r语言主成分分析

机器学习 | PCA 主成分分析 (Principal Ccnt Analysis)

通常用于高维数据降维。擒贼先擒王。我们为什么要进行降维？其实机器学习就是模拟一个人的成长过程，小时候有老师教，监督学习~开始的时候会教你这是什么那是什么，就是分类；当认识的差不多了。就需要自己去想，根据经验判断，就是回归；长大了，老师不见了，就需要自己去想，无监督学习~没有人告诉你是对是错了，只能靠自己的观察，收集信息，分门别类，就是聚类；事情越来越多，就需要断舍离，复杂问题简单化，降维。主——王
西皮呦·2023-12-21 19:01

R语言【invisible】——将控制台的输出模式调整为隐藏，只允许赋值后输出，返回对象的（临时）不可见副本

Packagebaseversion4.3.2invisible(x=NULL)参数【x】：一个任意的R对象，默认为NULL。如果希望函数返回的值可以赋值，但在未赋值时不打印，则可以使用该函数。f<-function(x){if(x){return(x)}else{return(invisible(x))}}f(1)f(0)只有f(1)显示结果：[1]1
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【cli】——cli_warn可以更便捷的在控制台输出警告信息

Packagecliversion3.6.2cli_warn(message,...,.envir=parent.frame())参数【message】：它是通过调用cli_bullets()进行格式化的。进一步地，还需要调用inline-makeup（内联标记）。参数【...】：传递给rlang::abort()，rlang::warn()或rlang::warn()的参数。参数【.envir】
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【assignOps】——通过超赋值符（＜＜-）向上层环境中的变量写入值，或者在上层环境中创建新变量并写入值

Packagebaseversion4.3.2在R语言中，处在某一个环境层的代码都拥有读入上一环境层的变量的权限，但相反地，若只通过标准的赋值运算符test_suprassign()[1]3>a错误
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言【cli】——通过cli_abort用 cli 格式的内容显示错误、警告或信息，内部调用cli_bullets和inline-makeup

cli_abort(message,...,call=.envir,.envir=parent.frame(),.frame=.envir)先从那些不需要下大力气理解的参数入手：参数【.envir】：进行万能表达式编译的环境。参数【.frame】：抛出上下文。默认用于参数【.trace_bottom】，当参数【.internal】为TRUE时，用于确定在内部错误中提及的内部软件包。参数【call】
ALittleHigh·2023-12-21 17:54

R语言机器学习与临床预测模型74--模型建立和验证的统计基础

R小盐准备介绍R语言机器学习与预测模型的学习笔记你想要的R语言学习资料都在这里，快来收藏关注【科研私家菜】01统计模型统计模型是一类数学模型，通常由一个或多个变量与近似现实相关的数学方程指定。
科研私家菜·2023-12-21 16:47

用Python画一个中国地图

为什么是Python先来聊聊为什么做数据分析一定要用Python或R语言。编程语言这么多种，Java,PHP都很成熟，但是为什么在最近热火的数据分析领域，很多人选择用Python语言？
小凶许打小脑斧·2023-12-21 15:12

R语言——文件读写（三）

目录一、获取数据二、读取文件三、写入文件四、读写Excel文件五、读写R格式的文件参考一、获取数据获取数据的三种途径：1.利用键盘来输入数据2.通过读取存储在外部文件上的数据3.通过访问数据库系统来获取数据edit()：定义一个数据编辑器，可直接输入修改数据，关闭编辑器，数据自动保存到变量中，注意这里需要将修改后的数据重新指向一个变量名，才可以成功保存fix()：可以直接修改并保存，不需要重新定义
Billie使劲学·2023-12-21 09:13

R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习技术应用

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。本教程针对
梦想的初衷~·2023-12-21 09:42

R语言——基本操作（二）

目录一、矩阵与数组二、列表三、数据框四、因子五、缺失数据六、字符串七、日期和时间参考一、矩阵与数组matrix：创建矩阵，nrow和ncol可以省略，但其值必须满足分配条件，否则会报错只写一个值则自动分配，默认按列分配byrow属性可以控制矩阵按行排列dimnames(m)：定义矩阵行和列的名字dim(x)：输出x的维度dim(x)<-c(2,5)：为x添加维度（创建数组），三个数字则为三维数组a
Billie使劲学·2023-12-21 09:41

R语言机器学习一揽子解决方案-tidymodels（Build a model）

本文为笔者从官网学习的代码实录，不对的地方请多指教！官网地址：https://www.tidymodels.org/官网介绍：Thetidymodelsframeworkisacollectionofpackagesformodelingandmachinelearningusingtidyverseprinciples.本次内容为getstarted部分的pipeline内容目录如下图内容目录载
灵活胖子的进步之路·2023-12-21 08:28

