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16S
微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组+宏病毒组+宏转录组--转载
转载:https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于
16S
/18S/ITS等扩增子做物种分类的
weixin_33963594
·
2020-08-08 00:29
安卓4g网络下访问特别慢 APN为ipv4的时候可以访问IPV6不可以访问
但是在3次握手前停滞了
16s
,这很奇怪!不经想问,3次握手前做了什么!由于个人水平有限,猜测是不是域名解析的问题呢!和后台交流一下!
weixin_33970449
·
2020-08-07 20:35
windows socket 设置connect的超时(附Linux平台connect超时设置)
linux平台下的socket通过设置超时时间可以在connect的时候进行超时判断,而windows设置超时对connect不起作用,默认大概是
16s
。
阿龙哥哥
·
2020-08-07 19:51
c++
免费c++图片操作库(类)
但该库似乎不大稳定,对32F和
16S
、8U的
必成桂
·
2020-08-07 12:25
c++
STL
VC++
让windows 10 WSL2成为生产力
比起之前的thinkpadE431性能有了不小的提升,八核心八线程,多线程处理速度相比之前的双核4线程要强了不止两倍,虽然同样16DG的内存,频率也从1600MHzDDR3变为2600MHz了,别的不提,只
16S
zd200572
·
2020-08-05 21:44
IT
win10
wsl
默认目录
16S
预测细菌表型-bugbase:革兰氏阴阳、生物膜、致病力、移动元件、氧气消耗等...
基于16SOTU表预测细菌表型数据库,同时可进行组间差异分析BugBasePredictsOrganismLevelMicrobiomePhenotypesTonyaWard,JakeLarson,JeremyMeulemans,BenHillmann,JoshuaLynch,DimitriSidiropoulos,JohnSpear,GregCaporaso,RanBlekhman,RobKni
刘永鑫Adam
·
2020-08-05 11:33
学完这些,js操作数组你就很牛逼了
push()7.pop()8.join()9.concat()10.shift()11.unshift()12.reverse()13.slice()14.splice()最高级方法15.sort()
16s
Lechar0327
·
2020-08-03 10:43
JavaScript
qiime2+biom+qiime1获得
16S
物种丰度
我们知道,不管是
16S
等扩增子测序,还是宏基因组,最后最重要的结果,就是物种的丰度情况了,qiime2给出的
16S
丰度结果是一个计数,对于许多软件来说这是可用的,那么如果我们想获得一个直接的百分比数据应该怎样做呢
zd200572
·
2020-08-01 08:22
生物信息
肠道微生物
生信小工具专题:BBTools/BBMap Suite 的使用 (2)
BBMapReadMerger合并双末端(PE)reads,在预期中这些reads有重叠的位置(例如
16S
扩增子测序)。通过重叠检测将配对的reads合并为单个read。
lakeseafly
·
2020-07-31 21:21
魅族
16s
的4800万+OIS防抖,网友:防抖很实用
而魅族
16s
配备的OIS光学防抖技术在行业内备受好评,这条微博虽无明说,但似乎也在暗示着同价位竞品“光有好的拍照参数,没有优秀拍照的体验”。4800万是常规操作,OIS防抖才是技术今年手机市场
礼物数码
·
2020-07-31 17:47
魅族
16S
和Reno十倍光变版简单比较
魅族
16S
和Reno十倍光变版作为各自品牌的旗舰机型,要说谁更值得买,那么就要来对比下两款手机的优缺点,然后看哪一款的优点能打动你!
