pvalue

Python特征分析- 相关性分析

Python特征分析-相关性分析相关性分析引入库图示初判变量之间的线性相关性散点图矩阵初判多变量间关系Pearson相关系数创建样本数据正态性检验→pvalue>0.05制作Pearson相关系数求值表求出
小白-小天·2022-11-28 00:42

Li‘s 影像组学视频学习笔记(9)-T检验(T-test)理论及示例

检验两组独立样本的平均数与其分布是否具有显著性差异(有显著性差异：p0.05）若两组数据不满足方差齐性，使用Welch’st-testLevene函数的使用：输入：levene(x,y)输出：LeveneResult(statistic,pvalue
有Li·2022-11-16 11:30

基因相关性的计算

1.读入数据以pbmc3k为例pbmc%filter(pvalue%filter(correlation>0)%>%arrange(desc(correlation))cor_data_sig_neg%
Hayley笔记·2022-07-01 10:09

R语言缺失值（NA）的去除

我们处理的数据集经常会出现一些‘NA’，比如二代测序数据到DESeq2包处理后，padj以及pvalue这一行datadata<-na.omit(data)上述代码会将所有含NA的行去除但有的时候不需要将所有含有
佳名·2022-04-03 20:40

代码文件备份 | 3-10：对arraymatrix数据进行初步筛选与分组差异表达分析

data0.25,select=c(Pvalue,Foldchange))filename=paste(region,"diffresult.csv",sep="_")write.csv(diffresult
今天也是个妖精头子呀·2022-03-12 13:11

ggplot火山图的绘制（volcano plot）

library(ggplot2)volcano1.5|log2(volcano$Foldchange)<(-1.5))&volcano$Pvalue<0.05)r03=ggplot(volcano,aes
今天也是个妖精头子呀·2022-03-12 13:11

R做线性回归基础

mod=lm(mpg~wt,data=mtcars)res=summary(mod)系数是否统计显著看tvalue/pvalue/*的数量，而不是绝对值大小，tvalue越大，pvalue越小，*越多那就越显著是否科学显著看绝对数值大小
hhyy_d·2022-03-12 13:36

在R里面使用dplyr对表格进行计算、筛选等操作

我的需求：基因表达差异分析结果的表格，每行是一个基因，不同的列分别表示表达值、FoldChange、Pvalue、Qvalue等信息，如果要根据基因名称筛选出特定的行，或者针对Pvalue进行数据转化并计算出
bioinfx·2022-02-23 11:26

根据基因间相关性系数R进行GSEA富集分析

=T)#转置一下mutwt_t<-t(mutwt)转置后文件内容为：纵坐标是样本名称，横坐标是不同基因的Ensembl#先写空向量gene_name<-c()##也可用vectorcor_r<-c()pvalue
没有猫但是有猫饼·2021-12-15 16:45

FWER和FDR(False Discovery Rate)

而最初通过取一个简单的cutoff(pvalue<0.05或pvalue<0.01)判断是否显著出现了很大的问题。举一个简单的例子，假设我们有两组数据。
坐看云起时zym·2021-06-26 21:56

如何用R语言进行Pvalue显著性标记？

作者：一只想飞的喵审稿：童蒙编辑：angelica箱线图是统计学中较常见的图形之一。这篇文章将讲述如何简单比较两组或多组的平均值，且添加显著性标记。通常情况根据显著性p值的数值大小，分为四类：（1）0.01≤p<0.05，*（2）0.001≤p<0.01，**（3）0.0001≤p<0.001，***（4）p<0.0001,****接下来会讲述三种添加显著性标记的方法。方法1-手动添加1：创建数据
生信阿拉丁·2021-06-06 00:36

2018-04-23 pvalue的简析和使用

今天在了解pvalue时候，一开始看到这样的定义：P值就是当原假设为真时所得到的样本观察结果或更极端结果出现的概率。
止一之路·2021-05-20 11:23

RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释

找到一个能反映文库大小的因子，利用这个因子对rawdata进行标准化3根据模型检验求pvalue：泊松分布(poissondis
没有猫但是有猫饼·2021-04-19 12:07

R语言画棒棒糖图（lollipop）展示snp在基因上的位置

还有一列用来添加文字标签下面我们构造一份数据集用来画图df<-data.frame(pvalue=sample(seq(0,1,by=0.001),20,replace=F),Ef
小明的数据分析笔记本·2021-04-13 16:10

ggprism包数据可视化之添加P值

可以说GraphPadPrism最受欢迎的功能之一是在绘图中添加p值，ggprism使用add_pvalue()添加带括号或不带括号的p值;喜欢的小伙伴可以关注我的公众号R语言数据分析指南持续分析更多优质资源
益民厂老厂长·2021-04-13 06:58

