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pvalue
Pathway富集分析气泡图
data.tsv>pathway=read.table("data.tsv",header=T,sep="\t")>library(ggplot2)>p=ggplot(pathway,aes(
Pvalue
dengximo9047
·
2020-06-23 03:16
python statsmodel 回归结果提取(回归系数、t值、
pvalue
、R方、、、、)
提取statsmodel里模型结果的各个元素以OLS回归结果为例相关函数官网链接:https://www.statsmodels.org/stable/search.html?q=OLSResults部分较常用的结果数值提取具体操作示例如下importstatsmodels.apiassm#模型训练model=sm.OLS(y,x).fit()#查看模型结果print(model.summary(
chongminglun
·
2020-06-22 22:53
数据分析
python
协方差
机器学习
统计学
《商务与经济统计》Python实现笔记(三)
b=[58,69,71,64,68]c=[48,57,59,47,49]stats.f_oneway(a,b,c)F_onewayResult(statistic=9.176470588235295,
pvalue
Duke_LH
·
2020-06-21 19:17
数据分析
2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异
第二种使用同意突变计算,计算的相关性很好image.png做一个T检验先看看是不是正态-目前看还算正态image.pngimage.pngTMB的结果高于cutoff与低于cutoffimage.png结果
Pvalue
Soliva
·
2020-06-06 23:50
ggplot2 绘制带星号和
Pvalue
值的相关系数热图
ggplot2绘制相关系数热图加显著性*和Pvaue值参考:哪里不会搜哪里,哈哈哈其实归根到底就是全文要敲用判断和paste()或者paste0()tidyverse::case_when()factor():重定义因子顺序takecolor下载链接也可以看我可能是R语言最全调色板:Paletteer包和自己慢慢收集的详细关于配色的操作library(tidyverse)library(resha
热衷组培的二货潜
·
2020-04-19 17:55
TCGA_08
GEO-1.热图:数值是数值型矩阵/数据框-2.箱线图:输入数据是一个数值型向量(数据)和一个有重复值的字符串向量(分组)差异分析:p值:越小差异越显著P值越小,-log10(
Pvalue
)越大,差异越显著
沈住氣
·
2020-04-17 23:20
第二章 技术
动态检测#includetemplateTypeOutsafe_reinterpret_cast(TypeIntIn){assert(sizeof(TypeIn)(tIn);}intmain(){void*
pValue
szn好色仙人
·
2020-04-08 05:11
heterosis SCA 和gd 关系
Com.ave.gd[,-c(1:3)])a<-rcorr(hete,type="pearson")write.csv(a$r,"corr_SCA_gd.csv")write.csv(a$P,"corr_SCA_gd_
pvalue
.csv
董八七
·
2020-04-07 21:21
Python - OptParse 分析命令行输入模块
OptParse支持一般性GNU的选项方法,包括:无参选项,-v有参选项,-
pvalue
,–para=value值参一体,-
pvalue
(不支持长参数)合并选项,-abc,-abcpvalue(最后一个可以是有参
fuyoufang
·
2020-03-27 01:34
R绘图:ggplot2绘制火山图
横坐标为Foldchange(倍数),越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为
Pvalue
(P值),值越大差异越显著。
谢俊飞
·
2020-03-11 15:42
简单实现angular2组件双向绑定
直接献上代码父组件import{Component,OnInit}from'@angular/core';@Component({selector:'ngx-input',templateUrl:`双向绑定{{
pvalue
琢磨先生lf
·
2020-03-01 12:48
C++学习笔记(动态内存)
double*
pvalue
=NULL;//初始化为null的指针
pvalue
=newdouble;//为变量请求内存deletepvalue;//释放
pvalue
所指向的内存如果自由存储区已被用完,可能无法成功分配内存
smallstrong
·
2020-03-01 08:26
plot散点图使用科学记数法展示p value
>pvalueplot(
pvalue
,ylim=c(1,10^-6),xlim=c(0,5))图做出来了,但是貌似什么问题都说明不了;那换用科学记数法的方式看看。
_eason_
·
2020-02-11 22:46
使用Scipy计算数据集的峰度和偏度
计算峰度和偏度的方法都在stats中,所以我们首先要导入stats:fromscipyimportstats峰度statistic,
