r语言data.frame

calc.blob.stats从Blob区域计算颜色和空间统计信息，R语言imagefx包，时序图像特征识别

calc.blob.stats从Blob区域计算颜色和空间统计信息，R语言imagefx包，时序图像特征识别calc.blob.stats从Blob区域计算颜色和空间统计信息1.pngcalc.blob.stats
youmigo·2023-09-24 14:32

R语言编程-Tidyverse 书籍 - R Markdown

RMarkdown是Markdown在R中的延伸。除了具备一般Markdown语法功能之外，最关键的是可以在Rmarkdown中插入代码块，并能运行代码，将代码运行结果显示出来。其作用：image.pngimage.png编译过程.Rmd文件提交给knitr后，将执行代码块创建一个新的包含代码和运行结果的Markdown文件（.md），再被Pandoc处理生成最终的输出文件。image.png1常
Hello育种·2023-09-24 13:23

基于R做宏基因组进化树+丰度柱状图TreeBar带聚类树的堆叠柱形图

写在前面同之前一样，重分析需要所以自己找了各路代码借鉴学习，详情请参考R语言绘制带聚类树的堆叠柱形图，实操效果如下：步骤表格预处理选取不同样本属水平的物种丰度图（绝对和相对水平都可以，相对画出来是齐的，
twocanis·2023-09-24 11:45

Python中的多项式回归拟合非线性关系实例

相关视频：非线性模型原理与R语言多项式回归、局部平滑样条、广义相加模型GAM分析非线性模型原理与R语言多项式回归、局部平滑样条、广义相加模型GAM分析，时长05:41多项式回归是独立x变量和因果y变量之间的非线性关系
拓端研究室·2023-09-24 11:38

R语言非线性方程数值分析生物降解、植物生长数据：多项式、渐近回归、米氏方程、逻辑曲线、Gompertz、Weibull曲线...

全文链接：https://tecdat.cn/?p=33742在选择最佳拟合实验数据的方程时，可能需要一些经验。当我们没有文献信息时该怎么办？我们建立模型的方法通常是经验主义的。也就是说，我们观察过程，绘制数据并注意到它们遵循一定的模式（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频简介例如，我们的客户可能观察到一种植物对某种毒性物质的反应是S形的。因此，我们需要一个S形函数来拟合我们的数据，但
拓端研究室TRL·2023-09-24 10:45

R语言学习笔记

R语言学习笔记一.准备环境二.认识控制台三.R包四.数据结构1.向量Vector1.1创建向量1.2访问向量中的数据1.3向量的循环补齐2.矩阵matrix2.1创建矩阵2.2访问矩阵中的数据3数组Array3.1
jzdnkbd·2023-09-24 09:30

R语言贝叶斯MCMC：GLM逻辑回归、Rstan线性回归、Metropolis Hastings与Gibbs采样算法实例...

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23236在频率学派中，观察样本是随机的，而参数是固定的、未知的数量（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频什么是频率学派？概率被解释为一个随机过程的许多观测的预期频率。有一种想法是"真实的"，例如，在预测鱼的生活环境时，盐度和温度之间的相互作用有一个回归系数？什么是贝叶斯学派？在贝叶斯方法中，概率被解释为对信念的主观衡量。所有的变量--
拓端研究室TRL·2023-09-24 05:30

python关联规则apriori算法_python实现关联规则分析Apriori算法

本节代码参考了《机器学习实战》第十一章中的代码，也参考了R语言的arules包，该包没有实现一对多的规则，因此，在以上基础上进行了改进，包括实现剪枝步，规则生成(一对一，一对多，多
weixin_39949584·2023-09-24 03:54

R语言sample函数

随机抽样又分为重复随机抽样（又称为“重抽样”或者“有放回抽样”）和不重复随机抽样（又称为“没有放回的抽样”）两种。重复抽样是指：本次从整体中抽取出的数据样本，在下一次抽取时同样有机会被抽取。不重复抽样就是：一旦被抽取为样本，下次就不能再被抽取了。sample函数可以完成随机抽样处理，其基本形式为：sample（x,size,replace=FALSE）具体参数说明：x整体数据，以向量形式给出siz
饮食有度的元气少女·2023-09-23 18:15

