itk

使用ITK-SNAP软件进行医学图像的标注（label标签设置、调整等）（windows版本，如mac和linux操作则略有不同）

使用ITK-SNAP软件进行医学图像的标注工作：如肿瘤、炎症、出血、梗死等的多类目标轮廓勾画等。
qianshuqinghan·2020-08-05 16:44

ITK基本介绍和实例分析

1.ITK简介：1999年，由美国国家卫生院NI（）2.ITK在windows7的编译：为了增加对ITK的直观理解，需要研究ITK的源代码和自带的很多例子。
inter_peng·2020-08-05 16:07

ITK中的那些分割算法1

第一次写博客，写的不好，多多见谅区域生长-ConnectedThresholdImageFilter此代码在ITK目录下Examples/Segmentation/ConnectedThresholdImageFilter.cxx
fengyewu12345·2020-08-05 16:52

医学图像处理工具包ITK

ITK介绍ITK是一个开放源码、面向对象的软件系统，提供一个医学图像处理、图像分割与配准的算法平台。不过我目前使用不多，只了解一些配准的东西，所以就不胡乱介绍了。
封不觉·2020-08-05 16:43

ITK阈值分割jpg图片

#include"itkImage.h"#include"itkImageFileReader.h"#include"itkImageFileWriter.h"#include"itkPNGImageIOFactory.h"#include"itkJPEGImageIOFactory.h"#include"itkThresholdImageFilter.h"#include"itkImageToV
csdn_1HAO·2020-08-05 16:36

ITK阈值分割nrrd图像

#include"itkImage.h"#include"itkImageFileReader.h"#include"itkImageFileWriter.h"#include"itkNrrdImageIOFactory.h"#include"itkThresholdImageFilter.h"#include"itkImageToVTKImageFilter.h"#include"vtkSmar
csdn_1HAO·2020-08-05 16:36

利用ITK-SNAP进行抠图操作并保存mask

问题描述:想要去掉图像背景,只保留中心部分目标:1.利用ITK-SNAP制作二值化标签(即mask)2.利用软件ITK-SNAP把一幅图像中自己想要的部分抠出来步骤:1.保存mask打开ITK-SNAP
云端浅蓝·2020-08-05 16:27

itk中的图像分割算法（一）

本文要记录的是图像分割中的经典：Snake。简单分割算法关注的是局部信息，忽略了图像的纹理结构、位置等信息，而Snake模型可以将局部特征和全局特征相结合。Snake简介：Snake的思路就是将目标图像的边缘检测转变为求解能量泛函最小值的过程。这类算法需要给出初始的轮廓，然后进行迭代，使轮廓沿能量降低的方向靠近，最后得到一个优化的边界。能量函数包括内外力两方面，如边界曲率和梯度。优点：1.Snak
winston600·2020-08-05 15:59

ITK-SNAP-2.4.2

ITK-SNAPversionCMakeversionITKversionVTKversionFLTKorQtversion1.8.0andlater2.4.63.85.2FLTK1.1.91.9.xandlater2.6.43.85.2FLTK1.1.92.1.4andlater2.6.4
winston600·2020-08-05 15:59

CMake实战技巧

CMake工具套件是由Kitware创建的，旨在满足ITK和VTK等开源项目对功能强大的跨平台构建环境的需求。简单来说，CMake是一款非常强大的编译工具，配合buildroot可以做到自动从下
坤昱·2020-08-03 10:09

Linux 下Cmake+ITK+ANTs安装配置（Could not find ZLIB）

Cmake安装下载地址：https://cmake.org/download/cd/homemkdirCmakecdCmakecdcamke-3.15.1下载到想安装的文件夹后对其利用：tarzxvfcmake-3.15.1.tar.gz，进行解压./configuremakemakeinstall然后进行环境变量的添加设置就可，1.进入bashrc:vi~/.bashrc2.添加：exportP
喜之郎0317·2020-08-02 15:49

