GCN

技能树直播课程学习-WGCNA-0-基础知识

1.基本步骤数据输入和清洗网络构建和模块检测量化模块和样本性状的关系挑出感兴趣模块内部的基因可视化TOM矩阵将网络导出到外部数据进行可视化2.加权共表达网络的类型signedorunsigned一般使用unsigned，因为不论是正相关还是负相关都是我们所关心的，但对于特殊的生物学故事可能需要使用signed目前据我所知使用以下函数时需要设置加权共表达网络类型（默认是unsigned）pickSo
大吉岭猹·2023-01-26 15:59

『TBtools-plugin』OneStepWGCNA插件

这个插件已经下架了，上架了更好用的WGCNAshiny：https://www.jianshu.com/p/4691c535a522常见问题反馈和总结插件释放了有差不多一个月了吧，总结了下大部分同学反馈回的问题大致分为以下几种情况
ShawnMagic·2023-01-26 14:51

Pytorch GCN入门

torch-geometric，其中torch-geometric是pytorch的一部分，使用它可以很方便的进行有关图神经网络的训练和推理，安装过程略,torch-geometric的详细信息可参见官方文档链接简单GCN
FPGA硅农·2023-01-26 11:34

pytorch版的GCN实现过程注解（一）

Pythonzip()函数参考链接：Pythonzip()函数Pythondict()函数pandas.get_dummies的用法get_dummies是利用pandas实现onehotencode的方式CSR-matrix稀疏矩阵（附demo）Pythonenumerate()函数pythoncoo_matrix的理解和用法NumPy和SciPy-.todense()和.toarray()之间
花开 流年·2023-01-26 11:32

Pytorch+PyG实现GCN(图卷积网络)

本专栏整理了《图神经网络代码实战》，内包含了不同图神经网络的相关代码实现（PyG以及自实现），理论与实践相结合，如GCN、GAT、GraphSAGE等经典图网络，每一个代码实例都附带有完整的代码。
꧁ 东 风 ꧂·2023-01-26 11:57

如何创建一个Vue项目

输入node-v若显示版本号即表示安装成功安装淘宝镜像输入npminstall-gcnpm--registry=http://registry.npm.taobao.org，安装淘宝镜像安装相关依赖安装
啦啦啦哈啦啦啦·2023-01-26 07:33

vue之使用webpack创建项目并使用elemntui

）官网：http://nodejs.cn/2.检查node.js是否安装完成检查命令：npm-vnode-v3.vue-cli脚手架的安装3.1安装淘宝镜像使用cnpm安装命令:npminstall-gcnpm
龚铱白·2023-01-26 01:17

论文记录：Decoupling GCN with DropGraph Module for Skeleton-Based Action Recognition

论文记录：DecouplingGCNwithDropGraphModuleforSkeleton-BasedActionRecognition论文地址论文代码Abstract:受cnn解耦聚合机制的启发
月薰的一些随笔·2023-01-25 12:38

人体动作识别论文（骨骼信息，GCN）

Two-StreamAdaptiveGraphConvolutionalNetworksforSkeleton-BasedActionRecognition基于骨架的双流自适应图卷积网络动作识别2s-AGCN
chenitu·2023-01-25 12:36

RA-GCN：Richly Activated Graph Convolutional Network for Robust Skeleton-based Action Recognition

RichlyActivatedGraphConvolutionalNetworkforRobustSkeleton-basedActionRecognitionTCSVT2020丰富的激活图表卷积网络，用于基于骨骼的骨骼动作识别现有方法大多使用完整的骨架，但是现实生活中，捕获不完全的或嘈杂的骨架是不可避免的，当某些信息关节被遮挡或受到干扰时，这可能会降低性能。探索在所有骨架关节上传播充分辨别特征使
KrystalKarlieKarina·2023-01-25 12:36

EEG-GNN论文阅读和分析：《EEG Emotion Recognition Using Dynamical Graph Convolutional Neural Networks》

EEGEmotionRecognitionUsingDynamicalGraphConvolutionalNeuralNetworks》算法方案构建邻接矩阵：按照Fig.3，展示的空间关系，在两个EEG的通道上有连接或者没有连接，这些连接关系被用来构建GCNN
KPer_Yang·2023-01-24 08:09

TensorBoard的命令和用法

C:\Users\xxxxx>tensorboard--logdir=C:\Users\xxxxx\DeepInf\gcn_ServingTensorBoardonlocalhost;toexposetothenetwork
hamimelon2020·2023-01-22 19:09

scwgcna官网教程中英文实战高维wgcna分析 单细胞wgcna分析

一文掌握单细胞wgcna分析hdWGCNAinsingle-celldata•hdWGCNA(smorabit.github.io)R:Findconsensusmodulesacrossseveraldatasets
YoungLeelight·2023-01-22 18:28

cs224w-图机器学习-Colab 3-GCN在pytorch-geometric中的实现

GCN在pytorch-geometric中的实现1.图数据卷积范式2.实现消息传播的三个部分（1）ϕ\phiϕ，MessagePassing.message(...)（2）□\square□，aggregationscheme
知之之·2023-01-21 21:30

