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单细胞转录因子
如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标|附代码数据
is.na(apply(D,1,mean)),] ; dim(D)## [1] 416 7查询部分数据(结果和预测
因子
)head(D)## time status
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2024-02-14 03:35
数据挖掘深度学习机器学习算法
10X
单细胞
(10X空间
转录
组)通讯分析之汇总(scSeqComm)
这一篇我们来汇总
单细胞
数据的通讯分析,参考文章在Identify,quantifyandcharacterizecellularcommunicationfromsingle-cellRNAsequencingdatawithscSeqComm
单细胞空间交响乐
·
2024-02-14 02:25
介绍一款
单细胞
细胞类型注释软件-scibet
作者:童蒙编辑:amethyst引言随着技术的进步,测序成本的降低,
单细胞
转录
组的数据呈指数级的爆发。
生信阿拉丁
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2024-02-14 01:55
HashMap原理 — 扩容机制及存取原理
用于保存key-value对;capacity:并不是一个成员变量,但却是一个必须要知道的概念,表示容量;size变量:表示已存储的HashMap的key-value对的数量;loadFactor变量:装载
因子
java雅雅
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2024-02-14 00:01
MAX-SUM算法
MAX-SUM算法是一个基于
因子
图的算法,整个算法的节点表示其中的变量和约束。每个节点表示各个系统的变量或者是函数节点。每个变量节点连接着所有的函数节
fpga和matlab
·
2024-02-14 00:09
MATLAB
板块5:网络通信
★MATLAB算法仿真经验
MAX-SUM
matlab仿真
SLICER:从
单细胞
RNA-seq数据推断分支的非线性细胞轨迹
image.pngSLICER是一种构建轨迹的算法,该轨迹描述了某些生物学过程中基因表达的变化。SLICER可以捕获高度非线性的基因表达变化,自动选择与该过程相关的基因,并检测轨迹中的多个分支和loopfeatures。SLICER(SelectiveLocallyLinearInferenceofCellularExpressionRelationships),是一种使用局部线性嵌入(LLE)重
生信编程日常
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2024-02-14 00:51
单细胞
注释
单细胞
-注释-2022-01-17多个样本
单细胞
分析流程-(jianshu.com)一、人工注释人工注释需要借助文献检索marker或者结合常用的注释数据库,例如两个常用的数据库:CellMarker(
刘综一
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2024-02-13 23:57
蚁群算法实现
在MATLAB中实现蚁群算法,你需要遵循以下基本步骤:初始化参数:确定蚁群的规模、信息素的挥发系数、信息素的重要程度、启发式
因子
的重要程度等。
qq_51497433
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2024-02-13 23:46
算法
CyTOF 质谱流式技术在CAR-T治疗中取得的最新成果
CyTOF技术作为最前沿的
单细胞
蛋白检测技术在CAR-T细胞治疗中具有不可替代的关键性作用,接下来分享三篇近期CAR-T细
普罗亭
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2024-02-13 22:29
内源性逆
转录
病毒一(基础知识)
内源性逆
转录
病毒概念:逆
转录
病毒属于逆
转录
病毒科(Retroviridae),是一类仅感染脊椎动物的单链正义不分节RNA病毒。
吕强强学生信
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2024-02-13 21:24
坚持就是胜利(五)
注射了两剂“粒细胞刺激集落
因子
”,今天的白细胞和粒细胞绝对值上升尚可。我的意见是,既然本次治疗是有效的,而且
悦读山人
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2024-02-13 20:24
转录
组文章 | 2022《Journal of Hazardous Materials》细胞壁多糖在水稻钒解毒中的作用及其
转录
组机制
一、导读细胞壁多糖在重金属结合方面起着至关重要的作用,这有助于植物体内重金属的解毒。然而,目前有关于钒(V)与植物根系细胞壁结合的分子机制的研究目前还没有,尤其是有关于对水稻(OryzasativaL.)的研究。本研究以两个不同V耐受程度的水稻品种为研究对象,探究了不同V浓度对V的亚细胞分布的影响,揭示了细胞壁多糖对V暴露的调控机制。结果表明,水稻根系抑制了V的向上迁移,V在根系细胞壁中的积累量达
生信师姐
·
2024-02-13 19:17
【算法详解】STitch3D:空间
转录
组数据和
单细胞
RNA测序数据共同建模的空转数据对齐和整合算法,实现更高分辨率的3D结构重建
目录0参考文献1模型特色2算法解析2.1模型概述2.2获得隐空间表示2.3获得细胞类型比例2.4处理批次效应0参考文献STitch3D原论文:Constructionofa3Dwholeorganismspatialatlasbyjointmodellingofmultiplesliceswithdeepneuralnetworks1模型特色生物体器官具有复杂的三维结构,生理过程的进行也很少在二维
yaoyao255
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2024-02-13 18:32
算法详解
算法
论文阅读
论文笔记
机器学习
人工智能
R、python读取空间
转录
组的8种方式
“空间
转录
组测序主要包括5个步骤,我们着重下游分析部分:空转数据分析和可视化。
生信小博士
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2024-02-13 18:01
python
服务器
linux
菌群宏基因组分析能解答哪些科学问题?
