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r语言随机森林
r 语言c函数,
R语言
常用函数详解
R语言
对于我们生信人员来讲,再熟悉不过,然而任何一门语言想要学好,必须经过常年的日积月累才可以做到,在这里,我列举R中常用的函数的用法,供大家学习。
李士季
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2023-04-10 17:12
r
语言c函数
R语言
apply函数族
R语言
apply函数族apply函数lapply函数sapply函数vapply函数mapply函数apply函数现有数据如下,请求出每一行的最大值,和每一列的最小值每一行的最大值apply(a,1,max
hence..
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2023-04-10 17:09
R语言数据分析
r语言
开发语言
R-$和@符号的意义
R-$和@符号的意义
R语言
中,$表示从一个dataframe中取出某一列数据@是从R的类实例里面读取数据,
[email protected]
就是从对象实例x中取出colors,而这个colors本身又是个
qq_39306047
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2023-04-10 17:38
R
R语言
中的apply函数用法
刚开始接触
R语言
时,会听到各种的
R语言
使用技巧,其中最重要的一条就是不要用循环,效率特别低,要用向量计算代替循环计算。那么,这是为什么呢?
hs6605015
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2023-04-10 17:35
R语言
--向量化计算(apply族函数)
R语言
最优秀的是它的向量化编程,这其中apply族函数扮演了非常重要的角色。apply族函数是由apply、sapply、lapply、mapply、tapply等函数组成的。
FTDdata
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2023-04-10 17:35
R语言
r语言
R语言
---scale函数,match函数和%in%详解
R语言
---scale函数,match函数详解1.scale函数2.两个向量匹配match和%in%(1)match函数(2)成员判断1.scale函数scale:ScalingandCenteringofMatrix-likeObjects
我是大南瓜
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2023-04-10 17:33
R语言
r语言
R语言
中apply系列函数详解
文章目录applylapply,sapply,vapplyrapplytapplymapply
R语言
系列:编程基础循环语句向量、矩阵和数组列表、数据帧排序函数apply系列函数
R语言
的循环效率并不高,所以并不推荐循环以及循环嵌套
微小冷
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2023-04-10 17:00
R语言
r语言
apply
rapply
mapply
函数式
枣枣记事之凌晨已过
以后要好好学stata,
R语言
什么的。
晾枣
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2023-04-10 14:48
R语言
-19主成分回归与因子分析
主成分分析library(psych)#画出碎石图确定数据集all的7到12列的数据的主成分个数fa.parallel(all[7:12],fa='pc',n.iter=100,show.legend=FALSE)#抽取出主成分,这里nfactors设置为2,#rotate指定旋转的方式为最大方差旋转(varimax),将成分载荷阵变得更容易解释#score为True计算出主成分得分data2_p
周一ing
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2023-04-10 13:23
长江流域土地利用与土地覆盖数据(1985-2020)
长江流域土地利用与土地覆被数据(1985-2020)简介本文利用1985-2020年Landsat数据,获取了长江流域每年的LULC地图,利用改进的
随机森林
方法将LULC的总体平均准确率提高到91.75%
树谷-胡老师
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2023-04-10 07:44
资源
arcgis
数据可视化的常用在线图表工具推荐
想要通过数据得到美观的图表,除了基础版的excel,专业版的PowerBI和Tableau、技术版的python-matplotlib库,
R语言
等等,还有一些比基础版较为高阶一点且着重于图表美化的在线工具
程what
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2023-04-10 06:34
R语言
分析微生物组数据代码示例大全
另一方面也让
R语言
的入门变得更加容易,这是生信小白的福音。,也是目前靠这玩意吃饭者的噩耗!这几个网站不仅给出我们苦苦寻找的分析R代码,同样重要的是他们还都给出方便易得的示例
周运来就是我
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2023-04-10 05:28
R语言
获取 GO/KEGG 中某一通路的基因集
