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r语言随机森林
R语言
安装第三方包的方法
转载:https://biozx.top/R-install-packages.html从CRAN(https://cran.r-project.org/)安装第三方包的方法:>install.packages("coefplot")第二种:从bioconductor安装从bioconductor(http://www.bioconductor.org/)安装第三方包的方法:>source("ht
我是爱哭虫小鱼
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2023-04-14 12:44
R语言
ggplot2 绘图入门
R语言
最擅长绘图。
R语言
最擅长的绘图包是ggplot2,由于很多朋友没有接触过ggplot2,必须要对其语言方式有个初步的认识。所以入门学习是必须的。
张朝辉_b688
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2023-04-14 12:58
结构方程模型(SEM)高阶应用系列
我们前期推出的《基于
R语言
结构方程模型》通过结构方程原理介绍、结构方程全局和局域估计、模型构建和调整、潜变量分析、复合变量分析及结构方程贝叶斯方法实现等一系列专题的介绍及大量案例讲解,由浅入深地系统介绍了结构方程模型的建立
Mr.靳靳477302280
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2023-04-14 12:25
r语言
机器学习
结构方程
贝叶斯
统计学入门(零):协方差,皮尔逊系数及斯皮尔曼系数的
R语言
实现
前言:
R语言
是实践统计学和机器学习的良好工具,个人觉得相比Python比较容易学习。
FrenchOldDriver
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2023-04-14 11:35
统计学/数据处理/机器学习
机器学习
数据挖掘
r语言
统计学
机器学习(八):集成学习
按照个体学习器的生成方式,集成学习可分为两类:序列集成方法,即个体学习器存在强依赖关系,必须串行生成,如Boosting;并行集成方法,即个体学习器不存在强依赖关系,可以并行生成,如Bagging,
随机森林
fromeast
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2023-04-14 10:51
R语言
机器学习与临床预测模型27--模型校准度评价
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01模型校准度评价一个好的疾病风险预测模型
科研私家菜
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2023-04-14 09:17
R语言
新知识2019-12-02
1、建立简单的二表连接:加载sqldf包,利用sql语句建立二表连接colnames(test6)[3]=c("素材片段")#修改列名称library(sqldf)#加载包test12021=sqldf("selectname,素材片段,sum,创意点名称fromtest6,scbwheretest6.素材片段=scb.素材片段")或者,在R里面利用%in%进行赋值,很麻烦。2、按照条件进行分组计
小白进修日志
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2023-04-14 08:03
学习小组Day4笔记--apple
今天是开始学习
R语言
的一天,由于前期已经有一部分了解,R也已经安装完毕,先说说一些tips前期基础一定要打好,书一定要认真看,推荐《
R语言
实战》做好不断报错的准备,其实慢慢掌握来自于不断解决各种报错,所以心态一定摆好
apple仔_6967
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2023-04-14 07:19
R语言
ggplot2作图的两套配色方案备选
第一个在邮箱看到了苹果的广告邮件,这个HomePodmini是啥产品不太清楚,音响吗?这个不管了,啥产品自己也买不起哈哈哈,第一眼见到感觉配色确实很好看,如果应用到我们的科研数据可视化里应该也不错image.png把颜色摘下来做个柱形图看看library(ggplot2)df<-data.frame(x=LETTERS[1:5],y=c(1,2,3,2,1))colors<-c("#c6c7c9"
小明的数据分析笔记本
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2023-04-14 04:21
利用python机器学习受试者声音数据早期发现帕金森病(全代码)
我们将在这里使用XGBoost、KNN算法、支持向量机(SVM)、
随机森林
算法,并利用著名的帕金森声音资料数据集进行全代码演示,数据集下载链接在代码开始之初给大家粘贴过去。
飞时过
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2023-04-14 03:15
python
机器学习
数据分析
学习小组Day4笔记--Monomania
2020年4月17日Day4:
R语言
基础今天学习的主要内容是
R语言
的基础。
Just_Monomania
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2023-04-14 01:02
R语言
学习.1-R安装及向量介绍
打底裤品牌可以‘
R语言
’,也可是‘python’。不过大多数人穿的都是
R语言
牌。建议你也先穿这个牌子。穿破了以后可以再换新的。打底裤穿好,再穿个裤子。
Seurat_
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2023-04-13 23:05
《学习小组Day4笔记--sy》
R语言
学习
R语言
作图plot(rnorm(20,3,4))画出均值为3,方差为4的正态分布随机出现20个数的点图plot.pngboxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species
shu_yi