BIOMOD2模型、MaxEnt模型物种分布模拟，生物多样性生境模拟，论文写作

①基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟实践技术应用针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题，科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。
天青色等烟雨..·2023-09-23 08:28

基于R语言、MATLAB、Python机器学习方法与案例分析

目录基于R语言机器学习方法与案例分析基于MATLAB机器学习、深度学习在图像处理中的实践技术应用全套Python机器学习核心技术与案例分析实践应用基于R语言机器学习方法与案例分析机器学习已经成为继理论、
天青色等烟雨..·2023-09-23 08:27

什么是vyper语言

Vyper是一种全新的以太坊开发语言。一、它在逻辑上类似于Solidity，在语法上类似于Python和Solidity一样，Vyper可编译为以太坊虚拟机（EVM）字节码，运行在以太坊虚拟机（EVM）上。语法与Python非常类似，可以说95%类似。所以Vyper是一个非常适合人类编写和阅读的语言。二、Vyper最显著的两大特点是：安全和简单以太坊是一个价值网络，构建于以太坊之上的应用大多需要进
野猪亲王·2023-09-23 02:06

R语言中字符串的处理(1/3)-长度计算，大小写转化，排序，空格去除，复制，拼接

本文主要介绍如何通过R语言的基础函数和stringr包中的函数实现字符串的常见处理。特别注意的的是R中的基础函数和stringr包函数有两个很大的不同。书写方式不同。
北欧森林·2023-09-22 13:30

R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性...

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24334像任何统计建模一样，贝叶斯建模可能需要为你的研究问题设计合适的模型，然后开发该模型，使其符合你的数据假设并运行（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频1.了解Stan统计模型可以在R或其他统计语言的各种包中进行拟合。但有时你在概念上可以设计的完美模型，在限制了你可以使用的分布和复杂性的软件包或程序中很难或不可能实现。这时你可能想
拓端研究室TRL·2023-09-22 09:14

R语言安装devtools失败解决方案

问题描述：安装devtools出现以上依赖安装失败。解决步骤：1.找到报错提醒退出R，把红框里面的所有包都用apt-get安装。PS.装完要再进去R，install.packages('devtools')，检查是否还有这个报错，如果有就继续用apt-get安装。2.安装httpuv完成上一步之后，还是装不了devtool，因为httpuv安装失败，所以需要用apt-get安装autoconfau
奶牛提纯算法·2023-09-22 08:19

R语言 gwasglue 包安装

使用github安装包：devtools::install_github("mrcieu/gwasglue",force=TRUE)失败1.注意先install.packages("devtools")加载library("devtools")才能用github安装。这里，我使用的R版本是4.3.0,不知道哪里下载，直接用我在网盘里的（永久有效）链接：https://pan.baidu.com/s
Queen_yu·2023-09-22 08:15

【R语言】完美解决devtools安装GitHub包失败的问题（以gwasglue为例）

devtools：devtools是R语言中一个非常有用的包，它提供了一套工具和函数，用于开发、测试和维护R包，devtools可以帮助R包的开发人员更轻松地进行包的创建、文档编写、测试和发布等
感谢地心引力·2023-09-22 08:45

R语言数据分析时的一些问题

一.在install.packages时报错如下情况一：Errorininstall.packages:ERROR:failedtolockdirectory‘E:\Ritself\R-3.6.3\library’formodifyingTryremoving‘E:\Ritself\R-3.6.3\library/00LOCK’步骤：找到‘E:\Ritself\R-3.6.3\library/00
绿豆棉花糖·2023-09-22 06:34

rlang包版本过低

R语言出现“载入了名字空间‘rlang’1.0.6，但需要的是>=1.1.0”的报错install.packages("devtools")安装：devtools::install_github(
绿豆棉花糖·2023-09-22 06:34

折线图geom_line()参数选项

往期折线图教程图形复现|使用R语言绘制折线图折线图指定位置标记折线图形状更改|绘制动态折线图跟着NC学作图|使用python绘制折线图前言我们折线的专栏推出一段时间，但是由于个人的原因，一直未进行更新。
小杜的生信筆記·2023-09-22 05:41

