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r语言随机森林
R语言
可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析
之前分享了如何用ggplot2可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。1.数据准备同样的,我们从DAVID获取KEGGpathway的结果。对于KEGG,我比较喜欢做气泡图,这样用两种形式的图结合在一起,效果更丰富更好看一点。2.作图library(ggplot2)kegg<-read.table("kegg.txt",header=T,sep="\t")#导入文件ggplot(
zrh_h
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2023-04-18 03:06
《Advanced R》学习笔记 | Chapter3 Vectors
专注系列化、高质量的
R语言
教程推文索引|联系小编|付费合集本篇推文是学堂君学习第3章“Vectors”的笔记,原文链接是https://adv-r.hadley.nz/vectors-chap.html
R语言学堂
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2023-04-18 03:36
r语言
学习
笔记
开发语言
R语言
系列1:数据结构、数据导入和常用函数
R语言
系列1:数据结构、数据导入和常用函数此文内容为《
R语言
实战》的笔记,人民邮电出版社出版。
爱吃汉堡薯条
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2023-04-18 01:27
线性回归算法梳理
目录1、机器学习基本概念2、线性回归原理3、优化方法4、线性回归的评估指标5、sklearn参数详解1、机器学习基本概念监督学习:KNN、线性回归、逻辑回归、SVM、决策树和
随机森林
、神经网络无监督学习
pandawang830
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2023-04-18 00:24
机器学习
线性回归
学生党
R语言
入门手册!终于截稿
1什么是
R语言
R语言
是一个开源的数据分析环境,起初是由数位统计学家建立起来,以更好的进行统计计算和绘图,这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。
童欣
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2023-04-18 00:16
机械学习模型训练常用代码(
随机森林
、聚类、逻辑回归、svm、线性回归、lasso回归,岭回归)
一、数据处理(特征工程)更多pandas操作请参考添加链接描述pandas对于文件数据基本操作导入的包sklearnpip3install--index-urlhttps://pypi.douban.com/simplescikit-learn缺失值处理#缺失值查看df.replace('NaN',np.nan,inplace=True)#将数据中一些None替换为NULLdf.isnull().
南师大蒜阿熏呀
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2023-04-18 00:49
回归
随机森林
聚类
R语言
stringr包处理字符串
stringr包是R数据处理神器Tidyverse包中的工具之一,是处理字符串很好用的工具,结合正则表达式,可以发挥巨大作用。字符串长度stringr包的操作对象是向量,str_length()函数用于确定字符串长度。>xstr_length(x)#>[1]355549但是如果是下面这种写法,便会出现语法错误,因为输入对象是非向量。>str_length("why","video","cross"
亘心37
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2023-04-17 17:17
2-14 |“特殊”的日子,多学一种表达爱的方式
首发于“生信补给站”https://mp.weixin.qq.com/s/U8yzX-BYQ6wdZObkBz8ecw全世界所有的语言都有表达爱意的方式,
R语言
当然也有!
生信补给站
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2023-04-17 16:56
学习小组Day5笔记-- 乳酸君
Day5向量与数据框向量向量的概念在
R语言
当中,元素指代的是字符串、数字等数据类型,可分为标量和向量。向量提示我们它是有方向的,我们可以简单地将它定义为一排有序排列的元素。
soda0301
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2023-04-17 15:41
facebook社交网络分析
1.2数据预处理本社交网络分析案例是基于
R语言
程序实现的。原始数据为.txt文件,读入
R语言
中,展示如下:建立社交网络关系图:
小小孩儿的碎碎念
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2023-04-17 13:55
R语言
学习笔记 -- R markdown 输出期刊投稿用 word 格式
转发一则技术贴AbetterwaytogotoWordfromRmd。旧链接失效,可访问其github。RMarkdown是R版的Markdown,其中可以嵌入R代码和latex语句,使人们使用易读易写的纯文本格式编写文档。相比word有不少优势,重复性特别好、没有格式排版的烦恼、支持pdf矢量格式图片、参考文献管理简单等等。RMarkdown对PDF的支持性最佳,但pdf无法投稿用,RMarkd
逍遥尐生
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2023-04-17 12:30
62-
R语言
防止过拟合训练神经网络模型
《深度学习精要(基于
R语言
)》学习笔记1、过拟合问题概述机器学习的一个陷阱是,越复杂的数据越有可能过拟合训练数据,因此,对相同数据训练模型的性能评价会导致有偏的、过度乐观的模型性能的估计,甚至会影响到对模型的选择
wonphen
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2023-04-17 12:04
R语言
数据的查询筛选-subset()
