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生物信息软件应用
第二章 创建并管理一个生信项目
第二章笔记本章目的:帮助读者了解实现
生物信息
学项目的可重复性和鲁棒性所需要的准备工作和持续性文档记录的习惯项目的目录结构命名原则起个简洁又清楚的名字(文件夹名&文件名)例子:研究关于ZeaMays的SNP
6102
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2023-03-24 11:40
采用微服务的6个主要理由
最近,大型企业和一些行业组织正在培养关注的焦点,并在大范围的
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解决方案中采用这一重要概念,例如:金
钱曙光
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2023-03-23 21:18
解决方案
设计
代码
自动
测试
生物信息
场景下的用户需求
背景分析概念定义基因测序是一种新型基因检测技术,是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。基因测序技术能锁定病变基因,提前预防和治疗。过长的测序周期以及上万美元的仪器成本,成了阻碍基因测序进入寻常百姓家的障碍。而运用新技术的基因测序仪,大大降低了基因组测序的门槛,使得更多研究人员能够使用这项技术开发多种应用。常用的测序平台有CompleteGenomics,Illum
大道云行TaoCloud
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2023-03-23 20:24
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分布式存储
信息与生物
而二代测序,
生物信息
技术本质
必康一点
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2023-03-23 11:43
vi多行注释或删除多行注释
微信公众号:
生物信息
学习添加多行注释的方法:1.进入vi/vim编辑器,按CTRL+V进入可视化模式(VISUALBLOCK)移动光标上移或者下移,选中多行的开头3.选择完毕后,按大写的的I键,此时下方会提示进入
gtt儿_生物信息学习
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2023-03-23 10:45
ios13测试版怎么卸载软件,苹果手机升ios13.2后怎么删除app ios13.2卸载
软件应用
方法...
ios13.2于今天凌晨正式进行了推送,估计已经有好多小伙伴们都进行了升级吧!新系统要怎么删除app呢?来和小编一起看看ios13.2删除app方法介绍吧!ios13.2怎么删除app方法一iOS13对用户的长按操作判定进行了修改,默认3DTouch菜单是优先级。也就是长按会优先唤醒3DTouch菜单,继续长按才能触发APP图标移动/卸载功能。所以,在iOS13系统中,你可以通过以下三种方式来删除
荔枝保
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2023-03-23 09:10
ios13测试版怎么卸载软件
最优化算法 - 动态规划算法
动态规划算法简介动态规划(Dynamicprogramming)是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和
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学中使用的,通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法。
Just_Paranoid
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2023-03-23 08:55
数据结构与算法
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我的第一次线上国学课
不安的是担心教课内容的不熟悉、担心线上教学
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不熟悉、担心教课方式会不会得到同学们的喜欢。
红郎少女
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2023-03-23 07:50
2019年“
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分析”暑期班培训报名通知
中关村华康基因研究院为了满足高校学生深入学习
生物信息
分析知识、掌握最新的
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分析技术及积累更多实战经验的需求,由浙江省
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学学会、中关村华康基因研究院主办的2019“
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分析”暑期班将在2019
华康基因
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2023-03-23 02:04
根据barcode拆分测序数据
在后续的
生物信息
分析中,根据Barcode序列即可将不同样品的序列拆分开来。接下来介绍两个序列拆分工具seqtk_demultiplex和fastq-multx。seqtk_demulti
赵会成
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2023-03-22 18:28
FastDDS(5)应用开发入门
数据分发服务(DDS)是一种用于分布式
软件应用
程序通信的以数据为中心的通信协议。它描述了实现数据提供者和数据使用者之间通信的通信应用程序编程接口(API)和通信语义。
pony12
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2023-03-22 14:18
FastDDS
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CMakeList.txt
HelloWorld.idl
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fastdds的快速使用
数据分发服务(DDS)是一种以数据为中心的通信协议,用于分布式
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程序通信。它描述了支持数据提供者和数据消费者之间通信的通信应用程序编程接口(API)和通信语义。
幼儿园扛把子的老大