DESeq2安装避坑

DESeq2在R-studio上的安装非常让人自闭，具体可参考徐洲更老师的R语言安装介绍https://www.bilibili.com/video/BV19p4y1i7Zb?
云养江停·2023-09-22 05:26

R语言ICC函数中Consistency 和 agreement，one-way和two-way，single和mean的选择

先给出ICC选择方法的文献：AGuidelineofSelectingandReportingIntraclassCorrelationCoefficientsforReliabilityResearchDOI：10.1016/j.jcm.2016.02.012intraclasscorrelationcoefficient(ICC)中文叫做同类相关系数。为什么要做icc呢。比如在标注的过程中，我
杰青的垫脚石·2023-09-21 23:25

【R】 装包提示 package ‘xxx’ is not available的解决方案

本人因学习生信入门R语言，按照生信技能树JIMMY给的R包安装代码运行，有4个包未能顺利安装：GSEABase，GSVA，clusterProfiler和hgu133plus2.db。
虫虫工工队·2023-09-21 22:07

跟着PNAS学作图：R语言ggplot2作图展示多序列比对结果

论文Theevidenceremainsclear:SARS-CoV-2emergedviathewildlifetradehttps://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2214427119在饶毅科学公众号看到的推文美国科学院院刊：逐条反驳新冠是实验室产物的错误说法其中有一个图是image.png今天的推文我们来试着复现一下这个图首先是一个多序列比对文件image.p
小明的数据分析笔记本·2023-09-21 21:17

R语言贝叶斯非参数模型：密度估计、非参数化随机效应meta分析心肌梗死数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23785原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯非参数模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。概述最近，我们使用贝叶斯非参数（BNP）混合模型进行马尔科夫链蒙特卡洛（MCMC）推断。在这篇文章中，我们通过展示如何使用具有不同内核的非参数混合模型进行密度估计。在后面的文章中，我们将采用参数化的广义线性混合模型，并展示如何切换到非
·2023-09-21 21:32

R语言贝叶斯非参数模型：密度估计、非参数化随机效应meta分析心肌梗死数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23785原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯非参数模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。概述最近，我们使用贝叶斯非参数（BNP）混合模型进行马尔科夫链蒙特卡洛（MCMC）推断。在这篇文章中，我们通过展示如何使用具有不同内核的非参数混合模型进行密度估计。在后面的文章中，我们将采用参数化的广义线性混合模型，并展示如何切换到非
·2023-09-21 21:29

R语言贝叶斯MCMC：GLM逻辑回归、Rstan线性回归、Metropolis Hastings与Gibbs采样算法|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=23236原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯MCMC的研究报告，包括一些图形和统计输出。什么是频率学派？在频率学派中，观察样本是随机的，而参数是固定的、未知的数量。概率被解释为一个随机过程的许多观测的预期频率。有一种想法是"真实的"，例如，在预测鱼的生活环境时，盐度和温度之间的相互作用有一个回归系数？什么是贝叶斯学派？在贝
·2023-09-21 21:29

R语言和Stan,JAGS：用rstan,rjags建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21978原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于Stan,JAGS的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文将介绍如何在R中用rstan和rjags做贝叶斯回归分析，R中有不少包可以用来做贝叶斯回归分析，比如最早的（同时也是参考文献和例子最多的）R2WinBUGS包。这个包会调用WinBUGS软件来拟合模型，后来的JAGS软件也使用与
·2023-09-21 21:58

R语言贝叶斯推断与MCMC：实现Metropolis-Hastings 采样算法示例|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=21545原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯推断的研究报告，包括一些图形和统计输出。示例1：使用MCMC的指数分布采样任何MCMC方案的目标都是从“目标”分布产生样本。在这种情况下，我们将使用平均值为1的指数分布作为我们的目标分布。所以我们从定义目标密度开始：target=function(x){if(x0&x2&x1))
·2023-09-21 21:58

箱线图进行方差分析并添加显著性标记

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何在计算多样性指数的基础上来进行显著性标记，可在文末找到获取数据的方式加载R包library(tidyverse)library(vegan)library(magrittr
R语言数据分析指南·2023-09-21 20:37