subset(x,subset,select,drop=FALSE,...)&多条件查询select显示指定列selectresult=subset(df1,name=="aa"&sex=="f",select=c(age,sex))负号排除指定列selectresult=subset(df1,name=="aa"&sex=="f",select=c(-age,-sex))例1:从快递帐单表中抽取
付德刚Q
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2023-04-17 11:32
大数据分析案例-基于多元线性回归算法构建用户信用评分模型
如果文章对你有帮助的话,欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴,希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于
随机森林
算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于
随机森林
算法的商
艾派森
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2023-04-17 11:31
大数据分析案例合集
python
数据分析
大数据
数据挖掘
新手如何理解管道符号
R语言
的管道符号%>%出自R包tidyverse,表示前一句代码的输出作为后一句代码的输入。举个栗子补充:iris是一个
R语言
内置数据框,filter
小洁忘了怎么分身
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2023-04-17 08:58
R语言
做单因素方差分析
R语言
做单因素方差分析检验三组与三组以上数据(需满足正态,方差,独立)整理数据保存CSV格式打开Rstudiogetwd()#查看工作目录read.csv("filename")df<-read.csv
μμ豆奶
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2023-04-17 07:26
r语言
CCLE:求任意基因的相关性
进行肿瘤的研究,求两个或多个基因的相关性,可以用GEPIA2或者直接下载数据用
R语言
处理,如果能再加上细胞系的相关性就能完美了。下面就分享下,手动下载CCLE测序数据,求任意两个基因的相关性。
高大石头
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2023-04-17 02:18
在jupyter notebook中使用
R语言
在jupyternotebook中使用
R语言
2018年09月17日15:52:14一窗星乱银河静阅读数:2677标签:
R语言
jupyternotebook更多个人分类:
R语言
学习笔记R的安装R的安装网上教程很多
榴莲气象
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2023-04-17 01:33
nomogram by R language_04Jul2020
目的:使用
R语言
结合某些包实现nomogram(列线图)绘制。缘起:由于偶然的机会,学到了这种图的画法,及其解读,在此作为笔记记录。
liang_rujiang
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2023-04-16 20:00
何时在机器学习中使用决策树与
随机森林
本博客将介绍决策树和
随机森林
算法背后的思想,并比较两者。我们还将研究
随机森林
与选择树的好处。决策树和
随机森林
算法决策树是一种模型,它根据其特征的值递归划分数据,以使用树状结构预测目标变量。
琉底骅网络
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2023-04-16 20:24
机器学习
决策树
算法
R语言
机器学习与临床预测模型21--预测模型的评价指标
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】00混淆矩阵混淆矩阵包含四部分的信息:
科研私家菜
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2023-04-16 19:20
Sklearn——集成模型
sklearn——集成模型1.bagging2.决策树的bagging2.1
随机森林
2.2极端
随机森林
2.3参数2.4并行化3.Adaboost3.1用法4.GradientTreeBoosting4.1
是菜鸡小小陈啊
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2023-04-16 16:10
sklearn
机器学习
python
【机器学习】三大树模型实战乳腺癌预测分类
本文从数据的探索分析出发,经过特征工程和样本均衡性处理,使用决策树、
随机森林
、梯度提升树对一份女性乳腺癌的数据集进行分析和预测建模。
风度78
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2023-04-16 15:43
人工智能
决策树
python
机器学习
数据分析
R语言
网页版笔记
给大家分享一些写的比较好的
R语言
笔记(或者称教程也可以),由于是我自己在网上看到的别人的笔记,所以这个是不定期更新的,那天看到有好的笔记,就会将链接分享到这里。
淡水鱼Ada
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2023-04-16 14:21
为Jupyter Notebook安装R Kernel
我们都知道在生物信息学领域,
R语言
发挥着极其重要的价值,相信大家平时进行个性化数据分析或者利用R进行工具开发时,主要用到的还是⬇⬇⬇。也就是最经典的
R语言
集成开发环境,RStudio⬇⬇⬇。
林枫bioinfo
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2023-04-16 11:25
学习小组Day4笔记-- Joanna
rnorm(50))image.png输入boxplot(irisSpecies,col=c("lightblue","lightyellow","lightpink"))image.pngiris是一个
R语言
十步芳艸
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2023-04-16 06:59
贝叶斯优化 | BO-RF贝叶斯优化
随机森林
