itk

【ITK库学习】使用itk库进行图像滤波ImageFilter：模糊降噪

目录1、itkDiscreteGaussianImageFilter离散高斯2、itkBinomialBlurImageFilter二项式模糊3、itkSmoothingRecursiveGaussianImageFilter图像模糊可以削弱图像频谱的高频部门1、itkDiscreteGaussianImageFilter离散高斯该类通过图像与离散高斯算子（内核）的可分离卷积来模糊图像。如果Set
leafpipi·2024-09-06 08:33

ITK 图像分割（一）：阈值ThresholdImageFilter

效果：Video:区域增加分割1、itkThresholdImageFilter该类的主要功能是通过设置低阈值、高阈值或介于高低阈值之间，则将图像值输出为用户指定的值。如果图像值低于、高于或介于设置的阈值之间，该类就将图像值设置为用户指定的“外部”值（默认情况下为“黑色”）。该类并不对像素进行二值化处理，输出图像中的像素值可以是浮点型或整型。常用的成员函数:Set/GetLower()：设置/获取
恋恋西风·2024-02-15 04:08

PyQt Python 使用 VTK ITK 进行分割 三维重建 医学图像可视化系统 流程

使用itk::GDCMImageIO作为DICOM图像的输入输出接口。使用itk::GDCMSeriesFileNames获取指定路径下的所有DICOM文件名。
恋恋西风·2024-02-15 04:07

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自动化新人·2024-02-12 14:50

三维重建 阈值分割 3D可视化 医学图像分割 CT图像分割及重建系统 可视化编程技术及应用

使用了第三方库VTK，ITK实现分割和生不重建。
恋恋西风·2024-02-12 14:46

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记忆的小河·2024-02-12 12:43

ITK snap进行标注，python读取label

1、对ITKsnap的探索（1）加载图片之后，画面大小可以通过按住鼠标右键拖动进行调整，左键调整画面位置。（2）点击“A”“S”"C"分别放大各个视图点击正方形框进行返回（3）选择标注的方式选择勾画工具，分为画笔polygon和画刷pointbrush两种左侧为画笔按住左键勾画闭合轮廓后确认即可填实、得到目标区域；右边为画刷需要手动完整涂抹目标区域：按住左键涂抹、按住右键擦除。2标注方式的选择2.
qq_1248742467·2024-02-09 13:57

itk 获取图像数据的文件存储类型

ImageIOBase::IOPixelType&pixelType,ImageIOBase::IOComponentType&componentType){typedefitk::ImageImageType;itk
张大饼的最爱·2024-02-07 08:28

Ubuntu编译和测试ITK4.13.1

环境：gcc--7.5.0cmake--3.15.2ccmake--3.15.2参考以下两篇博客安装：1、ITK的安装与测试（Ubuntu系统）_ubuntu20.04安装itk5.2-CSDN博客（注意看评论中的
c_daofeng·2024-02-06 09:31

ITK编译及安装

文章目录前言CMake配置选项说明运行VS2015编译及安装VTK转ITKITK转VTK参考文献最近想利用ITK读取整个Dicom图像到内存，再将读取到的ITK数据转换到VTK。
痛&快乐着·2024-01-31 21:24

ITK + ANT，无法显示三维

背景：之前用ANT保存ima格式的数据，选择的是保存所有的序列用python将dicom转为nii的格式，importnibabelasnibimporttorch"""不管是nii还是nii.gz都是二维的，为啥呢"""fobj=nib.load("nii/NII.nii.gz")sobj=nib.load("nii/orig/5converted-0.nii.gz")inp,out=torch
qq_1248742467·2024-01-20 06:48

3Dslicer在windows下源码编译源码并打包程序亲测可用

对于医疗图像数据可视化有一些比较成熟的开源软件库，其中包括volview(2011年已经停止维护和更新)，MITK（德国非中科大版），3Dslicer和ITK-SNAP。
火炎焱燚1989·2024-01-15 13:28

【ITK库学习】使用itk库进行图像配准：变换Transform（三）

目录1、itkAffineTransform仿射变换2、itkBSplineDeformableTransformB样条可变形变换1、itkAffineTransform仿射变换该类实现向量空间的仿射变换（例如空间坐标）此类允许定义和操作n维仿射空间（及其关联的向量空间）对其自身的仿射变换，一种常见的用途是定义和操作二维和三维的欧几里得坐标变换，但其他用途也是可能的。仿射变换在数学上定义为线性变换
leafpipi·2024-01-09 23:54