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2023-04-13 22:57
R语言
作图——Beeswarm plot拓展
从2018开始,小仙开始在公众号上分享
R语言
作图系列的文章,虽然是龟速更新,但到现在也是有了不少文章,常见的图表类型也画差不多了。
生信了
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2023-04-13 22:52
特征归因(Feature Attribution)
随机森林
中的相关特征具有较高的重要性,许多基于灵敏度分析的方法会置换特征,当置换后的特征与另一特征具有某种依赖性时,此关联将断开,并且所得数据点将外推到分布之外的区域。
Kenny_SI
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2023-04-13 19:36
可解释性
未来已来,OpenHarmony 3.2 Release发布,迈入发展新阶段
OpenHarmony3.2Release为开发者带来了什么ArkUI组件能力增强UI界面开发支持一次开发适配多屏幕规格应用框架应用包管理分布式技术分布式软总线分布式硬件分布式数据管理媒体音频播放相机图片程序访问控制ArkCompile
r语言
特性增强编译器运行时功能语言基础库
OpenHarmony开发者
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2023-04-13 19:06
系统安全
人工智能
安全
OpenHarmony
R语言
学习丨数据存储文件格式知识,CSV,EXCEL,XML,JSON,MYSQL等
今天笔记的主要学习内容是
R语言
里文件相关知识,包含CSV、Excel、XML、JSON、MySQL等。
生信分析笔记
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2023-04-13 16:39
后端
R语言
学习丨散点图怎么画?绘图基本知识与常用函数
今天笔记的内容是
R语言
中散点图绘制方法,用到了plot(普通散点图)、pairs(散点图矩阵)函数。
生信分析笔记
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2023-04-13 16:39
后端
R语言
中ggplot2绘制热图,美化热图流程
ggplot2是一款强大的绘图R包,今天的笔记内容是学习使用ggplot2来绘制一幅热图,并进行美化调整。需要加载的包有两个:ggplot2、reshape2。如果你也想跟着笔记一起学习,请访问链接下载脚本:https://down.jewin.love/?f=/Rscript/访问上面的网址即可下载使用,也可以直接在Rstudio中运行下面这一句代码,则会自动在当前工作路径下生成11副PDF图片
生信分析笔记
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2023-04-13 16:39
程序人生
利用ChatGPT学习生物信息数据分析
文末彩蛋记得看~分享几个小知识点,顺便考考ChatGPT:
R语言
中如何向列表追加值?要向列表中追加值,可以使用c()函数将新的值添加到原始列表中。
生信分析笔记
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2023-04-13 16:36
后端
量化资源
人工智能开发量化策略,基于python,提供策略自动生成器镭矿-基于量化回测平台果仁网-回测量化平台京东量化-算法交易和量化回测平台聚宽-量化回测平台优矿-通联量化实验室Ricequant-量化交易平台况客-基于
R语言
量化回测平台
梅_梅
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2023-04-13 16:42
第三-六章
R语言
数据类型
第三-六章
R语言
数据类型虽然本周没有更新推文,但是,每天都在仔细学习
R语言
------数据类型。
天涯清水
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2023-04-13 14:05
【
R语言
】热图绘制-heatmap+gplots配色方案
前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制热图☞【
R语言
】热图绘制-heatmap函数☞
R语言
中的颜色(一)-自带的调色板今天我们接着来聊heatmap这个函数绘制热图,
生信交流平台
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2023-04-13 08:48
R语言
绘图(ggplot2、ggpubr)从入门到精通04--柱状图美化之调色
本系列课程要求大家有一定的
R语言
基础,对于完全零基础的同学,建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——
R语言
基础教程》。
生信师兄
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2023-04-13 08:50
R语言
作图——Density plot
Step1.绘图数据的准备首先还是要把你想要绘图的数据调整成
R语言
可以识别的格式,把excel保存成csv格式。
生信了
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2023-04-13 06:38
基于Python近红外光谱分析与机器学习、深度学习方法融合技术应用
深度学习方法融合技术应用时间:4月15日-16日、22日-23日【四天实践课程】2:最新PyTorch机器学习与深度学习技术方法与案例实践应用时间:5月20日-21日、27日-28日【四天实践课程】3:【R-GIS】
R语言
空间分析
风度78
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2023-04-13 06:23
深度学习
python
机器学习
人工智能
开发语言
R语言
笔记Day1(三 函数与R包)
1.函数嵌套函数>gg(3)[1]3.03.54.04.55.05.56.06.57.07.58.08.59.02.R包2.1R包来源(1)CRAN网站:https://cran.r-project.org/web/views/安装:install.packages()(2)Bioconductor网站:https://bioconductor.org/安装:BiocManager::instal
