pvalue

python卡方检验计算pvalue值_Python数据科学：卡方检验

CodeWhiz·2024-09-14 14:00

C/C++编程：前置声明

前置声明」（forwarddeclaration）是类、函数和模板的纯粹声明，没伴随着其定义.一般的前置函数声明#includeusingnamespacestd;voidfun(charch,int*pValue

OceanStar的学习笔记·2024-03-09 21:51

数据之帆·2024-02-19 14:57

R语言泡泡图— —小泡泡如何变大泡泡？

ggplot2)pathway=read.csv("1KEGG.csv",header=TRUE,row.names=1,check.names=FALSE)p=ggplot(pathway,aes(Pvalue

赵玉鑫0507·2024-02-11 06:30

Error in if (pvalue ＞ 0.05) { : missing value where TRUE/FALSE needed

场景：导入数据正常，根据ANOVA算平均值和均值的时候，出现了这个errorErrorinif(pvalue>0.05){:missingvaluewhereTRUE/FALSEneeded将数据中每个

Rosebud的记录本·2024-02-11 00:40

用clusterProfiler做GSEA

此外，gseaplot2还可以同时显示多个功能组的富集曲线和pvalue。

Seurat_Satija·2024-01-26 02:19

生信分析中的p值，q值，padj值和pvalue值

pvalue(pval):统计学差异显著性检验指标。

村长吃火锅·2024-01-25 07:39

【PHY6222】绑定详解

1.函数详解bStatus_tGAPBondMgr_SetParameter(uint16param,uint8len,void*pValue)设置绑定参数。

我我我只会printf·2024-01-18 01:53

从网上找的DBMS_STATS.SET_DATABASE_PREFS资料

SET_TABLE_PREFS可以单独设置表的一些属性BEGINDBMS_STATS.SET_TABLE_PREFS(ownname=>'HFF',tabname=>'T1',pname=>'METHOD_OPT',pvalue

hffyxhjy·2024-01-17 01:37

C++ STL（2）--算法(2)

代码示例：classAA{int*m_pValue;public:AA(intv):m_pValue(ne

myepicure888·2024-01-13 23:18

添加统计检验 P value

本期分享如何使用R为为分组数据差异添加统计检验Pvalue。

qq_21478261·2024-01-13 05:18

原假设正确的情况下，p value的分布

若为单边检验pvalue=G(T)=1-F(T)；若为双边检验，pvalue=G(T)=2*(1-F(T))。显然，pvalue与T之间存在负相关的

坐看云起时zym·2024-01-08 05:30

宏病毒组分析之deepvirfinder结果的后续处理

我们知道，在使用deepvirfinder之后会给到一个得分表，类似于这样：deepvirfinder输出结果然后我们在使用Excel表格中的“筛选”功能，选取score>0.9和pvalue值＜0.01

宏病毒组·2024-01-04 12:31

GWAS数据下载详解（3）

#使用gwasrappidlibrary(gwasrapidd)help(package="gwasrappid")#获取研究my_studies%#根据P值筛选tidyr::drop_na(pvalue

weixin_49320263·2023-12-31 14:39

纯Python：在给定pvalue的情况下比较cafe结果文件中任意两个节点的基因数目

cafe运行结果文件中，在给定p值的情况下比较任意两个节点的所有基因家族内的基因数目差异注意：请在代码内部176行指定节点，以的格式，184行指定pvalue值运行格式pythoncompare_GF_branch_geneNum.pyreport_run.cafe

离子回旋·2023-12-27 15:17

【R画图学习2.1】火山图-plot篇

data1]<-"#FC4E07"color[data$pvalue<0.05&data$log2FoldChange<-1]<-"#00AFBB"#color[data$r

jjjscuedu·2023-12-18 06:47

在线作图|2分钟绘制一张精美的火山图（Volcano Plot）

火山图（volcanoPlot）火山图（VolcanoPlot）形似火山喷发，是一种表示特征差异表达的散点图，它将统计测试中的统计显著性量度（如pvalue）和变化幅度相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点

维凡生物·2023-12-17 22:49

小tips: 如何画简单的correlation图并调整图距

目的：我们有一组需要添加的r和pvalue，然后我们想把它加到图里然后并且调整图的边距。测试数据构建以及r和p给定以及对其进行四舍五入规定小数点以及科学计数法的转换。

土豆西红柿青椒·2023-12-16 21:03

2020-02-15

富集分析制作气泡图###自定义作气泡图x<-read.csv(file.choose(),stringsAsFactors=F)#筛选p<0.05x<-x[x$PValue<0.05,]x_go=x[,

