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r语言glmnet
数据可视化需要学习哪些知识
可视化工具:掌握至少一种常用的可视化工具,如Excel、Python的Matplotlib、Seaborn库、
R语言
的ggplot2库、Tableau等
优游的鱼
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2023-10-25 09:55
信息可视化
学习
python
数据分析
开发语言
R语言
生物群落(生态)数据统计分析与绘图
R语言
作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂,涉及众多统计分析方法。
Mr.靳靳477302280
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2023-10-25 06:06
环境
生态
r语言
1024程序员节
生物群落
跟着Cell学作图 | 2.柱状图+误差棒+散点+差异显著性检验
“复现是学习
R语言
的最好办法。”2021.4.12_1DOI:10.1016/j.cell.2020.05.032这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学文章里面有大量的生信内容。
木舟笔记
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2023-10-25 04:27
Matlab快速绘制类似
R语言
中的散点密度图
这里通过将数据进行重采样,进而绘制类似于
R语言
的散点密度图(输入的样本数量为459780个),重采样后的数据量降到4731:绘制的结
A-Chin
·
2023-10-25 02:04
数据处理
小技巧
matlab
r语言
matlab
开发语言
R语言
字符串截取(substr()函数和substring()函数)
1.语法代码参数备注substr(s,first,last)first和last为截取的起始位置。必须设置参数first和last,否则出错。substring(s,first,last=1000000)first和last为截取的起始位置。可以只设置first参数,last参数缺省时则默认为1000000,指字符串的最大长度。2.示例>ssubstr(s,2,5)[1]"2345">substr
A-Chin
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2023-10-25 02:33
R
r语言
字符串截取
substr函数
substring函数
R语言
设置数值输出(保留至小数点后位数和保留有效数字)
文章目录1options(digits)函数2round(x,n)函数3signif(y,n)函数4sprintf(fmt,...)函数在
R语言
中,数字的输出默认为7位:>a=0.1234567890#10
A-Chin
·
2023-10-25 02:02
R
R语言
数值输出
保留有效数字
保留小数点后位数
R语言
处理数据——生成随机数
生成随机数#如下连续生成16组1:3的随机不重复整数(每次3个),存储至repl中:repl<-NULLfor(xin1:16){repl<-c(repl,sample(1:3,3,replace=F))}
小八四爱吃甜食
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2023-10-24 18:45
开源项目
R语言
r语言
【
R语言
】箱线图统计检验线段长度
rm(list=ls())data("iris")library(ggplot2)library(ggsignif)library(ggsci)comp_list=list(c('setosa','versicolor'),c('setosa','virginica'))ggplot(iris,aes(Species,Sepal.Length,color=Species))+geom_boxplo
研究僧小蓝哥
·
2023-10-24 17:57
R语言
结题实验报告:近年来我国城区用地变化的影响因素和驱动机制的研究
目录1、小组分工2、数据采集与预处理2.1、数据采集与校正2.2、数据异常值检验与处理2.2.1缺失值检测与处理2.2.2离群点检测与处理3、相关性分析与相关性检验3.1、相关性分析3.2、相关性检验4、拟合回归方程4.1、使用主成分分析拟合一元线性回归方程4.2、使用最小二乘法拟合多元线性回归方程5、模型评估与回归诊断6、结果分析1、小组分工A:编写代码、数据采集、整合分析过程、编写实验报告B:
笼中小夜莺
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2023-10-24 16:40
R语言
数据分析
r语言
R语言
基础知识入门学习(一)
目录系列文章目录一、软件下载二、基本知识1.对象2.向量3.向量化4.因子总结系列文章目录
R语言
基础知识入门学习(一)一、软件下载我们可以通过这个网址对
R语言
软件进行下载,进入后界面如下R:TheRProjectforStatisticalComputinghttps
G氏yousa
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2023-10-24 11:52
R语言学习
r语言
学习
R语言
基础知识入门学习(二)
系列文章目录
R语言
基础知识入门学习(一)
R语言
基础知识入门学习(二)生成序列R提供了多种生成不同类型序列的方法。
G氏yousa
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2023-10-24 11:52
