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生物信息软件应用
【数学建模/数据分析论文写作】图表制作 | 数据可视化常用工具整理
致力于
生物信息
学/医学图像分析等领域,对计算机方向的特别友好~网址跳转:①http://sangerbox.com/Tool②http://vip.sangerbox.com/home.html派森诺基因云很多很多
RickieLim
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2023-01-18 00:23
Data
Visualization
1024程序员节
数据分析
数据挖掘
数据可视化
可视化
送书《R语言数据分析和可视化》 | 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香!!!...
生物信息
学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
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2023-01-17 09:41
编程语言
数据可视化
人工智能
数据分析
数据挖掘
RNA 22. SCI 文章中基于表达估计恶性肿瘤组织的基质细胞和免疫细胞(ESTIMATE)
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你90篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因
·
2023-01-17 09:48
RNA数据分析
人工智能
机器学习
数据分析
SCI文章
数据挖掘
【
生物信息
】ESTIMATE 分析免疫评分和肿瘤纯度
ESTIMATE分析免疫评分和肿瘤纯度背景:从病人身上获取的肿瘤组织不仅仅包括包括肿瘤细胞,还包括与肿瘤微环境相关的很多其他细胞,比如正常的基质细胞,免疫细胞、血管内皮和血管内的血细胞。其中比较重要的就是免疫细胞,免疫细胞的种类很多,不同类型的免疫细胞在抗肿瘤和肿瘤免疫逃逸过程中又发挥了不同的作用,肿瘤的生长、侵袭和转移与肿瘤的生长、侵袭和转移,无不与免疫细胞相关。其次就是基质细胞,基质细胞也被认
qqgzsws
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2023-01-17 09:13
生信
肿瘤
TCGA
r语言
ai人工智能语音分析系统_人工智能如何帮助需求分析工具
ai人工智能语音分析系统功能需求和用户案例为
软件应用
程序创建了蓝图。一组好的需求可以在将业务构想转换为工作代码时简化开发人员的工作。
curry3333
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2023-01-16 17:23
人工智能
java
大数据
编程语言
项目管理
Bioinformatics|MGPLI:探索蛋白质-配体相互作用预测的多粒度表示
Bioinformatics|MGPLI:探索蛋白质-配体相互作用预测的多粒度表示最近搞了个公众号《AIandBioinformatics》介绍应用于
生物信息
学的人工智能算法和研究进展,以及网络表示学习算法研究
Struggle~
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2023-01-16 09:38
生物网络文章
深度学习
人工智能
RNA 19. SCI 文章中无监督聚类法 (ConsensusClusterPlus)
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你83篇原创内容公众号基于RNA数据做临床预测时,我们往往并不知道该对样本怎么分类
桓峰基因
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2023-01-15 19:23
RNA数据分析
数据分析
人工智能
SCI文章
机器学习
数据挖掘
微服务架构系列主题:微服务架构概述
一、前言微服务(MicroServices)是一种架构风格,一个大型复杂
软件应用
由多个微服务和前端展示层组成。系统中的各个微服务可被独立部署,各个微服务之间是松耦合的。
LarryHai6
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2023-01-15 08:25
IT-微服务
微服务架构
anaconda 删除环境_Anaconda:解决你装包的烦恼
生物信息
学的日常就是利用五花八门的工具和各种各样的数据打交道,很多时候需要在命令行安装软件或者包。
weixin_39960147
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2023-01-14 14:11
anaconda
删除环境
anaconda删除环境
anaconda安装包
anaconda添加清华镜像
肿瘤TMB的计算原理及数学模型
本人从事
生物信息
多年,最近花了近三年的时间夜以继日开发了一系列肿瘤NGS检测算法(单计算函数自己就创建了近一百个!),包括超高深度测序数据的UMI分子标签算法。
JRuby9K
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2023-01-14 08:17
生物信息
IB生物笔记:Structure and function of organelles
OptionalTopics包括∶神经与行为学,生物科技与