【ITK库学习】使用itk库进行图像配准：变换Transform（一）

目录1、itkIdentityTransform一致变换2、itkTranslationTransform平移变换3、itkScaleTransform比例变换4、itkRigid2DTransform刚性2D变换5、itkCenteredRigid2DTransform居中刚性2D变换6、itkEuler2DTransform欧拉2D变换7、itkSimilarity2DTransform2D相
leafpipi·2024-01-09 23:23

【ITK库学习】使用itk库进行图像配准：变换Transform（二）

目录1、itkQuaternionRigidTransform四元刚性变换2、itkVersorTransformVersor变换3、itkVersorRigid3DTransformVersor刚体3D变换4、itkEuler3DTransform欧拉3D变换5、itkSimilarity3DTransform3D相似变换6、itkRigid3DPerspectiveTransform3D刚性透
leafpipi·2024-01-09 23:23

【ITK库学习】使用itk库进行图像分割（三）：分水岭分割算法

目录1、itkWaterShedImageFilter分水岭滤波器2、itkMorphologicalWatershedImageFilter形态学分水岭滤波器3、itkIsolatedWatershedImageFilter岛屿分水岭滤波器1、itkWaterShedImageFilter分水岭滤波器分水岭分割对图像特征基于梯度下降法和沿区域边界分析弱点将像素进行分类。该类可从标量值图像输入自动
leafpipi·2024-01-09 23:51

Visual Studio安装 ITK 的正确姿势！

写在开头之前一直用Python，最近写一个脚本需要用到ITK用来对处理医学图像，ITK与OpenCV主打功能相似，都是面向于图像处理，但是两者在领域应用方面有一定的差别；ITK：对二维三维医学图像数据做基本图像处理
小张Python·2024-01-07 21:19

几种读nii图像方法的轴序比较

读.nii/.nii.gz图像并转成numpy可用medpy.io、nibabel、itk、SimpleITK几种方法，然而几种方法读出来的轴序有出入，本篇比较此几种方法。
HackerTom·2024-01-05 00:51

ITK-SNAP 使用技巧

1.左手使用'键盘(1)(2)(4)’快速切换功能；画笔右键为擦除图1：定位功能（按‘1’）图2：画笔功能（按‘2’）2.通过contrast调整图像对比度图3：通过cotrast调整图像对比度3.面板左下角可调整标签透明度图4：调整标签透明度
StevenGerrad·2024-01-04 22:23

【ITK库学习】使用itk库进行图像配准：“Hello World”配准

目录1、itkImageRegistrationMethod/itkImageRegistrationMethodv42、itkTranslationTransform3、itkMeanSquaresImageToImageMetric/itkMeanSquaresImageToImageMetric44、itkRegularStepGradientDescentOptimizerv/itkReg
leafpipi·2023-12-24 01:29

【ITK库学习】使用itk库进行图像滤波ImageFilter：提取区域/切片/裁剪

目录1、itkRegionOfInterestImageFilter提取区域2、itkExtractImageFilter提取切片3、itkCropImageFilter裁剪图像区域1、itkRegionOfInterestImageFilter提取区域该类可以从输入图像中提取感兴趣的区域。该滤波器产生与输入图像具有相同尺寸的输出图像。如果想更改图像的尺寸，可以考虑使用ExtractImageFi
leafpipi·2023-12-24 01:59

【ITK库学习】使用itk库进行图像滤波ImageFilter：频域滤波

目录1、itkFFTConvolutionImageFilter快速傅里叶变换计算2、扩展：itkConvolutionImageFilter.h3、itkFFTShiftImageFilter频率转移滤波器4、itkFFTNormalizedCorrelationImageFilterFFT实现的归一化相关滤波器1、itkFFTConvolutionImageFilter快速傅里叶变换计算该类使
leafpipi·2023-12-24 01:29

【ITK库学习】使用itk库进行图像配准：内插器（插值）

目录1、itkNearestNeighborInterpolateImageFunction最近点插值2、itkLinearInterpolateImageFunction线性插值3、itkBSplineInterpolateImageFunctionB样条插值4、itkWindowedSincInterpolateImageFunction窗口化Sinc插值5、itkRayCastInterpo
leafpipi·2023-12-24 01:28