养猪场小老板
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2023-04-13 06:07
TCGA和GTEx的数据联合分析实战
0.缘起很多文章中用到GEPIA这个网页工具来进行TCGA和GTEx表达量的联合比较,但在此之前我不知道要怎样在
R语言
中实现。
小洁忘了怎么分身
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2023-04-13 04:00
《
R语言
实战》自学笔记23-第四章实战练习
回顾这一章的学习,主要讲了一个内容,如何用R基础包进行数据清洗。数据清洗(Datacleaning)–对数据进行重新审查和校验的过程,目的在于删除重复信息、纠正存在的错误,并提供数据一致性。数据清洗从名字上也看的出就是把“脏”的“洗掉”,指发现并纠正数据文件中可识别的错误的最后一道程序,包括检查数据一致性,处理无效值和缺失值等。借此,简单的将前面学的内容再复习一遍。数据准备df<-read.tab
zjh9280
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2023-04-13 03:04
【案例教程】基于
R语言
、MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作实践技术
【原文链接】:基于
R语言
、MaxEnt模型融合技术的物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作实践技术https://mp.weixin.qq.com/s?
weixin_贾楠
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2023-04-13 03:03
遥感数据与作物模型
地理
遥感
生态模型
r语言
开发语言
经验分享
R语言
中字符串的处理(2/3)-分割、提取、替换
本文转自微信公众号:一遇之见的大作R中字符串处理:函数实现。原文太长,分三次学习、消化。字符串分割函数:strsplit,str_split和str_split_fixed函数strsplit,str_split和str_split_fixed均可实现字符串的分割,但strsplit和str_split返回结果为列表,而str_split_fixed返回结果为矩阵。fruits=c("SmallY
北欧森林
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2023-04-13 00:28
R语言
数据类型
1.字符串1.连接字符串-paste()函数语法说明paste(var-1,var-2...,sep="",collapse=NULL)参数解释var-1,var-2...,表示要组合的任意数量的自变量sep,表示参数之间的任何分隔符。它是可选的collapse,用于消除两个字符串之间的空格。但不是一个字符串的两个字内的空间2.格式化数字和字符串-format()函数语法说明format(x,di
地平线上的背影
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2023-04-12 23:53
2019-06-29
R语言
作业(中级)
R语言
作业(中级)题目链接:http://www.bio-info-trainee.com/3750.html作业1根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl基因ID对应的基因名(symbol
LiuYueRR
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2023-04-12 22:18
跟着Nature Genetics学画图:
R语言
ggplot2画图展示SNP位点的碱基类型
论文是Pan-genomeanalysishighlightstheextentofgenomicvariationincultivatedandwildriceimage.png今天重复的图是来自于论文中的figure3bimage.png之前的推文已经介绍过上半部分的基因结果的画法,今天的推文介绍下半部分SNP位点的碱基类型的实现办法,背景颜色这里借助的是ggplot2包中的geom_tile
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 21:53
R语言
机器学习与临床预测模型55--线性回归之多变量线性回归
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】我们要建立的模型形式是Y=B0+B1x1+…+Bnxn+e,预测变量(特征)可以有1~
科研私家菜
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2023-04-12 19:22
R语言
-Cox比例风险模型的假设检验条件
Cox回归模型应用的前提是:比例风险(proportionalhazards)假定,即PH假定只有PH假定满足时(P>0.05),cox回归的结果才有意义PH假定:协变量对生存率的影响不随时间的改变而改变,即风险比值h(t)/h0(t)为固定值。library(survival)library(survminer)m=coxph(Surv(time,event)~gene+factor(sex)+
超级可爱的懂事长鸭
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2023-04-12 19:47
跟着Nature学作图:
R语言
ggplot2箱线图/堆积柱形图完整示例
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataF
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 14:14
跟着Nature microbiology学画图:
R语言
pheatmap包画热图展示密码子RSCU值
论文EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和数据下载链接https://github.com/plemey/SARSCoV2origins今天的推文我们来重复一下论文中的Figure5aimag