生物信息
学,生
IB_course
·
2023-01-13 13:02
学习
MATLAB | 如何使用MATLAB绘制序列logo图
这次开发了一个
生物信息
学比较常用的序列logo图绘制MATLAB代码包,绘制效果如下:数据来自基迪奥生物项目编号为seqlogojrois9l2jit的示例数据。
slandarer
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2023-01-11 19:37
#
MATLAB
科学绘图
matlab
开发语言
python
生物信息
学_序列比对(一)序列比对概述
比较是科学研究中最常见的研究方法之一,通过比较寻找研究对象可能具备的某些特征和特性。序列比较的理论基础是进化学说:如果两个序列之间具有足够高的相似性,那么两者可能是共同的进化祖先经过序列内残基的替换,残基或序列片段的缺失或插入以及序列重组等遗传变异过程分别演化而来。序列比较的目的主要有两点:根据相似性通过已知序列来预测未知序列的结构和功能推断序列之间的同源性,推测进化关系相似性同源性任意两条序列都
金石就好
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2023-01-11 08:57
生物信息学
生物信息学
【视频】Copula算法原理和R语言股市收益率相依性可视化分析|附代码数据
在本视频中,我们通过可视化的方式直观地介绍了Copula函数,并通过R
软件应用
于金融时间序列数据来理解它。为什么要引入Copula函数?当边缘分布(即每个随机变量的分布)不同的随机变量,互相之间并
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2023-01-10 22:48
数据挖掘深度学习机器学习算法
盘点微服务架构下的诸多身份验证方式
在传统的单体
软件应用
程序中,所有这些都发生在同一个应用程序中。但在微服务架构中,系统由多个服务组成,在这样的架构中,每个微服务都有自己的任
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2023-01-10 17:25
apisix认证授权微服务
知识图谱-
生物信息
学-医学论文(BMC Bioinformatics-2022)-挖掘阿尔茨海默病相关KG来确定潜在的相关语义三元组用于药物再利用
论文标题:MiningOnAlzheimer’sDiseasesRelatedKnowledgeGraphtoIdentityPotentialAD-relatedSemanticTriplesforDrugRepurposing论文地址:https://arxiv.org/pdf/2202.08712论文期刊:BMCBioinformatics20229.(2022.2.17)BMCBioinf
Cheng_0829
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2023-01-10 09:01
知识图谱
知识图谱
人工智能
机器学习
自然语言处理
生物信息学
R 语言 4.2.2安装 WGCNA
文章目录1WGCNA库介绍2安装踩坑还得是官方文档这样安装我出现的问题参考AppendixA.安装RB.配置环境C.修改镜像1WGCNA库介绍WGCNA是用于加权相关网络分析的R包,相关网络越来越多地用于
生物信息
学应用加权基因共表达网络分析是一种系统生物学方法
LiQiang33
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2023-01-09 19:31
编程环境配置
杂文
r语言
开发语言
【
生物信息
学】ATAC-seq流程及代码分析、复现文章
1:ATAC-seq的定义及用途whatisATAC-seq全称是AssayforTransposase-AccessibleChromatinsequencing即借助Tn5转座酶对开放染色质区域进行高通量测序主要原理:Tn5转座酶可以对染色质开放区域DNA切割并添加测序接头,然后进行高通量测序就取得了开放染色质区域的测序数据。与其他技术比较(DNase-Seq,FAIRE-Seq)ATAC-s
爱做饭的电饭煲
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2023-01-09 17:16
中科大研究生考试
ATAC-seq
生物信息学ATAC
NGSIM 数据集寻找前、后车速度
LankershimBoulevard南行、加利福尼亚州Emeryville的I-80东行以及佐治亚州亚特兰大的Peachtree街的详细车辆轨迹数据,数据是通过同步数字摄像机网络收集的,NGVIDEO是NGSIM开发的定制
软件应用
程序
Medely_QQ
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2023-01-08 17:57
NGSIM数据集
模型标定
大数据
经验分享
其他
关联规则挖掘(Apriori算法和FP-Growth算法)
一、关联规则概述1.关联规则分析用于在一个数据集中找出各种数据项之间的关联关系,广泛用于购物篮数据、个性化推荐、预警、时尚穿搭、
生物信息
学、医疗诊断、网页挖掘和科学数据分析中2.关联规则分析又称购物篮分析
小盗啊
[email protected]
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2023-01-08 14:33
Python
算法
大数据
机器学习
机器学习在
生物信息
(如DNA比对等方面)的研究现状是怎样的?