R语言进行孟德尔随机化+meta分析（1）---meta分析基础

R语言进行进行meta分析咱们就做最基本的部
天桥下的卖艺者·2023-09-21 18:49

R语言ggpubr包优雅绘制带统计数据的箱线图

ggpubr包是个很经典的R包，能绘制专业的论文绘图，它是对ggplot2进行了加强，R包的说明也是介绍用于创建和自定义基于“ggplot2”的出版物绘图，就是个为SCI而生的R包呀，今天咱们使用ggpubr绘制专业的论文需要的带统计数据的箱线图下面咱们开始，先导入R包和数据，使用R软件自带的ToothGrowth数据library(ggpubr)data("ToothGrowth")df<-To
天桥下的卖艺者·2023-09-21 18:18

R-Newton牛顿法解方程

转载自：用R语言求解非线性方程-R爱好者-博客园(cnblogs.com)仅用于学习image.pngimage.pngimage.pngimage.png
淡水鱼Ada·2023-09-21 17:29

跟着Science学画图：R语言ggplot2作热图展示基因存在缺失

论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本·2023-09-21 11:49

发布gridgame游戏包

R语言作为统计学一门语言，一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发，R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入，R语言的社区在迅速扩大成长。
Fens·2023-09-21 11:16

实验篇——根据群体经纬度提取环境数据（先导）

实验篇——根据群体经纬度提取环境数据（先导）文章目录前言一、获取数据文件1.1.经纬度文件1.2.环境数据的tif文件二、R语言代码实现三、环境文件介绍3.1.bio3.2.prec3.3.elev3.4
星石传说·2023-09-21 08:56

R语言风险价值：ARIMA，GARCH，Delta-normal法滚动估计VaR（Value at Risk）和回测分析股票数据...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=24492此分析的目的是构建一个过程，以在给定时变波动性的情况下正确估计风险价值。风险价值被广泛用于衡量金融机构的市场风险。我们的时间序列数据包括1258天的股票收益（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍为了解释每日收益率方差的一小部分，我们使用Box-Jenkins方法来拟合自回归综合移动平均(ARIMA)模型，并测试带下划线的假设。稍后
拓端研究室TRL·2023-09-21 05:09

R语言绘制图例legend()

目录一、legend()函数介绍二、par()函数：将多幅图形组合成一幅总括图形示例：三、par()函数：图形尺寸与边界尺寸四、legend()函数示例参考：一、legend()函数介绍当图形中包含的数据不止一组时，图例可以帮助你辨别出每个条形、扇形区域或者折线各代表哪一类数据。我们可以使用函数legend()来添加图例。其格式为：legend(location,title,legend,...)
饮食有度的元气少女·2023-09-21 04:19

R语言-关于颜色

目录颜色示例R颜色板参考：颜色什么场景会用到颜色？比如在绘图过程中，为了让图更好看，有的时候，需要选择使用不同的颜色进行绘制或者填充。本文提供了R颜色的相关参数。在R中，可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来制定颜色。举例来说，col=1,col="white"，col="#FFFFFF"，col=rgb(1,1,1)和col=hsv(0,0,1)都是表示白色的等价方式
饮食有度的元气少女·2023-09-21 04:44

R语言logistic回归的细节解读

医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。
医学和生信笔记·2023-09-21 04:28

R语言实现高级的韦恩图可视化（UpSetR）

hello,大家好，不知道下面这张图大家还有印象么图片.png在我之前分享的文章10X单细胞（10X空间转录组）之细胞通讯软件之间的分析比较中，大量采用这样的图进行展示，后来呢，在文章文章中的哑铃图复现（基础知识）尝试完全实现，可惜半路停止，今天就给大家展示如何实现这样的图，不带一点折扣。其实这个图有个专业的名词，叫韦恩图，但是大家熟悉的韦恩图应该是长下面的样子：图片.png少量的情况下非常美观，
单细胞空间交响乐·2023-09-21 01:33

