r语言data.frame

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=20828最近我们被客户要求撰写关于非凸惩罚函数回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是最小最大凹度惩罚函数(MCP)和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“弹性网络”）。还提供了用于执行交叉验证以及拟合后可视化，摘要，推断和预测的实用程序。我们研
·2023-09-20 21:44

R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24334最近我们被客户要求撰写关于贝叶斯线性回归的研究报告，包括一些图形和统计输出。像任何统计建模一样，贝叶斯建模可能需要为你的研究问题设计合适的模型，然后开发该模型，使其符合你的数据假设并运行1.了解Stan统计模型可以在R或其他统计语言的各种包中进行拟合。但有时你在概念上可以设计的完美模型，在限制了你可以使用的分布和复杂性的软件包或程序中很难
·2023-09-20 21:13

R语言RStan MCMC：NUTS采样算法用LASSO 构建贝叶斯线性回归模型分析职业声望数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24456原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于RStan的研究报告，包括一些图形和统计输出。如果你正在进行统计分析：想要加一些先验信息，最终你想要的是预测。所以你决定使用贝叶斯。\但是，你没有共轭先验。你可能会花费很长时间编写Metropolis-Hastings代码，优化接受率和提议分布，或者你可以使用RStan。Hamilto
·2023-09-20 21:13

R语言非线性方程数值分析生物降解、植物生长数据：负指数方程、幂函数曲线、米氏方程、逻辑曲线、Gompertz、Weibull曲线

全文链接：https://tecdat.cn/?p=33742原文出处：拓端数据部落公众号简介在选择最佳拟合实验数据的方程时，可能需要一些经验。当我们没有文献信息时该怎么办？我们建立模型的方法通常是经验主义的。也就是说，我们观察过程，绘制数据并注意到它们遵循一定的模式。例如，我们的客户可能观察到一种植物对某种毒性物质的反应是S形的。因此，我们需要一个S形函数来拟合我们的数据，但是，我们如何选择正确
·2023-09-20 21:12

kappa一致性检验教程_R语言中的试验一致性检验分析 kappa检验和McNemar检验

我们今天就来介绍下R语言如何实现临床化验结果的一致性与否的检验。在R语言中有两个函数
weixin_39638188·2023-09-20 19:04

R语言APRIORI关联规则、K-MEANS均值聚类分析中药专利复方治疗用药规律网络可视化...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30605应用关联规则、聚类方法等数据挖掘技术分析治疗的中药专利复方组方配伍规律（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。方法检索治疗中药专利复方，排除外用中药及中西药物合用的复方。最近我们被要求撰写关于用药规律的研究报告，包括一些图形和统计输出。对入选的中药专利复方进行术语规范化等处理，抽取信息、建立表，应用数据分析软件R对数据进行关联规则分析，
拓端研究室TRL·2023-09-20 14:34

AIGC入门 - LLM 信息概览

LLMOPTLLaMaAlpacaVicunaMosschatGLMBaichuanOpenbuddy一、OPT1、背景OPT全称OpenPre-trainedTransformerLanguageModels，即“开放的预训练Transformer语言模型
TFATS·2023-09-20 09:30

ggplot2做图（填坑中）

数据df<-data.frame(x=1:10,y=1:10,f=c(rep("A",5),rep("B",5)))做图1.散点图(scatterplot)#scatterplotscatter_plot
竹舞清风_忆·2023-09-20 08:57

R的一些奇奇怪怪的功能

1.欧氏距离计算df<-data.frame(x=1:10,y=1:10,row.names=paste0("s",1:10))euro_dist<-as.matrix(dist(df))2.集合运算union
竹舞清风_忆·2023-09-20 08:47

ggraph优雅的绘制环状网络图

欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用ggraph绘制圆形网络图，这里使用了一个R包ccgraph，各位观众老爷细细体会，下面通过一个小例子来进行展示加载R包library(tidygraph)library
R语言数据分析指南·2023-09-20 07:40

数据分享|R语言逻辑回归、线性判别分析LDA、GAM、MARS、KNN、QDA、决策树、随机森林、SVM分类葡萄酒交叉验证ROC...