机器学习在
生物信息
(如DNA比对等方面)的研究现状是怎样的?计算机研一小白一枚,实验室整体做的方向是机器学习,老板分给我的方向是机器学习在
生物信息
领域的应用。
wangchuang2017
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2023-01-07 17:40
其他
数据库
sql
机器学习在
生物信息
领域可以做什么
用“machinelearninggenomics”在biorxiv中检索(限定一下Bioinformatics领域),查看最新文章的标题和摘要,看看机器学习都能做些什么实际的项目。1.Machine-learningannotationofhumansplicingbranchpoints(RNA剪切体位点预测)使用机器学习来注释人类剪切体的分支点需要有RNAsplicing的知识,首先得搞懂b
hello~bye~
·
2023-01-07 17:37
生物信息学
人工智能
机器学习
生物信息
生物信息
学中的机器学习:使用K-Means和PCA进行基因组序列分析 COVID-19接下来如何突变?
许多人没有想到,病毒就像地球上为生存而挣扎的其他生物一样,它们会进化或变异。只要看一看人类病毒来源的蝙蝠携带的病毒RNA序列片段即可。AAAATCAAAGCTTGTGTTGAAGAAGTTACAACAACTCTGGAAGAAACTAAGTT…以及人类COVID-19病毒的RNA序列的摘录…AAAATTAAGGCTTGCATTGATGAGGTTACCACAACACTGGAAGAAACTAAGTT…显
python机器学习建模
·
2023-01-07 17:04
python生物信息学
机器学习
kmeans
人工智能
机器学习 及其在
生物信息
学的应用
由于我现在的方向是
生物信息
学,所以给大家推荐一本书,叫《
生物信息
学:机器学习方法》,网上提供下载,我就不放在附件中了。
0x0101
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2023-01-07 17:34
bioinformatics
人工智能
php
数据库
变异记录文件格式 vcf
vcf文件做记录个体或群体突变的文件格式,在
生物信息
学应用中举足轻重。主流的
生物信息
分析软件,在处理变异信息时,也基本上需要考虑支持解析或输出vcf格式的文件。
新爷话数据
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2023-01-07 16:33
生物信息学
生物信息
学|药物发现中的机器学习技术(1)
本篇推文引自:Advancedmachine-learningtechniquesindrugdiscovery1.摘要: 机器学习(ML)在药物发现中的持续增长,产生了令人印象深刻的结果。随着它们的使用增加,它们的局限性也变得越来越明显。这些局限性包括它们对大数据的需求、数据的稀缺性以及缺乏可解释性。也很明显的是,这些技术并不是真正自主的,即使在部署后也需要再训练。在这篇综述中,我们详细介
ShenggengLin
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2023-01-07 16:02
生物信息学
药物发现
机器学习
生物信息
学|药物发现中的机器学习技术(2)
本篇推文引自:Advancedmachine-learningtechniquesindrugdiscovery1.迁移学习 如果数据量比较少,那么有一些技术可以用来规避这个问题。迁移学习就是这样一种技术,它是将从解决一项任务中获得的知识转移到另一项相关任务的过程。迁移学习是一种越来越流行的ML框架,特别是在医学图像分类中,它包含了一系列技术。迁移学习是通过从已经学习的相关任务中转移知识来改
ShenggengLin
·
2023-01-07 16:02
机器学习
药物发现
当
生物信息
遇见机器学习
比如
生物信息
学里面的:回归分析、随机森林、支持向量机等算法,都是比较成熟的应用了。那今天本文,就给大家剖析一下当
生物信息
遇见机器学习,会有什么火花。
新爷话数据
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2023-01-07 16:01
机器学习
数字孪生智慧医院:构建三维医疗管控系统
图扑
软件应用
自主研发的HT产品,无缝融合
图扑软件
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2023-01-07 14:10
数字孪生
可视化
智慧医疗
可视化
前端
javascript
3d
物联网
python 相关性fdr矫正_【统计】对P值进行FDR校正的原理(附代码演示)
【统计】对P值进行FDR校正的原理(附代码演示)2018-09-15做了多年的
生物信息
处理,和统计显著已经打过很多交道。然而限于生物出身背景,对于统计知识了解不是很深刻。
weixin_39950764
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2023-01-06 16:45
