r语言aggredate

R语言贝叶斯推断与MCMC：实现Metropolis-Hastings 采样算法示例|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21545原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯推断的研究报告，包括一些图形和统计输出。示例1：使用MCMC的指数分布采样任何MCMC方案的目标都是从“目标”分布产生样本。在这种情况下，我们将使用平均值为1的指数分布作为我们的目标分布。所以我们从定义目标密度开始：target=function(x){if(x0&x2&x1))
·2023-09-21 21:58

箱线图进行方差分析并添加显著性标记

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何在计算多样性指数的基础上来进行显著性标记，可在文末找到获取数据的方式加载R包library(tidyverse)library(vegan)library(magrittr
R语言数据分析指南·2023-09-21 20:37

R语言进行孟德尔随机化+meta分析（1）---meta分析基础

R语言进行进行meta分析咱们就做最基本的部
天桥下的卖艺者·2023-09-21 18:49

R语言ggpubr包优雅绘制带统计数据的箱线图

ggpubr包是个很经典的R包，能绘制专业的论文绘图，它是对ggplot2进行了加强，R包的说明也是介绍用于创建和自定义基于“ggplot2”的出版物绘图，就是个为SCI而生的R包呀，今天咱们使用ggpubr绘制专业的论文需要的带统计数据的箱线图下面咱们开始，先导入R包和数据，使用R软件自带的ToothGrowth数据library(ggpubr)data("ToothGrowth")df<-To
天桥下的卖艺者·2023-09-21 18:18

R-Newton牛顿法解方程

转载自：用R语言求解非线性方程-R爱好者-博客园(cnblogs.com)仅用于学习image.pngimage.pngimage.pngimage.png
淡水鱼Ada·2023-09-21 17:29

跟着Science学画图：R语言ggplot2作热图展示基因存在缺失

论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本·2023-09-21 11:49

发布gridgame游戏包

R语言作为统计学一门语言，一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发，R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入，R语言的社区在迅速扩大成长。
Fens·2023-09-21 11:16

实验篇——根据群体经纬度提取环境数据（先导）

实验篇——根据群体经纬度提取环境数据（先导）文章目录前言一、获取数据文件1.1.经纬度文件1.2.环境数据的tif文件二、R语言代码实现三、环境文件介绍3.1.bio3.2.prec3.3.elev3.4
星石传说·2023-09-21 08:56

R语言风险价值：ARIMA，GARCH，Delta-normal法滚动估计VaR（Value at Risk）和回测分析股票数据...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=24492此分析的目的是构建一个过程，以在给定时变波动性的情况下正确估计风险价值。风险价值被广泛用于衡量金融机构的市场风险。我们的时间序列数据包括1258天的股票收益（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍为了解释每日收益率方差的一小部分，我们使用Box-Jenkins方法来拟合自回归综合移动平均(ARIMA)模型，并测试带下划线的假设。稍后
拓端研究室TRL·2023-09-21 05:09

R语言绘制图例legend()

目录一、legend()函数介绍二、par()函数：将多幅图形组合成一幅总括图形示例：三、par()函数：图形尺寸与边界尺寸四、legend()函数示例参考：一、legend()函数介绍当图形中包含的数据不止一组时，图例可以帮助你辨别出每个条形、扇形区域或者折线各代表哪一类数据。我们可以使用函数legend()来添加图例。其格式为：legend(location,title,legend,...)
饮食有度的元气少女·2023-09-21 04:19

R语言-关于颜色

目录颜色示例R颜色板参考：颜色什么场景会用到颜色？比如在绘图过程中，为了让图更好看，有的时候，需要选择使用不同的颜色进行绘制或者填充。本文提供了R颜色的相关参数。在R中，可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来制定颜色。举例来说，col=1,col="white"，col="#FFFFFF"，col=rgb(1,1,1)和col=hsv(0,0,1)都是表示白色的等价方式
饮食有度的元气少女·2023-09-21 04:44