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2023-03-22 14:16
Fast-DDS
自动驾驶
c++
自动驾驶
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学数据库导航
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作为计算机与生物的交叉学科,最近几年也受到的大家的关注,因此关于
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的数据库越来越多。
牧小熊
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2023-03-22 08:05
用R画boxplot+dotplot+violinplot+jitter及代码
微信公众号:
生物信息
学习我们在想要展示我们的科研成果的时候经常会需要用到一些图,其中boxplot,dotplot,violinplot和jitter等是我们经常要用到的图,那我们会画单个图后如何把这些图整合到一张图上呢
gtt儿_生物信息学习
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2023-03-22 05:10
[源码和文档分享]基于Android的真人社交游戏辅助应用APP设计与实现
在
软件应用
行业,也有越来越多的公司着手开发结合游戏的社交应用。本设计完成的应用为一款移动游戏社交应用,本设计根据软件设计的标准流程,从软件的需求分析、可
ggdd5151
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2023-03-22 03:43
建立静态博客的初步探究
建立博客建立一个免费的、易于维护的个人博客以用于自己或者中小组织的信息发布、生活记录等,个人认为是一个做
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的同学的必备技能,而博客做的是否好看还要多多学习。
龙小树
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2023-03-22 02:50
容器
罗斯议员首先发话:“
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提取技术和网络技术、航空技术一样,技术是中性的,我们的讨论焦点不应该是这个技术是否是合法的,而应该是如何合法地使用这项技术。
给我翻译翻译
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2023-03-21 23:56
java开发框架低代码平台会不会过时?
一、java开发框架的应用优势软件框架可以提供特定功能,促成
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、产品和解决方案开
Gzlcxxjs
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2023-03-21 22:02
低代码
java
开发语言
一步到位-生信分析流程构建框架介绍
我们都知道
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学(Bioinfomatics)包含两个部分:bio和informatics,即利用生物数据通过计算机学或统计学或数学的方法发现这些数据背后所具有的生物学意义。
亮亮就是亮
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2023-03-21 11:43
Go Web编程介绍
Web应用是当今使用最为广泛的一类
软件应用
之一,人们每天都在使用Web应用。实际上,手机里看上去像是原生的应用都在内部包含了使用Web技术构建的组件。
77fbb8bc241c
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2023-03-20 21:40
[DEBUG] springboot接收可变长文件数组
更多技术文章请访问我的博客园账户:点击这里那边会更新有关
生物信息
学,javaWeb,统计学理论和一些杂七杂八的记录:)leetcode刷题记录争取日更(github):点击这里部分敏感信息已打码。
陆书生
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2023-03-20 09:25
人工智能交互系统界面设计
1.导入相关库文件2.人脸信息验证功能3.语音交互与TCP数据通信4.数据信息可视化四、相关附件前言在现代信息化时代,图形化用户界面(GraphicalUserInterface,GUI)已经成为各种
软件应用
和设备交互的主流方式
lyx4949
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2023-03-19 19:53
python
tkinter
人工智能
交互
语音识别
python
Tkinter界面
前言
生物信息
学与基因组分析入门TO-DO
生物信息
学结合生物学、计算机科学和统计学等学科的方法,以实现对海量生物医学数据的分析与解读,从而揭示生命的奥秘。
adong
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2023-03-19 15:48
【对联临屏】题江梦南——感动中国2021年度人物之一
吉林大学药学院2015级硕士研究生,清华大学
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学博士研究生。靠学习唇语、看老师板书和自学
诗呆
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2023-03-18 19:21
NIPT(无创产前DNA检测)技术的解说及运用(五)
NIPT检测技术仅需采取孕妇静脉血,利用二代DNA测序技术对母体外周血浆中纯化后的游离胎儿DNA片段(cffDNA)进行测序,并将测序结果进行数据化处理、
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分析,可以从中解读出胎儿的遗传信
生物菌君
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2023-03-18 19:19
Biostar handbook学习笔记四
目前学习到的关于生物数据及数据库的基本知识有:常用数据格式:fasta,fastq,gff,GenBank常用序列数据库:美国国立生物技术信息中心(NCBI)欧洲
生物信息
学中心(EBI)DDBJ常用基因功能数据库
简书蚕账号
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2023-03-18 17:06
day32
rsync复制
软件应用
与实践what什么是?why为什么要用?where1、什么是rsync?
