宏观基因组第18页

SCI 文章中基因组的突变信号（maftools）

90066456ace6·2024-01-08 03:38

趣事与一致性表达

因为读书时间控制得并不好、读书方法可能也有问题，总是不能很连贯，缺少对整本书宏观整体上的把握，只是在细节上对书中的结论点是一种认同与受益的感觉!

长弓一亮·2024-01-08 01:55

文字材料-事前准备

三部分的经典分段一般第一、三部分需要对整个情况的全面了解包括已发生的或者可能发生的事情，第二部分则需要更多的是宏观的思路，既是一三部分的总结提炼，也是对国家、上级的部署落实，承前启后、承

水轮鸡·2024-01-08 01:23

全基因组CNV分析3. 深入CNVkit分析管道

值得一提的是CNVkit设计的出发点是可以针对hybridization原理的NGS数据进行分析，把on-target和off-target区域分开来考虑。但是我们的目标是WGS数据，不存在什么off-target，所以分析主线就是一条直线(无视左上角的Targetregions和Anti-targetregions)。就和前文快速上手所介绍的流程一样，bam-cnn(Bincoverages)-

Jason数据分析生信教室·2024-01-07 23:31

跟着Briefings in Bioinformatics学数据分析：植物线粒体基因组组装流程GSAT初步尝试

论文Mastergraph:anessentialintegratedassemblymodelfortheplantmitogenomebasedonagraph-basedframeworkhttps://academic.oup.com/bib/article-abstract/24/1/bbac522/6854450?redirectedFrom=fulltext&login=falseb

小明的数据分析笔记本·2024-01-07 22:52

利用基因组信息改善牲畜 -综述（2019）

这边综述从家畜物种（即牛、绵羊、山羊、猪、家禽和鲑鱼）的可用基因组资源的状况，以及如何使用这些资源来加速缺陷致病基因的发现和管理，以提高准确性并扩展GS的范围，确定基因组编辑策略的方向，并开发利用日益广泛可用的基因组信息的新应用

Hello育种·2024-01-07 20:56

【动植物研究动态】20220918文献解读

s/5NPyf7CQvvu0tRmjxye5LwInternationalJournalofMolecularSciences（IF=6.208）|中科院植物研究所孙小芹：“常香粳1813“染色体水平基因组揭示香粳和非香粳稻间的基因组变异

iBioinformatics·2024-01-07 19:25

2023-04-23

所以，微观上，我们要永葆青春的姿态，扎深根基，脚踏实地，耕耘平凡点滴；中观上，分析自己的教育特色，不断更新自己的知识储备，学习新理念，结合学生实际，因地制宜，敢于开拓创新；宏观上，能够理解国家政策风向标

任瑶怡·2024-01-07 18:07

《李嘉图的人生，每项都是满分》---赖建诚

从经济学发展三百年的宏观角度来看，如何评价李嘉图？如果依年代，主观排列最有影响力的五位，我认为是亚当·斯密、李嘉图、马克思、马歇尔、凯恩斯。若要依影响力排序恐怕很困难，因为会随着时代风潮而有显著变化。

德尔塔地摊·2024-01-07 16:13

微生物基因组产品常见问题解答

“…………今天我们就大家提出的微生物基因组问题做十问十答，解决你的燃眉之急。Q1：GC-depth图是怎么做出来的？有什么意义？

ee00dc6faab7·2024-01-07 14:41

第14课延展话题：学金融必先了解宏观背景

【课堂笔记】首先，“微观金融现象”的背后一定有宏观层面的逻辑和推动力；其次，中国市场受政府政策影响大，不理解宏观，很难理解金融市场的规律和现象。【学习心得】这其实是一个哲学命题，要学会辩证地看问题。

一路凯哥·2024-01-07 13:13

真核微生物基因组质量评估工具EukCC的安装和详细使用方法

介绍：GitHub-EBI-Metagenomics/EukCC:Tooltoestimategenomequalityofmicrobialeukaryotes安装：docker：dockerpullmicrobiomeinformatics/eukcc推荐conda环境：condainstall-cconda-forge-cbioconda"eukcc>=2"#mamba更快mambainst