有时候我们想看某一特定通路的富集情况,这时就需要获取该通路的基因集。一、从GO中获取下载脚本getGoTerm.R,获取所有的GOgeneSet,然后保存为RData,因为get_GO_data这一步非常耗时。source("getGoTerm.R")GO_DATAgeneSet$`TypeIIdiabetesmellitus-Homosapiens(human)`[1]"INS""INSR""I
正经昵称征集中
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2023-04-10 03:29
跟着Nature Genetics 学画图:
R语言
ggplot2画世界地图的简单小例子
论文是Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png这篇论文的数据是公开的,我们可以试着用公开的数据复现一下论文中用来展示数据的图。第一个图是使用地图来展示实验样本的地理分布。论文中写道画图是使用ggplot2,作图数据来自theNatu
小明的数据分析笔记本
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2023-04-10 03:22
随机森林
回归算法讲解
随机森林
(RandomForest)是一种基于集成学习的机器学习算法,被广泛用于回归问题。它通过使用多个决策树对数据进行建模,并将它们的预测结果进行集成,从而提高了模型的性能和稳定性。
爱吃熊掌的鱼
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2023-04-10 02:19
机器学习
随机森林
回归
【
R语言
】--- ggplot2绘制折线图
折线图一般用于描述一维变量随着某一连续变量(通常为时间)变化的情况。即折线图最适合描述时间序列数据的变化情况。也可随着有序离散变量变化。本文介绍ggplot2包的geom_line()函数绘制折线图。绘制方法是首先调用ggplot()函数选定数据集,并在aes参数中指明横轴纵轴。然后调用条形图函数geom_line()函数绘制出基本折线图。示例案例#利用ggplot2包自带的数据BOD绘制折线图#
生态数据
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2023-04-10 01:19
R语言
教程——Day3 变量 数据类型(1)
变量常量是内存中用于保存固定值的单元,比如1,字母abd,是无法更改的;而变量相当于一个代号,我们可以把数字、表、字符串甚至是图片存储在变量里,反复使用,更改,删除。先操作一下以下的代码。创建变量a,通过aa[1]1更改变量a的值,只需要重新赋值就会覆盖原有的值>aa[1]3查看工作空间有哪些变量,发现有了变量a>ls()[1]"a""al""b""e1""f""pts"删除变量a>rm(a)>l
LibertyStone
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2023-04-09 22:24
PyTorch深度学习实战 | 基于多层感知机模型和
随机森林
模型的某地房价预测
简介:在现实生活中,除了分类问题外,也存在很多需要预测出具体值的回归问题,例如年龄预测、房价预测、股价预测等。相比分类问题而言,回归问题输出类型为一个连续值,如下表所示为两者的区别。在本文中,将完成房价预测这一回归问题。■分类问题与回归问题区别对于一个回归问题,从简单到复杂,可以采取的模型有多层感知机、SVR、回归森林算法等,下面将介绍如何使用这些算法完成这一任务。01、使用MLP实现房价预测首先
TiAmo zhang
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2023-04-09 20:11
深度学习
深度学习
pytorch
随机森林
R语言
:多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包)
欢迎大家关注我的公众号:一只勤奋的科研喵文章来源:
R语言
|12.森林图-1:多因素Cox回归模型森林图(基于forestplot包)本期开始介绍Cox回归模型可视化。
小毛竹_mxd
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2023-04-09 16:31
R语言
决策树
决策树是以树的形式表示选择及其结果的图。图中的节点表示事件或选择,并且图的边缘表示决策规则或条件。它主要用于使用R的机器学习和数据挖掘应用程序。决策树的使用的例子是-预测电子邮件是垃圾邮件或非垃圾邮件,预测肿瘤癌变,或者基于这些因素预测贷款的信用风险。通常,使用观测数据(也称为训练数据)来创建模型。然后使用一组验证数据来验证和改进模型。R具有用于创建和可视化决策树的包。对于新的预测变量集合,我们使
yuanyb
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2023-04-09 16:21
XGBoost(三):Python语言实现
原文链接:XGBoost(三):Python语言实现微信公众号:机器学习养成记上篇文章介绍了XGBoost在
R语言
中的实现方法(XGBoost(二):
R语言
实现),本篇文章接着来介绍XGBoost在Python
三猫后端
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2023-04-09 13:42
R语言
之空间数据操作
求和计算3、栅格重分类矢量数据的读取5、栅格裁剪(Crop)6、栅格掩膜(Mask)裁剪与掩膜需要注意的地方关于数据投影信息的问题空间数据存储可视化制图(基于ggplot2)Raster包的函数介绍前言
R语言
作为一门开源的统计分析及可视化语言
Giser@lin
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2023-04-09 10:42
R语言
r语言
开发语言
经验分享
学习
R语言
学习笔记 |
R语言
的入门
文章目录前言
R语言
是什么?为什么要学习
R语言
?学习
R语言
困难吗?