GCN torch_geometric message_passing方法源码解析

message_passing方法源码解析前言源码位置源码及注释MessagePassing类propagate方法感谢及参考博文前言最近在看关于图神经网络相关论文，涉及到论文复现，所以要啃源码。网上虽然有一部分对源码的解析，如torch_geometric（）方法，但是在深入到里面具体方法，资料寥寥无几。特将自己学习笔记分享，一来方便自己以后查阅，二来给和我一样苦难的同胞一点点思路，三来方便热心
只是一个代号不必认真·2023-01-21 21:56

Interest-aware Message-Passing GCN for Recommendation(个人笔记)

论文：兴趣感知信息传递GCN（WWW.2021）文章链接：https://arxiv.org/abs/2102.10044代码链接：GitHub-liufancs/IMP_GCN（原版-tensorflow1
韭菜茁壮成长·2023-01-21 21:55

Pytorch实现GCN(基于Message Passing消息传递机制实现)

本专栏整理了《图神经网络代码实战》，内包含了不同图神经网络的相关代码实现（PyG以及自实现），理论与实践相结合，如GCN、GAT、GraphSAGE等经典图网络，每一个代码实例都附带有完整的代码。
꧁ 东 风 ꧂·2023-01-21 21:20

Pytorch实现GCN(基于PyTorch实现)

本专栏整理了《图神经网络代码实战》，内包含了不同图神经网络的相关代码实现（PyG以及自实现），理论与实践相结合，如GCN、GAT、GraphSAGE等经典图网络，每一个代码实例都附带有完整的代码。
꧁ 东 风 ꧂·2023-01-21 21:19

【论文翻译】Semantic Graph Convolutional Networks for 3D Human Pose Regression

Zhao_Semantic_Graph_Convolutional_Networks_for_3D_Human_Pose_Regression_CVPR_2019_paper.pdf【github】https://github.com/garyzhao/SemGCN
weixin_50862344·2023-01-21 14:10

pytorch自带网络_图神经网络 PyTorch Geometric 入门教程

可查看【GNN】万字长文带你入门GCN。而PyTorchGeometricLib
weixin_39887577·2023-01-21 14:38

pytorch + pyG实现GCN并分析代码

开发环境安装pytorch1.4.0PytorchGeometric1.6.1pytorch的安装网上教程已经说的很详细了，我就不再赘述了，有需要的朋友请自行百度解决。PytorchGeometric的安装我发现网上的教程绝大部分都需要科学上网，这一步就难倒一部分同学（也包括我），所以我在这里就提供一种更方便的方法。（建议先把pip的下载源改为国内镜像，比如清华源）命令如下：pipinstallt
D_pens·2023-01-21 14:00

PyTorch+PyG实现图神经网络经典模型目录

本专栏整理了《图神经网络代码实战》，内包含了不同图神经网络的相关代码实现（PyG以及自实现），理论与实践相结合，如GCN、GAT、GraphSAGE等经典图网络，每一个代码实例都附带有完整的代码。
꧁ 东 风 ꧂·2023-01-21 14:58

Pytorch-geometric: Creating Message Passing Networks 构建消息传递网络教程

Pytorch-geometric:CreatingMessagePassingNetworks构建消息传递网络教程一、背景二、MessagePassing基类三、例子3.1实现GCN层3.2实现EdgeConv
LeonYiLeonYi·2023-01-21 12:59

vue基础知识点

npm管理npm的服务器是在国外的国内下载很慢淘宝镜像：npmi-gcnpm--registry=https://registry.npm.taobao.orgjquery:1.cd到你要下载的文件夹下
唔西迪西0·2023-01-20 13:06

_jb_pytest_runner.py: error: unrecognized arguments: --cov报错

今天在运行GCN的时候，遇到了argparse，debug的时候报错：_jb_pytest_runner.py:error:unrecognizedarguments:--covargparse是python
思维在奔跑·2023-01-20 13:08

st_gcn_twostream网络报错 cannot find GPU device

gpu.py第35行调佣了cuda()，但是之前并没有让GPU可见，要在forgingus:之前加入os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES']=','.join(list(map(str,gpus)))最后要记得，重新在torchlight下安装setup.py，这时会将gpu.py拷贝到python系统安装路径，实际调用的是这里。
crazyman33·2023-01-20 13:06

st_gcn_twostream.py报错运算需要同一类型

将其中forward()函数里面改为ifTrue:m=torch.cat((torch.cuda.FloatTensor(N,C,1,V,M).zero_(),x[:,:,1:]-x[:,:,:-1]),2)else:m=torch.cat((torch.FloatTensor(N,C,1,V,M).zero_(),x[:,:,1:]-x[:,:,:-1]),2)主要是不开GPU时会出现变量类型不
crazyman33·2023-01-20 13:31

