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【单细胞测序】数据格式转换loomR

今天读文献，遇到比较感兴趣的样本，数据下载下来是loom文件，查了下loom文件转换为seurat对象的方法。做个笔记。背景seurat分析无法应付指数级增长的单细胞数据集计算需求。

森尼啊·2024-01-03 20:18

深度学习|Keras识别MNIST手写数字（一）

数据下载和处理数据下载Keras已经提供了模块用于下载数据，通过一下代码即可完成下载。

罗罗攀·2024-01-03 18:45

2022-03-07：substr函数在TCGA数据中提取样本信息

1：了解substr函数（截取函数），从start位置开始提取字符串，示例如下2：用substr函数在TCGA数据中提取样本信息tumor=10]根据TCGA数据中14，15位代表样本性质来提取分组信息

小白的生信之路·2024-01-03 12:42

基于长短期神经网络lstm的求解方程

目录背影摘要代码和数据下载：基于长短期神经网络lstm的求解方程资源-CSDN文库https://download.csdn.net/download/abc991835105/87657743LSTM

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2024-01-03 08:00

COLMAP 三维重建笔记

目录安装COLMAPCOLMAP数据下载使用Colmap+OpenMVS进行物体的三维重建安装COLMAP1.1下载Colmap：https://demuc.de/colmap/#download选择cuda

AI视觉网奇·2024-01-02 09:23

(Matlab)基于CNN-LSTM的多维时序回归预测(卷积神经网络-长短期记忆网络)

目录一、程序及算法内容介绍：基本内容：亮点与优势：二、代码实际运行结果展示：三、部分代码展示：四、本文完整代码+数据下载：一、程序及算法内容介绍：基本内容：本代码基于Matlab平台编译，将卷积神经网络

神经网络与数学建模·2024-01-01 20:57

门控循环单元(GRU)-多输入时序预测

目录一、程序及算法内容介绍：基本内容：亮点与优势：二、实际运行效果：三、部分代码：四、完整代码+数据下载：一、程序及算法内容介绍：基本内容：本代码基于Matlab平台编译，使用门控循环单元(GRU)，进行数据回归预测输入训练的数据包含

神经网络与数学建模·2024-01-01 20:25

千人基因组计划基因分型数据下载

最近需要下载千人基因组计划中的中国人数据作为参考，于是学习了下几个下载方法。发现还是有几个小技巧值得分享的，就记录分享一下！我找到的主要方法有两三个，分别是通过网页下载，API批量下载和ftp批量下载。1.网页下载这个比较简单，也已经有很多教程，列在这里，我就不写了。千人基因组计划数据库下载某段区域SNP传说中的千人基因组计划2.ftp或者ascp批量下载1)下载所有的数据和位点如果你需要所有的数

zd200572·2024-01-01 19:23

叶绿体基因组组装

组装叶绿体基因组安装condainstall-cbiocondagetorganelle安装叶绿体基因组databasesget_organelle_config.py--addembplant_ptNCBI测试数据下载从网上随机找了一篇文章进行组装文章链接

就叫啵啵吧·2024-01-01 16:17

八. 实战：CUDA-BEVFusion部署分析-环境搭建

目录前言0.简述1.CUDA-BEVFusion浅析2.CUDA-BEVFusion环境配置2.1简述2.2源码下载2.3模型数据下载2.4基础软件安装2.5protobuf安装2.5.1apt方式安装

爱听歌的周童鞋·2023-12-31 22:36

AVISO提供的MSLA数据下载

AVISO（ArchivingValidationandinterpretionofSatelliteOceanography）官方网站为：https://www.aviso.altimetry.fr/en/home.html首先申请账号，在申请账号时填写需要数据的名称，用途等相关信息。邮箱地址一定要填写正确，因为后续的消息都是通过邮件传递。申请好后就会收到AvisoUserServices官方发