Giser@lin
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2023-04-09 10:41
R语言
经验分享
r语言
R语言
绘制三元相图(ggtern包)
三元相图的绘制绘制工具
R语言
我比较喜欢用ggplo
Giser@lin
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2023-04-09 10:41
R语言
r语言
经验分享
学习小组Day4笔记--善良土豆
R语言
开车今天的学习内容:1.安装R(基础)和Rstudio(人性化一些的界面)2.粗略了解
R语言
是什么,干什么的,认识Rstudio的工作界面3.完成第一个R做的图4.学会外观设置和基本操作小提示:在安装
善良土豆
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2023-04-09 05:22
各种机器学习算法的应用场景
随机森林
平均来说最强,但也只在9.9%的数据集上拿到了第一,优点是鲜有短板。SVM的平均水平紧随其后,在10.7%的数据集上拿到第一。神经网络(13.2%)和boosting(~9%)表现不错。
郑佳露
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2023-04-09 03:16
2020-05-19 第十章 决策树与
随机森林
(python)
01决策树节点字段的选择模型介绍决策树属于经典的十大数据挖掘算法之一,是一种类似于流程图的树结构,其规则就是IF...THEN...的思想,可以用于数值型因变量的预测和离散型因变量的分类。该算法简单直观、通俗易懂,不需要研究者掌握任何领域知识或复杂的数学推理,而且算法的结果输出具有很强的解释性。image.png图中的决策树呈现自顶向下的生长过程,深色的椭圆表示树的根节点;浅色的椭圆表示树的中间节
程凉皮儿
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2023-04-09 02:31
excel处置4000行数据卡_【
R语言
】5行代码批量合并Excel文件,并增加文件来源列...
看到一篇文章,裴帅帅:Python使用9行代码批量合并Excel文件zhuanlan.zhihu.com咱们
R语言
也不能落后啊,5行代码批量合并Excel文件,再多做一步:增加文件来源列。
weixin_39746382
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2023-04-09 02:35
excel处置4000行数据卡
r语言合并多个csv文件
r语言按列合并两个向量
uni-app
list
2列
基于DEAP的脑电情绪识别(模型为SVM,KNN和决策树,
随机森林
)完整代码分析
源码见个人主页:https://download.csdn.net/download/qq_45874683/87667984基于DEAP的脑电情绪识别(模型为SVM,KNN和决策树,
随机森林
)完整代码
脑电永不过时
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2023-04-09 01:56
脑电情绪识别
决策树
随机森林
机器学习
高级算法梳理之
随机森林
本系列将重点续写集成算法,其中包括
随机森林
(RF)—>GBDT—>XGB—>LightGBM,本文将重点介绍
随机森林
算法(RF)。
阴天了
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2023-04-09 00:00
机器学习
随机森林算法
集成学习
boosting
bagging
【案例实践】
R语言
多元数据统计分析在生态环境中的实践应用
查看原文>>>
R语言
生物群落分析绘图、多元统计分析、CMIP6、遥感碳储量、GEE林业、InVEST等生态环境领域研究中常常面对众多的不同类型的数据或变量,当要同时分析多个因变量(y)时需要用到多元统计分析
吹翻书页的风
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2023-04-08 23:00
农林生态遥感
环境科学
数据语言
统计分析
r语言
数据挖掘
多元数据统计分析
混合效应模型
回归分析
基于单细胞测序的蛋白活性推断(PISCES)分析流程笔记,凎!