R语言学习
r语言
学习
开发语言
R语言
绘图函数:plot函数、x轴和y轴的标签、注释函数小结
R语言
绘图函数:plot函数、x轴和y轴的标签、注释函数小结在
R语言
中,plot函数是用于绘制图形的常用函数之一。
程序员拓荒
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2023-10-24 11:17
R语言
r语言
开发语言
R语言
R语言
分组箱线图添加显著性标记简单小例子
部分示例数据如下image.png第一列是数值第二列是处理一-第三列是处理二最终出图如下image.png这里自动做统计检验的函数是stat_compare_means()首先是做箱线图和小提琴图的代码读入数据df<-read.csv("boxplot_example_1.csv",header=T)head(df)作图library(ggplot2)ggplot(data=df,aes(x=do
小明的数据分析笔记本
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2023-10-24 09:53
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggplot2散点组合误差线展示响应比(Response ratio)
论文Meta-analysisoftheimpactsofglobalchangefactorsonsoilmicrobialdiversityandfunctionalityhttps://www.nature.com/articles/s41467-020-16881-7#Sec15论文里提供了数据和代码,很好的学习素材这篇论文是公众号的一位读者留言,说这篇论文提供了数据和代码,但是代码比较长
凉亭下
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2023-10-24 07:19
r语言
开发语言
跟着NatureMetabolism学作图:
R语言
ggplot2转录组差异表达火山图
论文Independentphenotypicplasticityaxesdefinedistinctobesitysub-typeshttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00629-2#Sec15s42255-022-00629-2.pdf论文中没有公开代码,但是所有作图数据都公开了,我们可以试着用论文中提供的数据模仿论文中的图今天的推文重复一下论
凉亭下
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2023-10-24 06:42
r语言
开发语言
Spark 简介
是基于内存计算的大数据并行计算框架具有如下特点:运行速度快Spark使用先进的DAG执行引擎,基于内存的执行速度可比HadoopMapReduce快上百倍,基于磁盘的执行速度也能快十倍容易使用支持使用Scala、Java、Python和
R语言
进行编通用性
博弈史密斯
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2023-10-23 16:22
Mongo+Spark
Java,python,scala及
R语言
的支持也是其通用性的表现之一。快速:这个可能是
亮亮-AC米兰
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2023-10-23 14:15
Spark
Mongo
Spark
微信小游戏屏幕适配方案
参考:https://blog.csdn.net/tianbo_zhang/article/details/80321972工具引擎:LayaAi
r语言
:AS3声明没有全能的适配方案16/9是大部分手机的比例尽量适配大部分手机
一眼就认出你
·
2023-10-23 12:09
在
R语言
的数据可视化工具ggplot2中,我们经常需要为图像添加标题,并且有时候我们希望将标题放置在图像内部的特定位置
在
R语言
的数据可视化工具ggplot2中,我们经常需要为图像添加标题,并且有时候我们希望将标题放置在图像内部的特定位置。
DarcyCode
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2023-10-23 08:10
R语言
信息可视化
r语言
开发语言
R语言
绘制逻辑斯蒂(logistic)生长曲线
我们在做真菌或者细菌的时候,一般都需要绘制一条生长曲线。我一般选择用冻干仪将菌丝冻干然后称量干重。很多物种的生长都符合逻辑斯蒂模型,这里就不过多讲解。直接上代码。PS:这还是我本科写的代码,时隔两年翻出来用,好有年代感,怀念。定义数据集:发酵时间为15天,也就是称量15次干重。m|t|)K.alpha0.5854210.00930462.92<2e-16***R.scale0.3821740.02
PriscillaBai
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2023-10-23 07:33
R语言
实战第四章
4.1创建leadership数据框manager75]=55&leadership$age75]=55&age建立一个54的矩阵y30,]#选择所有30岁以上的男性另一种写法attach(leadership)newdata30,]detach(leadership)4.10.4subset函数newdata25&gender=='M',select=gender:q4)4.10.5随机抽样my
小磨人人人人精
