医学文献结构化泛读方法

医学文献结构化泛读方法

【结构化阅读】快速提取关键信息

文献阅读难点

专业英语：日常基本用不到专业英语词汇

实验方法：眼花缭乱的各种实验名称

Biomarkers：是明星但你很陌生的分子名称

阅读成长三阶

阅读成长三阶

医学文献分类

临床研究：病例报告、病例对照、队列研究、横断面研究、 RCT 研究

基础研究：

• 干研究

• 干湿结合

• 湿研究（分子、细胞、动物实验内容）

  • 生信挖掘+简单表型

  • 样本检测+统计分析

  • 细胞表型+分子机制

  • 动物模型+指标检测

题目四要素

科学假设：在【疾病】中，【分子】经由【机制】介导了【表型】

五恒量三变量

单变量论证

分子→（需证明）表型→（已知）疾病

药物→表型（药效）→疾病

表达差异、正反回复、细胞动物

二元变量论证

二元变量论证

逻辑论证主次

	单变量论证	主变量论证	因变量论证
表达差异	✔️	✔️	①A 调节表型（单变量论证）
正反回复	✔️	✔️
细胞动物	✔️	✔️
调控关系		✔️	✔️②A 调节 B（二元变量论证）
回复验证		☑️	☑️③A 调节表型依赖 B（回复）

回复实验策略

image

分子（主变量）	通路（因变量）	表型
↑过表达	↑☒阻断-	观察表型	假设分子与通路间是正向调控	正正反
↓沉默	↓☒激活+	观察表型		正反正
↑过表达	↓☒激活+	观察表型	假设分子与通路间是负向调控	反正正
↓沉默	↑☒阻断-	观察表型		反反反

三元变量论证

三元变量论证

间接还是直接

间接还是直接

1. 转录因子：蛋白调节下游基因的启动子 DNA，从而影响基因转录过程

   • 适用于下游为功能蛋白或 ncRNAs

2. miRNA： miRNAI 调节下游基因 mRNA 的 3-UTR，从而影响基因转录后过程

   • 适用于下游为功能蛋白

3. 编码基因：蛋白可以调节靶基因的 DNA、转录、转录后、翻译、翻译后全部五个水平

   • 主要研究蛋白-蛋白相互作用

4. lncRNA：lncRNA 可调节靶基因的 DNA、转录、转录后、翻译、翻译后全部五个水平

   • 主要研究 RNA-RNA 和 RNA-蛋白相互作用

逻辑九宫格

逻辑九宫格

数据表现四维

数据表现四维

小结

1题目四要素

疾病、表型、分子、机制

2五恒量三变量

恒量：疾、型、模、法、标

变量：药物、分子、通路

3单变量论证

表达差异、正反回复、细胞动物

4二元变量论证

A 调节表型、A 调节 B、A 调节表型依赖于 B

5Rescue策略

正正反、正反正、反正正、反反反

6间接直接机制

蛋白-DNA、蛋白-蛋白、RNA-RNA、RNA-蛋白

7数据表现四维

组织水平、细胞水平、动物水平、分子水平