本流程需要一点点
R语言
与linux基础,我都是在生信技能树学的=。=!流程中做的是自己的项目,所以没有把结果图放上来;有一说一,我想设置付费阅读来着,但是我钻不够不让弄=。=!
喂鸡组的阿翔
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2023-04-08 23:01
C6_Decision Tree 决策树初探 以及安装Graphviz可视化生成的决策树
决策树和svm一样是一种通用机器学习算法既可以做回归,也可以做分类同时也是RandomForest
随机森林
的基本组件iris数据集安德森鸢尾花卉数据集,是一类多重变量分析的数据集。
DIO哒
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2023-04-08 20:03
R语言
实践——chronosphere入门(古地理图+古地理坐标重建)
目录chronosphere简介功能结构1.RasterArray2.SpatialArray访问RasterArray和SpatialArray的属性和功能构建子集和重组1.挑选图层(layer)——双方括号2.单方括号从raster和sp中继承的功能1.RasterArray2.SpatialArray绘图调色板RasterLayer3.RasterArray添加一个统一的图例编辑Raster
ALittleHigh
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2023-04-08 19:18
r语言
开发语言
R语言
实践——古今地理坐标点转换(rgplates)
1.安装rgplatesinstall.packages("rgplates")2.调用rgplateslibrary(rgplates)3.快速上手3.1单个坐标点转换计算当今坐标点(95,54)在140Ma(百万年前)的古坐标输入reconstruct(matrix(c(95,54),nrow=1),140,model="SETON2012")输出paleolongpaleolat[1,]84
ALittleHigh
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2023-04-08 19:48
R语言
r语言
开发语言
R语言
学习笔记
个人学习
R语言
过程中的记录,仅供个人查阅。
小琳子要开心呀
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2023-04-08 19:14
R语言
r语言
Seurat V5 | 最火的单细胞测序分析工具重磅更新啦!~
该工具基于
R语言
编写,使用了许多先进的统计学和机器学习算法,可以对scRNA-seq数据进行细胞聚类、细胞亚群鉴定、基因差异表达分析等。
生信漫卷
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2023-04-08 19:36
后端
R语言
实践——ggplot2+ggrepel绘制散点+优化注释文本位置
简介书接adjustText实践——调整matplotlib散点图标签,避免重复上文中,matplotlib+adjustText对于我的实例来说并没有起到很好的效果。所以,博主决定在R中利用gglot2+ggrepel绘制,期待效果。操作过程博主不常使用R,在此过程中详细记录每一步骤,以作备忘。1.R读取数据(openxlsx)library(openxlsx)fossils=read.xlsx
ALittleHigh
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2023-04-08 18:28
R语言
r语言
开发语言
R语言
基础教程 | 文件的输入与输出
做生物信息分析,少不了的就是数据,比如转录组的数据,无论是下载的还是测序的,用R进行分析,就必须将这些数据读入,分析的结果,比如一些图,就少不了输出,因此,文件的读写在数据分析中是比较常用的。一、读写文件1.从文件中读取数据库或矩阵read.table()函数是R最基本函数之一,主要用来读取矩形表格数据。Usageread.table(file,header=FALSE,sep="",quote=
生信师姐
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2023-04-08 15:28
R语言
边学边记5-数据的提取
>mtcarsmpgcyldisphpdratwtqsecvsamMazdaRX421.06160.01103.902.62016.4601MazdaRX4Wag21.06160.01103.902.87517.0201Datsun71022.84108.0933.852.32018.6111Hornet4Drive21.46258.01103.083.21519.4410HornetSporta
Jerry_5543
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2023-04-08 15:42
跟着Nature学作图:
R语言
corrplot包画热图展示相关系数
论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接,可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的
小明的数据分析笔记本
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2023-04-08 14:44