pvalue
=stats.skewtest(set)#偏度print(
闻榴莲的猫
·
2020-02-09 20:58
动态设置Unity粒子发射速率
ParticleSystemtParticleSystem=pGo.GetComponentInChildren();tParticleSystem.emission.rate=newParticleSystem.MinMaxCurve(
pValue
白九a
·
2020-02-09 13:50
DESeq找差异基因+火山图
DESeq2)##要求对象必须是矩阵liver_gly2%dplyr::filter((log2FoldChange>1|log2FoldChange1|res$log2FoldChange<(-1)&res$
pvalue
PriscillaBai
·
2020-02-09 00:49
ggplot2 绘制带星号和
Pvalue
值的相关系数热图
ggplot2绘制相关系数热图加显著性*和Pvaue值参考:哪里不会搜哪里,哈哈哈其实归根到底就是全文要敲用判断和paste()或者paste0()tidyverse::case_when()factor():重定义因子顺序takecolor下载链接也可以看我可能是R语言最全调色板:Paletteer包和自己慢慢收集的详细关于配色的操作library(tidyverse)library(resha
二货潜
·
2020-02-02 03:35
缓冲区溢出的原因及危害
使得修改了边界之外的内存;比如在栈上分配的内存数组intiData[100],然后修改数组元素:for(inti=0;i9)//shouldbeif(iPos>9||iPos<0){return-1;}
pValue
fooboo
·
2020-01-08 07:53
医学临床试验文献统计方法解读(一)
文献中的统计术语包括:显著性水平(significancelevel):p值(
pvalue
);统计功效(statisticalpower):统计效应:1.组内相关系数(intraclasscorrelationcoefficient
Norman_Plus
·
2019-12-28 11:45
python中p-value的实现方式
-1)*2#two-sidedpvalue=Prob(abs(t)>tt)print't-statistic=%6.3fpvalue=%6.4f'%(tt,pval)t-statistic=0.391
pvalue
CS青雀
·
2019-12-16 16:40
R数据可视化11:相关性图
相关性图不过上图中给的信息相对冗余,因为颜色和图形大小都与相关性的大小有关,在我们作图的过程中可以考虑将相关性的大小和
pvalue
用颜色和大小分别表示。当然除此之外还有更加复杂
jlyq617
·
2019-12-06 07:45
Stage 1 数学基础:统计的步骤
P值
Pvalue
置信区间Confidenceinterval2.收集Datacollection质量控制非常重要。基础数据的质量决定了统计结果。连续变量Contin
AdelaZhou
·
2019-11-30 09:25
Time Series ARIMA
DickerFullertest是不是stationary.使用adfulleradfullertest出来的结果里包含了一个ADFTeststatistics,P-value,#oflags,#ofobservations.如果
Pvalue
98Future
·
2019-11-27 16:22
c语言指向常量的指针和常量指针
指向常量的指针:该指针指向的值不能改变,指针不是常量,所以可以修改指针的指向intmain(void){intvalue=10;/*定义一个指向常量的指针*/constint*
pValue
=&value
xtceetg
·
2019-10-31 16:16
指向常量的指针
常量指针
c/c++
pathway注释
输入:cufdiff生成的差异基因列表(log2fold_change的绝对值>1,
pvalue
<0.01)目的:在KEGG网站中,利用KEGGmapper工具进行pathway注释。
zypiner
·
2019-10-17 09:00
浅谈C#中堆和栈的区别(附上图解)
如果我们写出如下两段代码:代码段1:publicintAddFive(intpValue){intresult;result=
pValue
+5;returnresult;}代码段2:publicclassMyInt
·
2019-09-23 19:46
[ZHUHAI_Biotrainee]实战_GEO分析
library(GEOquery)eSetthr]=thrn[n0.01,'stable',ifelse(deg$logFC>logFC_t,'up',ifelse(deg$logFC%filter(
pvalue
ShanSly
·
2019-07-16 17:11
仿GWAS曼哈顿图
1.根据vcf文件获取一个类似曼哈顿图的input文件,只是第4列的
pvalue
值变为了区间的snpnumber如下:SNPCHRBPP1chr110000013622chr111000013193chr112000013214chr113000014265chr114000015006chr115000015127chr116000013878chr117000012359chr11800001
细雨春风
·
2019-05-21 16:54
生物信息学
FDR-P值是什么东西!