远征科技指南
·
2020-07-28 20:21
旗舰机大PK 魅族
16s
只售2699性能价格全一流
发布后不到两个月,魅族旗舰
16s
就出现了500元的大降价,这是魅族"618夏日清凉价"活动的大手笔之一,6月6日至6月18日活动期间,该旗舰产品售价仅为2699元起。
豆包数码
·
2020-07-27 15:24
魅族
16s
安兔兔跑分揭晓:在优化中不断提高
【TechWeb】4月16日消息,随着OPPOReno的正式亮相,目前为止还没有推出搭载骁龙855处理器的旗舰新机的品牌真的不多了,而其中的魅族全新旗舰
16s
系列一直以来牵动着无数魅友的心。
techweb
·
2020-07-14 23:43
记一次开发组内课题 【 24G ng log 统计域名、uri访问次数top10,最终程序使用内存64M、花费时间
16s
】
组内发布一个课题:给一个4核、4G内存的环境,分析统计nglog中访问域名和uri数量的top10在没有OOM并结果正确的前提下,比拼处理速度。在大神帮助下、我的程序轻松夺冠。程序很简单,在写了多版程序后分析程序效率瓶颈、如何更省内存、如何避免发生GC等问题,过程经历难能可贵,写一篇帖子记下来。nglog格式:[02/Sep/2019:00:00:03+0800]-47.91.455.21serv
凌夏大叔
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2020-07-13 14:44
多线程
疑似魅族
16s
Pro通过3C认证:支持12V/2A 24W快充
从去年开始,魅族的发展遇到了不少的困难,推出新机的频率和步伐要远远小于往年,尤其今年已过去一多半,但魅族却仅仅推出了Note9和
16s
两款主打新机,而且反响并不高,虽然机海战术并不是最好的战略,但对于魅族来说
techweb
·
2020-07-13 14:38
关于我总结的QIIME 2
16S
扩增子分析流程
整理了QIIME216S扩增子分析流程常用的命令和可视化结果的图文解释,挑选了非常基础实用的部分做一个QIIME2学习大礼包(没错就是这篇文章)。东西太多就不搬运到啦(自己搬运自己真累),所以放个CSDN的传送门,戳这个:QIIME216S扩增子分析基础流程及常用命令(新手友好向)下载这篇文章的PDF版随时查阅:QIIME2扩增子分析流程及常用命令.pdf为什么今天的文章编辑模式变成Markdow
砂之家Kora
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2020-07-13 13:42
微生物培养的福音:一个直接用
16S
rDNA序列来预测其培养基配方的网站
【本文转载自“微生物生态”公众号,作者卢瑟菌,己获授权,本平台编辑对内容进行测试和更新。】今天卢瑟菌给大家隆重推出一个超级好的网站,网站名字叫KOMODO(KnownMediaDatabase),没错,网站作者就是严(tiao)肃(pi)地把科莫多巨蜥的照片放在了网站主页,见下图1左上角。言归正传,这个网站的神奇之处就在于可以根据细菌或古菌16SrDNA的序列来预测培养该菌的培养基配方!文章发表在
刘永鑫Adam
·
2020-07-12 15:14
software
16S
预测宏基因组最强R包-Tax4Fun
之前在公众号的文章《根据
16S
预测微生物群落功能最全攻略》阅读人数近3000人,有需求的用户还是非常多的。
刘永鑫Adam
·
2020-07-12 15:14
R
R语言绘图包
16S
预测细菌组表型-bugbase:革兰氏阴阳、生物膜、致病力、移动元件、氧气消耗等
基于16SOTU表预测细菌表型数据库,同时可进行组间差异分析BugBasePredictsOrganismLevelMicrobiomePhenotypesTonyaWard,JakeLarson,JeremyMeulemans,BenHillmann,JoshuaLynch,DimitriSidiropoulos,JohnSpear,GregCaporaso,RanBlekhman,RobKni
刘永鑫Adam
·
2020-07-12 15:14
software
最后2周 | 高级转录组分析和R语言数据可视化第十一期 (报名线上课还可免费参加线下课)...