画图专题 | 差异表达基因结果展示系列之柱状图

但是当我去查找这个函数的调整坐标的参数时：UsageS3methodforclass‘enrichResult’barplot(height,x=“Count”,colorBy=“pvalue”,s
淇酱酱爱吃棒棒鸡·2021-04-13 00:45

桑基图绘制（sankey diagram）

常用的方法有：ggalluvialsankeyNetwork主要是文件准备比较麻烦，代码如下sankey_make%filter(pvalueFC)exp_deg_sig_up_list%filter(pvalue
落寞的橙子·2020-12-28 04:51

RNA-seq摸索：4.2 rawdata差异分析的一些图

1.P值分布图:观察原始p值的分布是重要的，期待去看到在较低的p值处有个峰且P值高于0.1时处于均匀分布library(ggplot2)ggplot(res,aes(x=pvalue))+geom_histogram
没有猫但是有猫饼·2020-11-25 09:57

简单实用的环形队列(C语言)

include#include#include#definetrue1#definefalse0typedefintQueueType;typedefstruct_tQUEUE_{QueueType*pValue
SIENTIST·2020-11-23 15:56

使用R语言画火山图详细步骤

PPV-vs-PPV_TVMV.csv",header=T,row.names=1,sep=",")3.设置横轴和纵轴r03=ggplot(data,aes(log2FoldChange,-1*log10(pvalue
飘羽·2020-09-16 16:39

p值还是 FDR

已经计算了表达量和pvalue值，差异的基因（蛋白）太多了，如何筛选。其中最为关键的是需要对pvalue进行校正。基本概念：零假设：在随机条件下的分布。
相逢一醉为前缘·2020-09-15 20:17

如何用minitab检测一组数据是否服从正态分布

打开Minitab之后点击Stat>BasicStatistics>NormalityTest分析之后若Pvalue(P值)>0.05，说明此组数据服从正态分布转载于:https://
weixin_30836759·2020-09-12 18:23

ObjectARX 获取指定一个图层中的所有实体

BOOLCTest::getEntityByLayerName(constCString&strLayerName,AcDbObjectIdArray&objIds){TCHAR*pValue=newTCHAR
wh3202706·2020-09-12 11:10

vue全家桶+Koa2开发笔记(8)--开发网页

动态倒入数据mongoimport-dstudent-careasareas.dat-d后面是数据库名称；-c后面是表名称最后是数据源2.使用vue的watch监听的时候，是可以有参数的：watch:{pvalue
weixin_34199335·2020-09-10 19:44

用clusterProfiler做GSEA（二）

此外，gseaplot2还可以同时显示多个功能组的富集曲线和pvalue。
生信编程日常·2020-09-03 18:08

关于常量指针的用法

一、指向常量的指针例1intmain(){intnum=5;constintfun=100;int*pi;constint*pci;pi=#pci=&fun;printf("numaddr:%pvalue
林一捆·2020-08-20 07:53

使用R语言ggplot2包绘制pathway富集分析气泡图（Bubble图）:数据结构及代码

在对基因完成GO/KEGG分析后，使用气泡图可以直观的展示pathway、pvalue、count之间的关系。
ntuYision·2020-08-18 12:26

XmlHttp实现无刷新三联动下拉框

1.html代码XmlHttp实现无刷新三联动下拉框").innerText="省:"+pValue+"|"+pText+"市:"+cValue+"|"+cText+"区:"+aValue+"|"+aText
jbeauty·2020-08-16 13:03

update connection parameters

PeripheralcaseGAPROLE_PARAM_UPDATE_ENABLE:if((len==sizeof(uint8))&&(*((uint8*)pValue)gapRole_MaxConnInterval
Ayworld·2020-08-14 02:51

C++与Python打包（转载请注明出处，谢谢！！！）

写好Python代码声明PyObject*pName,*pModule,*pDict,*pFunc,*pArgs,*pValue;对象指针添加Python编译环境：Py_SetPythonHome(L”
滁州千丝万缕·2020-08-12 17:54

PhpSpreadsheet的使用（一）

phpspreadsheet二、引入加载文件getActiveSheet();//处理单元格属性必须先调用此方法三、常用方法1、单元格赋值：1.1、setCellValue($pCoordinate,$pValue
蜡笔小鑫~·2020-08-12 14:40

浮点数的二进制表示

includeintmain(intargc,charconst*argv[]){intnum=9;float*p=(float*)#printf("numvalue:%d\n",num);printf("*pvalue
六炅·2020-08-11 21:32

mybatis foreach循环map

${key}}where${pkey}=#{pvalue}insertinto${table}${key}values#{value}
trtterrttrettrt·2020-08-11 15:50