全文链接:http://tecdat.cn/?p=27384在本文中，数据包含有关葡萄牙“VinhoVerde”葡萄酒的信息（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。介绍该数据集（查看文末了解数据获取方式）有1599个观测值和12个变量，分别是固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧化硫、总二氧化硫、密度、pH值、硫酸盐、酒精和质量。固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧
拓端研究室TRL·2023-09-20 07:34

rexp() R函数，生成服从指数分布的随机数

x<-rexp(100,1/10)#生成100个均值为10的指数分布随机数参考：R语言【rexp】__BANA的博客-CSDN博客
饮食有度的元气少女·2023-09-20 06:17

R语言自学笔记-----R的系统函数

R基础包中含有的函数种类很多，从计算功能上可以分为数学函数、概率函数、统计函数、矩阵运算函数、字符串函数、数据管理函数、逻辑判断函数、文件管理函数等。现在对上述函数进行简单的介绍，具体的更加复杂的操作可以自行参考R的帮助文档。一、数学函数数学函数在R中用于基础的数学运算，是统计分析的重要函数之一函数名称及书写格式函数用途abs(x)计算x的绝对值sqrt(x)计算x的平方根ceiling(x)输出
月月我媳妇·2023-09-20 06:16

实验设计——R语言（DAY02：R语言基础操作）

R语言基础操作1.基础操作#文件读取geted()seted()file.choose()read.csv(file.choose())#保存文件save()#加载R文件load()#加载某个包的数据集
cyt—srhloveyou·2023-09-20 06:16

2021-07-09：细数我在GO注释时遇到的那些报错

上回说到，我废了九牛二虎之力，终于拿到了百十来个GB的GOEVIDENCE数据，你猜怎么着，接着往下进行的时候发现，R语言根本读不了。。。。
wangyantao1991·2023-09-20 05:09

呜呜呜我哭出声来

今天在R语言上栽了跟头。
蓬举举·2023-09-20 03:05

【R语言】——相关性分析和热图绘制

本期介绍了利用R语言进行相关性分析和数据的可视化的方法。一、什么是相关性分析？相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。
在打豆豆的小潘学长·2023-09-20 03:07

r语言 相关性作图_R语言学习指南(6) 初探相关性热图

相关性热图，顾名思义就是根据数据之间的相关性系数来绘制热图，可分为2类：组内相关性热图与组间相关性热图组内相关性热图，即由一组数据内部的相关性系数绘制而成，废话不多说直接看代码相关性矩阵可视化library(tidyverse)library(corrplot)cor(mtcars) %>% corrplot(method = "circle",order = "hclust",type = "l
PP鲁·2023-09-20 03:35

安装Rtools

前言  R语言对于做数据分析的人来说应该很熟悉，这个开源的平台对于分析人员来说也是相当的友好，里面有很多相当好用的函数可供使用，当然还有很多可供使用的第三方R包。
生信店小二·2023-09-20 01:04

R语言风险价值：ARIMA，GARCH模型，Delta-normal法滚动估计，预测VaR|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24492原文出处：拓端数据部落公众号介绍此分析的目的是帮助客户构建一个过程，以在给定时变波动性的情况下正确估计风险价值。风险价值被广泛用于衡量金融机构的市场风险。我们的时间序列数据包括1258天的股票收益。为了解释每日收益率方差的一小部分，我们使用Box-Jenkins方法来拟合自回归综合移动平均(ARIMA)模型，并测试带下划线的假设。稍后，当
·2023-09-20 00:57

R语言逻辑回归Logistic选股因素模型交易策略及沪深300指数实证|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32071原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于交易策略的研究报告，包括一些图形和统计输出。随着中国的证券市场规模的不断壮大、市场创新不断深化、信息披露不断完善、市场监管不断强化，随着现代投资组合理论的发展和计算机技术的进步，投资者为了在股票交易中取得更多的收益，就需要有合理有效的投资策略，因素模型的基础上发展出众多量化研究模型。对
·2023-09-20 00:57

R语言箱型图 boxplot

boxplot简介boxplot称为箱型图，又叫做盒状图，胡须图。是用来表示数值类型数据分布状况的统计图。它能显示出一组数据的最大值、最小值、中位数、及上下四分位数。四分位数百度百科第一四分位数(Q1)，又称“较小四分位数”，等于该样本中所有数值由小到大排列后第25%的数字。第二四分位数(Q2)，又称“中位数”，等于该样本中所有数值由小到大排列后第50%的数字。第三四分位数(Q3)，又称“较大四分
santiagoru·2023-09-19 18:16

