.h5')['data']//此文件下的data数据label=h5py.File('fuzzy.h5')['lable']//此文件下的lable数据lenght=len(hr_dataset)//获取数据的长度foriinrange(len(hr_dataset))://for循环提取数据y

我真不会写代码·2023-07-19 11:13

Pycharm 出现进程已结束,退出代码-1073741819 (0xC0000005) 的问题可能的解决方法

的问题可能的解决方法进程已结束,退出代码-1073741819(0xC0000005)这个错误代码表示进程遇到了一个无效的内存地址，可能是由于以下原因：1.Pycharm的问题，需要更换或卸载一些安装包，如h5py

钰宸y·2023-07-17 16:43

几种python存储数据(海量数据)的方式及读取时间对比

先说在本机环境下的测试结果，仅供参考，其中单次调用时测试了10次，多次调用时测试了5次：单次读取时，h5py文件整体平均读取速度最快，pkl文件整体平均读取最慢多次读取(循环读取同一文件10次，并取平均时间

祁彧w·2023-06-14 15:23

NetVLAD 问题总结

NetVLAD问题总结一、NetVLAD问题一：一、NetVLAD问题一：File"h5py/_objects.pyx",line54,inh5py.

IU_不错哦·2023-06-11 07:35

解决ModuleNotFoundError: No module named ‘h5py‘

运行程序出现如下错误：需要安装h5py库，可以使用pip镜像安装：pipinstall-ihttps://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simpleh5py输出如下表示安装成功！！

Love向日葵的兮兮子·2023-04-13 18:04

AttributeError: type object 'h5py.h5.H5PYConfig' has no attribute '__reduce_

详见我的博客：添加链接描述）运行kerascode，报错如下：AttributeError:typeobject'h5py.h5.H5PYConfig'hasnoattribute'__reduce_这个是h5py

做一只AI小能手·2023-04-12 04:26

调用tensorflow时出现h5py/init.py:36: FutureWarning

image.png参考：https://wuwb.me/2018/03/h5py-futurewarning-problem-fix.html

Babyzpj·2023-04-02 20:40

HDF5存储大于4GB的文件，OverflowError: cannot serialize a bytes object larger than 4 GiB是什么意思？

前两天用h5py做图像训练的时候遇到了一个问题，在用HDF5存储大文件的时候报错：OverflowError:cannotserializeabytesobjectlargerthan4GiB当时有大概

木木爱吃糖醋鱼·2023-04-02 05:55

ImportError: attempted relative import with no known parent package的解决方案

reduce_cython__'（2）ImportError:attemptedrelativeimportwithnoknownparentpackage2问题分析出现上面两个问题的原因大致都是tensorflow环境和h5py

ACMSunny·2023-03-30 03:02

轻狂清风·2023-03-22 04:54

h5py FutureWarning 问题修复

h5py/init.py:36:FutureWarning:Conversionofthesecondargumentofissubdtypefromfloattonp.floatingisdeprecated.Infuture

clhon·2023-03-20 08:10

hdf5存储

hdf5存储三维数据每一个key值（Dataset）可以对应存储一个多维数组【python】利用h5py存储数据两类容器：group&datasetgroup类似文件夹，字典。

Sshaylee·2023-03-09 10:15

解决‘AttributeError: ‘str’ object has no attribute ‘decode‘’报错

objecthasnoattribute'decode’报错，具体报错行#LoadweightstrainedonMS-COCOmodel.load_weights(COCO_MODEL_PATH,by_name=True)原因是h5py

北冥有渔jy·2023-02-05 23:06

python文件写入字典格式输出_python写入和读取h5、pkl、mat 文件

python中使用h5py对HDF5文件进行操作。

weixin_39959369·2023-01-30 08:55

python读取HADOOP/HDFS中的h5py文件

问题：python调用hdfs包从HADOOP上读取到的h5文件为二进制数据，没办法直接转换为h5的对象。pickle.loads、.decode()都不行。传统方式下需要先通过open(path,“wb”)文件写入硬盘，然后再从硬盘读取文件。速度慢不说，硬盘还面临大量读写，加速报废。解决思路：看：官方文档找：github解答代码：importosimportioimporth5pyfromhdf

docoter_c·2023-01-30 08:23

AMR开发板下python安装numpy库的参考

实现二维码识别2、莓派3安装Numpy，TensorFlow，Keras3、ARM开发板安装numpy+tensorflow4、树莓派4b虚拟环境下安装python3.5、tensorflow、numpy、和h5py

sususuqingxiao·2023-01-28 08:55

PYNQ-Z2安装keras库的方法

PYNQ-Z2是基于armv7l平台，使用pip3直接安装keras时会报错，如下：Infileincludedfrom/tmp/pip-build-taykg8ym/h5py/h5py/defs.c:

爱阳阳963·2023-01-27 22:16

【Keras load_weights报错】AttributeError: ‘str‘ object has no attribute ‘decode‘

1.问题：Keras载入历史模型报错：AttributeError:‘str’objecthasnoattribute‘decode’.原因是h5py的版本不对，需要安装适合版本的h5py；首先condalist

中杯冰美式·2023-01-26 01:36

20190822-使用keras预训练模型进行图像识别并利用pyinstaller打包程序为server.exe且启动后在状态栏显示

2.2环境h5py=

atlantistin·2023-01-24 11:01

8、智慧交通项目（1）

h5py从Python读取和写入HDF5文件。pandas用于数据分析、时间序列和统计的强大的数据结构。opencv-python用于Python的预构

C--G·2023-01-22 13:16

mumpy，h5py和tensorflow版本不匹配导致报错

自己开发了一个股票智能分析软件，功能很强大，需要的点击下面的链接获取：https://www.cnblogs.com/bclshuai/p/11380657.html1.问题描述一开始用pycharm，tensorflow2.0，去编写卷积神经网络的代码，是可以正常运行的，过了几天去编译又报错了。1.1numpy版本报错D:\Anaconda3\envs\tensorflow\python.exe

bclshuai·2023-01-17 09:01

python在conda环境下查看、安装库包

1.Windows+R，输入cmd2.在所出现的页面中输入：piplist可查看现有的库3.如果所需的库在其中没有，则需要安装，如安装h5py库须输入pipinstallh5py回车运行即可，安装成功则会显示

灿灿不想酷、·2023-01-11 17:18

报错：AttributeError: ‘str‘ object has no attribute ‘decode‘解决方法

grouporiginal_keras_version=f.attrs[‘keras_version’].decode(‘utf8’)AttributeError:‘str’objecthasnoattribute‘decode’解决办法：卸载原来的h5py

白码飞·2023-01-10 19:31

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