R语言连接MySQL读写中文数据乱码问题解决方案

R语言在对中文的读写上是有点不友好，估计也是众多R语言使用者吐槽的点。
LEEBELOVED·2023-09-21 01:15

R语言爬虫豆瓣高评分电影（喝最烈的酒，熬最深的夜，吃最好的胃药，敷最贵的面膜）

豆瓣电影TOP250抓取下了那么多包没用多少东西，看着黑人，反正pradaprada的赶紧逃，赶紧的，你会炸的这里面主要用到R/Rstudio里面的RCurl、XML、wordcloud、stringr、jiebaR勒几个包，熟悉的娃晓得R里面爬虫明星般的包就是RCurl和Rvset了，不过对于更强大的Rselenium、Rwebdriver什么的先不要管了，别把自己玩疯了，作文本处理的wordc
LEEBELOVED·2023-09-21 01:44

R语言stringr包字符串、文本数据处理函数（数据清洗、正则表达式）

最近一直在忙于数据清理、整理，分析、可视化都不多，想来把数据处理中的一些方法分享给大家！本篇是对你接到一个烫手山芋时，如何将它们一并拿下！stringr包函数处理脏数据可谓是屡试不爽，例如：网络爬取的数据、平台反馈数据、用户数据、医疗数据由于时间比较赶，下面写到的都是常用的数据处理函数1、最基础的就是字符串拼接函数：str_c、str_join2、数据匹配函数：inner_join、right_j
LEEBELOVED·2023-09-21 01:44

R语言dbplyr包实现R与SQL语句无缝衔接

注：并不支持所有R函数语句转换为SQL，例如：dplyr包的with_groups1、cop_to函数适用于少量数据复制到数据库（通常创建为临时表），然后使用R语句计算并转换为SQL语句；不建议直接复制数据到库再进行操作，大量数据复制会耗费较长时间，使用src_memdb将极大节省时间（并不会创建新的数据在R中，而是存储在src_memdb）。copy_to(src_x,#远程数据源链接，例如sr
LEEBELOVED·2023-09-21 01:14

R语言-高效数据处理-泛函数化@灵魂走风的江湖

本文主要运用apply函数族、map函数族、自定义函数的数据处理。将同类数据处理函数化，极大提升数据处理效率！1、自定义函数-含变量、参数#通用函数说明#data_eg为传入的数据集，var1为传入的变量，para1、para2为传入的参数#此函数便于计算任意变量在指定的范围内的计算结果eg_function%filter(between({{var1}},para1,para2))%>%grou
LEEBELOVED·2023-09-21 01:14

R语言data.table包高效处理/提升大数据效率@灵魂走风的江湖

目录1、data.table包中特殊符号.SD（通过.SDcols选择的变量作处理）、.SDcols（变量列选择）、.I（返回位置）、.N（计数）、.BY、J、CJ、SJ、:=2、分组计数（单一方法）比较：3、多分组情况下比较：4、if_else和fifelse函数比较：5、row_number、with_groups与order、by综合比较：6、字段拆分函数tstrsplit与str_spli
LEEBELOVED·2023-09-21 01:13

R语言dplyr包高效处理数据-补充函数

dplyr包补充用到的实用函数：1、函数cur_group_：数据分组组内标记#使用常见的R语言内置数据集iris#可以明确的知道当前数据属于哪个分组iris%>%group_by(Species)%>
LEEBELOVED·2023-09-21 01:42

R语言中多线程运行程序

R代码的运行效率不高，因此有时候可以考虑并行运行程序。#apply系列函数实际不是并行apply(X,MARGIN,FUN,...)lapply(X,FUN,...)sapply(X,FUN,...,simplify=TRUE,USE.NAMES=TRUE)vapply(X,FUN,FUN.VALUE,...,USE.NAMES=TRUE)##lapply()接受一个向量或者列表作为处理对象，返回
JeremyL·2023-09-20 21:35

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=20828最近我们被客户要求撰写关于非凸惩罚函数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是最小最大凹度惩罚函数(MCP)和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“弹性网络”）。还提供了用于执行交叉验证以及拟合后可视化，摘要，推断和预测的实用程序。我们研
·2023-09-20 21:16
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