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2023-10-23 06:52
跟着Cell学作图:
R语言
ggplot2作图展示差异表达的基因
一组对照加处理这种实验的差异表达分析结果通常是用火山图来展示,如果是很多组实验的话如何展示,这种情况我之前还没有遇到过。公众号后台有读者留言问到了如下的图image.png这个图来自于论文ASpatiotemporalOrgan-WideGeneExpressionandCellAtlasoftheDevelopingHumanHeart本地pdfPIIS0092867419312826.pdf他
小明的数据分析笔记本
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2023-10-23 04:58
如何将html格式动态图表网页嵌入ppt中
这确实很尴尬他呀,你不能直接拿着Rstudio跟客户演示呀(而且还不保证每一台PC上都安装有
R语言
软件),如果是ppt展示,突然退出来,然后用浏览器打开html文件也是够突兀的。
榴莲气象
·
2023-10-22 20:58
学生成绩统计实验linux,
R语言
-模拟产生统计专业学生的成绩
现在本人会以一个例子来说明
R语言
在统计学中的应用。模拟一个高中学生语数外三科的成绩单。
慧人小圣
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2023-10-22 20:32
学生成绩统计实验linux
SQL Seve
r语言
存储过程及触发器
存储过程:就像函数一样的会保存在数据库中--》可编程性--》存储过程创建存储过程:保存在数据库表,可编程性,存储过程createprocjiafa--需要的参数@aint,@bintas--存储过程内容declare@cint;set@c=@a+@b;return@c;go相当于一个函数publicint函数名(变量1,变量2){函数语句returnintc}存储之后可以直接调用,执行存储过程ex
dinghuangni7242
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2023-10-22 17:17
数据库
面试
R语言
中的颜色(一)
利用R绘图的时候,颜色是一个经常需要设置的参数。好的颜色搭配除了可以让你的图看上去更高大上,同时也能让结论更突出。接下来小编会用四期的内容来跟大家聊聊R里面的配色方案。在R里面,一般常用的单个颜色,我们可以直接使用对应的英文单词,如red,blue,yellow,green等等。在R里面像这样可以直接用英文单词调用的颜色一共有657个,可以使用colors()来查看colors()下面我们来看看R
生信交流平台
·
2023-10-22 15:06
「数据结构与算法」什么是数组,如何用C实现一个简单的动态数组
如果你用过
R语言
,那么一定用过向量,如果用Python,那么一定用过列表。那么问题来了,这两类数据结构有什么区别呢?
xuzhougeng
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2023-10-22 14:38
R语言
:主成分分析PCA
文章目录主成分分析处理步骤数据集code主成分分析主成分分析(或称主分量分析,principalcomponentanalysis)由皮尔逊(Pearson,1901)首先引入,后来被霍特林(Hotelling,1933)发展。主成分分析是一种通过降维技术把多个变量化为少数几个主成分(即综合变量)的统计分析方法。这些主成分能够反映原始变量的绝大部分信息,它们通常表示为原始变量的某种线性组合。主成分
Cachel wood
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2023-10-22 08:06
r语言
开发语言
windows
transformer
R
PCA
降维
R语言
:因子分析 factor analysis
文章目录因子分析数据集处理步骤主成分法做因子分析最大似然法做因子分析因子分析因子分析的用途与主成分分析类似,它也是一种降维方法。由于因子往往比主成分更易得到解释,故因子分析比主成分分析更容易成功,从而有更广泛的应用。从方法上来说,因子分析比主成分分析更为精细,自然理论上也就更为复杂。主成分分析只涉及一般的线性变换,不涉及模型,仅需假定二阶矩存在。而因子分析需建立一个数学模型,并作一定的假定。因子分
Cachel wood
·
2023-10-22 08:03
r语言
开发语言
transformer
python
windows
因子分析
FA
【
R语言
】--- graphics包的barplot()函数绘制柱状图
在
R语言
中,有很多包可绘制柱状图,比如graphics包barplot()函数和ggplot2包geom_bar()函数。本文介绍graphics包的barplot()函数绘制柱状图。
XXX美琳
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2023-10-22 01:17
r语言
开发语言
R语言
清洗与处理数据常用代码段
去掉数据框df的某一列:#删除不必要的变量data$unnecessary_var<-NULL选择需要的列进行读入数据框:#选择需要的列selected_cols<-c("col1","col2","col3")data<-fread("data.csv",select=selected_cols)逐块读取数据:如果数据集太大无法一次性读取到内存中,可以尝试使用逐块读取的方式,将数据分割成较小的块
XXX美琳
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2023-10-22 01:16