R语言分组求和，分组求平均值，分组计数

在R语言里面，aggregate函数就可以办到。
santiagoru·2023-09-19 18:16

R语言读取csv文件

read.csvR语言用read.csv读取csv文件，读取返回一个data.frame的内存对象。
santiagoru·2023-09-19 18:46

R语言有限混合模型聚类FMM、广义线性回归模型GLM混合应用分析威士忌市场和研究专利申请、支出数据|附代码数据

原文链接：http://tecdat.cn/?p=24742原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于有限混合模型聚类FMM的研究报告，包括一些图形和统计输出。摘要有限混合模型是对未观察到的异质性建模或近似一般分布函数的流行方法。它们应用于许多不同的领域，例如天文学、生物学、医学或营销。本文给出了这些模型的概述以及许多应用示例。介绍有限混合模型是对未观察到的异质性建模或近似一般分布函数
·2023-09-19 17:30

数据分享|R语言生态学种群空间点格局分析：聚类泊松点过程对植物、蚂蚁巢穴分布数据可视化...

全文链接:https://tecdat.cn/?p=33676点模式分析（点格局分析）是一组用于分析空间点数据的技术。在生态学中，这种类型的分析可能在客户的几个情境下出现，但对数据生成方式做出了特定的假设，因此让我们首先看看哪些生态数据可能与点模式分析相关或不相关（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频哪些数据适用于点模式分析？点模式分析的最重要假设是点的数量和位置都需要是随机的。此外，
拓端研究室TRL·2023-09-19 15:48

数据标准化 中心化以及R语言中scale

1.数据的中心化所谓数据的中心化是指数据集中的各项数据减去数据集的均值。例如有数据集1,2,3,6,3，其均值为3,那么中心化之后的数据集为1-3,2-3,3-3,6-3,3-3,即：-2,-1,0,3,02.数据的标准化所谓数据的标准化是指中心化之后的数据在除以数据集的标准差，即数据集中的各项数据减去数据集的均值再除以数据集的标准差。例如有数据集1,2,3,6,3，其均值为3,其标准差为1.87
赵会成·2023-09-19 13:59

一劳永逸的R语言运行环境管理方法

利用Anaconda进行R语言环境的管理。什么是AnacondaAnaconda是一种Python语言的免费增值开源发行版，用于进行大规模数据处理、预测分析，和科学计算，致力于简化包的管理和部署。
大道无形x我有型·2023-09-19 13:43

使用R语言包RIdeogram展示blast双序列比对结果

RIdeogram是用来展示染色体组型（idiogram）的一个R语言包，比如展示snp的密度分布；展示某类基因在染色体上的分布等等。
小明的数据分析笔记本·2023-09-19 11:32

R语言表与因子（详细知识点，深入知识点后续会补充！）

(1)level表示额外的信息,包含向量中不同值的记录>xxfxf[1]5121312Levels:51213#xf中不同数值(5,12,13)就是水平>length(xf)[1]4#因子的长度定义为数据的长度,而不是水平的长度#可以提前插入新的水平>xxffxff[1]5121312Levels:5121388>xff[2]xff[1]5881312Levels:5121388但是不能添加非法的
dulu~dulu·2023-09-19 11:38

洛克菲勒大学2021年生信课1：Introduction to R, session 1

R语言零基础同学看过来了，RockefellerUniversity最新的生信公开课。因为这个系列的课有PPT，所以我直接把PPT贴上来了，就不自己逐字逐句的打了（我好懒）。
生信start_site·2023-09-19 09:37

在R语言中轻松搞定数据透视表操作

【R语言】长宽格式数据相互转换函数介绍函数使用这里使用reshape2包中的dcast函数和acast函数，两个函数都可以将长格式数据转换成宽格式数据，dcast与acast几乎没有区别，唯一的差别在于
Sim1480·2023-09-19 08:16

跟着Cell学作图：R语言ggplot2做蜂群图的简单小例子

论文https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867421008916#da0010Ancientandmoderngenomesunraveltheevolutionaryhistoryoftherhinocerosfamilyimage.png犀牛本地论文1-s2.0-S0092867421008916-main.pdf数据和
小明的数据分析笔记本·2023-09-19 07:11

