单细胞转录因子

2018-07-28

热爱，反映一个人的政治觉悟，体现一个人的思想境界，是干事创业最具活力的“因子”。
Tangqunlin·2024-02-14 13:09

《自私的基因》读书笔记

科学家们在模拟远古时代的环境后产生了氨基酸和嘌呤、嘧啶，不知何时复制因子偶然出现。复制不一定是完全相似，任何复制过
彩云悦读乐教·2024-02-14 12:06

编译原理-递归下降分析法-c简单实现

2、递归下降分析法的前提改造文法：消除二义性、消除左递归、提取左因子，判断是否为LL（1）文法，3、递归下降分析法实验设计思想及算法为G的每个非终结符号U构造
都灵的夏天_·2024-02-14 11:55

题记(38)--整数的最大素因子

输出描述四、输入输出示例五、完整C语言代码一、题目内容对于给定的字符序列，从左至右将所有的数字字符取出拼接成一个无符号整数（字符序列长度小于100，拼接出的整数小于2^31,），计算并输出该整数的最大素因子
INT小蔡·2024-02-14 11:17

铁的食物来源和常见补铁误区

正常人体内含铁总量约为30-40mg/(kg·bw)，其中70%存在于血红蛋白，3%存在于肌红蛋白，1%存在于含铁酶类（例如细胞色素氧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶等）、辅助因子及运铁载体中，此类铁被称为功能性铁
Lasswitz聊健康·2024-02-14 10:55

晚熟是一种什么样的体验

我就是这样的一个人，从小到大，一直都很容易快乐，也许是我体内有快乐因子吧，我也想给其他人带去快乐，我想做他人的暖阳，有时候很不理解，为什么同龄人不能像我一样，开开心心的过，而是，板着脸，让人看不出任何情绪
藤梓悠·2024-02-14 10:24

用免疫风险评分预测黑色素瘤转移的风险

PredictingtheRiskofMelanomaMetastasisUsinganImmuneRiskScoreintheMelanomaCohort在黑色素瘤数据集中，用免疫相关的基因来预测患者的体内肿瘤瘤的转移状态发表期刊：FrontBioengBiotechnol发表日期：2020Mar31影响因子
生信学霸·2024-02-14 10:48

2022-02-03

美容院的小姐妹告诉了我一个抗衰好物，BOTULAX博德适家的赋能冻干粉，里面含有细胞外泌体、多种细胞因子，可以给我们皮肤提供很多营养成分。
Inspiration朝朝_6·2024-02-14 10:45

蓝桥杯每日一题----素数筛

时间复杂度：O(nlog(log(n)))O(nlog(log(n)))O(nlog(log(n)))上代码，//每个数的最小质因子//pre[i]表示i的
小西yu·2024-02-14 09:46

MogaNet实战：使用 MogaNet实现图像分类任务（二）

文章目录训练部分导入项目使用的库设置随机因子设置全局参数图像预处理与增强读取数据设置Loss设置模型设置优化器和学习率调整策略设置混合精度，DP多卡，EMA定义训练和验证函数训练函数验证函数调用训练和验证方法运行以及结果查看测试完整的代码在上一篇文章中完成了前期的准备工作
AI浩·2024-02-14 07:38

普通人傅首尔：迟早来到的BBking

工作中的灰犀牛出现，一切按流程走的事情又出现了自己不能控制，横空而降的不和谐因子，非常无语、无可奈何，但最后你要负责擦屁股。一小股无名之火蹭蹭就往上涨。时间再往前走，刚和寇森林摔了东西吵了架。
妙姐说了算·2024-02-14 06:46

单细胞测序最好的教程（一）：质量控制

目前，国内对于单细胞测序分析的教程五花八门，百花齐放，一个合适且准确的pipeline对于分析是很有价值的。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

单细胞测序最好的教程（二）：归一化

由于单细胞测序技术的限制，我们在样本中获得RNA的时候，经过了分子捕获，逆转录还有测序。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

单细胞测序最好的教程（三）：特征基因选择

前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的质控以及归一化的一些思想。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

python基因差异分析包_一个生信素人的上道经验分享-转录组测序（差异分析篇）...