r语言
python
开发语言
R实战 | Lasso回归模型建立及变量筛选
在这篇文章中,我们学习如何使用R包
glmnet
包建立LASSO模型。原文:https://mp.weixin.qq.com/s/Q-76vY
木舟笔记
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2023-10-21 23:26
R语言
学习笔记--利用R绘制T–S diagram
下面提供
R语言
绘制法。#先加载包library(testthat);library(gsw);library(oce)library(ggplot2);library(stringr);libra
逍遥尐生
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2023-10-21 19:31
在服务器中使用R--RStudio Server
RStudioServer是网页版的RStudio,相比于单机版,它的灵活性更强,部署在服务器上后,可随时随地完成
R语言
的工作。并且能很方便的完成R项目的部署调试。
FTDdata
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2023-10-21 18:47
R语言
学习 | 如何提取指定行名的行?
想要实现的目标如题。善用属于符号:%in%,以及不要忘记XX$V1。我想要提取数据框cpm2中行名在vectorinterest中的行,使用如下指令解决。interest<-read.table("result_coding_gene_id_2.txt")data<-cpm2[which(rownames(cpm2)%in%interest$V1),]interestV11ENSG00000000
今天也是个妖精头子呀
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2023-10-21 18:14
R语言绘图
r语言
开发语言
生物信息学
学习小组Day4笔记--刘洪
安装
R语言
和Rstudio安装的话,查看desktop的上一级,查看它是不是英文---是的话,否则无法安装Rstudio
R语言
是什么,干什么的,认识Rstudio的工作界面1590422044(1).png
刘洪_8afd
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2023-10-21 16:05
[个人笔记]
R语言
入门,个人查找手册 + mRNA数据预处理
相关点总结通用打印:print&sprintf&catprint(sprintf("something:%d",i)#不要漏了print,不然不输出使用print则转义字符失效,建议使用cat。注意print有自动换行,cat没有。(但print可以打印各种格式,包括list;而cat好像不能打印list,可能是只能打印字符串,本人暂未查证)因此,含转义字符的字符串用cat;其他数据类型如list
YuQiao0303
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2023-10-21 11:12
R语言
癌症分型
个人笔记
r语言
2017-8-27
R语言
学习路线
标签:有道云笔记1.初级入门《AnIntroductiontoR》,这是官方的入门小册子。其有中文版,由丁国徽翻译,译名为《R导论》。《R4Beginners》,这本小册子有中文版应该叫《R入门》。除此之外,还可以去读刘思喆的《153分钟学会R》。这本书收集了R初学者提问频率最高的153个问题。为什么叫153分钟呢?因为最初作者写了153个问题,阅读一个问题花费1分钟时间,全局下来也就是153分钟
怪异收集者
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2023-10-21 05:12
r语言
学习
第3章
R语言
编程基础——基于R软件的传统计算(超详细)
3.1统计分析多元统计分析常用的R包和函数3.1.1多元回归分析随机误差ε:计量模型案例分析:M2的建模与预测残差的五数估计参数的回归值、标准差、t检验量、p-value单变量显著性检验拟合优度和F检验Residualstandarderror:0.2046on128degreesoffreedomMultipleR-squared:0.852,AdjustedR-squared:0.8485F-
村里小公举
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2023-10-21 05:37
R语言基础
r语言
开发语言
R语言
-随机前沿分析法--SFA
3.1介绍生产函数模型:lnqi=x’i*b+vi-ui(随机生产前沿函数)qi:产出变量向量x’i:投入变量向量b:变量参数估计vi:统计噪声的对称随机误差ui:无效效应3.2度量技术效率的方法—SFA(参数),DEA(非参数)在经济学中,技术效率是指在既定的投入下产出可增加的能力或在既定的产出下投入可减少的能力。常用度量技术效率的方法是生产前沿分析方法。所谓生产前沿是指在一定的技术水平下,各种
hualigagaga
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2023-10-21 05:05
r语言
开发语言
R语言
的计量经济学技术
量经济学通常使用较小样本,但这种区别日渐模糊,机器学习在经济学领域、特别是经济学与其它学科的交叉领域表现日益突出,
R语言
是用于统计建模的主流计算机语言,在本次培训中,我们将从实际应用出发,重点从数据的收集与清洗
天青色等烟雨..