差异表达分析图及显著性标注

exp1<-rnorm(n=100,mean=10)exp2<-rnorm(n=100,mean=33)data.input<-data.frame(exp=c(exp1,exp2),Type=c(rep
judyhappy·2023-09-19 01:42

学习小组Day4笔记--彦凯

1.安装R（基础）和Rstudio2.了解R语言，认识Rstudio的工作界面2.1R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
前方道阻且长·2023-09-19 01:12

观察者笔记——阶段学习总结与未来安排（百日一更）

matplotlib四、网络爬虫五、人工智能5.1.传统机器学习5.2.深度学习六、数学建模七、数据结构与算法八、生物信息学九、人工智能+生物信息学十、常规软件系统的开发十一、观察者眼中的植物学十二、R语言十三
星石传说·2023-09-18 23:46

R语言Apriori算法关联规则对中药用药复方配伍规律药方挖掘可视化|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32316原文出处：拓端数据部落公众号我们常说的中药挖掘，一般是用药挖掘，还有穴位的挖掘，主要是想找出一些用药的规律。在中医挖掘中，数据的来源比较广泛,有的是通过临床收集用药处方，比如，一个著名老中医针对某一疾病的用药情况;有的是通过古籍，古代流传下来的药方;还有一种情况是在论文数据框里查找专门治疗某一疾病的文献，从中找到处方，用来分析。Aprio
·2023-09-18 23:04

视频|分类模型评估:精确率、召回率、ROC曲线、AUC与R语言生存分析时间依赖性ROC实现|附代码数据

p=20650原文出处：拓端数据部落公众号视频|分类模型评估:精确率、召回率、ROC曲线、AUC与R语言生存分析时间依赖性ROC实现分类模型评估精确率、召回率、ROC曲线、AUC与R语言生存分析时间依赖性
·2023-09-18 23:03

R语言Apriori关联规则、K-means均值聚类数据挖掘中药专利复方治疗用药规律网络可视化|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30605原文出处：拓端数据部落公众号应用关联规则、聚类方法等数据挖掘技术分析治疗抑郁症的中药专利复方组方配伍规律。方法检索治疗抑郁症中药专利复方，排除外用中药及中西药物合用的复方。最近我们被要求撰写关于用药规律的研究报告，包括一些图形和统计输出。对入选的中药专利复方进行术语规范化等处理，抽取信息、建立表，应用数据分析软件R对数据进行关联规则分析，
·2023-09-18 23:03

R语言生态学种群空间点格局分析：聚类泊松点过程对植物、蚂蚁巢穴分布数据可视化

全文链接:https://tecdat.cn/?p=33676原文出处：拓端数据部落公众号点模式分析（点格局分析）是一组用于分析空间点数据的技术。在生态学中，这种类型的分析可能在客户的几个情境下出现，但对数据生成方式做出了特定的假设，因此让我们首先看看哪些生态数据可能与点模式分析相关或不相关。哪些数据适用于点模式分析？点模式分析的最重要假设是点的数量和位置都需要是随机的。此外，我们需要知道客户的采
·2023-09-18 23:32

R语言绘图-3-Circular-barplot图

0.参考：https://r-graph-gallery.com/web-circular-barplot-with-R-and-ggplot2.html1.说明：利用ggplot绘制环状的条形图(circularbarplot)，并且每个条带按照数值大小进行排列。2绘图代码:注意：绘图代码中的字体为“TimesNewRoman”，如果没有这个字体的话，可以更换为其他字体，或者用下面代码加载改字体
@ZyuanZhang·2023-09-18 19:20

数据代码分享|R语言回归分析：体脂数据、公交绿色出行与全球变暖2案例|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32520原文出处：拓端数据部落公众号通常在现实应用中，我们需要去理解一个变量是如何被一些其他变量所决定的。最近我们被客户要求撰写关于回归分析的研究报告，包括一些图形和统计输出。回答这样的问题，需要我们去建立一个模型。一个模型就是一个公式之中，一个因变量（dependentvariable）(需要预测的值)会随着一个或多个数值型的自变量（indep
·2023-09-18 16:59