【R语言】logistic回归（一）批量单因素logistic回归

后续会继续分享一些R语言分析代码，欢迎大家一起讨论学习。
Moon_5237·2023-12-21 08:59

[原创][R语言]股票分析实战[3]:周级别涨幅趋势的相关性

[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父·2023-12-21 07:52

R语言：独立性检验函数

在R语言中，我们可以使用独立性检验函数来评估两个变量之间是否存在独立性关系。独立性检验是统计学中一种常用的方法，用于确定两个变量是否在统计上相互独立。
代码创造·2023-12-21 04:29

R语言中逻辑回归的R方求解

在R语言中，我们可以使用不同的函数和库来进行逻辑回归分析，并计算模型的R方（R-squared）值，以评估模型的拟合程度。R方是一种常见的统计指标，用于衡量回归模型对观测数据的拟合程度。
代码创造·2023-12-21 04:29

跟着PNAS学画图：R语言ggplot2分面的堆积柱形图

论文https://www.pnas.org/content/118/20/e2010588118Deathratesatspecificlifestagesmoldthesexgapinlifeexpectancyimage.png论文本地存储e2010588118.full.pdf很有意思的一篇论文，研究的内容是为什么女生比男生活的时间长（Whydowomenlivelongerthanmen
小明的数据分析笔记本·2023-12-21 03:40

R语言ggplot2绘制中国区域地图并添加河流信息的小栗子

下面是正文前几天看了几篇闫大佬绘制的中国沿海地区的地图（公众号：R语言数据分析指南），然后试着自己画了一下。大佬的代码里面只有中国主要河流的信息，没有区域河流信息。
小明的数据分析笔记本·2023-12-21 02:43

R语言|绘制组间差异柱状图

柱状图也是差异可视化图形的一种，今天小编来分享一下组间差异柱状图在R语言中的绘制方法，主要用的是ggplot2包，这个包功能的确很强大。
维凡生物·2023-12-21 01:45

变量类型转换：将变量转换为因子变量（R语言）

变量类型转换：将变量转换为因子变量（R语言）在R语言中，变量类型的转换是非常常见和重要的操作之一。其中，将变量转换为因子变量是一个常见的需求，特别是在数据分析和建模过程中。
独行侠影·2023-12-21 00:40

R语言入门系列：rep函数的用法

R语言入门系列：rep函数的用法在R语言中，rep函数是一个常用的函数，它用于创建重复的向量。这篇文章将详细介绍rep函数的用法，并提供相应的源代码示例。
独行侠影·2023-12-21 00:10

2019-12-05 Day4 学习R语言基础

安装R和Rstudio第一步：查看你的电脑用户名是中文还是英文如果是中文-百度[当Rstudio杠上中文用户名]（我这个电脑是英文）搜狗微信搜索：“果子学生信给自己一个全新的R语言环境”教程下载R语言https
卅衣·2023-12-20 23:47

解决R语言中文乱码问题

解决R语言中文乱码问题在R语言中，处理中文字符时可能会遇到乱码问题。这种问题通常出现在数据读取、数据处理和图形输出等环节。本文将介绍一些常见的乱码问题及其解决方法，并提供相应的源代码示例。
coding远方·2023-12-20 18:48

R语言--19

函数：定义函数mean,var,stderrmymeansqtest1(,4)#缺省值x=3[1]5>sqtest1(6,8)[1]10
白猫警长ic·2023-12-20 18:43

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图实践技术

R语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。
weixin_贾·2023-12-20 13:09

R：数据结构

中常见的数据结构向量矩阵数据框：经常使用的一种数据结构列表因子R中常见的数据结构数值型：数值可以用于直接结算，加减乘除字符串型：可以进行连接，转换，提取等逻辑型：真或者假日期型1.2向量向量概述向量是R语言中最基本的数据结构
尔玉RGX·2023-12-20 12:59

R语言--20/21/22

cor相关性：cor():cor(x,y,method=c("pearson","kendall","spearman"))计算x,y的相关性，x,y需要为向量，若为矩阵则计算x列，y列的相关性。method指定相关性计算的方法,默认情况下是Pearson相关性系数。Pearson，spearman计算方法见笔记本cor.test():cor.test()使用方法.pngcor()只给出相关性值，
白猫警长ic·2023-12-20 11:28

R语言专题班（训练营：2023.10.23~10.30）

茗创科技专注于脑科学，涵盖（EEG/ERP，fMRI，结构像，DTI，ASL，FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑科学课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技·2023-12-20 09:17

【R语言】estimate包计算免疫相关分值

前面小编给大家介绍了☞肿瘤免疫分值数据库—ESTIMATE☞肿瘤微环境生信高分套路☞如何合并ESTIMATEScore和生存时间☞合并TCGA表达谱数据，生存状态和生存时间在介绍ESTIMATE数据库的时候，小编就提到，目前该数据库中只提供25种肿瘤的Stromalscore,Immunescore和ESTIMATEscore这三种分值。（https://bioinformatics.mdande
生信交流平台·2023-12-20 08:44

