走进脑计划(二):linux下安装fsl5.0

最近一共计划安装:FSL+SPM+BrainVoyager+AFNI+Freesurfer这四个软件。

我的论文方向主要偏向于分析脑白质这一块,主要研究针刺的特异性。DPABISF好像这个旧笔记本带不动,所以先不研究DPABISF了,先把上面5个学会。

感兴趣的同学可以关注我,我经常会发布我的学习过程。

我所有的过程全部建立在:ubuntu19.0,今天安装的是fsl5.0,坑我全都踩过了,大家按照我的来都可以安装好。
一、下载
官网下载fsl
网址:http://neuro.debian.net/install_pkg.html?p=fsl-complete
step1 系统选择“ubuntu 19.04”,服务器选择“china Tsinghua university”,然后选择 “all software”
等待一小会儿,打开终端,复制以下代码输入。(或者可以复制官网的代码输入)

wget -O- http://neuro.debian.net/lists/disco.cn-bj1.full | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pool.sks-keyservers.net:80 0xA5D32F012649A5A9

然后复制以下代码输入。

sudo apt-get update
sudo apt-get install fsl

PS:官网的是sudo apt-get install fsl-complete,记得去掉-complete,输入我上面的代码。。。。这点真的有点坑。花了我一些时间才搞完。
二、配置环境
打开终端,输入:

sudo gedit /etc/bash.bashrc

然后会有个文档打开,在文档的最后(!!!注意这里,是在文档的最下面,有个fi,在fi后面点回车键,调出下一行)输入下面代码(代码的.与/etc之间有空格,或者可以直接复制我的代码),这点真的是花了我半个小时,小白一定要照着我的一步步做,高手忽视。

. /etc/fsl/fsl.sh

点右上角的保存,然后关闭终端!!,一定要关闭终端!!,然后打开新的终端,输入:

fsl

就可以看到fsl5.09,可爱的小鱼界面出来了。

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