【ITK库学习】使用itk库进行图像分割（二）：区域生长--连接ConnectedImageFilter

目录1、itkNeighborhoodConnectedImageFilter领域链接2、itkConfidenceConnectedImageFilter置信连接3、itkVectorConfidenceConnectedImageFilter向量图像的置信连接4、itkIsolatedConnectedImageFilter孤立连接1、itkNeighborhoodConnectedImage
leafpipi·2023-12-24 01:28

【ITK库学习】使用itk库进行图像滤波ImageFilter：Voting滤波器

目录1、itkVotingBinaryImageFilter2、itkVotingBinaryHoleFillingImageFilter洞穴充填滤波器3、itkVotingBinaryIterativeHoleFillingImageFilter4、itkLabelVotingImageFilter1、itkVotingBinaryImageFilter该类是一个基类，用于根据前景和背景像素的邻
leafpipi·2023-12-24 01:28

【ITK库学习】使用itk库对图像进行Binary与Gray形态学处理：膨胀、腐蚀

目录1、itkBinaryDilateImageFilter二值膨胀2、itkBinaryErodeImageFilter二值腐蚀3、itkGrayscaleDilateImageFilter灰度膨胀4、itkGrayscaleErodeImageFilter灰度腐蚀5、Binary与Gray函数的区别6、扩展：itkBinaryThresholdImageFilter图像二值化7、代码示例：1、
leafpipi·2023-12-24 01:58

itk中的配准整理

文章目录Perform2DTranslationRegistrationWithMeanSquares效果:源码:多模态互信息配准PerformMultiModalityRegistrationWithViolaWellsMutualInformation效果图源码:RegisterImagetoAnotherUsingLandmarks通过标记点配准图像效果图源码Perform2DTransla
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:44

将图片buffer写入到image

ImportPixelBufferintoanImage官方demo：https://itk.org/ITKExamples/src/Core/Common/ImportPixelBufferIntoAnImage
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:44

将itk::Image转换为vtkImageData

1.ConvertAnitk::ImageTovtkImageData官方demo：https://itk.org/ITKExamples/src/Bridge/VtkGlue/ConvertAnitkImageTovtkImageData
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:14

ITK学习

itk官方demo地址：https://itk.org/ITKExamples/src/index.htmlitk读取各种类型的文件ReadingandWritingforImagesandTransformshttps
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:14

itk中的一些图像处理

文章目录1.BinomialBlurImageFilter计算每个维度上的最近邻居平均值2.高斯平滑3.图像的高阶导数RecursiveGaussianImageFilter4.均值滤波5.中值滤波6.离散高斯平滑7.曲率驱动流去噪图像CurvatureFlowImageFilter8.由参数alpha和beta控制的幂律自适应直方图均衡化9.Canny边缘检测10.Sobel边缘检测和基于过零的
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:13

itk配准整理(1)

示例地址：itk\ITK\Examples\RegistrationITKv4\ImageRegistration7.cxx说明：itk二维图像的配准：平移+旋转+缩放效果图：运行结果：5253.6213
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:13

itk中图像2d-3d配准整理

示例代码#include"itkTwoProjectionImageRegistrationMethod.h"#include"itkEuler3DTransform.h"#include"itkNormalizedCorrelationTwoImageToOneImageMetric.h"#include"itkSiddonJacobsRayCastInterpolateImageFunctio
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:43

itk中生成drr整理

生成drrchar*input_name="test.mhd";//三维体数据char*output_name="test.tif";//生成的二维DRRfloatrx=90.;floatry=0.;floatrz=90.;floattx=0.;floatty=0.;floattz=0.;floatcx=0.;floatcy=0.;floatcz=0.;floatsid=400.;floatsx=
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:13

itk中互信息配准二维图像(仅平移)

原文地址:https://examples.itk.org/src/registration/common/mutualinformation/mutualinformation#Resample-the-moving-imagehttps
努力减肥的小胖子5·2023-12-23 10:07

vue中安装使用vtk，亲测版

一个医学影像资料的3D库，百度谷歌发现基本搜不到啥有用的信息，基本都是用python和c写的，这里做一个自己使用的分享VTK的api官网：https://kitware.github.io/vtk-js/api/ITK
ccc陈陈陈·2023-12-21 04:03