R语言logistic回归的细节解读

医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。
医学和生信笔记·2023-09-21 04:28

R语言实现高级的韦恩图可视化（UpSetR）

hello,大家好，不知道下面这张图大家还有印象么图片.png在我之前分享的文章10X单细胞（10X空间转录组）之细胞通讯软件之间的分析比较中，大量采用这样的图进行展示，后来呢，在文章文章中的哑铃图复现（基础知识）尝试完全实现，可惜半路停止，今天就给大家展示如何实现这样的图，不带一点折扣。其实这个图有个专业的名词，叫韦恩图，但是大家熟悉的韦恩图应该是长下面的样子：图片.png少量的情况下非常美观，
单细胞空间交响乐·2023-09-21 01:33

R语言连接MySQL读写中文数据乱码问题解决方案

R语言在对中文的读写上是有点不友好，估计也是众多R语言使用者吐槽的点。
LEEBELOVED·2023-09-21 01:15

R语言爬虫豆瓣高评分电影（喝最烈的酒，熬最深的夜，吃最好的胃药，敷最贵的面膜）

豆瓣电影TOP250抓取下了那么多包没用多少东西，看着黑人，反正pradaprada的赶紧逃，赶紧的，你会炸的这里面主要用到R/Rstudio里面的RCurl、XML、wordcloud、stringr、jiebaR勒几个包，熟悉的娃晓得R里面爬虫明星般的包就是RCurl和Rvset了，不过对于更强大的Rselenium、Rwebdriver什么的先不要管了，别把自己玩疯了，作文本处理的wordc
LEEBELOVED·2023-09-21 01:44

R语言stringr包字符串、文本数据处理函数（数据清洗、正则表达式）

最近一直在忙于数据清理、整理，分析、可视化都不多，想来把数据处理中的一些方法分享给大家！本篇是对你接到一个烫手山芋时，如何将它们一并拿下！stringr包函数处理脏数据可谓是屡试不爽，例如：网络爬取的数据、平台反馈数据、用户数据、医疗数据由于时间比较赶，下面写到的都是常用的数据处理函数1、最基础的就是字符串拼接函数：str_c、str_join2、数据匹配函数：inner_join、right_j
LEEBELOVED·2023-09-21 01:44

R语言dbplyr包实现R与SQL语句无缝衔接

注：并不支持所有R函数语句转换为SQL，例如：dplyr包的with_groups1、cop_to函数适用于少量数据复制到数据库（通常创建为临时表），然后使用R语句计算并转换为SQL语句；不建议直接复制数据到库再进行操作，大量数据复制会耗费较长时间，使用src_memdb将极大节省时间（并不会创建新的数据在R中，而是存储在src_memdb）。copy_to(src_x,#远程数据源链接，例如sr
LEEBELOVED·2023-09-21 01:14

R语言-高效数据处理-泛函数化@灵魂走风的江湖

本文主要运用apply函数族、map函数族、自定义函数的数据处理。将同类数据处理函数化，极大提升数据处理效率！1、自定义函数-含变量、参数#通用函数说明#data_eg为传入的数据集，var1为传入的变量，para1、para2为传入的参数#此函数便于计算任意变量在指定的范围内的计算结果eg_function%filter(between({{var1}},para1,para2))%>%grou
LEEBELOVED·2023-09-21 01:14

R语言data.table包高效处理/提升大数据效率@灵魂走风的江湖

目录1、data.table包中特殊符号.SD（通过.SDcols选择的变量作处理）、.SDcols（变量列选择）、.I（返回位置）、.N（计数）、.BY、J、CJ、SJ、:=2、分组计数（单一方法）比较：3、多分组情况下比较：4、if_else和fifelse函数比较：5、row_number、with_groups与order、by综合比较：6、字段拆分函数tstrsplit与str_spli
LEEBELOVED·2023-09-21 01:13

R语言dplyr包高效处理数据-补充函数

dplyr包补充用到的实用函数：1、函数cur_group_：数据分组组内标记#使用常见的R语言内置数据集iris#可以明确的知道当前数据属于哪个分组iris%>%group_by(Species)%>
LEEBELOVED·2023-09-21 01:42