爱看电影的橘猫·2023-11-27 08:27

Codesys扩展数据类型Any的探索

内部是一个数据结构体，在定义一个Any变量时，内部会转成其结构体，定义如下TYPEAny:STRUCT//实际参数的类型typeclass:__SYSTEM.TYPE_CLASS;//指向实际参数的指针pvalue

自由蝶鸟·2023-11-22 17:24

ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来

火山图（VolcanoPlot）常用于展示基因表达差异的分布，横坐标常为Foldchange（倍数），越偏离中心差异倍数越大；纵坐标为Pvalue（P值），值越大差异越显著。

生信补给站·2023-11-19 03:10

火山图——直观的特征差异可视化

火山图（Volcanoplots）是散点图的一种，根据变化幅度（FC，FoldChange）和变化幅度的显著性（Pvalue）进行绘制，其中标准化后的FC值作为横坐标，P值作为纵坐标，可直观的反应高变的数据点

Odd_guy·2023-11-15 22:44

macs2的输出文件解读

输出信息包含：染色体号peak起始位点peak结束位点peak区域长度peak的峰值位点（summitposition）peak峰值的高度（pileupheightatpeaksummit,-log10(pvalue

awk_bioinfo·2023-11-03 04:16

关于RNA-SEQ中GO分析的几个名词

如何计算见链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/264504322问题二：如何利用EXCEL计算Q值BH算法的公式为：Qvalue=p*(m/k)其中，m是检验的次数，k是这次检验的pvalue

ShanSly·2023-11-02 19:29

【R画图学习2.2】火山图-ggplot篇

library(ggplot2)library(dplyr)library(ggrepel)data=0.5&data$pvalue%通道符来实现。

jjjscuedu·2023-11-01 07:15

ggplot2绘制KEGG富集散点图

qvalue是做过多重假设检验校正之后的pvalue,qvalue的取值范

Seurat_Satija·2023-10-29 18:57

php excel 502,phpexcel超过26列的问题和解决方法

=count($content[0]);$maxRow=count($content);for($i=0;$igetActiveSheet()->setCellValue($pCoordinate,$pValue

成西风·2023-10-20 19:25

WGDI之深入理解blockinfo输出结果

即共线性的结果的唯一标识chr1,start1,end1即参考基因组（点图的左边）的共线性范围（对应GFF1的位置）chr2,start2,end2即参考基因组（点图的上边）的共线性范围（对应GFF2的位置)pvalue

xuzhougeng·2023-10-20 09:46

R语言矩阵相关性计算及其可视化？

生物信息与育种·2023-10-10 11:45

c语言数组模拟环状,简单实用的环形队列(C语言)

include#include#include#definetrue1#definefalse0typedefintQueueType;typedefstruct_tQUEUE_{QueueType*pValue

咱也不敢说·2023-10-09 23:55

指针参数和引用参数的区别

例如voidGeValue(double*pValue)和voidGeValue(double&pValue)都是函数声明，但它们有不同的用法和特点。

IT观察者·2023-09-23 00:29

结构体中定义string变量

typedefstructGS_DB_Event_Item_Stru{stringstrFieldName;uint16usType;//1//1number,2stringunion{int32nValue;char*pValue

sooolo·2023-09-11 02:07

R可视化17|ggstatsplot几行code终结SCI级图表统计+画图 (上)

「ggstatsplot最大亮点」：「轻松的在图形中添加统计检验」【多种检验可一键切换，展示数据子集间Pvalue及其他统计指标】

qq_21478261·2023-09-06 21:54

R可视化17-18|ggstatsplot几行code终结SCI级图表统计+画图

ggstatsplot最大亮点就是很轻松的在图形中添加了统计检验【多种检验可一键切换，展示数据子集间Pvalue及其他统计指标】ggstatsplot想要解决的中心问题很简单：将数据分析工作流中的数据可视化和统计建模

qq_21478261·2023-09-06 21:23

显著性检验

在原假设条件下，计算事件发生，即样本出现的概率(pvalue)。若概率小于显著性水平(α)，则拒绝原假设；否则，接受原假设。显著性检验的

子诚之·2023-09-04 19:59

ggplot2气泡图的又一个小例子

还有一个要求是能否突出p值=0.05")ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC,size=pvalue,color=Class,shape=group))+geom_point(alpha