小果运维·2024-01-07 12:18

Megahit, metaSPAdes, metabat2, GTDB-tk, checkM

参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/470457258、德布鲁因图和OLC组装基因组-简书(jianshu.com)、[算法学习1]基因组组装算法DeBruijnGraph-知乎

苦中作乐613·2024-01-07 12:48

一文详解宏基因组组装工具Megahit安装及应用

要点Megahit简介Megahit的基本组装原理Megahit的安装和使用Megahit实战hello，大家好，今天为大家带来关于宏基因组组装工具Megahit的超详细安装及应用教程。

JaneMarple️·2024-01-07 12:47

linux+基因组字符替换,IDBA-UD组装基因组简单用法

之前组装基因组一直用另外一个软件：SPAdes，组装效果还不错，但是IDBA的大名早就听说过，所以趁着这次刚那个两个菌的数据，分别用这两个软件组装一下，对比一下效果，在SPAdes的网站上面看到过几个组装软件的对比图

changlei chen·2024-01-07 12:17

宏基因组组装神器-MEGAHIT使用及常见问题

文章目录简介安装和使用常见报错和解决方法输出结果对内存需求样本实际组装时间参考简介宏基因组测序获得海量短片段测序数据，这些数据混合着环境中各种各样的微生物基因组序列，如何恢复出这些微生物基因组序列，基因组组装成为至关重要的一步

Neptuneyut·2024-01-07 12:15

纯二代测序从头组装基因组(基础版）

基因组组装基因组组装一般分为三个层次，contig,scaffold和chromosomes.contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。

wangchuang2017·2024-01-07 12:15

宏基因组：MEGAHIT组装拼接及quast评估

Megahit组装软件很多下面介绍三款组装软件：MEGAHIT下载地址https://github.com/voutcn/megahitgitclonehttps://github.com/voutcn/megahit.gitcdmegahitmake其他两款组装软件下载地址SOAPdenovo下载地址http://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/file

狗蛋儿张·2024-01-07 12:15

iMeta | 青岛华大范广益组基于共标签测序数据的高质量宏基因组组装工具MetaTrass...

点击蓝字关注我们MetaTrass：基于共标签测序数据的人类肠道微生物高质量宏基因组组装工具https://doi.org/10.1002/imt2.46RESEARCHARTICLE●2022年8月15

生信宝典·2024-01-07 12:45

Vamb宏基因组分箱：安装与使用

mkdir~/Software/VambcdVambgitclonehttps://github.com/RasmussenLab/vamb-bmastercdvambpipinstall-e.vamb-hGitHub-RasmussenLab/vamb:Variationalautoencoderformetagenomicbinning使用参考上述官方文档

CAAS_IFR_zp·2024-01-07 12:15

链读测序技术在宏基因组组装研究中的应用

链读测序（Linked-readsequencing）通过将相同的barcode与长DNA片段(10-100kb)的序列连接在一起，能够消除其中的一些错读，从而改进宏基因组组装。

谷禾牛博·2024-01-07 12:44

原创||宏基因组干货分享专题———组装

拿到宏基因组序列之后，首先要进行质控分析，这步的主要目的是去掉接头和低质量序列。质控结束之后，拿到了干净的数据。就要对基因序列进行组装，组装是一个繁琐且耗时久的一个过程。

bioDeep·2024-01-07 12:44

宏基因组序列无参考基因组装工具idba-ud的介绍及详细使用方法

介绍idba-ud工具是一种用于组装无参考基因组的工具，它可以将高通量测序数据转化为基因组序列。它是idba工具的升级版本，专门用于组装多样性的无参考基因组。

小果运维·2024-01-07 12:14

metaSPAdes,megahit,IDBA-UB:宏基因组装软件安装与使用

metaSPAdes,megahit,IDBA-UB是目前比较主流的宏基因组组装软件metaSPAdes安装GitHub-ablab/spades:SPAdesGenomeAssembler#3.15.5

CAAS_IFR_zp·2024-01-07 12:43

Guideseq分析流程

Guideseq是一种检测体内基因编辑脱靶的测序方法，基本原理是CRISPR系统剪切基因组后，在进行基因组修复时可能会将一段设计好的双链DNA，即tag，插入到基因组中，通过tag设计引物可将基因组断裂位点两侧的序列扩增出来建库