【ITK库学习】使用itk库进行图像滤波ImageFilter：保留边缘平滑滤波

目录1、itkGradientAnisotropicDiffusionImageFilter梯度各向异性扩散2、itkCurvatureAnisotropicDiffusionImageFilter曲率各向异性扩散3、itkCurvatureFlowImageFilter曲率各向异性扩散4、itkMinMaxCurvatureFlowImageFilter最大最小曲线流5、itkBilateral
leafpipi·2023-12-16 16:09

ITK-snap医学图像标注方法（超级详细）——保姆级

医学图像标注说明目录标注软件：ITK-SNAP官网下载百度网盘下载：1初始界面2导入病例文件方法一：方法二：3窗宽窗位调节4数据标注标注方法一：套索标注标注方法二：画笔标注5分割结果保存标注软件：ITK-SNAP
Curb·2023-12-14 17:02

使用c++版本的itk计算二值三维图像的表面

#include"itkImageFileReader.h"#include"itkImageFileWriter.h"#include"itkMesh.h"#include"itkBinaryThresholdImageFilter.h"#include"itkBinaryMask3DMeshSource.h"#include"itkMeshFileWriter.h"#include#inclu
吴天德少侠·2023-12-14 12:08

手把手教你Linux下基于ITK开发基础（1）

手把手教你Linux下基于ITK开发基础（1）*requirement:requirementversiongit2.17.1g++Ubuntu7.5.0-3ubuntu1~18.04ITK4.13VTK9.1.01
ye1391·2023-12-03 05:46

ITK读取裸数据方法

ITK读取裸数据方法关键词：ITK、裸数据、MRIcro、itk::RawImageIOITK多用于医学图像的配置和分割，所以其对DICOM文件读写操作的支持是很好的(ITK内部使用GDCM对DICOM
伍心·2023-11-30 17:12

基于VS2017 Teamcenter12 ITK开发环境配置

基于VS2017Teamcenter12ITK开发环境配置创建项目项目类型选择项目属性设置C/C++C/C++常规C/C++预处理C/C++代码生成链接器连接器常规链接器输入创建项目项目类型选择项目属性设置配置类型
gw_dragon·2023-11-25 15:49

读取nii数据，转为volume.dat二进制数据

include"functions.h"#include#includeusingGrayPixelType=unsignedchar;usingOrgPixelType=short;usingOrgImageType=itk
吴天德少侠·2023-11-24 16:07

闲扯-VTK与QT整合开发中的问题

之前曾质疑是否要一用QT来整合开发ITK、VTK，原来的想法是直接用VS2010，c++开发。后来发现自己总是配置出错，而且可以参考的资料不多。
weixin_34375054·2023-11-24 00:00

vite + electron引入itk报错

代码import{readImageArrayBuffer}from'itk-wasm'console.log(readImageArrayBuffer)通过itk-wasm官网，创建新的项目vite+
AwoCT·2023-11-10 19:14

Python随机生成指定长度字符串

In[7]:importosIn[8]:importbase64In[9]:base64.b64encode(os.urandom(48))Out[9]:b'ITk0zqRg18SMvh7XS6WEa4KTaLLcHPWRlSJk5
FreeSpider公众号·2023-11-08 00:31

cmake 概述

这个工作是ITK(一个医学开源可视化软件，InsightSegmentationandRegistrationToolkit)项目的一部分。
dodo_check·2023-10-29 15:04

Ubuntu18.04下Cmakes升级、ITK安装、Root安装、gate安装过程记录

可以先升级一下自己的Cmake,因为后面安装gate时会要求Cmake不低于多少版本，gate9.1好像说不低于cmake11。对，还有就是如果是虚拟机安装，可以在geant4安好后拍一个快照，以便后面安装不成功还回得来。如果gate要是安好了，就再拍一个快照，这样比较好。可以先安geant4,去下面说的地方学习怎么安装。cmake升级一、查看当前cmake的版本cmake--version二、从
张小懒君·2023-10-11 05:50

python read()读取图片_可以python sitk.ReadImage读取列表/系列图像吗？

但是在功能文件中它说：ReadImage(**VectorStringfileNames**,itk::simple::PixelIDValueEnumoutputPixelType)->ImageReadImage
teacher.dio·2023-10-05 12:02

Elastic开源图像配准工具

文章目录前言：图像配准综述一、常见的图像配准工具：ITK，SimpleITK，ANTs，Elastix，SimpleElastix二、Elastix：基于ITK开发的医学图像配准工具2.1、elastix.exe
胖墩会武术·2023-10-02 20:18
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