多输入单输出回归预测(Matlab完整程序)
贝叶斯优化|BO-RF贝叶斯优化
随机森林
多输入单输出回归预测(Matlab完整程序)目录贝叶斯优化|BO-RF贝叶斯优化
随机森林
多输入单输出回归预测(Matlab完整程序)预测结果基本介绍评价指标程序设计参考资料预测结果基本介绍贝叶斯优化
前程算法屋
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2023-04-16 05:46
贝叶斯优化(Bayesian
Optimization)
随机森林
回归
matlab
R语言
实战—2
图形初阶pdf("mygraph.pdf")attach(mtcars)#绑定了数据框mtcarsplot(wt,mpg)#绘制散点图abline(lm(mpg~wt))#向图形添加了一条最优拟合曲线title("RegressionofMPGonWeight")#添加了标题detach(mtcars)#为数据框解除了绑定dev.off()通过执行如plot()、hist()(绘制直方图)或box
七白七白七七白
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2023-04-16 05:34
大数据分析案例-基于决策树算法构建信用卡违约预测模型
如果文章对你有帮助的话,欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴,希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于
随机森林
算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于
随机森林
算法的商品评价情感分析大数据分析案例
艾派森
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2023-04-16 00:06
大数据分析案例合集
python
机器学习
决策树
数据挖掘
数据分析
【
R语言
】---列表
列表是
R语言
的对象集合,可以用来保存不同类型的数据,可以是数字、字符串、向量、另一个列表等,当然还可以包含矩阵和函数。
奶茶可可
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2023-04-15 23:40
r语言
开发语言
R语言
机器学习方法
在各种语言中,
R语言
以编程简单,方法先进脱颖而出。基于
R语言
机器学习方法与案例分析技术应用第一章:基础知识1.机器学习的基本概念2.机器
zkzhzy
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2023-04-15 20:55
机器学习
数据可视化
R语言
r语言
机器学习
开发语言
R语言
BIOMOD2模型的物种分布模拟
根据国家林草局最新工作指示,我国将积极整合、优化自然保护地,加快推进国家公园体制试点,构建以国家公园为主体的自然保护地体系。针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题,科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特定物种与其环境之间的关系,试图利用环境变量来模拟特定物种的生态位,基于R语
zkzhzy
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2023-04-15 20:54
生物多样性
生态系统
R语言
数据分析
r语言
随机森林
算法深入浅出
文章目录一
随机森林
算法的基本原理二
随机森林
算法的优点1.
随机森林
算法具有很高的准确性和鲁棒性2.
随机森林
算法可以有效地避免过拟合问题3.
随机森林
算法可以处理高维度数据4.
随机森林
算法可以评估特征的重要性三
随机森林
算法的缺点
夏沫の梦
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2023-04-15 20:52
机器学习
机器学习
人工智能
算法
个人博客文章合集
不定期更新链接:博客文章合集:data.table学习笔记ggplot2分面填充色与字体大小ggplot2画箭头ggplot2坡度图iTOL修饰进化树NMDS分析OPLS-DA在
R语言
中的实现PCA和PERMANOVA
研究僧小蓝哥
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2023-04-15 19:52
使用Stacking集成学习(逻辑回归、
随机森林
)对鸢尾花数据集进行分类
文章目录Stacking集成学习的步骤使用逻辑回归、
随机森林
对鸢尾花数据集进行分类Stacking集成学习的步骤Stacking(堆叠)是一种集成学习方法,它通常使用多个基础分类器和一个元分类器来提高模型的预测性能
WTIAW.TIAW
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2023-04-15 18:09
人工智能
集成学习
计算机视觉
深度学习
神经网络
pytorch
CentOS 7 安装R-4.2.0及Seurat、hdf5r、DoubletFinder
因为直接根据
R语言
官网的描述,CentOS7系统安装的R是3.6.0版本的,而Seurat包要求R-4.0.0以上版本,所以在这里记录下自己安装R-4.2.0以及几个R包的过程。
tiantianstudy
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2023-04-15 17:00
Flutter项目开发经验总结
近期新的项目采用Flutte
r语言
进行开发,也算是一次实践,在开发的过程中也踩了不少坑,所以想写一篇文章进行记录和分享。1.Flutter安装和环境配置 博主是使用Mac开发,其它开发环境可参考
笑里剑
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2023-04-15 11:17
R语言
,实现各种常用的数据输入与输出
R语言
支持读取众多格式的数据文件,excel文件,csv文件,txt文件和数据库(MYSQL数据库)等;其中,excel和csv是我们最常遇到的数据文件格式。
oncology咕噜
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2023-04-15 08:28
【
R语言
学习】生信人应该这样学
R语言
--学习笔记(2)