WuYankang·2024-01-07 10:44

笔杆子必读！让你写作开窍的宝藏书籍！

但对应公文写作来说，不仅要考虑影响，更是要从宏观及整体的角度去出发，逐步去应多。然而市面上面对公文写作的书籍实在是少之又少。

张慕甄·2024-01-07 10:55

2021-06-09读虚舟《复盘》前言下

004复盘思维是新的思维模型复盘的整体框架分为宏观、中

一枚秋迟印·2024-01-07 09:49

研报在哪里看？研报网站哪个好？

为大家介绍几个研究报告的搜索网站：1、国家宏观经济数据，主页就能看见社会消费品零售总额数据，想要及时又权威的数据，在这可以找到2、国家统计局，准确又权威3、其次是咨询机构、互联网公司的报告，他们依托强大的行业研究

行研社·2024-01-07 07:41

利用aTRAM定向组装目标序列

在系统发育中，我们往往只需要目标基因来进行系统发育重建，一些数据量大的基因组组装起来非常耗时耗资源，可以使用定向组装的方法来组装我们需要基因。

惊鸿影·2024-01-07 07:19

基层公务员的群体性焦虑，不仅仅是因为3000块的月薪

宏观上说，国家、省、市三级，都是布置任务的，只有基层，是落实任务的。所

带小狗看夕阳·2024-01-07 07:25

2022-07-17

发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=68.164推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、作者开发了VASA-seq程序，这是一种能够对单细胞的全长转录组进行测序的新技术，其在可扩展性、敏感性、基因组覆盖率检测方面具有明显的优势

图灵基因·2024-01-07 07:25

TBtools | 全基因组 - 基因密度统计，充实你的图片

摘要两张图总结本文，以方便大家确定是否还有看下去的兴趣写在前面Emmm...今天开放一个旧功能，全基因组基因密度统计。虽然是早前就写好的，但我一直没开放，主要是考虑到这个功能感兴趣或者用得上的人不多。

生信石头·2024-01-07 04:40

斯坦福极简经济学宏观经济学篇

这两天在极简经济学中的宏观经济学篇了解到了很多经常看到但是不懂得是什么意思的词汇如：GDP,M2,M1,通胀率，贸易顺逆差，汇率剧烈波动对经济造成的干扰这里我想在敲一遍这些专业名称的定义，仅仅是为了加深印象

Alice_b3f7·2024-01-07 02:23

第175篇【20190904】一个阶段一心一意只做一件事

本文提纲001Todolist+固定微习惯00220190904日程003刘润商学院基础3课-微观经济学04激励相容、05交易成本、宏观经济学01节约悖论004《茶花女》001Todolist+固定微习惯

Shirly伊文·2024-01-07 00:40

032-CPI-宏观经济

假设你抛下了眼前的苟且，去到了诗和远方，和你的爱人一起，在一个小村子里过上了无忧无虑的生活。村子的集市只卖一种商品，就是摩托车。村民每天都用手里的金子来买摩托车，别问我为什么，一定要问的话，我觉得你可能是去了印度。突然有一天，村民们发现了一座金矿，挖出了大量的金子。很快，集市上的金子数量比以前翻了5倍，原本1块金子买一辆摩托车，现在5块金子才能买一辆。你发现，摩托车变贵了，或者换个说法，金子没有以

西西弗斯XD·2024-01-07 00:53

中级经济师《经济基础》知识点总结-国债

国债的特征：自愿性、有偿性、灵活性国债的功能：弥补财政赤字、筹集建设资金、调节货币供应量和利率、调控宏观经济国债的负担：认购者负担、债务人负担、纳税人负担、代际负担国债的限度：绝对规模（国债余额、当年发行国债总额

为梦奋斗的人·2024-01-06 20:39

社情民意的写作特点和要求

民意，就是人民群众的意见愿望（即民情、民生、民心）从定义上我们可以看出：社情民意既可以是对国家和地方大事、要事的反映，也可以是对百姓生活小事、琐事的折射；既可以是前赡性的、宏观性的，也可以是具体的和微观的

蒋老师讲谈·2024-01-06 18:46

Hive 源码解析一：Driver

本文为Hive源码系列的第一节(共三节)客户端部分，本节主要内容是通过源码分析总结从bin/hive启动到SQL解析转换成MR再到提交任务打印结果的一个宏观流程；第二节则针对HSQL如何解析、转换成MR