R语言中多线程运行程序

R代码的运行效率不高，因此有时候可以考虑并行运行程序。#apply系列函数实际不是并行apply(X,MARGIN,FUN,...)lapply(X,FUN,...)sapply(X,FUN,...,simplify=TRUE,USE.NAMES=TRUE)vapply(X,FUN,FUN.VALUE,...,USE.NAMES=TRUE)##lapply()接受一个向量或者列表作为处理对象，返回
JeremyL·2023-09-20 21:35

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=20828最近我们被客户要求撰写关于非凸惩罚函数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是最小最大凹度惩罚函数(MCP)和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“弹性网络”）。还提供了用于执行交叉验证以及拟合后可视化，摘要，推断和预测的实用程序。我们研
·2023-09-20 21:16

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=20828最近我们被客户要求撰写关于非凸惩罚函数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是最小最大凹度惩罚函数(MCP)和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“弹性网络”）。还提供了用于执行交叉验证以及拟合后可视化，摘要，推断和预测的实用程序。我们研
·2023-09-20 21:44

R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24334最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯线性回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。像任何统计建模一样，贝叶斯建模可能需要为你的研究问题设计合适的模型，然后开发该模型，使其符合你的数据假设并运行1.了解Stan统计模型可以在R或其他统计语言的各种包中进行拟合。但有时你在概念上可以设计的完美模型，在限制了你可以使用的分布和复杂性的软件包或程序中很难
·2023-09-20 21:13

R语言RStan MCMC：NUTS采样算法用LASSO 构建贝叶斯线性回归模型分析职业声望数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24456原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于RStan的研究报告，包括一些图形和统计输出。如果你正在进行统计分析：想要加一些先验信息，最终你想要的是预测。所以你决定使用贝叶斯。\但是，你没有共轭先验。你可能会花费很长时间编写Metropolis-Hastings代码，优化接受率和提议分布，或者你可以使用RStan。Hamilto
·2023-09-20 21:13

R语言非线性方程数值分析生物降解、植物生长数据：负指数方程、幂函数曲线、米氏方程、逻辑曲线、Gompertz、Weibull曲线

全文链接：https://tecdat.cn/?p=33742原文出处：拓端数据部落公众号简介在选择最佳拟合实验数据的方程时，可能需要一些经验。当我们没有文献信息时该怎么办？我们建立模型的方法通常是经验主义的。也就是说，我们观察过程，绘制数据并注意到它们遵循一定的模式。例如，我们的客户可能观察到一种植物对某种毒性物质的反应是S形的。因此，我们需要一个S形函数来拟合我们的数据，但是，我们如何选择正确
·2023-09-20 21:12

kappa一致性检验教程_R语言中的试验一致性检验分析 kappa检验和McNemar检验

我们今天就来介绍下R语言如何实现临床化验结果的一致性与否的检验。在R语言中有两个函数
weixin_39638188·2023-09-20 19:04

R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30605应用关联规则、聚类方法等数据挖掘技术分析治疗的中药专利复方组方配伍规律（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。方法检索治疗中药专利复方，排除外用中药及中西药物合用的复方。最近我们被要求撰写关于用药规律的研究报告，包括一些图形和统计输出。对入选的中药专利复方进行术语规范化等处理，抽取信息、建立表，应用数据分析软件R对数据进行关联规则分析，
拓端研究室TRL·2023-09-20 14:34

AIGC入门 - LLM 信息概览

LLMOPTLLaMaAlpacaVicunaMosschatGLMBaichuanOpenbuddy一、OPT1、背景OPT全称OpenPre-trainedTransformerLanguageModels，即“开放的预训练Transformer语言模型
TFATS·2023-09-20 09:30

ggraph优雅的绘制环状网络图

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用ggraph绘制圆形网络图，这里使用了一个R包ccgraph，各位观众老爷细细体会，下面通过一个小例子来进行展示加载R包library(tidygraph)library
R语言数据分析指南·2023-09-20 07:40

数据分享|R语言逻辑回归、线性判别分析LDA、GAM、MARS、KNN、QDA、决策树、随机森林、SVM分类葡萄酒交叉验证ROC...