R语言关联规则Apriori对抗肿瘤中药数据库知识发现研究|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32660原文出处：拓端数据部落公众号肿瘤是近年来严重威胁人类的健康的疾病,据统计,目前大部分种类的肿瘤都呈现不同程度的上升趋势,中国因患肿瘤而死亡的人数约占全球肿瘤死亡总人数的1/4左右,人类正面临着肿瘤防治的新挑战。现代医学治疗肿瘤的手段和方式已经日臻完善,主要为手术配合放、化疗联合治疗。但传统西医治疗在提高缓解率的同时易产生较强的毒副作用与耐
·2023-09-18 16:58

R语言用logistic逻辑回归和AFRIMA、ARIMA时间序列模型预测世界人口|附代码数据

全文下载链接:http://tecdat.cn/?p=27493最近我们被客户要求撰写关于预测世界人口的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文应用R软件技术，分别利用logistic模型、ARFMA模型、ARIMA模型、时间序列模型对从2016到2100年的世界人口进行预测作者将1950年到2015年的历史数据作为训练集来预测85年的数据。模型稳定性经过修正后较好，故具有一定的参考价值。引言随着时
·2023-09-18 16:37

数据分享|R语言逻辑回归、线性判别分析LDA、GAM、MARS、KNN、QDA、决策树、随机森林、SVM|附代码数据

全文链接:http://tecdat.cn/?p=27384最近我们被客户要求撰写关于葡萄酒的研究报告，包括一些图形和统计输出。在本文中，数据包含有关葡萄牙“VinhoVerde”葡萄酒的信息介绍该数据集（查看文末了解数据获取方式）有1599个观测值和12个变量，分别是固定酸度、挥发性酸度、柠檬酸、残糖、氯化物、游离二氧化硫、总二氧化硫、密度、pH值、硫酸盐、酒精和质量。固定酸度、挥发性酸度、柠檬
·2023-09-18 16:06

R语言用logistic逻辑回归和AFRIMA、ARIMA时间序列模型预测世界人口|附代码数据

全文下载链接:http://tecdat.cn/?p=27493最近我们被客户要求撰写关于预测世界人口的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文应用R软件技术，分别利用logistic模型、ARFMA模型、ARIMA模型、时间序列模型对从2016到2100年的世界人口进行预测作者将1950年到2015年的历史数据作为训练集来预测85年的数据。模型稳定性经过修正后较好，故具有一定的参考价值。引言随着时
·2023-09-18 16:35

R语言与数据分析实战7-时点类函数

第1关：R自带的时点类函数任务描述R中其实有不少比较实用的时点类函数，我们在上一实训末尾介绍的几个时点计算方法算是其中的基础，而对于日期以及时间的相关时点处理，除了在上一个实训中提到的差值运算，还有很多高阶处理手段，比如日期或者时间的分组、关键日期（或时间）信息提取等。我们将在本关介绍Rstudio中相关自带函数的使用方法。#####R_date_adv.R###########begin####
Ssaty.·2023-09-18 14:37

代做CSE207、代写java/C++、代做systems、代写CS/Python程序设计调试C/C++编程|代做R语言编程

CSE207-Assessment2Semester1–2018/2019Section1.AssessmentInformationAssessmentNumber2ContributiontoOverallMark10%Submissiondeadlineat6pmonFriday,Nov.302018Section2.RelevantLearningOutcomesforthisAssess
guibijian·2023-09-18 13:35

R语言实现卡方检验并计算OR值

实现卡方检验和计算OR值library(epitools)tapw<-c("Lowest","Intermediate","Highest")outc<-c("Case","Control")#数据特点，第一行为基准，第一列为对照组，本例数据对照组在最后，后期需要设置rev="c"。dat<-matrix(c(2,29,35,64,12,6),3,2,byrow=TRUE)dimnames(dat
weixin_49320263·2023-09-18 12:43

R语言实现样本量的估算（2）

本文默认α=0.05(sig.level)，β=0.2(power)，根据研究需要可调整。导入包library(pwr)（1）已知标准差和预期差异1、单样本t检验：某治疗措施预期提高某物质水平8mg/L，标准差为10mg/L。#单样本t检验pwr.t.test(d=8/10,#期望的平均差异/总体标准差sig.level=0.05,power=1-0.2,type="one.sample",alt
weixin_49320263·2023-09-18 12:42
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