python
相关性fdr矫正
论文解读《STALLION:一个基于堆叠的原核赖氨酸乙酰化位点预测的集成学习框架》
识别蛋白质赖氨酸乙酰化(Kace)位点是
生物信息
学中的一项具有挑战性的任务。到目前为止,几种基于机器学习的方法,在硅中识别Kace站点的方法已经被开发出来。其中,少数是原核生物物种
HXH@
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2023-01-06 16:28
集成学习
机器学习
人工智能
利用计算机辅助药物设计方法有何优点,计算机辅助药物设计的原理及应用
刘景陶+刘映雪摘要:计算机辅助药物设计(computeraideddrugdesignCADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和
生物信息
学提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像
weixin_39630813
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2023-01-05 15:58
美颜滤镜:早已不是简单的磨皮美白
早期的手机自拍并不能实时加持美颜效果,需要拍摄后再利用
软件应用
进行后期处理。当时,以磨皮美白的技术闻名的
软件应用
为数不少,例如大众熟知
美狐美颜sdk
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2023-01-05 11:11
美颜算法
R语言机器学习mlr3:模型解释
获取更多R语言和生信知识,请欢迎关注公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记公众号主要分享:1.医学小知识、肛肠科小知识;2.R语言和Python相关的数据分析、可视化、机器学习等;3.
生物信息
学学习资料和自己的学习笔记
医学和生信笔记
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2023-01-05 02:20
R语言机器学习
r语言
机器学习
数据挖掘
python
R语言机器学习mlr3:技术细节
获取更多R语言和生信知识,请欢迎关注公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记公众号主要分享:1.医学小知识、肛肠科小知识;2.R语言和Python相关的数据分析、可视化、机器学习等;3.
生物信息
学学习资料和自己的学习笔记
医学和生信笔记
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2023-01-05 02:49
R语言机器学习
r语言
机器学习
python
数据挖掘(三)聚类
聚类分析(英语:Clusteranalysis,亦称为群集分析)是对于统计数据分析的一门技术,在许多领域受到广泛应用,包括机器学习,数据挖掘,模式识别,图像分析以及
生物信息
。
我是猫
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2023-01-05 00:02
Data
minding
数据挖掘
机器学习
数据分析
一起学习关于Biclustering的那点东西
双聚类算法之学习记录(1)前言双聚类简介背景与意义双聚类算法评估指标最后前言在读计算机专业硕士一枚,课题组方向为
生物信息
学,主要研究方向是双聚类算法。
普普通通的小C
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2023-01-05 00:30
聚类
算法
生物与编程的碰撞
之所以产生并开始学习编程一个大原因是因为21世纪毕竟是一个数据爆炸的时代,而如何处理数据,找到数据背后的规律也是生物专业所必需的技能,也因此催生了生物专业较为热门的小专业--
生物信息
学。
donerest
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2023-01-04 18:41
C/C++
c语言
学习
AI-多模态-2021:DALL-E模型【文本生成图像工具】【OpenAI】
Dall-e:从拟物文字到图片的创造人类不断地从五种感官接收和整合信息,通过视觉、听觉、触觉、嗅觉和味觉等
生物信息
来理解文字和图片。
u013250861
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2023-01-04 11:15
AI多模态
人工智能
生物化学 单个基因
生物信息
学分析笔记
单个基因
生物信息
学分析01基因结构预测和功能注释选择基因文件及物种预测结果02蛋白结构域预测03同源基因分析04多序列比对05蛋白二级三级结构预测06蛋白特性分析07跨膜结构分析08信号肽分析09亚细胞定位预测
FakeOccupational
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2023-01-04 08:16
深度学习
人工智能