保存及加载数据:save(a,file="GSE17215.Rdata")load("GSE17215.Rdata")清除内存变量、释放内存:rm(list=ls())#清除内存变量gc()#释放内存画一个热图:#参考https://www.jianshu.com/p/4e3a94bd155a第五部分aa,b之间的相关性,cor(exprSet)可以查看exprSet矩阵所有列之间的相关性;dim
你在想些什么呢
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2023-04-15 07:35
机器学习笔记之集成学习(二)Bagging与
随机森林
机器学习笔记之集成学习——Bagging与
随机森林
引言回顾:偏差、方差、噪声自助采样法(BootstrappingSampling\text{BootstrappingSampling}BootstrappingSampling
静静的喝酒
·
2023-04-15 06:47
算法八股查漏补缺
机器学习
机器学习
集成学习
人工智能
Bagging
随机森林
2020-01-28
Day6庐州月安装使用
R语言
包(以dplyr为例)1、安装下载镜像2、安装三部曲options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/
冉芽
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2023-04-15 04:06
win10 R-4.0.2 && Linux R-3.6.3 安装
Win10R-4.0.2&&LinuxR-3.6.3win10
R语言
软件安装1.什么是RR是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。
coisini.cn
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2023-04-15 02:36
linux
windows
r语言
ECE 0832代写、代做Java程序设计、代写Java编程、代做Digital代做Processing|代写
R语言
程序
ECE0832–DigitalWorld20/20Page1/1Re:InstructionsfortheJavaassignmentStudentAssistant:SeeEventCalendaroraskinstructorTableofContentTableofContent.........................................................
qiexinglun
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2023-04-15 01:12
R语言
学习笔记:文本分析
文本分析使用的数据:yelp_subset.csvlibrary(data.table)data.all=fread('yelp_subset.csv',stringsAsFactors=FALSE)dim(data.all)data=data.all[1:100,]#取前一百行来分析目标:利用评论预测打分为了简化,把星级分为两类:1-3星为0,4-5星为1data$rating=c(0)#做出新
DANoob
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2023-04-15 00:32
由于内存超载而崩掉的
R语言
程序的尝试解决方案
0.情景当
R语言
在处理大数据过程中,内存/CPU超载而导致报错的尝试处理方案1.Corefunctionrm(list=ls()).rs.restartR(afterRestartCommand="")
TroyShen
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2023-04-15 00:42
ggplot2绘图学习
学习书籍:ggplot2:数据分析与图形艺术
R语言
常用函数(参考来源)通过上周
R语言
基础的学习,这周复习上周知识并查找资料对于
R语言
的整体函数进行总体性了解与针对性学习;1.
R语言
基础
R语言
基础主要是一些数据的基本结构数据类型和字符类型结构
262153
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2023-04-14 23:38
R语言
常用的数据处理的包(2)
这一节我们来复习一下shape2的用法:reshape2包的主要功能函数是melt()和cast(),其实现了长数据和宽数据之间的转换。melt的功能用处:将列名作为行的值,减少列的个数,增加行的个数。用法:melt(data,id.vars,measure.vars,variable.name="variable",...,na.rm=FALSE,value.name="value")其中id.
Evil_Genius
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2023-04-14 21:29
主成分分析-PCA图的优化(
R语言
)
R语言
的主成分分析(PCA)详解和带聚类的PCA图绘制最近有个老师在整理文章数据,由于分组较多,想展示PCA图,说明不同分组的差异,公司默认给出的PCA图比较朴素,想做的好看一些,怎么来做呢。
纪伟讲测序
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2023-04-14 16:59
大数据挖掘建模平台产品功能特点
平台底层算法基于
R语言
、Python、Spark等引擎,使用JAVA语言开发,采用B/S结构,用户不需要下载客户端,可通过浏览器进行访
泰迪智能科技
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2023-04-14 15:13
数据挖掘
大数据
人工智能
R语言
学习-cor函数
通常通过cor计算皮尔逊相关系数,这个函数格式很简单。cor(x,y)就可以使用,有时候是cor(x,y,use="complete")是对于缺失值的处理,试了说明书说的几种写法,没什么区别。cor(x,y,use="complete")cor(x,y,use="complete.obs")cor(x,y,use="na.or.complete")cor(x,y,use="pairwise.com
虾里巴人
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2023-04-14 13:40
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