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组、Python课程线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。
刘永鑫Adam
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2020-07-12 15:41
试用python读取地震波形的二进制SAC文件
defread(self,sFile):#sFile='e:\\10.sac'f=open(sFile,'rb')hdrBin=f.read(632)sfmt='f'*70+'I'*40+'8s'*22+'
16s
wjb801
·
2020-07-12 15:59
Python
关于AIDL通讯在魅族16Xs的兼容性问题
关于AIDL通讯在魅族16Xs的兼容性问题最近在项目中遇到一个AIDL兼容魅族手机(16Xs,
16s
)问题,记录一下,以便下次后续翻阅。
奔跑草-
·
2020-07-12 01:23
Android
OpenCV2学习(10)之Mat类对象元素的获取与赋值
矩阵元素的表达:对于单通道图像,其元素类型一般为8U(即8位无符号整数),当然也可以是
16S
、32S、32F等;这些类型可以直接用uchar、short、float等C/C++语言中的基本数据类型表达。
kou_ching
·
2020-07-11 10:34
OpenCV2
ZT:微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组+宏病毒组+宏转录组
本文转自:生信者言建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于
16S
/18S/ITS等扩增子做物种分类的Metataxanomics、鸟枪法打断全基因组DNA序列的Metagenomics
felixhell
·
2020-07-10 09:17
Microbiome:使用
16S
rRNA基因数据集实现种水平的分类
编译:A国民少女,编辑:小菌菌、江舜尧。导读16SrRNA基因测序的低成本促进了人口规模的分子流行病学研究。现有的计算算法可以将16SrRNA基因序列解析为高分辨率扩增子序列变体(ASV),这代表了可用于不同研究的一致标签。将这些ASV分配给物种级别的分类,可增强基于16SrRNA基因的微生物群研究的生态和/或临床相关性,并进一步促进跨研究的数据比较。论文ID原名:Constructionofha
刘永鑫Adam
·
2020-07-09 00:49
QIIME 2教程. 29参考数据库DataResources(2020.2)
文章目录前情提要数据资源Dataresourcesq2-feature-classifie使用的分类学分类器标记基因参考数据库Greengenes(16SrRNA)数据库的各种版本及下载链接如下:Silva(
16S
刘永鑫Adam
·
2020-07-09 00:17
扩增子分析
魅族
16s
真香机当仁不让
一年一度的年中购物盛典“618”正火热进行中,对于消费者来说,这是购物的绝好机遇。尤其是对于那些想要购买手机的朋友们来说,各种优惠买到即是赚到。6月6日,魅族“618夏日清凉价”活动正式开启,并将一直持续到6月18日。在此期间,魅族官网、天猫、京东及苏宁每日放送满619减618元神券,魅族16X直降200、魅族Note9星耀蓝首发、魅族16th系列及魅族X8系列等领券立减200。此外,更有砍价赢手
人生谈数码
·
2020-07-07 09:29
Python并发实践_03_并发实战之一
16S
数据质控流程,一次下机lane包括很多的项目,每个项目有独立的合同号,一个项目可能包含
16S
或者ITS两种,通过一个完整的pipeline,将上游拆分好的数据全部整理成可以直接分析的数据。
didang1878
·
2020-07-07 06:33
小米9降价厮杀荣耀,不料网友都想买它,手感爽到极点
降价后的小米9跟魅族
16s
的对比也让人非常关注,到底谁更值得入手呢?两种屏幕方案,谁优谁劣一目了然说起来两款手机都是855旗舰中的爆款机型,但也正因如此却更让人难以决定如何选择,所以只能硬刚一下。
数码源动力
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2020-07-06 18:31
2019微生物组——
16S
扩增子分析专题培训第四期
可重复计算和统计绘图五、功能预测和机器学习六、网络和环境因子分析往期精彩回顾主讲教师助教团队授课模式培训时间授课地点课程价格课程福利在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在2019年4月12-14日北京推出《
16S
刘永鑫Adam
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2020-07-06 07:27
扩增子
PNAS-2018-多年多点5千样本鉴定玉米根际可遗传微生物
摘要重要性图1.环境与年龄根际微生物群落结构图2.2010年田间个体广义遗传力鉴定2010年可遗传OTUs图3.可遗传OTUs进化关系材料与方法概述玉米根际土收集和准备
16S
扩增子处理和分析Beta多样性和
刘永鑫Adam
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2020-07-06 07:26
papers
Krona绘制物种或功能组成圈图
Krona简介Excel插件安装和使用实例欣赏Linux下安装和使用Reference猜你喜欢写在后面之前介绍SILVAngs:
16S
/18S在线分析流程中,就整合有KRONA圈图的结果,非常漂亮。
刘永鑫Adam
·
2020-07-06 07:26
software
微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7,早鸟价仅剩1周)...