小明的数据分析笔记本·2023-08-10 18:39

固高运动控制卡的使用 <2> 关于IO的访问以及调用（C#版）

关于官方对这两方法的说明：指令原型：GT_GetDi(shortdiType,long*pValue)指令说明：读取数字IO输入状态指令类型：立即指令，调用后立即生效指令参数：diType：指定数字IO

aaaaabin·2023-06-18 19:03

终于有人把 p 值讲明白了！

导读：p值（Pvalue）就是当原假设为真时，比所得到的样本观察结果更极端的结果出现的概率，是用来判定假设检验结果的一个参数。p值是根据实际统计量计算出的显著性水平。

数据不吹牛·2023-04-08 19:57

使用和解释P值的“六原则”

pvalue.png2014年2月，美国曼荷莲学院（MountHolyokeCollege）数学与统计学教授GeorgeCobb在美国统计学会（AmericanStatisticalAssociation

统计大师·2023-04-08 10:13

高颜值火山图绘制脚本

它归根到底是是散点图的一种，它能将统计学中的统计显著性量度（如pvalue，矫正后的P值）和变化幅度相结合，从而能够帮助人们识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据（如基因，蛋白等），如下图所示。

xw_欢乐豆·2023-04-06 19:35

【R画图学习13.3】散点图---曼哈顿图

一般横轴是代表染色体，纵轴则表示SNP位点与表型关联的显著程度，一般-log10(Pvalue)，实线一般表示统计学上的显著性cutoff。

jjjscuedu·2023-03-26 15:21

2022-09-19一张图画多个KEGG富集结果

check.names=FALSE)head(pathway)plot<-ggplot(pathway,aes(Species,PATHWAY))+geom_point(aes(size=Gene,color=Pvalue

AsuraPrince·2023-03-26 02:25

ggplot---展示带下标的log2FC和-log10(pvalue)

格式如下：xlab(expression("-log"["2"]*"FC"))+ylab(expression("-log"["10"]*"PValue"))+注意expression里面要用*把文本隔开

一只烟酒僧·2023-03-17 00:26

六、GEO差异基因功能注释之KEGG和GO

，用于富集分析（symbol转entrezid，然后inner_join）library(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)#Hs代表人类s2e%filter(pvalue

芋圆学徒·2023-02-17 21:36

统计|假设检验中的P值(pvalue)如何看/怎样理解

本博文源于《商务统计》，之前在做matlab编程和spss统计分析中，对p值的理解就是懵懵懂懂，无法确定出真正含义。今天就以新生儿的例子来观看p值是如何看的，并且了解假设检验的5个步骤。例子：新生儿假设检验的一般步骤建立假设抽样分布寻找临界值计算检验统计量决策进行结论建立实验假设联合国卫生部说标准新生男女标配为108:100就是0.519的样子，也就是100名新生儿中，52个为男的。这是一个单侧假

小风旗·2023-02-04 00:47

[C#基础知识之]详解C#中堆和栈的区别

如果我们写出如下两段代码：代码段1：publicintAddFive(intpValue){intresult;result=pValue+5;returnresult;}代码段2：publicclassMyInt

一片·2023-01-14 19:31

无信息变量消除算法matlab,蒙特卡罗-无信息变量消除特征提取偏最小二乘建模...

uve.spa.pls└──uve.spa.pls├──axisrange.m├──carsplslda.m├──carspls.m├──carspls_mccv.m├──classplot2.m├──compute_pvalue.m

用户6731453637·2023-01-10 11:39

R语言 ggplot报错Removed 1 rows containing missing values (`geom_point()`).

（1）首先是因为我的数据里存在空白，即存在数据都是0的情况，这样通过差异表达分析算出来的pvalue和adj-q都是NA，所以才会报错然后我用一行代码进行了数据清理但是运行后还是继续报错（2）然后我还发现

小宇的生物笔记·2022-12-25 23:07

带你搞明白单侧双侧T检验

双侧T检验零假设H0:μ=0，对立假设Ha:μ≠0（pvalue可以通俗的理解为同时满足tscore和对立假设的概率，所以越小越支持原假设）如果tscore=1.96，此时pvalue就是两个白色面积的和

Dana-Song·2022-12-22 00:54

python statsmodel 回归结果提取（回归系数、t值、pvalue、R方）【转载】

@创建于：2022.12.12@修改于：2022.12.12文章目录1、训练模型2、提取元素-回归系数类3、模型评价类4、计量经济学方面的系数5、参考来源1、训练模型相关函数官网链接：statsmodels.regression.linear_model.OLSResultsstatsmodels.discrete.discrete_model.LogitResultsimportstatsmod

条件漫步·2022-12-15 09:34

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