文献计量学方法与应用、主题确定、检索与数据采集、VOSviewer可视化绘图、Citespace可视化绘图、R语言文献计量学绘图分析

目录一、文献计量学方法与应用简介二、主题确定、检索与数据采集三、VOSviewer可视化绘图四、Citespace可视化绘图五、R语言文献计量学绘图分析六、论文写作七、论文投稿更多应用文献计量学是指用数学和统计学的方法
小艳加油·2023-12-20 06:10

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图丨R语言基础、tidyverse数据清洗、多元统计分析、随机森林模型、回归及混合效应模型、结构方程模型、统计结果作图

R语言的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。
小艳加油·2023-12-20 06:01

基于主成分分析和神经网络的人脸识别研究

1引言1.1文献综述近年来，随着人脸识别技术的发展和研究的深入提出了很多成熟的识别算法如基于人工神经网络算法、基于模板匹配的算法、基于隐马尔科夫模型的算法等各种算法都有各自的优缺点。多种算法结合是目前人脸识别领域最受关注的方法，其优势在于综合利用了人脸面部的各种特征信息将各种成熟算法的优势相结合与单一算法相比，大大提高了人脸识别的效率和准确率。1.2研究思路任务一:使用ORL人脸数据集，将数据集切
ZT-Brillly·2023-12-20 04:44

GO.db:存储Gene Ontology信息的R包

在生信分析领域，R语言由于其简单易用的特点和良好的生态环境，占用重要的一席之地。其中，Bioconductor作为生信分析专用的R语言社区，提供了许多的R包。
生信修炼手册·2023-12-20 02:58

R语言采集获取58商铺出租转让信息

在R语言中，你可以使用rvest等包从58等网站抓取商铺出租和转让信息。以下是一个使用伪代码的步骤计划：1、加载必要的R库（如rvest，htt
q56731523·2023-12-19 22:48

R语言绘制频率直方图

频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式，同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型；R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便，但是当遇到多组数据的时候就不如ggplot2绘制来的方便。1.基础做图hist函数hist(rnorm(200),col='blue',border='yellow',main='',xlab='')1.1多图展示par(mfrow=c(2,3)
种地的pele·2023-12-19 22:31

R语言之简单图表制作1

比如简单画一个图foo=5],y[y>=5],pch=4,col="darkmagenta",cex=2)points(x[y=5&x-5&y=5&x-5&y15)&(y>-5&y15)&(y>-5&y<5)])lines(x,y,lty=4)arrows(x0=8,y0=14,x1=11,y1=2.5)legend("bottomleft",legend=c("overallprocess","
知识分享小能手·2023-12-19 22:25

R绘图_几种多重比较方法

本文参考:基于R语言的七种多重比较方法若研究目的是方差分析有统计学差异后，想知道哪些组间的均数有差异，便是事后比较。事后比较的常用方法有SNK、Turkey、Scheffe和Bonferroni法。
谢俊飞·2023-12-19 21:14

学习小组Day4笔记--Jeremy

R语言基本操作Rstudio界面图片来源于生信星球查看目录及文件查看目录及文件基本算术基本算术赋值与删除赋值与删除作图图1图2
Jeremy_bin·2023-12-19 20:53

R语言基础（1）——数字、字符与向量

向量1、向量的赋值第一种赋值方法：c()xx#进一步有y3)#结果显示为FALSEany(c(1,2,3,4,5,6)>3)#结果显示为TRUE6、缺失数据用NA表示某处的数据缺省或缺失x<-c(1,2,3,NA)y<-is.na(x)#结果为is.na()函数是检测缺失数据的函数，如果返回值为值（TRUE），则说明此数据是缺失数据，如果返回值为假（FALSE），则此数据不是缺失数据
令平子·2023-12-19 17:29

R语言：转换—宽数据↔长数据

博客来源于我的语雀专栏：R语言·语雀更多内容同步更新请关注我的语雀：令平子·语雀参考资料：部分已引用到各段落宽转长二维数据转长r-Reshapingdata.framefromwidetolongformat-StackOverflow
令平子·2023-12-19 17:29

【R语言】--- 回归分析最优拟合模型及作图

因变量和自变量间的拟合关系对于生态学而言极其重要，很多因变量和自变量间关系是一元线性回归，然而很多数据并不一定是直线关系，而是需要探索其曲线拟合关系。这种曲线关系并非直观看出，而是需要进行统计检验，通过比较拟合度及其显著性，来选择最优拟合模型。赤池信息准则（Akaikeinformationcriterion,AIC）和贝叶斯信息准则（Bayesianinformationcriterion,BI
生态数据·2023-12-19 15:05

跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言做方差分解的一个简单小例子

之前好多人在公众号留言问这个方差分解的内容，但是之前自己也没有听说过。最近看到有人分享了公众号推文一种简单易行的方差分解方法。看了这个推文我目前理解的是方差分解的主要作用是量化回归模型Y=b0+b1x1+b2x2+…中x1,x2,x3…对Y贡献的相对大小，以及不同X所属的因素类别（如生物因素，非生物因素）对Y的贡献大小。这篇推文以已经发表的论文中的数据为例子进行了介绍，论文是image.png这篇
小明的数据分析笔记本·2023-12-19 15:22

R语言——基本操作（一）

目录一、基本操作二、R包的安装及使用三、获取帮助四、内置数据集五、数据结构六、向量索引七、向量运算参考Rstudio控制台常用快捷键Ctrl+↑：查看所有历史记录，比直接使用↑查找更方便Esc：中断操作，可中断未完成的操作（未完成回车后是+），也可以清空命令。Ctrl+L：清空屏幕Alt+Shift+K：显示Rstudio中所有的快捷操作一、基本操作getwd()：显示当前工作目录setwd('E
Billie使劲学·2023-12-19 13:00

《数量生态学：R语言的应用》—第四章聚类分析1 概述

数量生态学：R语言的应用—第四章聚类分析之前我们了解了关联测度与矩阵，主要是Q模式与R模式。从今天开始给大家带来《数量生态学：R语言的应用》—第四章聚类分析。
fafu生信小蘑菇·2023-12-19 10:09

R语言中do.call函数学习

虽然R语言有类型很丰富的数据结构，但是很多时候数据结构比较复杂，那么基本就会用到list这种结构的数据类型。
学好生信·2023-12-19 10:18

使用R语言对SSR数据做主成分分析（PCA）的一个简单小例子

昨天的推文介绍了使用R语言对比对后的DNA序列做主成分分析的一个简单小例子，推文下有朋友留言问如何对0,1矩阵做主成分分析（PCA）查了一下参考资料找到了一个办法参考资料的链接1、https://cran.r-project.org
小明的数据分析笔记本·2023-12-19 09:00

MATLAB 主成分分析PCA拟合平面点云 （42）

MATLAB主成分分析PCA拟合平面点云（42）一、算法介绍二、算法实现一、算法介绍主成分分析（PrincipalComponentAnalysis，PCA）是一种常用的数据降维和特征提取技术。
点云学徒·2023-12-19 06:02

R语言怎么绘制热图（一）

1.什么是热图？在组学研究的相关文章中，我们常常可以看到热图（Heatmap）的展示。这些红绿相间且色彩变化丰富的热图总是能吸引读者的眼球，从而为文章增添不少亮色。当然，作为严谨的科学研究论文，图表的展示当然不可能仅仅是为了好看。热图作为一种对实验数据及其分析结果的直观的表达方式，在很多文章中都有着不可或缺的地位。它是一种将规则化矩阵数据转换成颜色色调的常用的可视化方法，其中每个单元格对应数据的某
心有灵犀啦·2023-12-19 05:01

JupyterNotebook VS JupyterLab 如果jupyter安装成功，点击jupyterlab即可进入lab环境

一般来说，如果是使用R语言的话，使用Rstudio居多，使用Python的话，使用Jupyter居多。
生信小博士·2023-12-19 05:44

大数据/人工智能/EXCEL/R语言精品教材推荐

泰迪智能科技携手人民邮电出版社通过采用任务式、项目式等多种教材编写模式，教材内容注重实践能力培养，贴合教师教学实际和学生实践实验，已经被1500余所院校选用为教材。图书优势理实一体化本系列教材注重学生的实践能力培养，针对高校实践教学中的痛点，首次提出“鱼骨教学法”的概念。以企业真实需求为导向，学生学习技能时紧紧围绕企业实际应用需求，将学生需掌握的理论知识，通过企业案例的形式进行衔接，达到知行合一、
泰迪智能科技·2023-12-18 19:57

R语言【rgbif】——什么是多值传参？如何在rgbif中一次性传递多个值？多值传参时的要求有哪些？

rgbif版本：3.7.8.1什么是多值传参？您是否在使用rgbif时设想过，给某个参数一次性传递许多个值，它将根据这些值独立地进行请求，各自返回独立的结果。rgbif支持这种工作模式，但是具体的细节需要进一步地学习才能掌握，避免在使用时出现事与愿违的结果。如何在rgbif中一次性传递多个值？在使用rgbif的方法时，向某个参数传入多个值，用户的表达语句差之毫厘，代码结果就会失之千里。比如说下面的
ALittleHigh·2023-12-18 10:50
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