Qvalue需要利用公式从
pvalue
校正计算后得到,所以Qvalue通常又被称为adjustedpvalue。所以
caokai001
·
2018-12-11 20:17
故障诊断的几种时域故障计算(matlab2018)
常用的时域指标均值:u=mean(x)标准差:stdvalue=std(x)方差:sigm=var(x)峰峰值:P_
Pvalue
=max(x)-min(x)方根幅值(有量纲指标):Xr=mean(sqrt
hanlin2333
·
2018-11-16 22:29
statsmodels常用函数(更新中)
fromstatsmodels.tsa.stattoolsimportadfullerasADF导入ADF检验importnumpyasnpprint(ADF(np.random.rand(100)))#返回的结果有ADF值、p值等返回值:adf(flot):检验统计量;
pvalue
灰兔子-刘
·
2018-09-05 21:29
Python数据分析与挖掘
C++ 指针与引用
指针指针是一个变量,它存放了某一块内存的地址,指针应该这样定义:int*
pvalue
=NULL;type*指针变量=指向的内存地址指针所指向的空间需要在初始化时完成。
elGONG
·
2018-04-07 11:37
『STATISTICS』傻瓜弄懂t检验
现在前面因为我时常忘记t分布,假设检验,t检验,tvalue,
pvalue
的意思,所以各方整理出一套笔记,忘记时方便复习。
amazingmango
·
2017-11-05 21:46
统计
t分布
统计
关于P-value,及显著与多重检验校正
例如,通常说的
Pvalue
(Evalue是blast中一种特殊的
pvalue
)小于1%,就是说我们做出了一个判断,但这个判断
sober01
·
2017-10-14 16:29
C++动态内存
delete[]
pvalue
,释放内存。intmain(){int*p=NULL;p=newint;p=20;std::cout#include#defineMINI
路路Rol
·
2017-09-08 13:01
Python - 实现简单单链表
代码如下:classNode():def__init__(self,
pvalue
,pnext=None):self.
pvalue
=pvalueself.pnext=pnextdefCreateLinkedList
Jark_
·
2017-08-22 16:15
Python
Algorithm
Python
Coding
C++ 前置声明详解及实例
C++前置声明详解及实例【1】一般的前置函数声明见过最多的前置函数声明,基本格式代码如下:#includeusingnamespacestd;voidfun(charch,int*
pValue
,doubledValue
kaizen
·
2017-06-05 08:51
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及Bonferroni校正
pvalue
,qvalue,FDR数据分析中常碰见多重检验问题(multipletesting).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(FalseDiscove
Honglei_Ren
·
2016-04-13 15:11
ggplot左右两个y轴
两个ggplot图合并到一起,一个x轴两个y轴raw_data% dplyr::filter(grepl('GO',Term)&
PValue
% select(c(1,2,3,5))%>% dplyr::
tanzuozhev
·
2016-01-03 16:00
原子性获取最大值
原子性获取最大值 voidSet(int64_ti) { for(;;){ int64_tv=common::AtomicGet(
pValue
); if(common::AtomicCompareExchange
chenglinhust
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2015-11-20 16:00
Iterator
std; template <typename T> class Iterator { public: T& Value() { return *m_
pValue
·
2015-11-13 06:08
iterator
学习假设检验初步
假设检验初步这篇文章讲的相当不错,在这里总结一下 P:是原假设,也是准备拒绝的假设 当我们假设P成立的时候,可以从数据中观测到事件Q 然后判断Q是否为非常极端的(
pvalue
非常小<置信水平
·
2015-11-12 16:10
学习
Balanced and stabilized quicksort method
initialized at opposite ends of the array or partition to be sorted and an initial partition value
Pvalue
·
2015-11-11 13:25
Quicksort
Javascript获取地址参数
修改地址后的参数: <script> function getNewUrl(oldurl,paramname,
pvalue
){ var reg
·
2015-11-11 10:23
JavaScript
指针和数组及内存管理
int value = 10; int *
pvalue
= &value; 上面这个语句的内存模型是: 注意: &(取地址)操作符只对内存中存在的对象起作用,如
·
2015-11-11 09:12
内存管理
C#中堆和栈的区别分析(有待更新总结2)
如果我们写出如下两段代码: 代码段1: public int AddFive(int
pValue
) {
·
2015-11-11 00:39
C#
本地存储
Code public void SaveToIsolatedStorage(string pKey, string
pValue
) {
·
2015-10-30 10:37
本地存储
面试题
汉王机器视觉(软件工程师):1.以下变量
pValue
分别是什么类型?并请谈谈你对static和const的理解。
Allyli0022
·
2015-10-28 08:00
配置文件读写(c语言指针实现)
define_INC_CFG_OP_H #ifdef__cplusplus extern"C"{ #endif intGetCfgItem(char*pFileName/*in*/,char*pKey/*in*/,char*
pValue
my_sky2012
·
2015-10-12 13:00
白话空间统计之四:P值和Z得分(中)
另外,还要纠正一个说法,p是一个值(
pvalue
),而z是一个得分(zscores),上篇文章中,称谓出错了。就像上面那个PH试纸的标尺,从中间往两边延伸,表示酸碱的强度。
allenlu2008
·
2015-07-31 16:00
算法
global
arcgis
I
空间统计
空间自相关
Morans
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