ITK 配准框架示例

图像配准的基本过程如下：1.指定用于评估配准效果的相似度或误差测度；2.指定一个变换模型，如刚体变换、仿射变换、弹性变换(elastic)、流体变换或B-样条等；3.指定插值策略，如最邻近插值(nearstneighbour)、三线性插值(trilinear)、sinc插值等；4.寻找变换参数以最大化相似性测度。如下图所示：配准框架的基本流程如下：1．输入待配准的两幅图像，参考图FixedImag
Yournero9·2020-07-30 13:06

ITK 中的智能指针与对象工厂演示-1

在ITK中将智能指针与对象工厂结合。除少部分非常小的类之外，其它类都继承自LightObject或者Object（其中，Object也继承自LightObject）。
Yournero9·2020-07-30 13:34

ITK 编译安装

使用VS2005编译ITK.1.下载CMake:http://www.cmake.org/cmake/resources/software.html选择需要的版本.我使用的是cmake-2.6.4-win32
Yournero9·2020-07-30 13:34

ITK 数据源

一些医学图像研究用的数据源:1.RIRE:Vanderbilt大学的J.M.Fitzpatriek教授领导的可回溯性医学图像配准评估（RIRE）项目组,是世界是医学图像配准评估工作最出名完善的.该项目提供大量的病人实例数据,主要用于CT-MR以及PET-MR的配准评估.研究人员可以下载其数据,使用自己的配准技术进行实验后,把自己的实验结果提交到网站,经过专业人员的评估后,会将评估结果返回给研究者.
Yournero9·2020-07-30 13:34

ITK 中的智能指针与对象工厂演示-2

6.对象工厂基类 //MyObjectFactoryBase.h#pragmaonce#include"MyCreateObjectFunction.h"#include#include#include////关于对象工厂,参考上面给出的文章,写得很不错,关于泛化对象工厂的原理阐述的很清晰.//泛化对象工厂:http://blog.csdn.net/azure1987/archive/2009/1
Yournero9·2020-07-30 13:34

Pluggable Object Factory 可插入式对象工厂

ITK中使用的其实是种称为pluggableobjectfactory的设计模式，它可以在运行时进行动态替换，而且可以不修改已有代码的情况下添加处理新格式的图像文件类，等还有一些其它优点。
Yournero9·2020-07-30 13:34

ITK 编程步骤示例

使用ITK,CMake进行编程,基本过程如下:建立文件夹D:/I_VTK/test/src,D:/I_VTK/test/bin,src用来存放源程序,bin为程序编译目标如下HelloITK示例.1.建立
Yournero9·2020-07-30 13:34

ITK 中的智能指针与对象工厂演示-3

11.测试智能指针//TestMySmartPointer.h#pragmaonce#ifdefined(_MSC_VER)#pragmawarning(disable:4786)#endif#include"MySmartPointer.h"#include#include//测试类基类，测试智能指针：MySmartPointerclassMyTestObject{public:typedefM
Yournero9·2020-07-30 13:34

医学图像处理常用的看图软件介绍及使用(RadiAnt DICOM Viewer、ITK-Snap和3D Slicer)

作者常用的医学图像看图软件有RadiAntDICOMViewer、ITK-Snap和3DSlicer，这三个都可从网上下载到。在不同的场景下，不同软件的功能和便利程度都不同。
小鹿学长·2020-07-30 09:35

3Dslicer学（在slicer中编程）

1.Slicer的模块：CLI(命令行交互)Python脚本模块：这个是特色，我们可以用python控制台去访问数据，对象，GUI，处理库(numpy,VTK,ITK,CTK等)可加载的模块：用于优化计算
Monologue_thl·2020-07-30 08:27

医疗图像三维重建方法小结（python+VTK+ITK+Mayavi）

医疗图像三维重建forpython环境简介方法方法一Poly3DCollection+matplotlib方法二VTK+ITK方法三Mayavi之contour3d最终方法Mayavi+TVTK环境简介语言是
踏雪飞鸿12·2020-07-28 20:22

TC二次开发之ITK开发自学笔记（一）

我相信可能会有人和我一样，刚看到TC时，会误以为是TurboC的简写，而事实上，这里并不是。TC是Teamcenter的简写。以后TC这个简写，在我的文章中，绝大多数时候表示的是Teamcenter。Teamcenter是什么？一般的软件开发人员或许并不清楚，但接触过工业制造的人多半会了解。Teamcenter是一套软件，它提供了一整套全方位的产品数字化生命周期管理解决方案（头晕吧？^_^）。说白
super_admi·2020-07-28 12:16