代码分享|
R语言
使用ARIMA模型进行时间序列分析
最近我们被客户要求撰写关于ARIMA的研究报告,包括一些图形和统计输出。时间序列分析是一种数据分析,用于检查数据在一段时间内的行为。有许多技术可用于预测绘图图上的时间序列对象,但ARIMA模型是其中使用最广泛的方法。时间序列预测时间序列预测是借助对具有历史数据的数据集使用的一些统计工具和方法来预测未来值的过程。时间序列预测的一些应用是:预测股票价格天气预报预测产品的销量ARIMA模型ARIMA代表
拓端研究室
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2023-04-08 14:18
R语言
机器学习
r语言
python
R语言
文本和线段一起画geomtextpath包
https://github.com/AllanCameron/geomtextpathimage.png昨天看到的这个图,红色框内的不知道是如何实现的,今天看到这个图的代码是使用geomtextpath这个R包做的github主页是https://github.com/AllanCameron/geomtextpath主页上有很多例子
小明的数据分析笔记本
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2023-04-08 14:50
二元置信椭圆
r语言
_绘图(二元关系与多元关系)_R
参考书《
R语言
实战(第2版)》;作者RobertI.Kabacoff[美];译者王小宁、刘撷芯、黄俊文等。建议购买正版图书学习。高密度散点图首先,感受一下什么是高密度:能看出x、y有什么关系吗?
weixin_39669761
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2023-04-08 13:11
二元置信椭圆r语言
二元置信椭圆
r语言
_
R语言
第4章 初级绘图(6)
分析数据间的关系散点矩阵图如果数据框是多维数据,那么plot函数将绘制出两两之间散点图组合成为散点矩阵图(matrixofscatterplots)。散点矩阵图将多个散点图组合起来,以便可以同时浏览多个二元变量关系,一定程度上克服了在平面上展示高维数据分布情况的困难。示例:plot函数plot(iris[,:4])pairs函数参数参数解释x数值型的矩阵或者数据框,作为散点的坐标,逻辑性和因子型会
weixin_40000702
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2023-04-08 13:11
二元置信椭圆r语言
学习小组Day5笔记--Xiaofan1991
R语言
正式开始一、数据类型重点掌握重点掌握向量和数据框二、读取本地数据read.table函数要重点掌握read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)a<
xiaofan1991
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2023-04-08 12:19
R语言
基础和画图相关资料
http://www.r-project.org/R的官方网站http://cran.r-project.org/manuals.htmlR官方文档http://www.bioconductor.org/R在生物学里面的应用,主要是芯片数据.http://www.biosino.org/R/R-doc/R的一些中文文档http://cran.r-project.org/doc/Rnews/R的官方
统计大师
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2023-04-08 11:27
大数据分析案例-基于XGBoost算法构建二手车价格评估模型
如果文章对你有帮助的话,欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴,希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于
随机森林
算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于
随机森林
算法的商品评价情感分析大数据分析案例
艾派森
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2023-04-08 11:07
大数据分析案例合集
python
数据挖掘
机器学习
Seurat4.0系列教程1:标准流程
R语言
和Seurat已以势如破竹之势进入4.0时代,天问一号探测器已进入火星乌托邦平原了,你还不会单细胞吗?那么为了不被时代抛弃的太远,跟着我们一起通过学习seurat系列教程入门单细胞吧。
Seurat_Satija
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2023-04-08 05:33
学大数据需要什么语言基础?,学前必知
首先,学大数据是需要有java,python和
R语言
的基础。1)Java学习到什么样的程度才可以学大数据呢?java需要学会javaSE即可。javaweb,javaee对于大数据用不到。
cuijiao7259
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2023-04-08 03:41
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