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 09:45
可能会用到的
R语言
包~2
aplotY叔开发,拼图解决坐标对齐的问题extrafont解决ggplot2绘图导出pdf文件中文字体乱码的问题对应的B站介绍视频https://www.bilibili.com/video/BV1ke411p7B4?from=search&seid=18105130207805018028rstatix里面有一个函数sample_n_by()分组取样,基本用法sample_n_by(iris,
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 09:03
2022-03-27
就比如说
R语言
,这样的大众工具,却有那么多昂贵的培训。跟下来,也就是把老师的代码在机器上粘贴后的复现。而课程结束自我感动完成后,多数回归原位,如昙花一现,黄粱一梦,擦干泪水
朗月斋主
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2023-04-12 09:44
R语言
|Cox模型校准度曲线绘制
转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记:
R语言
实现Cox模型校准度曲线绘制研究背景这是关于cox模型的第二篇文章,上一篇文章分享了运用Lasso回归如何筛选变量,将筛选后的变量绘制Nomogram
小易学统计
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2023-04-12 05:45
R语言
:UPGMA聚类分析和树状图
下面介绍用
R语言
中的UPGMA函数分析微生物多样性数据和结果可视化的方法,内容如下:1)模拟(样品、丰度)矩阵数据;2)计算braycurtis相异指数和UPGMA聚类;
小白菜学生信
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2023-04-12 05:21
20机器学习开放基础课程--集成学习和
随机森林
方法
集成学习和
随机森林
方法集成假设已经为某一特定问题选中了最佳的模型,想进一步提升其准确率,就需要应用一些更高级的机器学习技术:集成(Ensemble)。
Jachin111
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2023-04-12 04:06
学习小组Day5笔记--阿星》
R语言
数据类型思维导图作业:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错objectXnotfound,是为什么,应该怎么解决?
阿星爱小羊
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2023-04-12 02:19
决策树随笔
最近在学习Pyspark的过程中,了解到了决策树算法(DecisionTree)和
随机森林
(RandomForest),在学习过程中,为了加深了解以及避免遗忘,做随笔记录如下。
风筝flying
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2023-04-12 01:27
R语言
|基于Cox模型pec包深度验证
转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记:
R语言
pec包深度验证Cox模型研究背景在cox回归中,如何利用已经构建好的预测模型预测单个患者的生存概率呢?
小易学统计
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2023-04-12 00:11
r语言
与python r中python环境的创建
#remotes::install_github(“rstudio/reticulate”)library(reticulate)use_condaenv(‘C:/Users/yll/AppData/Local/r-miniconda/envs/giotto_env/’)‘’’conda_install(envname=“giotto_env”,packages=c(“pandas”,“pytho
Young.Dr
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2023-04-12 00:00
python
r语言
R语言
边学边记--数据结构
阿三矩阵:>n1n2ppABCa123b456c789d101112>p[1,2][1]2>p[2][1]4>p[5][1]2>p[3,4]Errorinp[3,4]:subscriptoutofbounds>p[2,c(2,3)]BC56>p[3,]ABC789>p[,3]abcd36912>3.数组>ebqwebb,,A武大郎武二郎a13b24,,B武大郎武二郎a57b68,,C武大郎武二郎a
Jerry_5543
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2023-04-11 23:19
【机器学习】案例一:
随机森林
预测泰坦尼克号生还概率
目录前言:【一】数据清洗及可视化介绍知识点环境准备数据特征介绍检查数据相关系数缺失值偏态分布数值化和标准化离群点实验总结一【二】分类模型训练及评价介绍环境准备模型评估模型选择性能度量实验总结二【三】
随机森林
分类器及其参数调节介绍知识点实验原理决策树集成学习
随机森林
让机器理解语言か
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2023-04-11 23:49
#
机器学习案列
python
机器学习
数据挖掘
机器学习之RandomForest、GBDT、XGBoost、lightGBM 原理与区别
目录
随机森林
--RandomForestGBDT(GradientBoostingDecisionTree)XGBoostlightGBMRF,GBDT,XGBoost,lightGBM都属于集成学习(
文子轩
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2023-04-11 18:26
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