凡夫俗子_9e56
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2023-03-17 10:46
第三方个人免签支付工具、个人支付通道使用介绍(支付通道 支付系统 支付接口)
第三方个人免签支付工具使用介绍随着互联网的发展日新月异,现在在线交易平台越来越多,而支付则是每个交易平台绕不过去的,而个人免签支付,则是特意为中小企业应运而生的一款
软件应用
,下面我就将其使用方法告诉大家
水原先生
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2023-03-17 07:28
R语言作业—初级
教程对应B站:【生信技能树】生信人应该这样学R语言配套资料:B站的11套
生物信息
学公益视频配套讲义、练习题及思维导图先仔细观看视频,理解代码含义初级题目题目链接:http://www.bio-info-trainee.com
琪音
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2023-03-17 04:35
用户体验五要素
软件应用
大致可以分为:工具型:作为一种工具帮助用户高效便捷的完成某件事情,其最核心的是功能,例如浏览器、计算器。信息型:最核心的是内容,例如各种新闻资讯APP、博客APP等。
阿文不吃糖
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2023-03-16 13:18
生物信息
学从零开始学(5)——蛋白质-小分子分子对接详细步骤(docking)
叠合两个蛋白质三维结构蛋白质三级结构的比对蛋白质三维结构比对就是对蛋白质三维空间结构的相似性进行比较。可用于探索蛋白质进化及同源关系改进序列比对的精度改进蛋白质结构预测工具为蛋白质结构分类提供依据帮助了解蛋白质功能结构比对的结果可以用很多种参数来衡量,最常用的是rootmeansquareddeviations(RMSD)。如果两个结构的RMSD为0埃,则结构一致,可以完全重合;一般来说RMSD小
今日之森
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2023-03-16 07:36
理解 RESTful API
RoyThomasFielding博士在他那篇著名的博士论文《ArchitecturalStylesandtheDesignofNetwork-basedSoftwareArchitectures》中提出了几种
软件应用
的架构风格
china_木木
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2023-03-15 13:56
三维基因组(Hi-C)的原理以及应用
Hi-C技术源于染色体构象捕获(ChromosomeConformationCapture,3C)技术,利用高通量测序技术,结合
生物信息
分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质三维结构信息
生信编程日常
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2023-03-15 12:45
BERT6mA:使用基于深度学习的方法预测DNA N6甲基腺嘌呤位点
methyladeninesiteusingdeeplearning-basedapproaches》ShoTsukiyama,MdMehediHasan,Hong-WenDengandHiroyukiKurata日本九州理工学院生物科学和
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学系
Good_Ly
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2023-03-15 07:54
深度学习
人工智能
基于多组学网络的
生物信息
学方法识别 KTR中miRNA 生物标志物(IF8+)
Multi-omicsnetworkcharacterizationrevealsnovelmicroRNAbiomarkersandmechanismsfordiagnosisandsubtypingofkidneytransplantrejection多组学网络特征揭示了新的microRNA生物标志物和肾移植排斥反应的诊断和亚型划分机制发表期刊:JTranslMed发表日期:2021Aug13
生信学霸
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2023-03-14 22:03
2019-06-17 学习清单TODO list
专业TODO:1.利用python进行数据分析2.STL源码解析3.概念图模型(机期学习的书)4.哔哩哔哩上北大公开课5.鸟哥的linux私房菜6.流畅的python7.公开课:北大
生物信息
学(13h9m
啦啦啦Leo
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2023-03-14 21:12
什么是用户画像分析?创建维度+方法,透视其价值究竟在哪?