原标题：一个生信素人的上道经验分享-转录组测序(差异分析篇)转录组测序技术(RNA-seq)作为目前二代测序领域最普遍的技术手段，自从转录组测序问世以来，已经开发了数百种分析工具。
weixin_39607873·2024-02-14 06:17

PySCENIC（一）：python版单细胞转录组转录因子分析

关于单细胞转录组转录因子的分析我们之前在单细胞系列讲过R语言版本的，参考：跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录组因子分析，但是R语言分析起来速度非常慢，如果你动辄上万的单细胞可能要运行好几周，这显然不现实
TS的美梦·2024-02-14 06:47

TO G不易：“萌新”产品经理 V.S.“老炮儿”销售

有时候你不得不感叹，销售们真的是个单细胞动物。分不清公司产品，经常错把你的产品商机录入到了别的产品经理那边去了；搞
稀奇星球·2024-02-14 06:51

Python转录组学分析框架：Omicverse的安装教程

Python转录组学分析框架：Omicverse的安装教程OmicVerse是用Python进行多组学（包括Bulk和单细胞分析）的基础框架。
Starlitnightly·2024-02-14 06:46

单细胞数据分析之PCA再认识与ScaleData函数

我们首先再认识一下PCA数据做PCA分析的前提是1、主成分分析认为主元之间彼此正交，样本呈高斯分布；2、主成分分析假设源信号间彼此非相关；那么这里我们需要讨论一下，我们的单细胞或者空间转录组数据是呈现高斯分布的么
单细胞空间交响乐·2024-02-14 04:18

10X空间转录组分析回顾之Giotto

这一篇我们回顾一下10X空间转录组的分析软件----Giotto，文章在Giotto,atoolboxforintegrativeanalysisandvisualizationofspatialexpressiondata
单细胞空间交响乐·2024-02-14 04:30

如何在生存分析与Cox回归中计算IDI，NRI指标|附代码数据

is.na(apply(D,1,mean)),] ; dim(D)## [1] 416   7查询部分数据（结果和预测因子）head(D)##   time status   
·2024-02-14 03:35

10X单细胞（10X空间转录组）通讯分析之汇总（scSeqComm）

这一篇我们来汇总单细胞数据的通讯分析，参考文章在Identify,quantifyandcharacterizecellularcommunicationfromsingle-cellRNAsequencingdatawithscSeqComm
单细胞空间交响乐·2024-02-14 02:25

介绍一款单细胞细胞类型注释软件-scibet

作者：童蒙编辑：amethyst引言随着技术的进步，测序成本的降低，单细胞转录组的数据呈指数级的爆发。
生信阿拉丁·2024-02-14 01:55

HashMap原理 — 扩容机制及存取原理

用于保存key-value对；capacity：并不是一个成员变量，但却是一个必须要知道的概念，表示容量；size变量：表示已存储的HashMap的key-value对的数量；loadFactor变量：装载因子
java雅雅·2024-02-14 00:01

MAX-SUM算法

MAX-SUM算法是一个基于因子图的算法，整个算法的节点表示其中的变量和约束。每个节点表示各个系统的变量或者是函数节点。每个变量节点连接着所有的函数节
fpga和matlab·2024-02-14 00:09

SLICER：从单细胞RNA-seq数据推断分支的非线性细胞轨迹

image.pngSLICER是一种构建轨迹的算法，该轨迹描述了某些生物学过程中基因表达的变化。SLICER可以捕获高度非线性的基因表达变化，自动选择与该过程相关的基因，并检测轨迹中的多个分支和loopfeatures。SLICER（SelectiveLocallyLinearInferenceofCellularExpressionRelationships），是一种使用局部线性嵌入（LLE）重
生信编程日常·2024-02-14 00:51