一种基于传统图像处理算法的烟丝规格自动计算方法

基于深度学习方法的CNN、RNN、GCN在精度和速度上有所提升，但结果不尽如人意。近来，有学者提出了基于传统图像算法的烟丝宽度在线估计分析方法，但仍然需要人工干预。
xhtnewbility·2023-01-20 09:22

基于stgcn的乒乓球基础动作识别评价系统

本人和同伴一起自主完成并参加比赛详细比赛视频介绍清晰包含例程安装与使用全过程想要一起讨论学习源码请私聊我
xhtnewbility·2023-01-20 09:21

论文理解 Linkage Based Face Clustering via Graph Convolution Network

论文理解LinkageBasedFaceClusteringviaGraphConvolutionNetwork背景要解决的问题基于GCN的人脸图像聚类图卷积层节点合并KNN搜索MxNet复现GCNLayer
碧落回雪·2023-01-19 21:16

GCN学习：Attributed Graph Clustering via Adaptive Graph Convolution

阅读论文AGC，利用高阶结构信息来提升聚类的效果。本文从图信号处理角度来理解GNN，增强聚类效果。目标还是将节点划分成m个聚类。文章目录一、Introduction原理步骤二、算法提到了一些预备条件k阶图卷积如何选择合适的k一、Introduction近年来的几种图卷积的聚类方法在一些真实的属性网络上取得了良好的聚类性能。然而现有方法都是低阶的，只考虑每个节点的邻居，或者两个三个跳之外的节点，固定
我咋就看不懂·2023-01-19 21:15

AGC：Attributed Graph Clustering via Adaptive Graph Convolution

GCN的问题GCN的每个卷积层都与投影层耦合，无法构造深层GCN。一般使用2~3个GCN，即只能考虑2，3阶邻居，丢失了global信息。固定模型忽略了真实数据的多样性。
格洛米_·2023-01-19 21:41

【GCN】论文笔记：Attributed Graph Clustering via Adaptive Graph Convolution

基于自适应图卷积的属性图聚类前言方法介绍总结前言属性图聚类是一个具有挑战性的问题，它要求图结构和节点的联合建模属性。虽然图卷积已经被证明在整合结构和特征信息时是非常有效的，但是几乎没有研究说明如何应用它来最大化集群性能。现有的方法基本上都是使用图卷积的固定的（忽略了图的多样性）低阶的（只考虑每个节点几跳内的邻居，没有充分利用节点关系）顺序。在本文中，我们提出了一种自适应的利用高阶图卷积实现属性图聚
予^·2023-01-19 21:40

深度学习笔记-经典分割算法总结&后续论文思路

非实时性）FCN：语义分割端到端的开端U-Net&FushionNet:医学分割算法中的龙头SegNet&DeconvNet:对称编解码结构DeepLab系列：从v1到v3+，算法越来越完善，结果越来越好GCN
地表最菜研究生·2023-01-19 15:14

GIKT: A Graph-based Interaction Model forKnowledge Tracing

表示是否正确回答】和新问题qt，目标：预测学生正确回答新问题的概率p问题技能关系图，一个问题对应多个技能，一个技能与多个问题相关【ni--与问题qi相关的技能的数目nj--与技能sj相关的问题的数目】总体框架：使用GCN
幸运满当当ღ·2023-01-18 23:25

论文笔记: Diffusion-Convolutional Neural Networks

前言相较于GCN早期基于频域的若干方法，这篇论文虽然内容较少，方法存在一定的局限性，但是可以说是基于空域GCN的开山之作，它提供了一个很清晰的对非欧式空间进行卷积的思路。
饮冰l·2023-01-18 22:46

医疗AI实践与思考汇总

医学图像分类和分割：CNN文本中信息抽取、疾病预测：CNN、RNN、transformer病患语音识别和机器翻译：RNN、Seq2Seq体征检测和疾病风险评估：RNN、MLP、transformer新药研发：GCN
梦无痕123·2023-01-18 18:58

SIGIR 2021 | 推荐系统中的自监督图表征学习

信息检索摘要推荐系统中用户-物品交互图上的表征学习（RepresentationLearning）已经从使用单个ID或历史交互行为发展到利用交互图上的高阶邻域信息，催生了诸如PinSage和LightGCN
PaperWeekly·2023-01-17 19:08