旋转地球·2023-12-31 21:26

欧空局新版哥白尼数据下载系统简介与使用——下载sentinel-1、sentinel-2、sentinel-3、sentinel-5p、DEM和年度、季度无云影像(worldcover-cloudl)

欧空局新版哥白尼数据下载系统简介与使用——下载sentinel-1、sentinel-2、sentinel-3、sentinel-5p、DEM和年度、季度无云影像0前言1注册：2新版下载系统的特性2.1

Vigo*GIS_RS·2023-12-31 21:25

基于自定义权重的支持向量机，基于自定义权重的SVM

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于自定义权重的支持向量机，基于自定义权重的SVM资源-CSDN文库https

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-31 21:55

关于卫星测高沿轨数据下载地址及使用方法

数据下载地址：CMEMS官网CMEMS账号密码输入都是对的，但无法登录，提示为账号密码不匹配。原因：浏览器的原因。ME浏览器会出现此问题，换用IE和谷歌就可以登陆。

糖Cindy·2023-12-31 21:24

CMEMS数据下载

CMEMS最近在更新数据库，有一些数据库不能像之前一样在网页上下载了，但是CMEMS推荐了一个工具CopernicusMarineToolbox，通过脚本进行下载。环境：Ubuntu20.04一、CopernicusMarineToolbox安装（原文为mamba或者python，这里用conda安装）新建一个文件，命名为copernicus-marine-client-env.yml，文件复制内

竹泉听风·2023-12-31 21:54

GWAS数据下载详解（3）

（1）GWASCatalog关于GWASCatalog数据库的下载，本文主要使用gwasrappid实现。#使用gwasrappidlibrary(gwasrapidd)help(package="gwasrappid")#获取研究my_studies%#根据P值筛选tidyr::drop_na(pvalue)%>%dplyr::pull(association_id)->association_

weixin_49320263·2023-12-31 14:39

TCGA TOBACCO_SMOKING_HISTORY含义

在UCSCXena下载的临床信息中有tobacco_smoking_history这列信息，从1到5，知道是跟吸烟有关但不知道什么数字含义，google查到可能的解释LifelongNon-smoker(lessthan100cigarettessmokedinLifetime)=1Currentsmoker(includesdailysmokersandnon-dailysmokersorocc

王诗翔·2023-12-31 08:43

哨兵2号数据下载及处理【ai earth】

AIEarth提供了一系列的工具和服务一、数据下载可以方便快捷的下载数据，比如哨兵2号数据，比在欧空局要快很多很多，配合idm使用。二、处理分析提供了很多工具，具体效果需要看实际情况。

binToDo·2023-12-30 22:25

DEM数据下载——以地理空间数据云为例

数字高程模型（DigitalElevationModel)是进行地形分析的重要基础，诸如坡度、坡向及水文分析等都在此基础上进行。今天，我们一起来聊一聊一种DEM数据常见下载方式。按照惯例，先将网址列出：https://www.gscloud.cn/home地理空间数据云是由中国科学院计算机网络信息中心科学数据中心开发的在线平台，支持数据检索下载及相关服务。平台提供了一系列DEM数字高程数据产品，包

角砾岩队长·2023-12-30 22:22

基于支持向量机SVM的界面黏附能预测，SVM的详细原理，SVM工具箱使用说明

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于支持向量机SVM的界面黏附能预测(代码完整，数据齐全)资源-CSDN文库https

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-30 21:16

SVM的详细原理，SVM工具箱使用说明，基于SVM的油压油温预测，基于支持向量机SVM的油压油温预测

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于SVM的油压油温预测，基于支持向量机SVM的油压油温预测资源-CSDN文库