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2023-10-21 05:30
R语言
经验分享
r语言
2019-05-05《
R语言
绘图》之饼图 Pie Charts 自学笔记
《
R语言
绘图》之饼图PieCharts自学笔记语法:pie(x,labels=names(x),edges=200,radius=0.8,clockwise=FALSE,init.angle=if(clockwise
伊莲娜娜
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2023-10-21 05:19
R语言
中fread怎么使用?
R语言
中fread怎么用?今天分享的笔记内容是数据读取神器fread,速度嘎嘎快。
生信分析笔记
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2023-10-21 04:11
后端
R语言
数据可视化ggplot2-检验变量相关性图形汇总
可视化用于检验变量相关性本文介绍的图主要有助于检查两个变量的相关程度。共涉及图形包括:1.散点图Scatterplot2.带环绕的散点图ScatterplotwithEncircling3.抖动图JitterPlot4.计数图CountsChart5.气泡图BubblePlot6.边际直方图/箱线图MarginalHistogram/Boxplot7.相关图Correlogram1.散点图Scat
RookieTrevor
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2023-10-21 02:56
R语言vs科研
r语言
R语言
数据相关性分析及可视化
R语言
数据相关性分析及可视化数据相关性分析是数据科学中常用的一种技术,用于确定两个或多个变量之间的关系强度和方向。在
R语言
中,有许多强大的函数和包可以用于执行相关性分析,并通过可视化工具呈现结果。
纸飞机的轨迹
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2023-10-21 02:56
R语言
r语言
开发语言
R语言
RStudio实现空气质量数据可视化
爬取的网站是:https://www.aqistudy.cn/historydata/index.php,之前博客写了
R语言
爬取的天气网站数据集下载:链接:https://pan.baidu.com/s
Mrrunsen
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2023-10-21 02:56
R语言大学作业
信息可视化
r语言
开发语言
conda使用
R语言
--安装(Ubuntu)
在conda中使用
R语言
可以避免很多问题,更方便,特别是在无root权限时首先下载miniconda,https://docs.conda.io/projects/miniconda/en/latest
小龙虾笨死
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2023-10-20 20:12
利用
R语言
做基因表达图RT-qPCR(一):数据的准备及整理
1、对数据进行整理。将Cq值按照下列格式,在excel中整理好,并将其另存为Cq.csv。注:NA,表示没有Cq值。2、计算基因的Cq的平均值及SDsetwd("D:/R/data")##设定数据所在的路径。Gene.cq<-read.csv("Cq.csv")##读取数据到内存。library(plyr)##调用程序Gene.mcq<-ddply(Gene.cq,c("Target","Samp
orchidlove
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2023-10-20 15:16
r语言
数据
基因RT-qPCR
pcorr3d图像的相位相关,
R语言
imagefx包,时序图像特征识别
pcorr3d图像的相位相关,
R语言
imagefx包,时序图像特征识别#TueOct1214:37:462021edit#字符编码:UTF-8#R版本:R4.1.1x64forwindow11#cgh163email
youmigo
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2023-10-20 14:03
基于“SRP模型+”多技术融合在生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI 指数的生态质量评价及拓展应用
查看原文>>>基于“SRP模型+”多技术融合在生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价及拓展应用本文集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析,
R语言
统计分析的优势
吹翻书页的风
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2023-10-20 12:41
农林生态遥感
环境科学
SRP模型
生态环境脆弱性评价
时空格局演变分析
RSEI
指数
生态质量评价
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