区域生长算法

预备知识编程工具：VS2010，CMAKE编程语言：C++编程库：ITK数据结构：栈，通过栈实现区域生长算法数据：三维的病变视网膜图像目的：分割视网膜图像中的病变区域，即色素上皮层脱离区域。
learn_sunzhuli·2020-07-28 01:51

开源库编译

CMake工具套件是由Kitware创建的，以满足开源项目（如ITK和VTK）强大
青番茄·2020-07-27 23:32

ITK-SNAP 安装和使用

一.下载ITK-SNAP安装包下载资源链接：https://sourceforge.net/projects/itk-snap/?
emPoint·2020-07-14 22:26

ITK-SANP 使用指南

简介SNAP:SNakeAutomaticPartitioning（蛇形自动分区）灰度图像:把黑色与白色之间分为若干等级，一般为256级（人眼分辨极限），0~255，黑色为0，白色为255图像强度（ImageIntensity）:单通道图像像素的强度，在灰度图像中，该强度就是图像的灰度通道:普通彩色图片由RGB三原色组成，每个原色对应一个通道体素（VolumePixel）:三维空间上能够分割的最小
csdn果冻柠檬·2020-07-14 13:11

itk、vtk、qt 显示dicom 数据

以下代码实现了itk读取dicom数据，转换为vtkData，然后用Qt显示。
COSummer·2020-07-11 01:21

itk 读取dcm 或nii.gz数据

关键代码如下，判断如果是dcm,则转换为nii.gz：#include"itkGDCMSeriesFileNames.h"usingNamesGeneratorType=itk::GDCMSeriesFileNames
COSummer·2020-07-11 01:21

VTK+Python实现三维重建---环境搭建

环境搭建本人使用的是pycharm这个IDE有个很方便的管理各种包的地方，所以我在这个基础上直接安装了VTK和ITK的包，发现示例代码能直接使用。
洛天1957·2020-07-10 22:10

使用Anaconda搭建SimpleITK开发环境

*推荐搜索关注微信公众号：医影杂记使用Anaconda搭建SimpleITK开发环境从C++和Matlab图像处理编程说起很多采用C++进行医学图像处理编程的同学都会选择ITK来作为底层图像处理的函数库
ZStarWalker·2020-07-10 15:40

visual studio中头文件和库文件路径设置

在程序开发中，很多时候需要用到别人开发的工具包，如OpenCV和itk。一般而言，在vs中，很少使用源文件，大部分是使用对类进行声明的头文件和封装了类的链接库（静态lib或动态dll）。
Jimmy1224·2020-07-10 12:18

手术导航系统重新开发1：创建新的MFC对话框应用

之前的手术导航系统，用vs2008、32位的环境由MFC开发，项目文件无法在高版本visualstudio运行，由于本人对VTK、ITK、IGSTK开发工具和整体模块的细节功能还不够了解，所以决定，在VS2019
人工智睿·2020-07-08 15:02

MIUI系统刷第三方Recovery+Magisk

//www.miui.com/unlock/index.html2、下载TWRPrecovery：https://pan.baidu.com/s/1iB2y__dnRsnc27767X35Ow提取码:itk8
ourjaycn·2020-07-07 18:51

ITK4.11.1编译配置+VS2015+Cmake3.8.1

前提：我的系统是Win10，所安装的VS是2015，已经安装了Cmake3.8.1；（其他版本的也是类似的操作，有些地方有小小的区别而已）下载ITK4.11.1到ITK官网下载：InsightToolkit
wae42675·2020-07-05 19:48

CBCT重建系列1：RTK从安装配置到Demo实现

1RTK简介RTK(RTK官网)是一个开源的CBCT重建算法包，是Kitware公司旗下的，基于ITK包扩展出来的。
PaulAlexander·2020-07-05 11:13

使用ITK-SNAP进行抠图操作并保存mask的实例

问题描述：想要去掉图像背景,只保留中心部分目标：1.利用ITK-SNAP制作二值化标签(即mask)2.利用软件ITK-SNAP把一幅图像中自己想要的部分抠出来步骤:1.保存mask打开ITK-SNAP
·2020-07-01 12:11