单细胞注释

单细胞-注释-2022-01-17多个样本单细胞分析流程-(jianshu.com)一、人工注释人工注释需要借助文献检索marker或者结合常用的注释数据库，例如两个常用的数据库：CellMarker（
刘综一·2024-02-13 23:57

蚁群算法实现

在MATLAB中实现蚁群算法，你需要遵循以下基本步骤：初始化参数：确定蚁群的规模、信息素的挥发系数、信息素的重要程度、启发式因子的重要程度等。
qq_51497433·2024-02-13 23:46

CyTOF 质谱流式技术在CAR-T治疗中取得的最新成果

CyTOF技术作为最前沿的单细胞蛋白检测技术在CAR-T细胞治疗中具有不可替代的关键性作用，接下来分享三篇近期CAR-T细
普罗亭·2024-02-13 22:29

内源性逆转录病毒一(基础知识)

内源性逆转录病毒概念：逆转录病毒属于逆转录病毒科(Retroviridae)，是一类仅感染脊椎动物的单链正义不分节RNA病毒。
吕强强学生信·2024-02-13 21:24

坚持就是胜利（五）

注射了两剂“粒细胞刺激集落因子”，今天的白细胞和粒细胞绝对值上升尚可。我的意见是，既然本次治疗是有效的，而且
悦读山人·2024-02-13 20:24

转录组文章 | 2022《Journal of Hazardous Materials》细胞壁多糖在水稻钒解毒中的作用及其转录组机制

一、导读细胞壁多糖在重金属结合方面起着至关重要的作用，这有助于植物体内重金属的解毒。然而，目前有关于钒（V）与植物根系细胞壁结合的分子机制的研究目前还没有，尤其是有关于对水稻（OryzasativaL.）的研究。本研究以两个不同V耐受程度的水稻品种为研究对象，探究了不同V浓度对V的亚细胞分布的影响，揭示了细胞壁多糖对V暴露的调控机制。结果表明，水稻根系抑制了V的向上迁移，V在根系细胞壁中的积累量达
生信师姐·2024-02-13 19:17

【算法详解】STitch3D：空间转录组数据和单细胞RNA测序数据共同建模的空转数据对齐和整合算法，实现更高分辨率的3D结构重建

目录0参考文献1模型特色2算法解析2.1模型概述2.2获得隐空间表示2.3获得细胞类型比例2.4处理批次效应0参考文献STitch3D原论文：Constructionofa3Dwholeorganismspatialatlasbyjointmodellingofmultiplesliceswithdeepneuralnetworks1模型特色生物体器官具有复杂的三维结构，生理过程的进行也很少在二维
yaoyao255·2024-02-13 18:32

R、python读取空间转录组的8种方式

“空间转录组测序主要包括5个步骤，我们着重下游分析部分：空转数据分析和可视化。
生信小博士·2024-02-13 18:01

菌群宏基因组分析能解答哪些科学问题？

研究环境样本中微生物的构成与丰度；2.研究环境样本中的功能基因信息及丰度；3.研究不同环境样本间细菌群落、功能组成及丰度的差异（不同处理对环境中物种与基因的影响）；3.探究不同环境样本间引起细菌群落结构/功能差异的物种及相关的环境因子
f70420f979c3·2024-02-13 18:02

MapNeXt：Revisiting Training and Scaling Practices for Online Vectorized HD Map Construction

参考代码：None动机与出发点MapTR算法在局部在线地图任务中已经表现出了很强的能力，但是在该算法的基础上是否可以进行更近一步探究影响局部地图感知性能的影响因子呢？
m_buddy·2024-02-13 16:26

客囚沙

当我躺在床上舒缓疲劳，或是燃起香烟卸下负担的时候，一些不安分的因子开始勾引我，她们就像虔诚的佛教徒，利用诸如"旅行，是旅
莫北天云·2024-02-13 15:15