V2X技术周 ｜ V2X地图数据结构介绍和梳理

示例文件{"msgCnt":"1",//MsgCount"nodes":{"Node":[
OpenV2X开源社区·2023-01-17 18:58

零基础多图详解图神经网络（GNN/GCN）【论文精读】

原文链接：AGentleIntroductiontoGraphNeuralNetworks(distill.pub)我们不仅仅关系整个图的架构，其实我们更关心的是每个顶点每条边和整个图所表示的信息。我们如何把我们想要的信息表示成以上这些向量，以及这些向量是否能够通过数据来学到。这也是整个图神经网络要关注的重点。一、数据如何表示成图如何把一张图片表示成图，假如我们有一张图，其高宽都是244.然后有三
黄乐荣·2023-01-17 16:17

论文阅读笔记：DSTGCN-Deep spatio-temporal graph convolutional network for traffic accident prediction

文章地址：https://doi.org/10.1016/j.neucom.2020.09.043特点：道路级别而非网格，未使用RNN一类时间序列网络，残差网络abstract：在现实世界中，交通事故通常会导致严重的人员伤亡和巨大的经济损失。及时准确地预测交通事故对保护公共安全和减少经济损失有很大的潜力。然而，由于交通事故具有复杂的因果关系，包括交通相关异质数据中的空间相关性、时间动态交互性和外部
ayuuuuu·2023-01-17 11:19

T-GCN：时间图卷积网络用于交通速度预测-模型实验部分

新的一周，你好~T-GCN：时间图卷积网络用于交通速度预测-简介部分1、文章信息《T-GCN:ATemporalGraphConvolutionalNetworkforTrafficPrediction
当交通遇上机器学习·2023-01-16 08:23

T-GCN-时间图卷积网络交通速度中的预测

为了捕获时空间依赖性，本文提出了T-GCN（temporalgraphconvolutionalnetwork），模型融合了图卷积网络(GCN)和门控递归单元(GR
奥卡姆的剃刀·2023-01-16 08:22

pointcnn pointweb pointconv randla 阅读（二）

pointweb不同于DGCNN，本文章考虑所有的局部邻域内的两点之间的关系对于FPS采样和KNN得出的邻域内点集合F，其中的每个点都看作Fi本身特征加邻域内的特征其中fimp是MLP得出得Fj对Fi的影响
官方陈奕迅·2023-01-15 14:55

论文阅读：CNN+GCN

论文名称：卷积神经网络加上图卷积神经网络的边界回归方法用于医学图像分割。期刊名称：ISSV2019作者：YandaMengMengWei.作者单位：利物浦大学以及中科院宁波工业技术研究院。摘要：解剖结构的精准分割是医学图像分析的重要步骤，而边界回归的方法收到了研究者们的青睐。这种方法是从一个起点出发来进行分割任务，而不是对密集的像素点进行分类。然而，由于CNN的固有特性，使用卷积核拥有的局部感受野
sigmoidAndRELU·2023-01-15 12:33

DGL踩坑留念

无论采取什么方法都不能使得准确度继续上升，模型如下：importtorch.nnfromtorch.nnimportModule,ReLU,Dropoutfromdgl.nn.pytorchimportGraphConvclassGCN_Mod
kun996·2023-01-14 15:46

论文笔记《DeepTective》

DeepTective:DetectionofPHPVulnerabilitiesUsingHybridGraphNeuralNetworks∗摘要1简介2模型概述2.1预处理2.2GRU2.3GCN2.4Classification3DATTASETS3.1SARD3.2GIT4EXPERIMENTS4.1
炎凰先生·2023-01-14 09:36

dgl-02 gcn

目录GCN代码实现GCN为什么需要gcn之前的cnn无法处理非欧式距离的数据而非欧式距离的数据（比如拓扑结构，网络结构）在现实中是一种广泛存在的数据结构GCN原理比较多的是从谱域来解释，关于怎么从二维卷积到图卷积
Evangelion-02·2023-01-14 09:29

基于图卷积网络的测量与先验知识相结合的故障诊断方法

GraphConvolutionalNetwork-BasedMethodforFaultDiagnosisUsingaHybridofMeasurementandPriorKnowledgeAbstractIntroductionPreliminaryA.GraphConvolutionNetworkB.MainStepofFaultDiagnosisBasedonGCNGCN-SAMeth
不知名高校研究生·2023-01-14 08:36

手把手安装GNN必备库 —— pytorch_geometric

GCN：图卷积神经网络，GNN在训练过程中，有将attention引入图结构的，有将门控机制引入图结构的，还有将卷积引入图结构的，引入卷积的GNN就是GCN，通过提取空间特征来进行学习。
clarkjs·2023-01-14 08:30
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