MachineLearning 5. 癌症诊断和分子分型方法之支持向量机(SVM)
点击关注,桓峰基因桓峰基因
生物信息
分析,SCI文章撰写及
生物信息
基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你92篇原创内容公众号桓峰基因的教程不但教您怎么使用
桓峰基因
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2023-01-04 08:13
机器学习
支持向量机
算法
机器学习
数据挖掘
数据分析
操作系统面试题
它为计算机硬件和软件提供了一种中间层,使应用软件和硬件进行分离,让我们无需关注硬件的实现,把关注点更多放在
软件应用
上。2.操作系统的主要功能进程、内存、设备、文件管理和提供用户接口。
lalajh
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2023-01-03 13:15
操作系统
面试
面试
深度学习训练与推理---台式、便携式、机架式、集群硬件配置推荐2022
21世纪计算机最大挑战—深度学习、人工智能,它帮助更多领域的应用研究获取质的进展,计算机视觉、语音识别、自动机器翻译、自动驾驶汽车、药物发现、
生物信息
、医学诊断、视频游戏、围棋、智能电网…不怕千招会,就怕一招绝
於無聲處聽驚雷
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2023-01-03 09:10
深度学习
深度学习
人工智能
pytorch
tensorflow
paddlepaddle
一文读懂什么是低代码开发?
低代码开发是一种新的应用程序创建方法,它使开发人员能够以最少的手工编码去创建功能强大的
软件应用
程序。简而言之,低代码平台
YonBuilder低代码开发平台
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2023-01-02 04:05
低代码开发
低代码
送书 | 令附生信专用简明 Python 文字和视频教程
本教程专注于帮助初学者,尤其是
生物信息
分析人员快速学会Python的常用功能和使用方式,因此只精选了部分Python的功能,请额外参考Python经典教程Abyteofpython和它的中文版来更好的理解
生信宝典
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2023-01-01 07:53
列表
lamp
scipy
crm
lighttpd
什么是无代码平台?未来软件终极平台
未来
软件应用
会是什么样子的?那么一定是无代码所谓无代码,简单来说就是不用编写代码就可以搭建各种业务应用。比如通过三叠云平台,只需要通过自由拖拽相关组件,即可快速搭建表单。
三叠云
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2022-12-31 16:06
大数据
Spring Boot构建多租户SaaS平台核心技术指南
概述笔者从2014年开始接触SaaS(SoftwareasaService),即多租户(或多承租)
软件应用
平台;并一直从事相关领域的架构设计及研发工作。
yang202924111010
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2022-12-31 12:24
java
java
spring
boot
Spring Boot 构建多租户SaaS平台核心技术指南
1.概述笔者从2014年开始接触SaaS(SoftwareasaService),即多租户(或多承租)
软件应用
平台;并一直从事相关领域的架构设计及研发工作。
六月·飞雪
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2022-12-31 12:22
后台
spring
boot
java
数据库
2021年顺义区支持企业智能转型升级项目申报条件及要求,补贴1000万
华夏泰科了解到2021年顺义区支持企业智能转型升级项目申报,对智能制造装备和
软件应用
项目最高支持200万元,对项目建设期不超过2年的智能制造单元和智能产线项目最高支持300万元,对项目建设期不超过3年的数字化车间和智能工厂项目最高支持
华夏泰科指尖申报
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2022-12-31 11:03
生存分析及生存曲线_2021-01-30
生存分析(英文:SurvivalAnalysis),是
生物信息
学分析中常用到的一种重要方法,主要分析场景如:不同组癌症病人在一种或者一种以上的变量作用下其生存概率随着记录时间发展而发生的变化或者走势。
知无牙
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2022-12-31 08:23
R数据可视化
数据可视化
R
R数据分析
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