番茄工作法

特别是碰见我可爱的图片发自App不知不觉间，成为了我时间的“拿铁因子”。耗费了我太多的时间。而且有时还经常“一心二用”。how在手机上下载一个“潮汐APP”，辅助我进行番茄工作法。玩的尽兴学
静静的长大·2024-02-13 14:22

统计学（51）-结构方程模型

它可以看作路径分析(PathAnalysis)和验证性因子分析(ConfrrmatoryFactorAnalysis)的组合。1、路径分析image.png血压到底是自变量还是因变量？
Zhigang_Han·2024-02-13 11:31

「数据结构」哈希表1：基本概念

基本概念哈希表哈希冲突负载因子调节解决哈希冲突1.闭散列法2.开散列法（哈希桶）哈希表哈希表是一种数据结构，它使用哈希函数将键映射到数组中的一个位置（即将元素的存储位置和它的key之间建立映射关系）在存储一个键值对时
Ice_Sugar_7·2024-02-13 11:43

CSP-202312-2-因子化简（质数筛法）

CSP-202312-2-因子化简一、质数筛法主流的质数筛法包括埃拉托斯特尼筛法（SieveofEratosthenes）、欧拉筛法（SieveofEuler）、线性筛法（LinearSieve）等。
LOST P·2024-02-13 10:27

永生花

空气中弥漫着的因子，渗入了我的灵魂，看着床边的玩偶、窗帘、茶杯，没有一物有能力开口诉说。而我已然生出了不舍的情绪，想到了此时偏头侧倚的自己，眼角晶莹的露珠，是寄托着谁的孤独和共鸣呢？
年年穗穗kx·2024-02-13 10:29

2021年你的基金回本了吗？回本后还会继续持仓吗？--附优秀债基

--《小狗钱钱》2021年春节后，市场风格轮换，煤炭、钢铁、建材、化工、有色等顺周期行业大幅上涨，相应的行业基金如广发价值领先混合、广发多因子混合等业绩大幅领先。而此前大涨的消费、医疗、新能源等行业的
蚂蚁不吃土·2024-02-13 10:11

单细胞测序生信分析1-Seurat

单细胞分析的经典包——Seurat包有自己的官方教程，跟着教程过一遍可以get大致过程（https://satijalab.org/seurat/archive/v3.1/pbmc3k_tutorial.html
18b79e7933ad·2024-02-13 08:46

SVD奇异值分解

几何解释：奇异值可以被视为矩阵在变换过程中每个方向的缩放因子。在奇异值分解中
jjm2002·2024-02-13 06:45

NoteExpress使用培训

影响因子，是一种很好的选重点的方法，也是高手学习的方法。标签。标签分类是一种横向分类，结合文件夹竖向分类，可以快速定位很多文件。标签
见龙在田007er2770·2024-02-13 04:29

肿瘤浸润性巨噬细胞的复杂作用（综述浏览）

Thecomplexroleoftumor-infiltratingmacrophages-PubMed(nih.gov)长期以来，人们一直认为巨噬细胞是一种进化古老的细胞类型，参与组织稳态和对病原体的免疫防御，但现在人们又发现巨噬细胞是包括癌症在内的多种疾病的调节因子
hx2024·2024-02-13 03:17

10.单细胞 RNA-seq：聚类分析

学习目标：评估是否存在聚类过程产生的技术误差使用PCA和UMAP图确定聚类质量，并了解何时重新聚类评估已知的细胞类型标记与假设簇的细胞类型同一性单细胞RNA-seq聚类分析现在我们已经进行了整合，我们想知道我们的细胞群中存在哪些不同细胞类型
denghb001·2024-02-13 01:02

Smart seq2 2014

需要单细胞分辨率来增加我们对细胞间变异性的理解。我们的团队最近证明了Smart-seq
韧_7e6f·2024-02-12 23:08

分析流程||scanpy单细胞分析流程2-降维聚类及差异基因鉴定

gzh：BBio，欢迎关注scanpy软件由TheisLab实验室开发，和Seurat相同都是常用的单细胞数据分析工具。
BBio·2024-02-12 20:44
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