小王是个弟弟·2024-01-06 17:25

【笔记】价值投资的分析与数据类型

而价值投资主要分析企业的年报四季报、各种业务模式和财务指标，以及宏观经济环境和产业趋势，是把企业当做经营来看，评估产业是否有价值、企业是否有竞争力、购买的时机是否合适。目前

gikod·2024-01-06 17:51

【自少目多集】行业低谷或许是淬炼升华的时机

近期宏观环境和行业环境都进入了低谷，这是也不免产生迷茫，相信很多从业者都有所感受。而横向比较多个行业的发展历史，或许低谷时期是淬炼升华的好时机。

gikod·2024-01-06 17:51

面对一堆忙不完的事情的时候，我们应该怎么办？

从宏观上讲，这是一个价值观的问题，价值观就是判断什么是重要的？什么是更重要的？如果一个人的价

Robinzhang辉哥·2024-01-06 16:17

Transformer架构和对照代码详解

2、编码器2.1编码器介绍从宏观⻆度来看，Transformer的编码器是由多个相同的层叠加⽽成的，每个层都有两个⼦层（⼦层表⽰为sublayer）。

科学禅道·2024-01-06 13:48

体内内源基因调控之CRISPRi与CRISPRa

众所周知，CRISPR/Cas9系统可以用来操纵基因组：规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA（gRNA）的指引下，靶向基因组中的特定区域并切割DNA，产生DNA双链断裂

Seurat_Satija·2024-01-06 13:35

2019-08-15 事件循环与宏观微观任务

一什么是JavaScript?js是单线程,异步,非阻塞的解释型脚本语言二为什么JavaScript是单线程?如果JavaScript不是单线程,那意味着可以同时执行多个任务,假如不是单线程,同时有两个任务都对dom进行了操作,一个添加节点,一个删除节点,浏览器会去执行哪一个线程呢?在html5中推出了webworker标准,允许JavaScript创建多个线程,但是子线程完全受主线程控制且不得操

宋天瑞·2024-01-06 12:57

Linux学习记录——삼십삼 http协议

文章目录1、URL2、http协议的宏观构成3、详细理解http协议1、http请求2、http响应1、有效载荷格式2、有效载荷长度3、客户端要访问的资源类型4、修改响应写法5、处理不同的请求6、跳转3

咬光空气·2024-01-06 12:39

重构经济学(9)：从微观出不清市场到宏观周期性运行

全书PDF下载：https://pan.baidu.com/s/1VfHsY6R0D7BgH7y_O8jr4g｜张明著｜九、第四种转移方法——投资转移现在我们将叙述的是最重要的方法，即现代经济运行上最通行的方法——投资转移。以上已经阐述的三种方法——货币转移、借贷转移和强制转移，实质都仅是将生产过程终结性的产品即消费品，从过剩人手中转移到需要者手中。而投资这种转移方法，不再是转移终结性的消费品，而

张明_专注理论经济学研究·2024-01-06 12:32

负载均衡式OJ系统

文章目录负载均衡式OJ系统1.演示项目2.所用技术及开发环境所用技术：开发环境3.项目宏观设计I.leetcode结构II.宏观结构III.编写思路4.compiler服务1.编译功能：2.运行功能3.

@YuanWei·2024-01-06 10:59

项目：【负载均衡式在线OJ】

目录项目功能项目描述技术栈与开发环境项目思维导图项目宏观结构Comm公共模块日志工具log.hpp其他工具util.hppCompilerServer模块编译模块compiler.hpp运行模块runner.hpp

周周汪·2024-01-06 10:56

真核微生物基因序列鉴定工具EukRep工具的安装和详细使用方法

EukRep从宏基因组数据集中分类真核和原核序列安装要求Python3推荐使用conda安装：$condacreate-y-neukrep-env-cbiocondascikit-learn==0.19.2eukrep

小果运维·2024-01-06 09:31

宏基因组序列分析工具EukRep

文章：Genome-reconstructionforeukaryotesfromcomplexnaturalmicrobialcommunities|bioRxiv仓库：patrickwest/EukRep:ClassificationofEukaryoticandProkaryoticsequencesfrommetagenomicdatasets(github.com)推荐使用conda进行

小果运维·2024-01-06 09:00

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