ITK 实现多张图像转成单个nii.gz或mha文件案例

主要实现的部分是利用NameGeneratorType读入系列图像，见头文件#include"itkNumericSeriesFileNames.h"。需要包含的头文件有：#include"itkImage.h"#include"itkImageSeriesReader.h"#include"itkImageFileWriter.h"#include"itkNumericSeriesFileNam
·2020-07-01 12:07

使用SimpleITK读取和保存NIfTI/DICOM文件实例

/nifti.nii.gz')img=sitk.GetArrayFromImage(itk_img)print("imgshape:",img.shape)##saveout=sitk.GetImag
·2020-07-01 12:05

《python程序设计应用教程》第一章 python语言概述

第一章python语言概述1.1python语言简介①众多的开源的科学计算软件包都提供了python的调用接口，例如：计算机视觉库OpenCV、三维可视化库VTK、医学图像处理库ITK。
weixin_44322234·2020-06-29 12:08

ITK介绍

ITK：TheInsightSegmentationandRegistrationToolkit一、ITK简介ITK是美国国家卫生院下属的国立医学图书馆开发的一款医学图像处理软件包,是一个开源的软件，用于处理图像配准和分割的问题
wangwei_007·2020-06-27 13:26

[Python教程] Python SimpleITK软件包常用参数与使用方法分析

内容列表SimpleITK1.SimpleITK.ReadImage(path)2.SimpleITK.GetArrayFromImage(itk_img)3.itk_img.GetOrigin()4.
gogogo！·2020-06-26 04:00

使用SimpleITK读取和保存Nii.gz文件

/nifti.nii.gz')img=sitk.GetArrayFromImage(itk_img)print("imgshape:",img.shape)##saveout=sitk.GetImageFromArray
Wisley.Wang·2020-06-25 02:56

Linux下VTK、ITK的安装及运行 转载

1.安装VTK（1）在www.cmake.org下载cmake-2.4.6.tar.gz，并安装好（2）在www.vtk.org上下载vtk-5.0.3.tar.gz和vtkdata-5.0.3.tar.gz（3）随便新建一个文件夹，比如就在桌面上新建一个文件夹。重命名为vtk（Llinx是区分大小写的），把vtk-5.0.3.tar.gz和vtkdata-5.0.3.tar.gz都解压到桌面，得
jifaley·2020-06-23 22:59

ITK/VTK gains popularity in China

StatisticsofITK/VTKusageinChinaRecently,Prof.YangandhisstudentsfromBeijingInstituteofTechnologyhavecollectedsomeinterestingstatisticsoftheusageofITK/VTKinChinaintermsofpublicationsandwebforumactivitie
ITKBarCamp·2020-06-21 22:17

2019-02-13/02-14

一、把ITK-SNAP的一些问题弄懂参考文章：2019-02-03我先下载原图，然后导入到ITK-SNAP里
Lemonweed_hh·2020-03-26 23:25

安装x64下的VS, VTK, ITK和Boost

安装x64下的VTK，ITK注意：若要同时使用itk和vtk，需要先安装vtk。然后安装itk。当itk在CMake中configure的之前，需要(1
璟的简书·2020-03-21 18:52

怎样打开并查看.nii和DICOM格式的医学图像

1.ITK-SNAP软件ITK-SNAP软件的下载地址为：下载地址安装之后在打开.nii格式的文件时直接选择该软件即可，如上图所示，该软件可以显示在x、y、z三个轴方
棉花糖灬·2020-03-17 20:15

十二、ITK例程-医疗图像配准的HelloWorld程序

一、说明医疗图像配准是ITK的一个重要内容，而我们今天想要说的一个程序则相当于是其中的HelloWorld程序。
星光夜·2019-12-22 11:00

2019年年度计划

2018－2019工作质量技术vtk，itk知乎付费回答专家github有系列demo入门公司举行培训dicom医疗规范知乎领域专家系列文章公司培训dicom数据传输采用开源，指标和商用一致知乎该问题领域专家公司培训沟通主动反馈每日总结个人商用
一石头快·2019-12-19 10:49
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