研究环境样本中微生物的构成与丰度;2.研究环境样本中的功能基因信息及丰度;3.研究不同环境样本间细菌群落、功能组成及丰度的差异(不同处理对环境中物种与基因的影响);3.探究不同环境样本间引起细菌群落结构/功能差异的物种及相关的环境
因子
f70420f979c3
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2024-02-13 18:02
MapNeXt:Revisiting Training and Scaling Practices for Online Vectorized HD Map Construction
参考代码:None动机与出发点MapTR算法在局部在线地图任务中已经表现出了很强的能力,但是在该算法的基础上是否可以进行更近一步探究影响局部地图感知性能的影响
因子
呢?
m_buddy
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2024-02-13 16:26
BEV
Perception
#
Lane
Detection
自动驾驶
计算机视觉
客囚沙
当我躺在床上舒缓疲劳,或是燃起香烟卸下负担的时候,一些不安分的
因子
开始勾引我,她们就像虔诚的佛教徒,利用诸如"旅行,是旅
莫北天云
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2024-02-13 15:15
番茄工作法
特别是碰见我可爱的图片发自App不知不觉间,成为了我时间的“拿铁
因子
”。耗费了我太多的时间。而且有时还经常“一心二用”。how在手机上下载一个“潮汐APP”,辅助我进行番茄工作法。玩的尽兴学
静静的长大
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2024-02-13 14:22
统计学(51)-结构方程模型
它可以看作路径分析(PathAnalysis)和验证性
因子
分析(ConfrrmatoryFactorAnalysis)的组合。1、路径分析image.png血压到底是自变量还是因变量?
Zhigang_Han
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2024-02-13 11:31
「数据结构」哈希表1:基本概念
基本概念哈希表哈希冲突负载
因子
调节解决哈希冲突1.闭散列法2.开散列法(哈希桶)哈希表哈希表是一种数据结构,它使用哈希函数将键映射到数组中的一个位置(即将元素的存储位置和它的key之间建立映射关系)在存储一个键值对时
Ice_Sugar_7
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2024-02-13 11:43
Java数据结构
散列表
数据结构
哈希算法
算法
CSP-202312-2-
因子
化简(质数筛法)
CSP-202312-2-
因子
化简一、质数筛法主流的质数筛法包括埃拉托斯特尼筛法(SieveofEratosthenes)、欧拉筛法(SieveofEuler)、线性筛法(LinearSieve)等。
LOST P
·
2024-02-13 10:27
c++
算法
永生花
空气中弥漫着的
因子
,渗入了我的灵魂,看着床边的玩偶、窗帘、茶杯,没有一物有能力开口诉说。而我已然生出了不舍的情绪,想到了此时偏头侧倚的自己,眼角晶莹的露珠,是寄托着谁的孤独和共鸣呢?