BFPRT算法C++实现

只不过选择标杆值不一样，BFPRT是选择中位数组的中位数来当pvalue，而快排是随机选择。
Longb2·2020-07-30 23:37

SPSS学习笔记之——两独立样本的非参数检验（Mann-Whitney U ）

NMI评估指标：统计上述8个数据集的ARI和NMI均值，作为NMI和SE聚类的性能评估，但均值可能是随机采样导致的结果更优，如果要严格说明需进行统计学分析，如Mann-WhitneyU等统计方法，如果得到pvalue
guomutian911·2020-07-27 22:06

多因素生存分析图绘制

(survival)rt=read.table(“risk.txt”,header=T,sep="\t")diff=survdiff(Surv(futime,fustat)~risk,data=rt)pValue
木之如水·2020-07-15 08:09

c++调用python函数时，使用PyArray_SimpleNewFromData(nd, dims, typenum, data)函数时出现内存错误的问题...

示例程序：int main(int argc, char *argv[]){PyObject*pName,*pModule,*pDict,*pFunc,*pValue,*pArgs,*pXVec,*c,
dianmei0256·2020-07-11 05:47

将任意字符串中的汉字提取出来的方法

注：_pMutableStr为已经存在的字符串NSMutableString*pValue=[[NSMutableStringalloc]init];for(inti=0;i0x4e00&&tmp<0x9fff
hey雅克·2020-07-10 04:58

100916 中软实训 之 TreeCtrl

如下为错误的方法：G_pValue->department[20]={"销售查询
rattles·2020-07-10 01:11

C语言基础---文件操作

按照字符读写文件fputsfgets按照行读写文件（读写配置文件）freadfwirte按照块读写文件（大数据块迁移）fprintf按照格式化进行读写文件fprintf(fp,"%s=%s\n",pKey,pValue
ZebraWei·2020-07-09 14:58

假设检验与常见的统计检验方法

在这个方法下，我们首先对总体作出一个假设，这个假设大概率会成立，如果在一次试验中，试验结果和原假设相背离，也就是小概率事件竟然发生了，那我们就有理由怀疑原假设的真实性，从而拒绝这一假设1.2P值P值（Pvalue
tide1994·2020-07-08 20:55

FDR校正的程序实现及严格程度对比

FDR校正的程序实现及严格程度对比前言做统计分析就离不开Pvalue1000的情况，否则原则上会崩溃。我用MATLAB测试过，会出现warning，但不会报错。
Brain_er·2020-07-07 16:30

COM 字符串数组参数的实现

LONGargc,VARIANTargvs){AFX_MANAGE_STATE(AfxGetStaticModuleState());if(argvs.vt==(VT_ARRAY|VT_BSTR)){BSTR*pValue
飘_飘·2020-07-07 07:29

背包问题

intKnapsackProblem(int*pweight,int*pvalue,intn,intw){int*ptbl=malloc(sizeof(int)*(w+1));memset(ptbl,0
FengPrince·2020-07-06 21:16

(json-c学习3) linux c语言封装json单个对象（纯代码）

void)211{212//封装成如下形式的json内容：213/*214{215"loop_number":1,216"sensor_address":1217}218*/219json_object*pValue
天泉证道·2020-07-06 02:23

自身特化的模板类：奇异循环模板

考虑如下代码：templateclassCBase{public:CBase();~CBase();staticint*m_pValue；}；classCDriver:publicCBase{public
超频化石鱼·2020-07-04 16:18

白话空间统计之四：P值和Z值（中）

另外，还要纠正一个说法，p是一个值（pvalue），而z是一个得分（zscores),上篇文章中，称谓出错了。就像上面那个PH试纸的标尺，从中间往两边延伸，表示酸碱的强度。
大虾卢·2020-07-01 17:14

c++——动态内存分配

#include"pch.h"#includeusingnamespacestd;intmain(){double*pvalue=NULL;//初始化为null的指针pvalue=newdouble;/
taojYang·2020-06-29 08:57

C语言实现一个循环移位函数

include#include#includetypedefunsignedintuint_t;/*函数名称：rotl（仿照stdlib.h中的_rotl函数）函数功能：实现无符号整数左循环移位参数介绍：pvalue
大道曙光·2020-06-24 13:26

贴上JNA—JNI终结者、深入解析JNA—模拟C语言结构体两篇文章的完整源代码

JNA—模拟C语言结构体两篇文章的完整源代码C语言源代码：头文件#defineMYLIBAPIextern"C"__declspec(dllexport)MYLIBAPIvoidsay(wchar_t*pValue
iteye_18139·2020-06-23 19:43
上一页 1 2 3 4 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他