全文链接:http://tecdat.cn/?p=27384在本文中，数据包含有关葡萄牙“VinhoVerde”葡萄酒的信息（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍该数据集（查看文末了解数据获取方式）有1599个观测值和12个变量，分别是固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧化硫、总二氧化硫、密度、pH值、硫酸盐、酒精和质量。固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧
拓端研究室TRL·2023-09-20 07:34

rexp() R函数，生成服从指数分布的随机数

x<-rexp(100,1/10)#生成100个均值为10的指数分布随机数参考：R语言【rexp】__BANA的博客-CSDN博客
饮食有度的元气少女·2023-09-20 06:17

R语言自学笔记-----R的系统函数

R基础包中含有的函数种类很多，从计算功能上可以分为数学函数、概率函数、统计函数、矩阵运算函数、字符串函数、数据管理函数、逻辑判断函数、文件管理函数等。现在对上述函数进行简单的介绍，具体的更加复杂的操作可以自行参考R的帮助文档。一、数学函数数学函数在R中用于基础的数学运算，是统计分析的重要函数之一函数名称及书写格式函数用途abs(x)计算x的绝对值sqrt(x)计算x的平方根ceiling(x)输出
月月我媳妇·2023-09-20 06:16

实验设计——R语言（DAY02：R语言基础操作）

R语言基础操作1.基础操作#文件读取geted()seted()file.choose()read.csv(file.choose())#保存文件save()#加载R文件load()#加载某个包的数据集
cyt—srhloveyou·2023-09-20 06:16

2021-07-09：细数我在GO注释时遇到的那些报错

上回说到，我废了九牛二虎之力，终于拿到了百十来个GB的GOEVIDENCE数据，你猜怎么着，接着往下进行的时候发现，R语言根本读不了。。。。
wangyantao1991·2023-09-20 05:09

呜呜呜我哭出声来

今天在R语言上栽了跟头。
蓬举举·2023-09-20 03:05

【R语言】——相关性分析和热图绘制

本期介绍了利用R语言进行相关性分析和数据的可视化的方法。一、什么是相关性分析？相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。
在打豆豆的小潘学长·2023-09-20 03:07

r语言 相关性作图_R语言学习指南(6) 初探相关性热图

相关性热图，顾名思义就是根据数据之间的相关性系数来绘制热图，可分为2类：组内相关性热图与组间相关性热图组内相关性热图，即由一组数据内部的相关性系数绘制而成，废话不多说直接看代码相关性矩阵可视化library(tidyverse)library(corrplot)cor(mtcars) %>% corrplot(method = "circle",order = "hclust",type = "l
PP鲁·2023-09-20 03:35

安装Rtools

前言  R语言对于做数据分析的人来说应该很熟悉，这个开源的平台对于分析人员来说也是相当的友好，里面有很多相当好用的函数可供使用，当然还有很多可供使用的第三方R包。
生信店小二·2023-09-20 01:04

R语言风险价值：ARIMA，GARCH模型，Delta-normal法滚动估计，预测VaR|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24492原文出处：拓端数据部落公众号介绍此分析的目的是帮助客户构建一个过程，以在给定时变波动性的情况下正确估计风险价值。风险价值被广泛用于衡量金融机构的市场风险。我们的时间序列数据包括1258天的股票收益。为了解释每日收益率方差的一小部分，我们使用Box-Jenkins方法来拟合自回归综合移动平均(ARIMA)模型，并测试带下划线的假设。稍后，当
·2023-09-20 00:57