年年穗穗kx
·
2024-02-13 10:29
2021年你的基金回本了吗?回本后还会继续持仓吗?--附优秀债基
--《小狗钱钱》2021年春节后,市场风格轮换,煤炭、钢铁、建材、化工、有色等顺周期行业大幅上涨,相应的行业基金如广发价值领先混合、广发多
因子
混合等业绩大幅领先。而此前大涨的消费、医疗、新能源等行业的
蚂蚁不吃土
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2024-02-13 10:11
单细胞
测序生信分析1-Seurat
单细胞
分析的经典包——Seurat包有自己的官方教程,跟着教程过一遍可以get大致过程(https://satijalab.org/seurat/archive/v3.1/pbmc3k_tutorial.html
18b79e7933ad
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2024-02-13 08:46
SVD奇异值分解
几何解释:奇异值可以被视为矩阵在变换过程中每个方向的缩放
因子
。在奇异值分解中
jjm2002
·
2024-02-13 06:45
机器学习
人工智能
NoteExpress使用培训
影响
因子
,是一种很好的选重点的方法,也是高手学习的方法。标签。标签分类是一种横向分类,结合文件夹竖向分类,可以快速定位很多文件。标签
见龙在田007er2770
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2024-02-13 04:29
肿瘤浸润性巨噬细胞的复杂作用(综述浏览)
Thecomplexroleoftumor-infiltratingmacrophages-PubMed(nih.gov)长期以来,人们一直认为巨噬细胞是一种进化古老的细胞类型,参与组织稳态和对病原体的免疫防御,但现在人们又发现巨噬细胞是包括癌症在内的多种疾病的调节
因子
hx2024
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2024-02-13 03:17
大数据
10.
单细胞
RNA-seq:聚类分析
学习目标:评估是否存在聚类过程产生的技术误差使用PCA和UMAP图确定聚类质量,并了解何时重新聚类评估已知的细胞类型标记与假设簇的细胞类型同一性
单细胞
RNA-seq聚类分析现在我们已经进行了整合,我们想知道我们的细胞群中存在哪些不同细胞类型
denghb001
·
2024-02-13 01:02
Smart seq2 2014
需要
单细胞
分辨率来增加我们对细胞间变异性的理解。我们的团队最近证明了Smart-seq
韧_7e6f
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2024-02-12 23:08
分析流程||scanpy
单细胞
分析流程2-降维聚类及差异基因鉴定
gzh:BBio,欢迎关注scanpy软件由TheisLab实验室开发,和Seurat相同都是常用的
单细胞
数据分析工具。
BBio
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2024-02-12 20:44
图灵日记--Map&Set&字符串常量池&反射&枚举&Lambda表达式&泛型
目录搜索树概念实现性能分析和java类集的关系搜索概念及场景模型Map的使用Map常用方法Set的说明常见方法说明哈希表冲突-避免-负载
因子
调节冲突-解决-闭散列冲突-解决-开散列/哈希桶冲突严重时的解决办法实现和
图梓灵
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2024-02-12 19:34
数据结构
java
数据结构
java
NAC
转录
因子
家族分析文章解读
这是一篇今年4月25日发表在BMCPlantBiology(的NAC
转录
因子
家族分析文章,文章内容很简单,一起来看一下具体内容:说起基因家族分析,不外乎以下分析内容:1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域,
组学大讲堂
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2024-02-12 19:33
flutter布局-3-center
如果维度不受约束且相应的大小
因子
为null,
liu_520
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2024-02-12 19:24
2020-10-23 《让大脑自由:释放天赋的12条定律》:越运动越聪明
关键词:运动改善认知、运动改善儿童注意力、运动治疗脑失调、葡萄糖、血液吸收、自由基、基因突变、氧气、大脑2%,需20%能量,运动促进血管畅通、生长
因子
、脑源性神经营养
因子
、蛋白质、齿状回、海马区、运动产生肥料
居燃心理咨询师
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2024-02-12 19:56
LeetCode-263 丑数
二、解题思路判断一个数质
因子
是否为只有2,3,5,只需
书瓖果fifty
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2024-02-12 16:19
2022-09-20
NatComm|肝母细胞瘤
单细胞
分析预测化疗敏感性原创图灵基因图灵基因2022-09-2010:39发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制肝母细胞瘤是儿童最常见的肝癌形式。
图灵基因
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2024-02-12 16:51
2022-07-28
CancerDiscov|8万个
单细胞
测序揭示肿瘤浸润淋巴细胞分化动态原创huacishu图灵基因2022-07-2811:47发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文:huacishuIF=38.272
图灵基因
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2024-02-12 13:17
发酵饲料在养殖业迅速普及的原因
发酵饲料是益生菌在生长代谢过程中将原料中的抗营养
因子
分解或转化,产生更能被生猪采食、消化、吸收,养分更高且无毒害作用的饲料。1改善饲料的适口性,刺激猪的采食量发酵饲料是
发酵饲料
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2024-02-12 12:59
10X空间
转录
组的文献思路简单分析
这一篇我们简单回顾10X空间
转录
组的分析思路和过程,上一篇说到,ST需要对基因表达、空间位置和组织学信息进行更全面和综合的考虑,所以难度上,比
单细胞
需要更高,对人的
单细胞空间交响乐
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2024-02-12 12:59
《香帅的北大金融学课》摘抄130I 本周问答:A股市场上还有其他定价
因子
吗?