用户画像分析旨在可靠而真实地反映企业期望一群人如何参与产品、服务或活动是建立一个可用
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的基础之一。用户配置文件推动了应用程序的组织和术语的使用。例如,菜单、功能和控
微说运营
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2023-03-14 16:42
生物技能树--fasta和fastq格式文件的shell小练习
这个是有机结合
生物信息
学的linux和数据格式的练习题:下载bowtie2软件后拿到示例数据:mkdir-p~/biosoftcd~/biosoftwgethttps://sourceforge.net
Hannahhao
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2023-03-14 13:18
云服务器配置方案
2、web类(门户、电影、电商)主要是消耗带宽资源,因为现在web站点图片、流媒体较多,用户的访问服务器的交互只是建立连接获取这些信息,相对
软件应用
服务器计算量很少。
冬冬天的冬
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2023-03-13 22:02
生物信息
学常用数据库
一.信息类数据库1.综合型数据库NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/UCSC:http://genome.ucsc.edu/(基因组浏览器)Ensembl:http://asia.ensembl.org/index.htmlGenecards:https://www.genecards.org/BioGPS:http://biogps.org/#goto=welco
晓佥
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2023-03-13 05:54
IGV-基因组浏览器
电脑系统:Ubuntu18.04ItegrativeGenomicsViewer(IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具,此工具可以让从事
生物信息
的科研工作者轻松的分析查看多种基因组数据
东风008
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2023-03-12 15:34
对bam文件做downsample
微信公众号:
生物信息
学习如果各个样本测的数据量相差较大,想把这些样本downsample到相同的reads,可用以下方法:目标reads数为15000000,需要先计算出需要downsample的比例,
gtt儿_生物信息学习
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2023-03-11 18:20
上瘾:让用户养成使用习惯的四大产品逻辑
书中,作者对用户在使用
软件应用
时所产生的成瘾行为进行观察及总结,得出“上瘾模型”。
C懵猪
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2023-03-11 17:57
fasta和fastq格式文件的shell小练习
这个是有机结合
生物信息
学的linux和数据格式的练习题:下载bowtie2软件后拿到示例数据:>mkdir-p~/biosoft>cd~/biosoft>wgethttps://sourceforge.net
生信_小陌
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2023-03-11 10:55
开源工作也需要构筑领域知识的体系
在计算机科学(CS)中,有一个很有意思的交叉学科——
生物信息
学(Bioinformatics)。
小叶与小茶
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2023-03-11 09:18
ReactomeGSA:高效的单细胞通路分析工具
然而,整合来自不同组学技术和不同物种的数据仍然需要大量的
生物信息
学知识。在单细胞数据科学中,Pathwayanalyses也是基因表达数据链接其他组学的主
周运来就是我
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2023-03-11 09:51
解锁复杂问题的秘密武器:动态规划算法
这种算法思想在许多领域中都有重要的应用,例如计算机视觉、自然语言处理、
生物信息
学、经济学等领域。本文将介绍动态规划的基本概念、经典问题和算法实现方式。
陈书予
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2023-03-11 08:41
算法
算法
动态规划
服务器
网络
运维
探索量子的秘密 百草汉医量子微磁消融仪太赫兹能量灸
量子医学开辟现代医学最前沿的全新门类,美国《科学》杂志报道:量子医学不依赖任何药物和营养剂,而是利用磁场频率所转化的带运动轨迹的量子波与人体细胞产生共振而转化的
生物信息
,从而激发人体排毒机能、免疫机能、
衡水百草汉医国医馆
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2023-03-11 08:06
生物信息
学常用的R语言包
org.Hs.eg.dbThisisapackageforgenome-wideannotationforhuman,haveentrezID,ensembleIDandgenesymbolIDs.Donothavespecificversionsincedonotincludetheactualcoordinatesofthegenebutthelocusofthegene,e.g.19q13.
傅小潇
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2023-03-11 05:22
JAMA Oncology 文献解读 | 使用随机森林预测肿瘤类型
在之前的推文里,大可已经给大家说过,机器学习结合
生物信息
学,也许是未来
生物信息
学发表的新出路。
医科研
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