福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam
·
2020-07-06 07:54
宏基因组报名倒计时!报名线上课还可免费参加线下课
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组和Python课程的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。
刘永鑫Adam
·
2020-07-06 07:23
微生物组-扩增子
16S
分析研讨会(2020.1)
网络和环境因子分析往期精彩回顾主讲教师刘永鑫中科院遗传发育所工程师陈同易汉博基因科技CEO周欣中科院微生物所博士在读助教团队授课模式培训时间授课地点课程价格课程福利在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在2020年1月3-5日北京推出《扩增子
16S
刘永鑫Adam
·
2020-07-06 07:22
扩增子分析
微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
生信宝典
·
2020-07-05 02:19
中科院单细胞分析算法开发博士带你做单细胞转录组分析
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组和Python课程的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。
生信宝典
·
2020-07-05 02:19
微生物组-宏基因组分析第8期 (报名直播课免费参加线下2020.7)
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
生信宝典
·
2020-07-05 02:19
最新好消息!| 微生物组—宏基因组分析专题研讨会
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组和Python课程的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。
生信宝典
·
2020-07-05 02:19
【语义分割系列】一图讲解FCN16s实现过程。对照着pytorch代码讲解的。
这里就以FCN16s为例讲解,
16s
清晰了32s8s只是在此基础上减,加而已了。我看的代码是一VGG16为主干网络。关键步骤的解释在下图中已标记清晰,对照其他主干网络代码看也都能看的通。
若曦爹
·
2020-07-04 16:05
微生物组-宏基因组分析第8期(报名直播课免费参加线下2020.7)
福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam
·
2020-07-04 03:16
微生物组—宏基因组分析专题研讨会(线上课已开通,可以报名,线下课程时间待定)...
“福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组和Python课程的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。
刘永鑫Adam
·
2020-07-04 03:16
0049-【宏基因组】-
16S
分析qiime1极简教程2
1.软件安装qiime1.9.1——condainstallqiimeFLASh——condainstallflash2.数据和文件准备#pairfastq原始数据$ltrawdata/total3.8M-rw-r--r--1toucantoucan65Sep232017A.mf-rw-r--r--1toucantoucan698KSep232017A_1.fastq-rw-r--r--1touc
leadingsci
·
2020-07-02 07:47
【宏基因组】
黄章揭秘魅族
16s
,魅族Note9海报预告
一位魅友在魅族社区发帖:“如果魅族
16s
没有三摄,你们会不会买?”魅族科技创始人、董事长兼CEO黄章回应,目前多个摄像头只是增加一些辅助功能,长焦和广角副摄像头都远不如主摄像头拍的好。
机蜂侠
·
2020-06-30 15:50
【小记备忘】之sscanf 安全方法 sscanf_s【2014.04.23】
staticconstchar*s_formatBaseSourceString="{#%
16s
}{#%12s}";//{#MyOutputFileName}{#MyAppVerPath}charappVerKey
moooxin
·
2020-06-30 02:02
【C++】
【程序员的日子】
【代码备忘】
【C】
【VC】
【小记备忘】
【原创之味】
高级转录组分析和R数据可视化第11期(报名线上课还可免费参加线下课2020.6)
福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子
16S
分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。
刘永鑫Adam
·
2020-06-29 20:48
Android性能优化系列之渲染优化
然而有的时候你的程序会出现这样的情况,如果某个绘制操作超过了16秒用了24秒这时候用户看同一张图片花了32秒而不是
16s
,用户会感到卡顿,这
伯努力不努力
·
2020-06-27 02:48
性能优化
小米推新,黄章怒骂!留给魅族们的时间不多了 | 畅言
不知道是为了给魅族
16S
宣传炒作还是真是黄章先生有
CSDN资讯
·
2020-06-23 01:21
价格让小米修炼成槽点,年度旗舰小米9遇到它算是凉了
卢伟冰打脸自己,网友更看好魅族
16s
犹记得当初魅族
16s
上市两个月后就降价500元,小米副总裁卢伟冰就立马更博一边讽刺友
数码源动力
·
2020-06-21 08:49
魅族
16s
Pro光荣谢幕 魅族17发布会邀请函4月22日见
去年八月,魅族16sPro正式发布。作为魅族的高颜值旗舰,魅族16sPro通过多款亮眼的配色,获得了不少用户的肯定。近期,魅族官方宣布这部高颜值手机正式谢幕,并推出魅族16sPro梦幻独角兽特别定制纪念版,以微博抽奖的形式送给粉丝。魅族16sPro光荣谢幕此前魅族曾表示后续发布的手机均为5G手机,其中首款5G旗舰魅族17将在不久后与我们见面。根据目前已知的信息来看,魅族17已经进入量产阶段,并在全
手机中国
·
2020-04-20 00:00
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