R语言逻辑回归Logistic选股因素模型交易策略及沪深300指数实证|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32071原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于交易策略的研究报告，包括一些图形和统计输出。随着中国的证券市场规模的不断壮大、市场创新不断深化、信息披露不断完善、市场监管不断强化，随着现代投资组合理论的发展和计算机技术的进步，投资者为了在股票交易中取得更多的收益，就需要有合理有效的投资策略，因素模型的基础上发展出众多量化研究模型。对
·2023-09-20 00:57

R语言箱型图 boxplot

boxplot简介boxplot称为箱型图，又叫做盒状图，胡须图。是用来表示数值类型数据分布状况的统计图。它能显示出一组数据的最大值、最小值、中位数、及上下四分位数。四分位数百度百科第一四分位数(Q1)，又称“较小四分位数”，等于该样本中所有数值由小到大排列后第25%的数字。第二四分位数(Q2)，又称“中位数”，等于该样本中所有数值由小到大排列后第50%的数字。第三四分位数(Q3)，又称“较大四分
santiagoru·2023-09-19 18:16

R语言分组求和，分组求平均值，分组计数

在R语言里面，aggregate函数就可以办到。
santiagoru·2023-09-19 18:16

R语言读取csv文件

read.csvR语言用read.csv读取csv文件，读取返回一个data.frame的内存对象。
santiagoru·2023-09-19 18:46

R语言有限混合模型聚类FMM、广义线性回归模型GLM混合应用分析威士忌市场和研究专利申请、支出数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24742原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于有限混合模型聚类FMM的研究报告，包括一些图形和统计输出。摘要有限混合模型是对未观察到的异质性建模或近似一般分布函数的流行方法。它们应用于许多不同的领域，例如天文学、生物学、医学或营销。本文给出了这些模型的概述以及许多应用示例。介绍有限混合模型是对未观察到的异质性建模或近似一般分布函数
·2023-09-19 17:30

数据分享|R语言生态学种群空间点格局分析：聚类泊松点过程对植物、蚂蚁巢穴分布数据可视化...

全文链接:https://tecdat.cn/?p=33676点模式分析（点格局分析）是一组用于分析空间点数据的技术。在生态学中，这种类型的分析可能在客户的几个情境下出现，但对数据生成方式做出了特定的假设，因此让我们首先看看哪些生态数据可能与点模式分析相关或不相关（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频哪些数据适用于点模式分析？点模式分析的最重要假设是点的数量和位置都需要是随机的。此外，
拓端研究室TRL·2023-09-19 15:48

数据标准化 中心化以及R语言中scale

1.数据的中心化所谓数据的中心化是指数据集中的各项数据减去数据集的均值。例如有数据集1,2,3,6,3，其均值为3,那么中心化之后的数据集为1-3,2-3,3-3,6-3,3-3,即：-2,-1,0,3,02.数据的标准化所谓数据的标准化是指中心化之后的数据在除以数据集的标准差，即数据集中的各项数据减去数据集的均值再除以数据集的标准差。例如有数据集1,2,3,6,3，其均值为3,其标准差为1.87
赵会成·2023-09-19 13:59

一劳永逸的R语言运行环境管理方法

利用Anaconda进行R语言环境的管理。什么是AnacondaAnaconda是一种Python语言的免费增值开源发行版，用于进行大规模数据处理、预测分析，和科学计算，致力于简化包的管理和部署。
大道无形x我有型·2023-09-19 13:43

使用R语言包RIdeogram展示blast双序列比对结果

RIdeogram是用来展示染色体组型（idiogram）的一个R语言包，比如展示snp的密度分布；展示某类基因在染色体上的分布等等。
小明的数据分析笔记本·2023-09-19 11:32

R语言表与因子（详细知识点，深入知识点后续会补充！）

(1)level表示额外的信息,包含向量中不同值的记录>xxfxf[1]5121312Levels:51213#xf中不同数值(5,12,13)就是水平>length(xf)[1]4#因子的长度定义为数据的长度,而不是水平的长度#可以提前插入新的水平>xxffxff[1]5121312Levels:5121388>xff[2]xff[1]5881312Levels:5121388但是不能添加非法的
dulu~dulu·2023-09-19 11:38
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