动量
因子
和换手率是有关的,动量
因子
在换手率比较低的时候更加有效,在换手率比较高的时候效果就会差一点。在现实生活中,有这么一句话你是要坚守的——要坚持你的策略,不能换来换去,否则就会两边不讨好。
守正出奇赢辉煌未来
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2024-02-12 12:19
【2024年最新更新】国内外期刊最全信息库(2024版,6w+期刊)
时间跨度:更新至2024年三、数据范围:6w+国内外期刊四、包含指标学科分类期刊名称简介主办单位编辑部地址邮编微信公众号邮箱网址国内统一刊号国际标准刊号期刊等级状态电话主管部门主编官网微信号主任定价影响
因子
自引率是否
T0620514
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2024-02-12 12:11
大数据
别人等送伞,我在等雨停。
5、幸福的
因子
飘散在你们左右,躲在角落的我除了流着泪祝福,还能做些什么。6、[无论你是矜持
huhu咪
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2024-02-12 11:50
应用Cellpose进行细胞核分割
在这个教程中,我们将展示如何应用组织结构的细胞分割算法Cellpose(包含在squidpy.im.segment)进行空间
转录
组数据图像的细胞核分割。
JUpter_
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2024-02-12 10:39
Energiediebe(能量小偷)
昨天晚上和凯佳姐吃完火锅到家已经懒得打字了,姨妈期的我充满了情绪不稳定
因子
,波动非常大。斌姐几个月没来姨妈去看医生,发现已经早更了,真可怕。顺便问了问她的HR小哥对于他工作的建议,品牌确实是条路子。
袁袁阿
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2024-02-12 09:56
小鼠嗅球的
单细胞
rna-seq揭示了细胞的异质性和成体神经元活性依赖的分子普查
Single-CellRNA-SeqofMouseOlfactoryBulbRevealsCellularHeterogeneityandActivity-DependentMolecularCensusofAdult-BornNeurons题目:小鼠嗅球的
单细胞
猫姐Lily
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2024-02-12 06:26
8旬老人去世床下塞满14万保健品,老人对保健品过度需求,谁之过?
因子
女平时不在老人身边,虽知道母亲会买保健品,但没想到这么夸张,对推销员的行为很不满。目前店家已退还6万元,双方还在协商中。二、老人爱买保健品的主要原因老人为什么这么喜欢买保健品?
笑妈聊情感
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2024-02-12 05:03
我在夏天听雨声
和着炎夏特有的热气,混着从地面蒸腾而上的土香气,空气中弥漫着满满的躁动
因子
,使人莫名的烦闷。我偏头,试图拂开面前的鼻前沉闷之气,恰巧瞥见茅屋上的
你好_5b5e
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2024-02-12 04:07
2022-11-19
在此
转录
因是子静坐法,供大家参考共学。《因是子静坐养生法》中,运用通俗的语言和科学方法对静坐养生法进行了较系统的阐释,对养生文化的普及起了很大的推动作用。
净心斋
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2024-02-12 03:27
最新8.4分纯生信,中性粒相关热点值得推荐!
影响
因子
:8.44本文的思路是通过
单细胞
数据分析识别了某种免疫细胞特有的marker基因,然后利用这些基因进行预后模型的构建。
生信小课堂
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2024-02-12 03:57
【6s965-fall2022】量化 Quantization Ⅱ
什么是线性量化r=S(q−Z)r=S(q-Z)r=S(q−Z)式中,SSS是比例
因子
,通常是一个浮点数;qqq是rrr的量化后的表示,是一个整数;ZZZ也是一个整数,把qqq中和ZZZ相同的整数映射到rrr
代码缝合怪
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2024-02-12 03:45
机器学习+深度学习
pytorch
深度学习
算法
边缘计算
人工智能
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