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-30 21:45

如何下载全国POI兴趣点数据？

通过以下方法可以将全国POI兴趣点数据下载到本机。

GIS数据转换器·2023-12-30 03:37

ChIP-seq 数据分析

1ChIP-Seq技术1.1概念1.2ChIP-seq技术原理2ChIP-Seq数据分析2.1数据下载2.2质量控制（data_assess）2.3比对到参考基因组（mapping_analysis）2.4

fengzhibifang·2023-12-29 19:13

ChIP-seq笔记

文章目录ChIP-seq学习1数据下载1.1数据主要分为三个部分1.2从NCBI上下载数据2质量控制2.1软件安装2.2转化数据格式sra-----fastq2.3下载小鼠参考基因组的index2.4质量检测

sunyu_03·2023-12-29 19:43

ChIP-seq 数据分析1 ChIP-Seq技术2 ChIP-Seq数据分析

1ChIP-Seq技术1.1概念1.2ChIP-seq技术原理2ChIP-Seq数据分析2.1数据下载2.2质量控制（data_assess）2.3比对到参考基因组（mapping_analysis）2.4

wx1871428·2023-12-29 19:43

CHIP-Seq数据分析流程

美丽的lemon·2023-12-29 19:41

Bulbea助力实现股票的深度学习量化

1.1加载数据Bulbea内置了数据下载模块，让你很轻易地能够下

python慕遥·2023-12-29 16:10

TCGA基因表达文件提取免疫相关基因

萍智医信·2023-12-29 08:58

生信分析矫正P值_甲基化芯片数据的差异分析

火山图有误，阅读原文看修改版前情提要前面两个步骤已经完成了数据下载、探针过滤、数据质控、样本

weixin_39902598·2023-12-29 05:53

TCGA新版数据差异分析

上一篇文章里面简单学习了一下表达矩阵的提取，顺便探索了一下SummarizedExperiment对象。今天学习下用TCGAbiolinks做差异分析。加载R包和数据rm(list=ls())library(SummarizedExperiment)##Loadingrequiredpackage:MatrixGenerics##Loadingrequiredpackage:matrixStats

医学和生信笔记·2023-12-28 16:04

基于SVM的冷却剂流量预测，基于支持向量机SVM的冷却剂流量预测

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于SVM的冷却剂流量预测，基于支持向量机SVM的冷却剂流量预测（代码完整，数据齐全

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-28 11:14

基于支持向量机SVM的港口分类，SVM原理，SVM工具箱详解

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于支持向量机SVM的港口分类（代码完整，数据齐全）资源-CSDN文库https

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-28 11:14

UE4中使用地理数据构建数字城市

p=21、可以使用通过OSM数据生成任意的区域模型OSM数据下载网站：https://www.openstreetmap.org/，可以搜索指定的地理区域，框选后导出指定区域osm数据2、将osm数据导入到

李留白·2023-12-28 08:45

yolov8 细胞分割数据集准备及训练

1、数据下载：https://universe.roboflow.com/motherson-hm/5-part-diff500来张，5个类别（嗜碱性细胞、嗜酸细胞、淋巴细胞、单核细胞、中性粒细胞）yolo

loong_XL·2023-12-28 01:11

1. pytorch mnist 手写数字识别

文章目录一、数据集介绍1.1、简介1.2详细介绍1、数据量2、标注量3.标注类别4.数据下载5.数据集解读二、读取、加载数据集1、pytorch自带库函数2、通过重构Dataset类读取特定的MNIST

nsq_ai·2023-12-27 17:06

模型微调入门介绍一

模型微调大致会有下面5大步骤，其中数据下载主要用transformers库中的datasets来完成，数据预处理部分会用到tokenizer对象。本篇博客会重点介绍数据加载和数据预处理

taoli-qiao·2023-12-27 14:39

TCGA超过1G的病理wsi数据下载-gdc-client

使用网页端下载TCGA超过1G的病理wsi数据，数据下载到1G后就不能完整下载。遂采用gdc-client下载。

hx2024·2023-12-27 02:42

echarts生成地图(自定义区域色块,自定义图标样式,自定义移入效果)

echarts生成一个地图,看一下生成效果图二、使用步骤1.先准备需要的数据DataV.GeoAtlas地理小工具系列可以去这个网站下载需要的json数据,也可在线引入,但是发布到线上有问题,所以我这边是直接把数据下载到本地使用

芒果沙冰哟·2023-12-26 17:34

CNA和CNV

copy-numberalterations：体细胞事件，体细胞中染色体/基因的缺失或扩增copynumbervariations：生殖细胞事件但但但是，TCGA用的一直都是CNV而不是C

被格格巫抓到的蓝精灵·2023-12-26 11:42

基于SVM的用气量预测，基于支持向量机SVM的用气量预测

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于SVM的用气量预测，基于支持向量机SVM的用气量预测（代码完整，数据齐全）

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-25 09:13

从CNS封面文章中找数据 | Science：人类原发性肿瘤染色质可及性图谱

利用ATAC-seq对来自TCGA的涉及23种人类癌症类型的410个肿瘤样本进行染色质可及性分析，鉴定了近56.3万个DNA调节元件，绘制了796个全基因组染色质可及性图谱。

尐尐呅·2023-12-25 07:46

Landsat8温度反演&地图制图

1、landsat8数据下载（中科院遥感数据共享平台）地址：http://ids.ceode.ac.cn/query.html注：需先注册账号，可能需要时间等待网站审核通过1）查询数据前先登录2）设置好查询条件

Run不动了·2023-12-24 21:08

Python遥感图像处理指南(5)-投影、镶嵌、裁剪和叠加

1、数据下载进入网站（自己想办法），找到之前哨兵影像对应的区块，我之前下载的是位于巴西的70W0Nand60W0N两个图幅，

gis收藏家·2023-12-24 09:10

GIS相关网站下载全国的GeoJSON格式数据可以到区县级数据

数据下载地址：http://datav.aliyun.com/tools/atlas/#&lat=35.28150065789119&lng=87.3193359375&zoom=4image上述可以下载

墨迹嘿嘿·2023-12-24 07:05

论文笔记--Learning Political Polarization on Social Media Using Neural Networks

LearningPoliticalPolarizationonSocialMediaUsingNeuralNetworks1.文章简介2.文章概括3.相关工作4.文章重点技术4.1Collectionofposts4.1.1数据下载

Isawany·2023-12-24 03:04

数据分析-18-Video Game Sales电子游戏销售分析（包含数据代码）

文章目录0.数据代码下载1.数据的观察和清理2.从用户方面3.从发行商方面4.从市场方面5.总结0.数据代码下载关注公众号：『AI学习星球』回复：电子游戏销售分析即可获取数据下载。

AI研习星球·2023-12-24 03:17

数据分析-14-基于Python的信用评分卡数据分析（包含代码数据）

关注公众号：『AI学习星球』回复：基于Python的信用评分卡数据分析即可获取数据下载。算法学习、4对1辅导、论文辅导或核心

AI研习星球·2023-12-24 03:45

【铁死亡>>预后模型】04.铁死亡+PAAD（3.3分）

TCGA+GTEx：当正常样品较少时，TCGA与GTEx联合分析。gemcitabineresistance：选取GSE80617耐药数据集，检查铁死亡相关基因的表达差异，即可说明其与耐药反应的差异。

高大石头·2023-12-23 14:16

基于SVM的鸟鸣识别,语谱分析

目录支持向量机SVM的详细原理SVM的定义SVM理论Libsvm工具箱详解简介参数说明易错及常见问题完整代码和数据下载链接：基于SVM的鸟鸣识别,语谱分析（代码完整，数据齐全）资源-CSDN文库https

神经网络机器学习智能算法画图绘图·2023-12-23 13:56

MATLAB处理高光谱图像数据

）；（2）显示前四条叶绿素值的条形图（3）显示叶绿素与各个波段的相关性折线图（4）计算植被指数NDVI与叶绿素对应的散点图；此链接为数据链接：MATLAB高光谱图像数据-数据集文档类资源-CSDN文库数据下载之后你可以选择将这个表格放在

周周写代码·2023-12-23 12:34

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